We investigated differences in ventricular and hippocampal volumes between CSF tap test (CSFTT) responders and non-responders in idiopathic normal-pressure hydrocephalus (INPH) patients and compared these parameters in INPH patients with that of age- and gender-matched healthy controls. We also evaluated relationships between ventricular and hippocampal volumes and clinical profiles in INPH patients. We enrolled 48 patients with INPH and 29 healthy controls. Ventricular and hippocampal volumes were measured on MRI, including 3-dimensional volumetric images. INPH patients, when compared to healthy controls, had significantly larger ventricular and smaller hippocampal volumes. No difference in ventricular and hippocampal volumes was found between CSFTT responders and non-responders in INPH patients. And hippocampal volumes showed significant negative correlations with Clinical Dementia Rating Scale scores, INPH grading scale cognitive scores, Timed Up and Go Test scores, and Unified Parkinson's Disease Rating Scale motor scores in INPH patients. Volumetric assessment of ventricular and hippocampal regions may have no predictive value in differentiating between CSFTT responders and non-responders in INPH patients. Our findings may help us understand the potential pathophysiology of unique symptoms associated with INPH.
목적: 본 논문은 마코브 랜덤필드(Markov Random Field)와 깁스 랜덤필드(Gibbs Random Field) 및 라인모델(LIne Model)에 기반한 3차원 자기공명영상의 분류 방법을 소개하고자 하였다. 대상 및 방법 : 통계적으로 이질적 성분들로 구성된 영상을 대상으로한 깁스분류 결과는 영상내의 국소적으로 정적인 영역들을 이웃화소 시스템 내에서 정의되는 상호작용 인자(inetraction parameter)의 메커니즘에 의해 분리하\ulcorner로서 개선시킬 수 있다. 이를 위하여 영상에서 라인모델의 생성을 고려할 수 있으며, 본 논문에서는 영상의 미분방법에 근거한 다중신호영상을 위한 라인모델을 구축하였다. 라인모델은 서로 상이한 통게적 특성을 갖는 영역사이에 존재하는 관측할 수 없는 라인필드의 존재 유무를 확률 값으로 제공한다. 영상으로부터 획득한 라이모델은 Gibbs 분류기의 에너지함수 값을 결정하는 상호작용 인자 값을 결정하는데 사용된다. 결과 : 3차원 자기공명영상의 분류를 위한 MRS-Gibbs 분류기는 영상분류의 도메인이 일반적인 이차원 영상의 $E^{2}$ 공간에서 $E^{3}$ 공간으로 확장되었다. 개발된 깁스분류기를 이용한 자기공명여상의 분류결과 기존의 context free 분류방법에 의한 결과에 비하여 특히 동일성질을 갖고 있는 영역 및 경계부분 등의 분류결과가 우수함을 알 수 있었다. 결론 : 본 논문에서는 다중 신호, 3차원 자기공명영상을 위한 라인모델을 구축하고 그로부터 MRF-Gibbs분류기의 에너지함수를 결정하기 위한 상호작용 인자를 유도하였다.
Jeewon Suh;Young Ho Park;Hang-Rai Kim;Jae-Won Jang;SangHak Yi;Min Ju Kang;Yun Jung Bae;Byung Se Choi ;Jae Hyoung Kim;SangYun Kim
대한치매학회지
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제23권2호
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pp.89-94
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2024
Background and Purpose: This study aimed to evaluate the brain magnetic resonance imaging (MRI) of patients with acute transient global amnesia (TGA) using volumetric analysis to verify whether the brains of TGA patients have pre-existing structural abnormalities. Methods: We evaluated the brain MRI data from 87 TGA patients and 20 age- and sex- matched control subjects. We included brain MRIs obtained from TGA patients within 72 hours of symptom onset to verify the pre-existence of structural change. For voxel-based morphometric analyses, statistical parametric mapping was employed to analyze the structural differences between patients with TGA and control subjects. Results: TGA patients exhibited significant volume reductions in the bilateral ventral anterior cingulate cortices (corrected p<0.05). Conclusions: TGA patients might have pre-existing structural changes in bilateral ventral anterior cingulate cortices prior to TGA attacks.
자기 공명 영상(MRI)은 인간의 신경계 장애에서 뇌 구조의 변화를 검사하는 중요한 기술이다. 뇌 발달은 매우 복잡한 과정이며, 신경 생성과 유전자 프로그램의 영향을 받게 된다. 나이가 들어감에 따라 뇌의 다양한 구조 영역이 변화하면서 뇌 질환 형성에 기여하게 되며, 건강한 뇌의 발달에 영향을 미치는 다양한 변수 중 성별은 가장 큰 영향을 주는 요인 중 하나이다. 영상 데이터는 FSL(FMRIB software library)에서 제공하는 SIENAX, FIRST, 정점분석(Vertex Analysis)과 같은 다양한 프로그램을 통해 분석이 수행되었다. 우리의 결과는 특정 연령대의 피질하부영역에서 유의한 성별 관련 차이가 관찰되었음을 보여주고 있다. 성별과 볼륨간의 이러한 변화 정도 차이의 크기는 조사 된 영역에 따라 다르게 나타나고 있다. 이 연구에서 우리는 각 성별간 피질하부영역의 구조 분석을 위해 고해상도 3T MRI를 사용하였다. 또한, 정점 분석은 각 성별간의 피질 구조에서 체적 차이를 시각화하는데 사용되었다. 이 연구는 70대 그룹으로 제한되어 있으며, 향후 더 넓은 연령대를 대상으로 추가 연구가 필요하다.
Objective: To investigate the relationship between 18F-FDG PET/CT semi-quantitative parameters and the International Association for the Study of Lung Cancer, American Thoracic Society/European Respiratory Society (IASLC/ATS/ERS) histopathologic classification, including histological subtypes, proliferation activity, and somatic mutations. Materials and Methods: This retrospective study included 419 patients (150 males, 269 females; median age, 59.0 years; age range, 23.0-84.0 years) who had undergone surgical removal of stage IA-IIIA lung adenocarcinoma and had preoperative PET/CT data of lung tumors. The maximum standardized uptake values (SUVmax), background-subtracted volume (BSV), and background-subtracted lesion activity (BSL) derived from PET/CT were measured. The IASLC/ATS/ERS subtypes, Ki67 score, and epidermal growth factor/anaplastic lymphoma kinase (EGFR/ALK) mutation status were evaluated. The PET/CT semi-quantitative parameters were compared between the tumor subtypes using the Mann-Whitney U test or the Kruskal-Wallis test. The optimum cutoff values of the PET/CT semi-quantitative parameters for distinguishing the IASLC/ATS/ERS subtypes were calculated using receiver operating characteristic curve analysis. The correlation between the PET/CT semi-quantitative parameters and pathological parameters was analyzed using Spearman's correlation. Statistical significance was set at p < 0.05. Results: SUVmax, BSV, and BSL values were significantly higher in invasive adenocarcinoma (IA) than in minimally IA (MIA), and the values were higher in MIA than in adenocarcinoma in situ (AIS) (all p < 0.05). Remarkably, an SUVmax of 0.90 and a BSL of 3.62 were shown to be the optimal cutoff values for differentiating MIA from AIS, manifesting as pure ground-glass nodules with 100% sensitivity and specificity. Metabolic-volumetric parameters (BSV and BSL) were better potential independent factors than metabolic parameters (SUVmax) in differentiating growth patterns. SUVmax and BSL, rather than BSV, were strongly or moderately correlated with Ki67 in most subtypes, except for the micropapillary and solid predominant groups. PET/CT parameters were not correlated with EGFR/ALK mutation status. Conclusion: As noninvasive surrogates, preoperative PET/CT semi-quantitative parameters could imply IASLC/ATS/ERS subtypes and Ki67 index and thus may contribute to improved management of precise surgery and postoperative adjuvant therapy.
Convolutional Neural Networks (CNNs) have recently been gaining popularity in the medical image analysis field because of their image segmentation capabilities. In this paper, we present a CNN that performs automated brain tumor segmentations of sparsely annotated 3D Magnetic Resonance Imaging (MRI) scans. Our CNN is based on 3D U-net architecture, and it includes separate Dilated and Depth-wise Convolutions. It is fully-trained on the BraTS 2018 data set, and it produces more accurate results even when compared to the winners of the BraTS 2017 competition despite having a significantly smaller amount of parameters.
Kim, Ju Ho;Choi, Dae Seob;Kim, Seong-hu;Shin, Hwa Seon;Seo, Hyemin;Choi, Ho Cheol;Son, Seungnam;Tae, Woo Suk;Kim, Sam Soo
Investigative Magnetic Resonance Imaging
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제19권2호
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pp.67-75
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2015
Purpose: To investigate the value of image post-processing software (FreeSurfer, IBASPM [individual brain atlases using statistical parametric mapping software]) and inversion time (TI) in volumetric analyses of the hippocampus and to identify differences in comparison with manual tracing. Materials and Methods: Brain images from 12 normal adults were acquired using magnetization prepared rapid acquisition gradient echo (MPRAGE) with a slice thickness of 1.3 mm and TI of 800, 900, 1000, and 1100 ms. Hippocampal volumes were measured using FreeSurfer, IBASPM and manual tracing. Statistical differences were examined using correlation analyses accounting for spatial interpretations percent volume overlap and percent volume difference. Results: FreeSurfer revealed a maximum percent volume overlap and maximum percent volume difference at TI = 800 ms ($77.1{\pm}2.9%$) and TI = 1100 ms ($13.1{\pm}2.1%$), respectively. The respective values for IBASPM were TI = 1100 ms ($55.3{\pm}9.1%$) and TI = 800 ms ($43.1{\pm}10.7%$). FreeSurfer presented a higher correlation than IBASPM but it was not statistically significant. Conclusion: FreeSurfer performed better in volumetric determination than IBASPM. Given the subjective nature of manual tracing, automated image acquisition and analysis image is accurate and preferable.
Objective : In this study, we aimed to investigate the underlying ethiological factors in chiari malformation (CM) type-I (CMI) via performing volumetric and morphometric length-angle measurements. Methods : A total of 66 individuals [33 patients (20-65 years) with CMI and 33 control subjects] were included in this study. In sagittal MR images, tonsillar herniation length and concurrent anomalies were evaluated. Supratentorial, infratentorial, and total intracranial volumes were measured using Cavalieri method. Various cranial distances and angles were used to evaluate the platybasia and posterior cranial fossa (PCF) development. Results : Tonsillar herniation length was measured $9.09{\pm}3.39mm$ below foramen magnum in CM group. Tonsillar herniation/concurrent syringomyelia, concavity/defect of clivus, herniation of bulbus and fourth ventricle, basilar invagination and craniovertebral junction abnormality rates were 30.3, 27, 18, 2, 3, and 3 percent, respectively. Absence of cisterna magna was encountered in 87.9% of the patients. Total, IT and ST volumes and distance between Chamberlain line and tip of dens axis, Klaus index, clivus length, distance between internal occipital protuberance and opisthion were significantly decreased in patient group. Also in patient group, it was found that Welcher basal angle/Boogard angle increased and tentorial slope angle decreased. Conclusion : Mean cranial volume and length-angle measurement values significantly decreased and there was a congenital abnormality association in nearly 81.5 percent of the CM cases. As a result, it was concluded that CM ethiology can be attributed to multifactorial causes. Moreover, congenital defects can also give rise to this condition.
$^{18}F$-fludeoxyglucose PET (FDG-PET) can help finding an abnormal metabolic activity in brain. In this study, we evaluated an efficiency of volume- and cortical surface-based analysis which were used to determine whether standardized uptake value ratio (SUVR) of FDG-PET was different among Alzheimer's disease (AD), mild cognitive impairment (MCI), and healthy control (HC). Each PET image was rigidly co-registered to the corresponding magnetic resonance imaging (MRI) using mutual information. All voxels of the co-registered PET images were divided by the mean FDG uptake of the cerebellum cortex which was thresholded by partial volume effect (>0.9). Also, the SUVR value of each vertex was linearly interpolated from volumetric SUVR image which was thresholded by gray matter partial volume effect (>0.1). Lobar mean values were calculated from both volume- and cortical surface-based SUVRs. Statistical analysis was conducted to compare two measures for AD, MCI and HC groups. Even though the results of volume (SUVR_vol) and cortical surface-based SUVR (SUVR_surf) analysis were not significantly different from each other, the latter would be better for detecting group differences in SUVR of PET.
Bae, Seon Yong;Park, Chul-Kee;Kim, Tae Min;Park, Sung-Hye;Kim, Il Han;Choi, Seung Hong
Investigative Magnetic Resonance Imaging
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제19권4호
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pp.218-223
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2015
Purpose: To investigate whether volumetric analysis based on T2WI and contrast-enhanced (CE) T1WI can distinguish between isocitrate dehydrogenase-1 mutation-positive ($IDH1^P$) and -negative ($IDH1^N$) glioblastomas (GBMs). Materials and Methods: We retrospectively enrolled 109 patients with histopathologically proven GBMs after surgery or stereotactic biopsy and preoperative MR imaging. We measured the whole-tumor volume in each patient using a semiautomatic segmentation method based on both T2WI and CE T1WI. We compared the tumor volumes between $IDH1^P$ (n = 12) and $IDH1^N$ (n = 97) GBMs using an unpaired t-test. In addition, we performed receiver operating characteristic (ROC) analysis for the differentiation of $IDH1^P$ and $IDH1^N$ GBMs using the tumor volumes based on T2WI and CE T1WI. Results: The mean tumor volume based on T2WI was larger for $IDH1^P$ GBMs than $IDH1^N$ GBMs ($108.8{\pm}68.1$ and $59.3{\pm}37.3mm^3$, respectively, P = 0.0002). In addition, $IDH1^P$ GBMs had a larger tumor volume on CE T1WI than did $IDH1^N$ tumors ($49.00{\pm}40.14$ and $22.53{\pm}17.51mm^3$, respectively, P < 0.0001). ROC analysis revealed that the tumor volume based on T2WI could distinguish $IDH1^P$ from $IDH1^N$ with a cutoff value of 90.25 (P < 0.05): 7 of 12 $IDH1^P$ (58.3%) and 79 of 97 $IDH1^N$ (81.4%). Conclusion: Volumetric analysis of T2WI and CE T1WI could enable $IDH1^P$ GBMs to be distinguished from $IDH1^N$ GBMs. We assumed that secondary GBMs with $IDH1^P$ underwent stepwise progression and were more infiltrative than those with $IDH1^N$, which might have resulted in the differences in tumor volume.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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