• 한국환경생태학회지
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• 제25권3호
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• pp.318-326
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• 2011

섬진강 중 상류 수계에서 붕어의 자원량 및 자원관리의 기초로 사용되는 붕어의 개체군 생태학적 특성치를 추정하고자 하였다. 채집된 붕어의 전장은 95-288mm의 범위를 보였으며, 연령은 비늘의 윤문을 통해 결정하였다. 연령형질로서 비늘은 윤문이 뚜렷하게 구분되었으며, 이를 통해 확인된 최고 연령어는 5세로 나타났다. 전체 표본에서 2세 연령어가 가장 많은 양을 차지하였으며(n=38), 다음으로는 3세 연령어가 풍부하였다(n=22). 연변수지수 분석을 통해 매년 단일 윤문이 형성됨이 확인되었다. 체장과 체중 간의 관계식은 BW = $0.0038BL^{3.73}$($R^2$=0.96) (p<0.01)로 추정되었고, 인경과 체장 간의 관계식은 BL = 2.362R+2.76($R^2$=0.89)로 나타났다. 비선형 회귀분석을 통해 추정된 von Bertalanffy 성장 파라미터들은 이론적 최대체장 33.2cm이었으며, 이론적 최대체중 1,798.4g, 성장계수 0.20년$^{-1}$, 체장이 0일 때의 연령 -0.51년 등으로 추정되었다. von Bertalanffy에 의한 붕어의 성장식은 $L_t$ = 33.23($1-e-^{0.20(t+0.51)}$)($R^2$=0.98)로 확인되었다. 연간 생존율은 0.427년$^{-1}$로, 순간자연사망계수는 0.784년$^{-1}$로 추정되었으며, 순간어획사망계수는 0.067년$^{-1}$로 산출되었다. 생존율로부터 추정된 순간전사망계수는 0.851년$^{-1}$로 추정되었다.

• 대한환경공학회지
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• 제29권8호
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• pp.895-903
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• 2007

매립지를 직접 생태학적으로 모니터링하는 방법을 개발하고자, 매립지 내의 생화학적 반응에 관여하는 세균들과 효소의 양을 정량함과 동시에 지하수 수질인자와 상호 연관성을 조사하여 생태학적 인자와의 연계 이용 가능성을 평가하였다. 이를 위하여 4개의 매립 종료된 비위생 매립지(천안(C), 원주(W), 논산(N), 평택(P) 매립지)에서 계절별로 지하수 시료를 채취하였으며 동시에 16S rDNA 방법을 사용하여 미생물 다양성을 분석하였다. 이를 기반으로, 매립지에서 주로 발견되는 세균과 효소를 대표하는 유전자를 정량하기 위한 특이 프라이머 쌍을 제작하였으며 상관계수에 기초하여 수질인자와 유전자 지표 인자간의 정량적 관련성을 비교하였다. 그 결과 DSR(황환원 세균) gene과 BOD(생화학적 산소요구량)사이의 상관관계는 0.8 이상인데 반해 NSR(질산화 세균-Nitrospira sp.) gene과 질산성 질소는 0.9 이상이었다. 안정화지표(BOD/COD)와 MTOT(메탄 산화 세균), MCR(Methyl coenzyme M reductase), Dde(Dechloromonas denitrificans) gene들은 0.8 이상의 상관관계를 가졌으나 3가 철과 Fli(Ferribacterium limineticm) gene은 0.7로 낮았다. MTOT gene의 경우, BOD/COD과의 관련성이 100%에 가깝게 높았다. 또한, 혐기성 유전자들(nirS-아질산 환훤효소, MCR, Dde, DSR)과 DO 역시 0.8 이상으로 나타나 일반적인 매립지 혐기성 반응들이 DO에 크게 의존함을 보였다. 결론적으로 분자생물학적 조사와 수질인자가 높은 상호연관성이 있었으며 real-time PCR이 전통적인 모니터링 인자들과 동시에 상호 보완적으로 모니터링에 사용됨으로써 매립지안정화 및 주변 영향을 평가하는데 효율적으로 사용 될 수 있음을 알 수 있었다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제45권6호
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• pp.891-900
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• 2003

c-fos 유전자는 전사조절인자로서 주로 c-jun family와 결합하여 heterodimers를 형성하며 AP-1 조절 부위를 가지는 유전자들의 전사를 조절하는 것으로 알려져 있다. 이 유전자의 발현은 myoblasts를 비롯한 여러 세포의 분화와 성장을 조절하며 최근 돼지에서 육질에 영향을 미치는 근섬유와 관련된다는 보고가 있다. 본 연구는 소에서 육질과 c-fos 유전자와의 관계를 알아보기 위한 기초자료로서 총 1,443 bp의 mRNA 염기서열을 최초로 소에서 밝혔으며 여러 조직과 기관에서의 발현양상도 살펴보았다. 한우의 c-fos 유전자의 염기서열을 사람, 돼지 및 쥐와 비교하여 본 결과 각각 89.8%, 93.5%와 87.0%의 높은 상동성을 보였다. 이 유전자의 발현은 근육중 갈비에서 가장 많은 발현량을 보였고, 조직에서는 비장에서 가장 많은 발현량을 보이는 것을 알 수 있었다. 이 연구에서 밝혀진 c-fos 유전자는 SNP의 추가분석에 의해 한우에서 육질의 향상과 관련이 있는 후보유전자로 쓰일 수 있을 것으로 사료된다.

• Journal of Biosystems Engineering
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• 제28권4호
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• pp.343-350
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• 2003

This study was conducted to find out the coefficient relationships between intensity values of image processing and biological/physical parameters of soil in greenhouses. Soil images were obtained by an image processing system consisting of a personal computer and a CCD earners. A software written in Visual C$\^$++/ systematically integrated the functions of image capture, image processing, and image analysis. Image processing data of the soil samples were analyzed by the method of regression analysis. The results are as follows. For detecting soil density of unbroken soil samples, the highest correlation coefficients of 0.82 and 0.84, respectively were obtained fur R-value and S-value among image processing data while it was 0.97 for G-value. Considering the relationship between biological characteristics and image processing data of soil in greenhouse, the correlation was found generally low. For pH of unbroken soil sample, the correlation coefficients were found 0.87, 0.85, and 0.94, respectively with G, I, and H values of image processing data. In the case of bacteria, any correlation was not found with the image processing data For Actinomyctes, they were 0.86 and 0.85, respectively with G-value and B-value of image processing data showing high correlation coefficient compared to the other variables. The correlation coefficient between Fungi and H-value was shown 0.88, the highest among the variables higher than 0.8 while the other variables showed low correlation. For broken soil samples from greenhouse, the relation between biological parameter and image processing data were rarely shown in this study. The results of this study indicated that most of correlation coefficient between the variables were usually lower than 0.01. Accordingly, it was assumed that the soil should be used without broken to fairly estimate biological characteristics using CCD camera.

• 한국조경학회지
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• 제14권2호
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• pp.81-90
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• 1986

공원 이요자수의 변동에 대한 구체적인 파악은 $\ulcorner$레크레이션$\lrcorner$ 수요적 측면엣 공원의 계획 및 관리에 가장 중요한 지표가 된다. 본 연구는 서울 어린이 대공원을 대상으로 1일 이용자수의 변동에 관계하는 요인들을 구체적으로 분석함으로써 관련변수의 종류 및 상대적 영향력 등을 계략적으로 규명하고자 하였다. 본 연구의 주요결과는 다음과 같다. 1) 월별 이용자수의 최대집중원은 5월이었으며 4월, 8월, 10월의 순이었는데, 이 기간들은 본 공원의 주이용자인 어린이들의 소풍 및 방학기간으로 특정지원다. 2) 상관분석 결과, 이용자수와의 상관관계는 요일, 월 평균온도, 월특성(소풍기간 여부)의 순으로 높게 나타났다. 3) 비계량적(nonmetric)인 변수들의 영향력을 계량적으로 비교분석하기 위한 다원변람분석의 결과, 본 공원은 기존연구에서와는 달리 계절에 의한 구분보다도 월특성(소풍기간, 방학기간 등)으로 $\ulcorner$카테고리$\lrcorner$화 하는 것이 바람직하게 나타났으며, 날씨보다도 요일에 의해 더 큰 영향을 받는 것이 확인되었다. 4) 중외귀분석의 결과, 이용자수는 요일, 월평균기온, 날씨, 월특성 (방학기간여부), 월간일조시간등의 독립변수에 의한 함수관계로 나타났으며, $\ulcorner$더미$\lrcorner$ 변수들로만 분석한 경우에는 휴일, 소풍기간, 날씨의 맑음여부 등의 순으로 영향력이 크게 나타났다. 5) 이와 같은 이용자수의 변동에 관계하는 요인들에 대한 분석작업이 모든 공원에 대해 이루어짐으로써 주요변수별 유형화가 가능하다. 따라서 이러한 분석작업들은 보다 구체적인 이용행태의 파악과 더불어 공원의 계획 및 관리등에서 기초적인 근거로써 활용될 수 있어야 할 것이다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제47권4호
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• pp.498-508
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• 2019

Bacillus species were isolated from iru, a traditional fermented condiment in Nigeria. Polyphasic approach was used to evaluate the phylogenetic relationship and strain sub-type of the isolated species. Additionally, the phylogenetic profiles of the species isolated from iru were compared with those of bacilli isolated from different continents. The phylogenetic diversity analysis was performed using the combination of 16S rRNA gene sequencing, ITS-PCR, ITS-PCR-RFLP, and M13 RAPD-PCR. The analysis revealed that Bacillus subtilis U170B and B. subtilis U146A isolated from iru were the closest relatives of strains belonging to the phylogeny of B. subtilis sensu stricto and were related to other bacilli isolated from different continents that had functional benefits. The two isolated species exhibited resistance to acidic pH (pH 2.0). The survival rates of B. subtilis U170B, B. subtilis U146A, and B. clausii UBBC-07 (commercial probiotic strain) cultured at pH 2.0 for 3 h were 33.45, 12.44, and 9.53%, respectively. The strains were highly tolerant to bile salts [0.3% (w/v)]. B. subtilis U170B exhibited the highest cell viability (43.45%) when cultured for 3 h in the presence of bile salts, followed by B. subtilis U146A (25%) and B. clausii UBBC-07 (18.94%). B. subtilis U170B and B. subtilis U146A did not exhibit haemolytic activity and were susceptible to different antibiotics. Additionally, these two strains exhibited weak antagonistic activity against B. cereus. The diverse wild strains of B. subtilis can be used as a safe multifunctional starter culture for the industrial production of condiments with health benefits.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제22권1호
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• pp.34-45
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• 2012

A thermophilic Bacillus stearothermophilus F1 produces an extremely thermostable serine protease. The F1 protease sequence was used to predict its three-dimensional (3D) structure to provide better insights into the relationship between the protein structure and biological function and to identify opportunities for protein engineering. The final model was evaluated to ensure its accuracy using three independent methods: Procheck, Verify3D, and Errat. The predicted 3D structure of F1 protease was compared with the crystal structure of serine proteases from mesophilic bacteria and archaea, and led to the identification of features that were related to protein stabilization. Higher thermostability correlated with an increased number of residues that were involved in ion pairs or networks of ion pairs. Therefore, the mutants W200R and D58S were designed using site-directed mutagenesis to investigate F1 protease stability. The effects of addition and disruption of ion pair networks on the activity and various stabilities of mutant F1 proteases were compared with those of the wild-type F1 protease.

• 환경생물
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• 제29권1호
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• pp.52-60
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• 2011

식물과 그 식물의 근권미생물과의 협력관계는 이미 오래전부터 관심을 받아왔고 지구 기후변화에 따라 식물과 그 근권미생물의 생태 및 지구환경에 대한 적응성은 막대한 지장을 받을 것으로 생각되어 왔다. 따라서 지구온난화에 따라 식물뿌리에 서식하는 근권미생물인 토양미 생물의 우점종이 어떻게 변화하는지에 대해 규명하고자 본 실험을 실시하였다. 우선 한국 식물생태계의 대표종인 소나무 (A), 잣나무 (B), 상수리나무 (C), 오리나무 (D) 를 선발하여 각각 실온인 $27^{\circ}C$와 $29^{\circ}C$(실온$+2^{\circ}C$), $31^{\circ}C$(실온$+4^{\circ}C$), $33^{\circ}C$(실온$+6^{\circ}C$)에서 1년 이상 성장시킨 후 이들의 뿌리토양을 무균적으로 채취하여 미생물 screening법과 colony counting을 통하여 각각의 군에서 우점종을 선별한 뒤 16S rRNA 분석에 의해 이들 각각의 우점종을 동정하였다. 그 결과 소나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus와 Enterobacter sp. CCBAU 15492, 소나무 $29^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. 210_64와 Enterobacter sp. CCBAU 15492, 소나무 $31^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. 210_64와 Enterobacter ludwigii, 소나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. 210_64와 Enterobacter sp. CCBAU 15492, Bacillus marisflavistrain DS6이 검출되었고, 잣나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus Q1, Pseudomonas sp. PR1-3, Arthrobacter woluwensisstrain CBU05/5295, 잣나무 $29^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. G3, Pseudomonas sp. PR1-3, Bacillus sp. 210_24, 잣나무 $31^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus Q1, Pseudomonas sp. PR1-3, 잣나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus coagulans strain, Pseudomo-Dominant-species Change of Soil Microbes 59 nas sp. PR1-3, Chryseobacterium sp. COLI2, 상수리나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus strain B1, Pseudomonas putida strain W30, Arthrobacter woluwensis strain CBU05/5295, 상수리나무 $29^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus strain CICC10185, Pseudomonas putida strain W30, 상수리나무 $31^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus strain CG-T2, Pseudomonas sp. W15Feb9B, 상수리나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. CCBAU 51490, Arthrobacter woluwensis strain CBU05/5295, 오리나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. B18, Pseudomonas sp. PD 16, Enterobacter sp. CCBAU 15492, 오리나무 $29^{\circ}C$에서는 Rhodococcus erythropolis PR4, 오리나무 $31^{\circ}C$에서는 Enterobacter cloacae, Pseudomonas sp. PD 16, 오리나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus subtilis strain SYH15, Pseudomonas sp. PD16을 우점종으로 동정하였다. 이 중 소나무는 $33^{\circ}C$에서 Bacillus marisflavi strain DS6가 $27{\sim}31^{\circ}C$에서는 발견되지 않다가 온도가 상승함에 따라 출현한 새로운 우점종으로 나타났고 잣나무에서는 $27^{\circ}C$에서 Bacillus cereus Q1, $29^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. G3, $31^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus Q1 등의 Bacillus속이 주요 우점종으로 나타났으나 온도가 가장 많이 상승한 $33^{\circ}C$에서는 Chryseobacterium sp. COLI2으로 우점종이 변한 것을 확인하였다. 본 실험은 차후 더 다양한 온도에서의 토양미생물 우점종 변화에 대한 연구가 진행되어야 할 것으로 사료되며 이들 연구결과들이 연계되어 지구온난화와 미생물의 관계, 그리고 새롭게 출현한 토양미생물과 식물간의 관계를 규명하는데 도움이 되는 데이터가 도출 될 것으로 기대된다.

• Journal of Nutrition and Health
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• 제31권9호
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• pp.1446-1456
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• 1998

Bones are important parts in sustaining the shape of the body, but they are also metabolic organs which undergo bone remodeling by constant bone resorption and formation. Osteoporosis, the typical metabolic bone disease, is characterized by a reduction in bone mineral density (BMD). Women more than men are at risk fir osteoporosis-related fractures, especially in the lumbar spine, wrist, and hip region. Risk of fracture depends on one's BMD, which open determined by the peak bone mass value achieved at skeletal maturity and followed by subsequent age-and menopause-related bone loss. Genetic and environmental factors are known to play a key role in bone metabolism and diet is considered as one of the important environmental factors. The purpose of the present study was to assess the status of BMD and bone mineral content(BMC) to clarify the relationships between dietary intakes and the risk of osteoporosis in adult women in Taegu. Subjects were 130 healthy females in between 20 and 69 years of age. BMD and BMC of the lumbar spine(venebrae L2-4) of the subjects were measured by dual energy X-ray absorptiometry. The average age of the subjects was 47.4${\pm}$11.7 years old, the average weight was 57.2${\pm}$8.4kg, the average age of menarche was 16.6${\pm}$1.9 years old and the average age of menopause was 48.4${\pm}$5.3 years old. The nutrient intakes of the subjects measured by the convenient method were generally lower than the level of RDA. The result of nutrient intake assessed has shown that the average energy intake was 1701${\pm}$316kca1 which is 85.1% of the RDA and the average calcium intake was 485.4${\pm}$172.3mg which is 69.3% of the RDA. The intakes of protein, vitamin A, vitamin B$_1$, niacin were greater than the RDA, whereas the remaining nutrient intakes were lower than the RDA. The average BMD of the subjects was shown to be 1.06${\pm}$1.09g/$\textrm{cm}^2$. The highest BMD of 1.24${\pm}$0.14g/$\textrm{cm}^2$ was noticed in the subjects of 30s compared to 20s, 40s, 50s, 60s. The BMD values were compared by the relative body weight(R3W) of the menopause subjects, and it was found that the underweight group had significant lower BMB while the rest of the groups did not have any differences in BMD. The most strongly correlated nutrient with BMD among the menopause subjects appeared to be calcium. The women whose Ca intakes were higher than 500mg showed the significantly higher BMD than those with Ca intakes lower than 500mg. This study suggests that the most effective way to prevent osteoporosis and to reduce the incidences of fractures seems to be minimizing bone loss through the adequate intake of calcium as well as avoiding underweight, especially in menopausal women. (Korean J Nutrition 31(9) . 1446-1456, 1998)

• 한국어류학회지
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• 제21권1호
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• pp.7-14
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• 2009

강도다리의 수온과 체중에 따른 대사 반응을 조사하기 위해 절식한 자어(습중량, $1.5{\pm}0.4g$, 540마리)와 대형어 ($37.4{\pm}2.3g$, 90마리)를 대상으로 여섯 가지 수온(4, 7, 10, 13, 16 그리고 $19^{\circ}C$)에 따라 유수식 형태의 호흡실을 이용하여 24시간 동안 5분 간격(3반복)으로 산소 소비율(oxygen consumption rate, OCR)을 측정하였다. 수온과 체중 그리고 두 인자의 상호작용 모두가 강도다리의 산소 소비율에 유의한 영향을 미쳤다(p<0.001). 수온 상승에 따라 강도다리 자어와 치어의 산소 소비율은 모두 유의적으로 증가하였다(p<0.001). 수온 4, 7, 10, 13, 16 그리고 $19^{\circ}C$에서의 시간당 평균 산소 소비율은 자어의 경우 각각 1386.0, 1601.7, 1741.0, 1799.2, 2239.1 그리고 $2520.3mg\;O_2\;kg\;fish^{-1}\;h^{-1}$이었고, 치어의 경우 각각 83.8, 111.4, 126.3, 147.1, 187.7 그리고 $221.3mg\;O_2\;kg\;fish^{-1}\;h^{-1}$이었다. 실험 수온 조건에서 체중 증가에 따라 산소 소비율은 유의하게 감소하였다(p<0.001). 강도다리의 산소 소비율에 미치는 수온(T)과 체중(W)의 상관관계는 OCR=1520.91+40.85T-49.22W ($r^2=0.95$, p<0.001)이었다. 대사 작용에 의한 에너지 손실은 수온 증가와 체중 감소에 따라 증가하였다(p<0.001). 수온 4, 7, 10, 13, 16 그리고 $19^{\circ}C$에서 일간 평균 에너지 손실은 자어의 경우 각각 907.9, 1046.5, 1141.6, 1177.0, 1467.3 그리고 $1650.1kJ\;kg\;fish^{-1}\;d^{-1}$이었고, 치어의 경우 각각 54.8, 73.0, 82.9, 96.2, 122.9 그리고 $144.6kJ\;kg\;fish^{-1}\;d^{-1}$이었다. $Q_{10}$ 값은 $4{\sim}7^{\circ}C$, $7{\sim}10^{\circ}C$, $10{\sim}13^{\circ}C$, $13{\sim}16^{\circ}C$ 그리고 $16{\sim}19^{\circ}C$ 구간에서 자어의 경우 각각 1.62, 1.32, 1.12, 2.07 그리고 1.48이었고, 치어의 경우 2.59, 1.52, 1.67, 2.25 그리고 1.73이었다.