• 제목/요약/키워드: WASP gene

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WASP 유전자의 Exon 2에서 새로운 돌연변이를 가진 Wiskott-Aldrich 증후군의 1례 (A Case of Wiskott-Aldrich Syndrome with Novel Mutation in Exon 2 of the WASP Gene)

  • 이혁;박정인;김선영;문경희;이호근;황평한
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제48권5호
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    • pp.551-556
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    • 2005
  • 저자들은 혈소판 평균용적 및 혈소판 수의 감소, 심한 아토피 피부염 및 반복 감염을 임상적 증상으로 추정 진단된 WAS 환아로부터 WAS의 확진에 필수적인 분자학적 분석을 실시하여 WASP 단백질의 발현이 감소되어 있으며, WASP 유전자의 Exon 2, 번역 개시점으로부터 208번째의 염기서열 구아닌(g)이 아데닌(a)으로 변이되어 70번째 아미노산인 글라이신(Gly)이 알지닌(Arg)으로 변화된 missense 변이(G70A)를 발견하여 확진된 WAS 환자를 경험하였기에 문헌 고찰과 함께 이를 보고하는 바이다.

WASP5 & WASP Builder을 이용한 농업용저수지 유역의 수질관리 (Water Quality Management using WASPS & WASP Builder for a Basin of an Agricultural Reservoir)

  • 정팔진;고홍석;현미희;이은주
    • 한국물환경학회지
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    • 제20권5호
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    • pp.422-431
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    • 2004
  • Water quality modeling was performed for the purpose of diagnosis and prediction of water quality in Gyoung Choen reservoir, using EUTR05/WASP Build model. WASP Builder is capable of visual display in window and it has an advantage of updating and modification for data. Field data of 1992, Spring, Summer, and Fall, were used to calibrate model and these results were validated using data of 2000, Spring, Summer, and Fall. The reservoir was divided into 4 epilimnion segments. Water quality system for modeling were consist of BOD, Chlorophyll-a, DO, $NH_3-N$, $NO_3-N$, T-N, $PO_4-P$, T-P. The results of water quality modelling using EUTR05/WASP Builder, a range of the Correlation for calibration of BOD, T-N, T-P, and Chlorophyll-a according to three seasons are 0.63~0.90, 0.81~0.97, 0.75~0.98, and 0.77~0.98 respectively. And the correlation between simulated and observed values for verification of BOD, T-N, T-P, and Chlorophyll-a according to three seasons are 0.93, 0.94, 0.81, and 0.80 respectively. Among the pollutant sources for a basin of the Gyoung Choen reservoir, generated amount of livestock is the highest and BOD, T-N, T-P of generated loading percentage are 94%, 81%, and 95%. So, we suppose that inflow load amount will decrease 50% and increase 50% only livestock about current load amount. If increasing load amount of livestock 50% in segment 2 and 3, BOD, T-N, and T-P simulated increasing to range of $0.02~0.15mg/{\ell}$, $0.029~0.08mg/{\ell}$, $0.011~0.029mg/{\ell}$ in comparison with current water quality

Genomic Structure of the Cu/Zn Superoxide Dismutase(SOD1) Gene from the Entomopathogenic Fungus, Cordyceps pruinosa

  • Park, Nam Sook;Jin, Byung Rae;Lee, Sang Mong
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제39권2호
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    • pp.67-73
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    • 2019
  • The genomic structure of the Cu/Zn superoxide dismutase (SOD1) gene from the entomopathogenic fungus, Cordyceps pruinosa was characterized. The SOD1 gene of C. pruinosa spans 947 nucleotides and consisted of four exons encoding for 154 amino acids and three introns. Four exons of the SOD1 gene are composed of 13, 331, 97 and 20 nucleotides respectively. Homology search of amino acid sequences of the SOD1 gene of C. pruinosa with another 13 fungi species showed higher sequence similarity of 69% ~ 95% and had the most highest sequence identity of 95% with Beauveria bassiana and Cordyceps militaris, which can easely infect domesticated Bombyx mori and another wild lepidopteran species in artificial or natual manner of infection. This SOD1 gene sequence showed copper, zinc and beta-barrel fold sites. Homology search showed that the Cu/Zn SOD1 gene from the entomopathogenic fungus, C. pruinosa is an orthologous gene homolog present in different species of organism whose ancestor predates the split between the relating species. In addition, C. pruinosa SOD1 gene is placed together within the ascomycetes group of fungal clade. From these results it is concluded that C. pruinosa SOD1 gene is orthologous gene having the same or very similar functions with a common evolutionary ancestor.

A Technique of Segment Expression and RNA Interference (SERI) Reveals a Specific Physiological Function of a Cysteine-Rich Protein Gene Encoded in Cotesia plutellae Bracovirus

  • Barandoc, Karen;Kim, Yong-Gyun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제19권6호
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    • pp.610-615
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    • 2009
  • As a provirus, polydnavirus has a segmented DNA genome on chromosome(s) of host wasp. It contains several genes in each segment that presumably play critical roles in regulating physiological processes of target insect parasitized by the wasp. A cysteine-rich protein 1 (CRP1) is present in the polydnavirus Cotesia plutellae bracovirus (CpBV) genome, but its expression and physiological function in Plutella xylostella parasitized by the viral host C. plutellae is not known. This CpBV-CRP1 encoding 189 amino acids with a putative signal peptide (20 residues) was persistently expressed in parasitized P. xylostella with gradual decrease at the late parasitization period. Expression of CpBV-CRP1 was tissue-specific in the fat body/epidermis and hemocyte, but not in the gut. Its physiological function was analyzed by inducing transient expression of a CpBV segment containing CpBV-CRP1 and its promoter, which caused significant reduction in hemocyte -spreading and delayed larval development. When the treated larvae were co-injected with double-stranded RNA of CpBV-CRP1, the expression of CpBV-CRP1 disappeared, whereas other genes encoded in the CpBV segment was expressed. These co-injected larvae significantly recovered the hemocyte-spreading capacity and larval development rate. This study reports that CpBV-CRP1 is expressed in P. xylostella parasitized by C. plutellae and its physiological function is to alter the host immune and developmental processes.

간암세포주에서 지속적인 p16 단백질발현이 유도하는 유전자발현의 변화 (Gene Expression Changes Associated with Sustained p16 Expression in Hepatocellular Carcinoma Cells)

  • 오상진;임지영;정제훈;이용복
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제4권4호
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    • pp.237-243
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    • 2004
  • Background: The normal functions of the cell cycle inhibitor p16INK4a are frequently inactivated in many human cancers. Over 80% of hepatocellular carcinoma (HCC) cases lack a functional p16/Rb pathway. p16/Rb pathway, as well as p53 pathway, is considered as one of key components of tumor suppression. Methods: To study the roles of p16INK4a in HCC, a stable cell line expressing exogenous p16 was generated from SNU-449 hepatocellular carcinoma cells lacking endogenous p16, and suppression subtractive hybridization (SSH) was performed in parallel with the control cells. Results: 1) SSH identifies fibronectin (FN1), crystallin ${\alpha}B$ (CRYAB), Rac1, WASP, RhoGEF, and CCT3 as differentially-expressed genes. 2) Among the selected genes, the up-regulation of FN1 and CRYAB was confirmed by Northern blot, RT-PCR and by proteomic methods. Conclusion: These genes are likely to be associated with the induction of stress fiber and stabilization of cytoskeleton. Further studies are required to clarify the possible role of p16 in the signal transduction pathway.

프루텔고치벌 브라코바이러스(Cotesia plutellae Bracovirus) 유래 $I_{k}B$ 유전자 구조와 피기생 배추좀나방(Plutella xylostella) 체내 발현 패턴 (Gene Structure of Cotesia plutellae Bracovirus (CpBV)-$I_{k}B$ and Its Expression Pattern in the Parasitized Diamondback Moth, Plutella xylostella)

  • 김용균;;;배성우
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제45권1호
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    • pp.15-24
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    • 2006
  • 프루텔고치벌(Cotesia plutellae)은 내부기생봉이고 kB억제자 (IkB)와 유사한 유전자가 이 기생봉의 절대 공생바이러스(C. plutellae bracovirus: CpBV) 게놈에서 발견되었다. 이 유전자의 발현 부위는 417 br의 크기이며 138개 아미노산 서열 정보를 포함하였다. 이 단백질은 4개의 ankyrin 반복영역을 지니고 있었으며, 알려진 다른 폴리드나바이러스 유래 IkB 유전자와 높은 상동성을 보였다. 초파리 Cactus 단백질을 통해 대상 기주 IkB와 비교하여 보면, IkB 신호수신영역이 부재하는 구조를 보여, CpBV-IkB는 NFkB 신호전달체계의 비가역적 억제 인자로 작용할 것으로 추정되었다. CpBV-IkB는 프루텔고치 벌에 기생된 배추좀나방에서만 발현되었다. 정량적 RT-PCR 방법으로 CpBV-IkB의 발현량을 조사하여 보면, 기생 첫날부터 발현을 보이기 시작하여 뚜렷한 발현량을 기생 전체 기간동안 유지하는 양상을 보였다. 이 CpBV-IkB의 기능 분석이 간접적으로 이뤄졌으며, 이 유전자 발현물이 대상 기주 항바이러스 억제 인자로 작용할 것이라는 가설을 제시하였다.

폴리드나바이러스와 새로운 해충방제 전략 (Polydnavirus and Its Novel Application to Insect Pest Control)

  • 김용균
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제45권3호
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    • pp.241-259
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    • 2006
  • 폴리드나바이러스는 고치벌 및 맵시벌류에 공생하는 DNA 바이러스로 기주 염색체에 프로바이러스 형태로 존재한다. 이 바이러스의 복제는 기주 용발육시기에 난소받침 상피세포에서 시작되어 유리 바이러스 형태의 입자 구조를 이루게 된다. 바이러스 입자는 기주가 피기생체에 산란할 때 알과 함께 혈강으로 옮겨진다. 이 바이러스 게놈의 염기서열을 바탕으로 여러 폴리드나바이러스 유전자군이 동정되었으며, 이들의 생리적 기능도 알려지고 있다. 본 종설은 기생 생리적 견지에서 폴리드나바이러스 게놈을 특성화하고, 이를 토대로 생리 교란 유전자들을 응용할 수 있는 새로운 해충 방제 전략을 소개한다.

폴리드나바이러스 유래 CpBV-ELP1 발현 담배의 내충성 (Insect Resistance of Tobacco Plant Expressing CpBV-ELP1 Derived from a Polydnavirus)

  • 김은성;김용균
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제56권1호
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    • pp.19-28
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    • 2017
  • 폴리드나바이러스(polydnavirus: PDV)는 일부 내부기생봉에 공생하는 이중나선형 DNA 바이러스 분류군이다. Cotesia plutellae bracovirus (CpBV)는 프루텔고치벌(C. plutellae)에 공생하는 일종의 PDV이다. 프루텔고치벌은 어린 배추좀나방(Plutella xylostella) 유충에 기생한다. 기생 초기에 발현하는 CpBV-ELP1 유전자는 혈구세포에 세포독성을 발휘하면서 기주의 세포성 면역을 억제하여 기생에 중요한 역할을 담당하고 있다. 본 연구는 이 유전자를 담배 식물에서 발현하여 해충에 대한 경구독성을 분석하는 데 목적을 두었다. 재조합 CpBV-ELP1 단백질이 배큘로바이러스 발현시스템을 통해 합성되어 세포배양액에 분비되었다. 수거된 세포배양액은 일련의 단백질 분리과정(ammonium sulfate 단백질 분획, size exclusion 크로마토그래피, 이온교환 크로마토그래피)을 통해 CpBV-ELP1 단백질을 분리하는 데 이용되었다. 분리된 rCpBV-ELP1 단백질은 파밤나방(Spodoptera exigua) 혈구에 대한 뚜렷한 세포독성을 보였다. CpBV-ELP1은 파밤나방 5령충에 대해서 혈강 주입하여 살충력을 나타냈고, 엽침지법을 이용하여 경구독성을 갖고 있는 것을 확인하였다. CpBV-ELP1 유전자를 CaMV 35S 유전자 프로모터와 opaline synthase 유전자 전사종결신호를 갖는 pBI121 벡터에 클로닝하여 Agrobacterium tumefaciens LBA4404 세균에 형질전환을 유도하였다. 형질전환된 세균은 담배(Nicotiana tabacum Xanthi)잎에 감염하여 캘러스를 유도하게 하였고 이후 차세대(T1)를 확보하였다. T1 세대 담배는 파밤나방에 대한 해충저항성을 갖고 있음을 확인하였다. 이러한 결과는 CpBV-ELP1 유전자가 형질전환작물을 통해 해충방제에 응용될 수 있다는 것을 제시하고 있다.

Wiskott-Aldrich 증후군 환아의 증례보고 (WISKOTT-ALDRICH SYNDROME WITH DENTAL PROBLEMS : CASE REPORT)

  • 이연주;현홍근;장철호;김영재;김정욱;장기택;김종철;한세현;이상훈
    • 대한소아치과학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.468-472
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    • 2007
  • Wiskott-Aldrich 증후군은 WAS 단백질 유전자의 돌연변이에 의해서 야기되는 면역결핍질환으로 X 염색체 열성으로 유전되는 양상을 보인다. 혈소판감소증과 그로 인한 출혈경향, 면역결핍으로 인해 반복되는 감염, 아토피성 피부염등의 소견을 보인다. 첫 번째 증례는 서울대학교 치과병원 소아치과에 내원한 2세 11개월의 남아로 서울대학교 어린이병원에서 골수이식수술 전에 감염성 요소의 제거를 위해 의뢰되었다. 두 번째 증례는 2세 6개월의 남아로 구각부 및 치은의 연조직 질환과 치아 및 치은의 착색을 주소로 본과에 의뢰되었다. 이들 두 환자에서 보이는 Wiskott-Aldrich 증후군의 특징적인 치과적 소견과 치과치료시의 주의사항에 대해 보고하는 바이다.

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우리나라에서의 임목육종(林木育種)에 의(依)한 생산성(生産性) 증가(增加) (Improvement of Productivity by Forest Tree Breeding Work in Korea)

  • 류장발;심상영
    • 한국산림과학회지
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    • 제77권4호
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    • pp.382-388
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    • 1988
  • 우리나라에서의 임목육종(林木育種)에 의(依)한 생산성(生産性) 증가(增加)를 중요(重要)한 몇 수종(樹種)에 관하여 살펴보았다. 소나무 수형목(秀型木) 17가계(家係)의 차대(次代)는 15년생(年生)에서 비수형목(非秀型木) 차대(次代)와 비교(比較)하여 57%의 재적(材積) 증가(增加)를 보였다. 17가계(家係)중 우수(優秀)한 세 가계(家係)를 재선발(再選拔)한다면 배이상(倍以上)의 재적 증가가 기대되었다. 15년생(年生) 리기테다소나무는 전북(全北) 완주(完州)에서 리기다소나무보다 배이상(倍以上)의 재적 생장을 하였다. 그러나 이 잡종(雜種)의 우수성(優秀性)은 북(北)쪽으로 올라 갈수록 감소(減少)하였는데 주로 내한성(耐寒性)이 약(弱)한 탓으로 생각된다. 경기(京畿) 용인(龍仁)의 평지(平地)에서는 리기테다소나무가 리기다소나무보다 생장(生長)이 훨씬 좋았으나 산정(山頂)에서는 리기다소나무보다 생장(生長)이 떨어졌다. 현사시는 10년생때 식재장소(殖栽場所)에 따라 양친수종(兩親樹種)보다 2~2.5배(倍)의 생장(生長)을 보였다. 도입(導入)된 리기다소나무도 재적(材積) 생장(生長) 증가(增加)를 보였다. 45개(個) 산지(産地)에서 도입(導入)한 12년생(年生) 리기다소나무중에서 우수한 다섯 산지(産地)를 선발(選拔)하면 국내(國內)에서 선발(選拔)한 수형목(秀型木) 차대(次代)보다 53%의 재적(材積) 증가(增加)가 기대되었다. 선발(選拔)된 다섯 산지(産地) 각각에서 최상(最上)의 가계(家係)를 (산지(産地)당 5가계(家係)로 조성되었음) 재선발(再選拔)한다면 다시 14%의 재적(材積) 증가(增加)가 기대된다. 연간 밤 생산(生産)은 칠만톤에 달하는데, 이것은 밤나무 순혹벌에 내충성(耐虫性) 품종(品種)을 심은 덕으로 생각된다. 비내충성(非耐虫性)인 재래종(在來種) 품종(品種)은 이 곤충(昆虫)에 의해 거의 전멸(全滅)하였기 때문이다. 콜키신처리(處理)에 의(依)한 배수체(倍數體) 및 돌연변이체(突然變異體)가 생산(生産)된 수종(樹種)은 10여 수종(樹種)에 이르나 경제적으로 중요한 수종은 없다. 장차 획기적인 생산성(生産性) 증가(增加)가 생물공학(生物工學)에 의하여 기대되는데 생물공학(生物工學)은 세포(細胞), 세포(細胞) 소기관(小器管), 유전자(遺傳子) 단위에서 선발(選拔), 교잡(交雜), 외래(外來) 유전자(遺傳子) 도입(導入)이 가능하고, 유전자조작(遺傳子操作)까지 가능하기 때문이다. 그러나 현재로는 유전적 우수성이 입증된 조림 수종을 조직배양(組織培養)으로 대량번식(大量繁殖)시킴으로써 생산성(生産性) 증가(增加)에 기여할 것이다.

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