Seong Kyu Han;Hyunwoo C. Kwon;Jae-Seong Yang;Sanguk Kim;Seung-Jae V. Lee
Molecules and Cells
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제47권2호
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pp.100011.1-100011.3
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2024
Online application for survival analysis (OASIS) and its update, OASIS 2, have been widely used for survival analysis in biological and medical sciences. Here, we provide a portable version of OASIS, an all-in-one offline suite, to facilitate secure survival analysis without uploading the data to online servers. OASIS portable provides a virtualized and isolated instance of the OASIS 2 webserver, operating on the users' personal computers, and enables user-friendly survival analysis without internet connection and security issues.
개인정보 유출을 위한 공격자의 시도는 다양한 보안 시스템에 로그를 남기게 된다. 이러한 로그정보들은 개인정보 유출에 관여했다고 보고된 특정 IP 주소에 대한 확신도를 도출하기위한 요소가 될 수 있다. 본 논문에서는 보편적으로 활용 가능한 보안 시스템들의 로그정보들을 기반으로 확신도를 도출하기 위한 규칙기반 전문가 시스템의 섣계 및 구현을 다루고 있다. 일반적으로 개인정보유출과 연관된 다양한 로그정보들은 개인정보 관리자에 의해서 분석되어, 의심 대상이 되는 IP 주소에 대해 정보유출에 관여한 정도를 도출하게 된다. 이러한 개인정보 관리자가 수행하는 분석절차는 전문가의 축적된 지식 (Know-how)이라고 할 수 있으며, 이는 규칙 형태로 정의되어 분석절차의 자동화에 활용될 수 있다. 특히, 개인정보유출과 관련된 로그정보의 분석 범위는 다양한 해킹시도를 탐지 해내야하는 침입탐지 및 대응 분야와 비교할 때 상대적으로 넓지 않다. 따라서 도출해내야 하는 규칙의 개수가 상대적으로 많지 않다고 할 수 있다. 본 논문에서는 특히 IDS. Firewall 및 Webserver 의 로그정보들을 개인정보유출의 관점에서 상호 연관성을 도출하였고, 이러한 연관성을 기반으로 규칙을 정의하고 이들을 생성/변경/삭제 할 수 있는 시스템을 개발하였다. 본 연구의 결과에 해당하는 규칙기반 지식베이스 및 전문가 시스템은 개인정보유출에 관여 했다고 여겨지는 특정 IP 주소에 대한 낮은 수준(Low-level)의 검증을 수행하여 확신도를 도출하는데 활용이 가능하다.
Kim, Hyo Jung;Lee, Ki-Young;Kim, Yena;Kwon, Ae-Ran;Lee, Bong-Jin
한국자기공명학회논문지
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제20권2호
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pp.36-40
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2016
MRA1997 is a highly conserved protein from mycobacterial strains. However, no structural and functional information is associated with it. Thus, to obtain details about structure and function of this protein, we have utilized NMR spectroscopy. The recombinant MRA1997 was highly purified and its DNA binding mode was characterized. The tertiary structure of MRA1997 was modeled on the basis of our NMR chemical shift data combined with the webserver CS23D. The binding of MRA1997 with DNA was first monitored by electrophoresis mobility shift assays. The residues involved in DNA binding are identified using NMR chemical shift perturbation experiments. Based on our study, we suggest that MRA1997 interacts with DNA and may play an important role in Mycobacterium tuberculosis physiology.
웹 서비스는 기능의 특성상 다른 서비스와는 달리 외부에 노출되어 있고 다양한 어플리케이션들이 웹 서비스와 연동되어 있어서 많은 보안 취약점들이 존재한다. 특히 새로운 웹 기술들이 개발되면서 전에 없던 새로운 형태의 보안 취약점들이 꾸준히 생겨나고 있다. 본 논문에서는 이러한 취약점들을 바탕으로, 가상화 환경을 이용하여 웹서버와 허니웹을 구축함으로써 어떤 공격에 대해서도 시스템의 하드웨어까지 영향을 미치지 않도록 구성되며 허니웹을 통하여 새로운 공격에 대해서도 정보를 수집할 수 있도록 웹 서버 보안시스템을 설계 및 구현 하였다. 이를 통하여 상호 통신의 웹 환경에서 적절한 보안을 제공 할 수 있다.
임베디드 시스템을 인터넷에 접속할 수 있도록 하는 초소형의 임베디드 웹서버는 산업 현장에서 가정에 이르기까지 널리 활용되고 있다. 본 논문에서는 인터넷을 통해 DGPS 간이 기준국의 보정 정보를 항체에게 제공하기 위한 임베디드 웹서버를 제안하였다. 제안한 간이 기준국용 임베디드 웹서버는 HTTP 1.0과 1.1 표준에서 제시한 구조를 기반으로 설계 가능하다. HTTP 1.0 표준을 기반으로 한 서버는 클라이언트의 요청을 순차적으로 처리하는 반면, HTTP 1.1 표준을 기반으로 한 서버는 클라이언트에 대하여 독립된 프로세스를 할당하여 처리한다. 간이 기준국에 적합한 서버 구조를 결정하기 위하여 각 서버 프로그램의 구조 및 특징을 비교하고 네트워크 인터페이스를 가지는 GPS 수신기에 상용의 실시간 운영체제를 기반으로 구현하였다. PC 내부에 탑재한 상용의 웹브라우저를 통하여 제안한 임베디드 웹서버에 접속하여 DGPS 간이 기준국의 보정 정보를 수신하는 실험을 수행하였다. 실험 결과 제안한 임베디드 웹서버의 구조가 DGPS 간이 기준국에 적합함을 확인하였다.
In this paper, we analyzed the factors of adoption and implemented a predictive model to activate the adoption of animals. Recently, animal shelters are saturated due to the abandonment and loss of companion animals. To address this, we need to find a way to encourage adoption. In this paper, a study was conducted using two data from an open data portal provided by Austin, Texas. First, a correlation analysis was conducted to identify the attributes that affect the result value, and it was found that Animal Type Intake, Intake Type, and Age upon Outcome influence the Outcome Type with correlation coefficients of 0.4, 0.26, and -0.2, respectively. For these attributes, the analysis was conducted using Multiclass Logistic Regression. As a result, dogs had a higher probability of Adoption than cats, and animals subjected to euthanasia were more likely to adopt. In the case of Public Assist and Stray, it was found that the Missing rate was high. Also, the length of stay for cats increased to 12.5 years of age, while dogs generally adopted smoothly at all ages. These results showed an overall accuracy of 62.7% and an average accuracy of 91.7%, showing a fairly reliable result. Therefore, it seems that it can be used to develop a plan to promote the adoption of animals according to various factors. Also, it can be expanded to various services by interlocking with the webserver.
Due to the increasing interest in synonymous codons, several codon bias-related terms were introduced. As one measure of them, the tRNA adaptation index (tAI) was invented about a decade ago. The tAI is a measure of translational efficiency for a gene and is calculated based on the abundance of intracellular tRNA and the binding strength between a codon and a tRNA. The index has been widely used in various fields of molecular evolution, genetics, and pharmacology. Afterwards, an improved version of the index, named specific tRNA adaptation index (stAI), was developed by adapting tRNA copy numbers in species. Although a subsequently developed webserver (stAIcalc) provided tools that calculated stAI values, it was not available to access pre-calculated values. In addition to about 100 species in stAIcalc, we calculated stAI values for whole coding sequences in 148 species. To enable easy access to this index, we constructed a novel web database, named STADIUM (Species-specific tRNA adaptive index compendium). STADIUM provides not only the stAI value of each gene but also statistics based on pathway-based classification. The database is expected to help researchers who have interests in codon optimality and the role of synonymous codons. STADIUM is freely available at http://stadium.pmrc.re.kr.
Epicoccum nigrum produces epipyrone A (orevactaene), a yellow polyketide pigment. Its biosynthetic gene cluster was previously characterized in E. nigrum KACC 40642. The YES liquid culture of this strain revealed high-level production of epicoccamide (EPC), with an identity that was determined using liquid chromatography-mass spectrometry analysis and molecular mass search using the SuperNatural database V2 webserver. The production of EPC was further confirmed by compound isolation and nuclear magnetic resonance spectroscopy. EPC is a highly reduced polyketide with tetramic acid and mannosyl moieties. The EPC structure guided us to localize the hypothetical EPC biosynthetic gene cluster (BGC) in E. nigrum ICMP 19927 genome sequence. The BGC contains genes encoding highly reducing (HR)-fungal polyketide synthase (fPKS)-nonribosomal peptide synthetase (NRPS), glycosyltransferase (GT), enoylreductase, cytochrome P450, and N-methyltrasnferase. Targeted inactivation of the HR-fPKS-NRPS and GT genes abolished EPC production, supporting the successful localization of EPC BGC. This study provides a platform to explore the hidden biological activities of EPC, a bolaamphiphilic compound.
Song, Si Yeol;Ahn, Seung Do;Chung, Weon Kuu;Shin, Kyung Hwan;Choi, Eun Kyung;Cho, Kwan Ho
Radiation Oncology Journal
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제33권2호
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pp.142-148
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2015
Purpose: To develop new on-line statistical program for the Korean Society for Radiation Oncology (KOSRO) to collect and extract medical data in radiation oncology more efficiently. Materials and Methods: The statistical program is a web-based program. The directory was placed in a sub-folder of the homepage of KOSRO and its web address is http://www.kosro.or.kr/asda. The operating systems server is Linux and the webserver is the Apache HTTP server. For database (DB) server, MySQL is adopted and dedicated scripting language is the PHP. Each ID and password are controlled independently and all screen pages for data input or analysis are made to be friendly to users. Scroll-down menu is actively used for the convenience of user and the consistence of data analysis. Results: Year of data is one of top categories and main topics include human resource, equipment, clinical statistics, specialized treatment and research achievement. Each topic or category has several subcategorized topics. Real-time on-line report of analysis is produced immediately after entering each data and the administrator is able to monitor status of data input of each hospital. Backup of data as spread sheets can be accessed by the administrator and be used for academic works by any members of the KOSRO. Conclusion: The new on-line statistical program was developed to collect data from nationwide departments of radiation oncology. Intuitive screen and consistent input structure are expected to promote entering data of member hospitals and annual statistics should be a cornerstone of advance in radiation oncology.
본 논문에서는 대화형 인공지능 인터랙티브 아트인 "진화하는 신, 가이아" 작품을 중심으로 예술 의미적인 배경과 작품이 구현된 기술적 구조에 대해 제시한다. 최근 여러 분야에서 인공지능의 기술을 사용하면서 예술 분야에도 이러한 시도가 접목되고 있다. 또한 과학의 발달로 생체모방 기술이나 인공생명 기술이 발달하면서 기계와 인간의 구분이 모호해지고 있다. 본 논문에서는 이러한 기계 생명의 은유를 담고 있는 예술 작품 사례를 제시하고, 본 작품에서 차별적으로 구현된 대화 시스템에 대해 상세히 부각한다. 본 작품에서는 로봇이 관객과의 자연스러운 소통을 위해 관객을 인식하여 바라보고 눈을 맞추며, 관객의 음성을 직접 인식하고 이에 따른 적절한 응답을 음성 합성으로 출력한다. 본 작품의 대화 시스템은 작품 내에 내장된 안드로이드 클라이언트와 질문-대답 사전을 내장한 서버로 구성된 질의응답시스템으로 구현되었다. 본 작품은 이러한 인터랙션을 통해 넓은 의미에서의 생명에 대한 의미를 논하며 관객과의 공감을 이끌어낸다. 본 논문에서는 작품의 기계적 구조와 대화 시스템 등의 제작 방법 및 관객 반응을 살펴봄으로써 인공지능 예술 작품의 제작 및 전시 기획에 기여하고자 한다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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