• 제목/요약/키워드: Virus isolation

검색결과 225건 처리시간 0.122초

HIV Integrase Inhibitory Activity of Agastache regosa

  • Kim, Hye-Kyung;Lee, Hyeong-Kyu;Shin, Cha-Gyun;Huh, Hoon
    • Archives of Pharmacal Research
    • /
    • 제22권5호
    • /
    • pp.520-523
    • /
    • 1999
  • We have been screening anti-HIV integrase compounds from Korean medicinal plants by using an in vitro assay system which is mainly composed of recombinant human immunodeficency virus type 1 integrase and radiolabeled oligonucleotides. From the above screening, the aqueous methanolic extract of the roots of Agastache rugosa exhibited a significant activity. Bioactivity-guided chromatographic fractionation of the methanolic extract resulted in the isolation of rosmarinic acid. The structure of the compound was determined by spectroscopic data and by the comparison with the reported values. The $IC_{50}$ of the rosmarinic acid was approximately $10{\mu}g/ml$ against HIV integrase.

  • PDF

전염성 기관지염의 국내발생 (Outbreaks of Infectious Bronchitis in Korea)

  • 이영옥;김재홍;김재학;모인필;윤희정;최상호;남궁선
    • 대한수의학회지
    • /
    • 제26권2호
    • /
    • pp.277-282
    • /
    • 1986
  • Reduced egg production with depigmented, chalky deposit, wrinkled and malformed eggs was observed in breeder flecks at the end of 1985 and further spread in laying flocks throughout the country. The disease was identified as Infectious Bronchitis based on serological findings and virus isolation.

  • PDF

Streptomyces sp. GCA0001로부터의 신규 항생물질 Cystocin의 구조분석, 생물활성 및 유도체제조 (Structure Analysis, Biological Activity of a Novel Antibiotics, Cystocin, from Streptomyces sp. GCA0001 and Production of its Derivatives)

  • 김자용;이희찬;우진석;송재경
    • 한국산학기술학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국산학기술학회 2001년도 춘계학술대회 발표논문집
    • /
    • pp.295-297
    • /
    • 2001
  • 본 발명의 Puromycin 유도체인 Cystocin 화합물은 유기 합성에 의해 제조된 물질이 아니라 방선균 계열의 신균주인 Streptamyces sp GCA0001로부터 추출된 신규 물질로서, 항박테리아, 항종양 및 항바이러스 활성 등의 생물학적 미생물 활성면에서 종래의 Puromycin 화합물에 비해 현저히 뛰어난 효과를 지니고 있고 Streptomyces sp GCA0001로부터 추출, 분리 및 정제 과정을 통해 제조된 자연의 선택의 과정을 거친 화합물이므로, Puromycin을 대체할 수 있는 획기적인 물질로 볼 수 있다.

국내에서 유행한 Respiratory Syncytial 바이러스의 염기서열 및 계통분석 (Sequence and Phylogenetic Analysis of Respiratory Syncytial Virus Isolated from Korea)

  • 권순영;최영주;김소연;송기준;이용주;최종욱;성인화
    • 대한바이러스학회지
    • /
    • 제26권1호
    • /
    • pp.9-22
    • /
    • 1996
  • Respiratory Syncytial virus (RSV) is an important cause of acute lower respiratory tract infections in human, with infants and young children being particularly susceptible. In the temperate zones, sharp annual outbreaks of RSV occur during the colder months, in both the northern and the southern hemisphere. RSV is unusual in that it can repeatedly reinfect individuals throughout life and infect babies in the presence of maternal antibody. RSV isolates can be divided into two subgroups, A and B, on the basis of their reactions with monoclonal antibodies, and the two subgroups are also distinct at the nucleotide sequence level. The specific diagnosis of RSV infection was best made by isolation of virus in tissue culture, identification of viral antigen, or by specific serologic procedures. Recently, rapid detection of RSV and analysis of RSV strain variation became possible by development of methods of reverse transcription and polymerase chain reaction amplification. In this study, to determine the genetic diversity of RSV found in Korea, 173 bp and 164 bp spanning selected regions of the RSV F and SH genes were enzymatically amplified and sequenced, respectively. Eight for F gene and three for SH gene were detected in 66 nasopharyngeal swap samples tested. Two major antigenic subgroups, A and B were confirmed from Korean samples (seven for subgroup A and one for subgroup B). At the nucleotide level of the F gene region, Korean subgroup A strains showed 95-99% homologies compared to the prototype A2 strain of subgroup A and 93-100% homologies among Korean subgroup A themselves. For the SH gene region, Korean subgroup A strain showed 97.5% homology compared to the prototype A2 strain of subgroup A, and Korean subgroup B strain showed 97% homology compared to the prototype 18537 strain of subgroup B. Most of base changes were transition and occured in codon position 3, which resulted in amino acid conservation. Using the maximum parsimony method, phylogenetic analysis indicated that Korean RSV strains formed a group with other RSV strains isolated from the United States, Canada, the Great Britain and Australia.

  • PDF

C형 간염바이러스(HCV) 유전체를 특이적으로 변형할 수 있는 Trans-Splicing Aptazyme 발굴 (Development of Trans-Splicing Aptazyme Which Can Specifically Modify Hepatitis C Virus Genome)

  • 김주현;이창호;장선영;이성욱
    • 미생물학회지
    • /
    • 제44권3호
    • /
    • pp.186-192
    • /
    • 2008
  • C형 간염바이러스(hepatitis C virus; HCV) 복제를 효과적이며 특이적으로 제어할 수 있는 유전산물을 개발하기 위하여 특정 리간드 존재에 의해 allosteric하게 그 활성이 조절될 수 있는 HCV 유전체 표적 trans-splicing 리보자임(trans-splicing aptazyme)을 발굴하였다. 이러한 trans-splicing aptazyme은 특정 리간드와 특이적으로 결합하는 RNA aptamer 부위, aptamer와 리간드와의 결합에 의해 리보자임 활성을 유도할 수 있도록 구조적 변이를 전달할 수 있는 communication module부위 및 HCV IRES의 +199 nt를 인지하는trans-splicing리보자임 등으로 구성되도록 설계하였다. 특히 trans-splicing 리보자임의 catalytic core의 P6과 P8 부위에 aptamer와 communication module을 삽입하였을 때 가장 allosteric하게 리보자임 활성이 유도되었다. 이러한 리보자임은 리간드가 없거나 대조 리간드가 존재할 때에는 trans-splicing 반응을 유도하지 못하였으나 특정 리간드가 존재할 때에만 효과적이며 특이적으로 trans-splicing 반응을 유도하여 표적 RNA를 변형시킬 수 있음을 관찰하였다. 이러한 aptazyme은 HCV 증식에 대해 특이적이며 효과적인 억제를 위한 선도물질로 이용 가능할 뿐 아니라 HCV 치료선도 물질의 스크리닝용 도구로서도 활용될 수 있을 것이다.

2003-2004 절기 서울지역의 인플루엔자 바이러스 분리 및 아형 분석 (Analysis of Influenza Virus Isolates in Seoul during 2003-2004 Season)

  • 황영옥;이재인;서병태
    • 미생물학회지
    • /
    • 제41권1호
    • /
    • pp.53-59
    • /
    • 2005
  • 인플루엔자바이러스는 거의 매년 겨울철에 유행을 일으키는 급성 호흡기 질환의 주요한 원인 바이러스중의 하나로 막대한 사회 경제적 손실을 가져온다. 본 실험은 2003-2004절기 동안 $38^{\circ}C$이상의 갑작스러운 발열과 더불어 기침 또는 인후통을 보이는 401명의 인플루엔자의사환자(ILI : Influenza-like illness) 검체로부터 124주의 인플루엔자바이러스를 분리하여 형 및 아형 분석과 그에 따른 유행양상을 분석하였다. 인플루엔자 의사환자 연령별 분포를 살펴보면 20-49세의 성인층의 환자수가 $23\%$로 가장 많았으며, 바이러스 분리율은 7-19세의 학령기에서 $50\%$로 가장 높았다. 분리된 인플루엔자바이러스 124주 중 A/H3N2 type는 83주, Type B는 41주였다. 지역별 인플루엔자 의사환자 발생율은 노원구, 서초구, 강남구의 발생율이 타 지역에 비해 비교적 높았으며 바이러스 분리율은 용산구 $66.7\%$, 강남구 $50.0\%$, 노원구 $39.9\%$, 강북구 $36.8\%$ 서초구 $27.8\%$, 동작구 $21.2\%$ 순이었다. 인플루엔자 의사환자의 예방접종현황조사결과 접종을 받았음에도 불구하고 인플루엔자 의사환자로 보고된 경우가 $40\%$였으며, 접종율은 20-49세 성인층이 가장 높았다. 이와 같은 인플루엔자 실험실 표본감시체계 결과의 분석을 통하여 새로운바이러스형 출현을 감시하며, 현행 예방백신의 효과 및 유행양상을 예측하여 국가 인플루엔자 관리대책을 수립하는데 활용하고자 한다.

광주광역시동물보호소 입양 대상 유기견의 호흡기 질병 실태 조사 (A survey of respiratory pathogens in dogs for adoption in Gwangju metropolitan city animal shelter, South Korea)

  • 고바라다;김한나;김효중;오아름;정보람;박재성;이재기;나호명;김용환
    • 한국동물위생학회지
    • /
    • 제43권2호
    • /
    • pp.67-77
    • /
    • 2020
  • Canine infectious respiratory disease (CIRD), also known as infectious tracheobronchitis or kennel cough occurs in a multiple-dog environment such as a shelter. In this study, we were collected 300 of nasal swab samples from dogs and 145 of environmental samples from a shelter to investigate respiratory pathogens of dogs in the Gwangju metropolitan city animal shelter from February to October, 2019. Bacteria cultures for isolation of Bordetella (B.) bronchiseptica and polymerase chain reaction (PCR) tests were performed for detection of eleven canine respiratory pathogens, namely Mycoplasma (M.) cynos, canine distemper virus (CDV), canine influenza virus (CIV), canine parainfluenza virus (CPIV), canine respiratory coronavirus (CRCoV), alpha-coronavirus (CCoV), canine pneumovirus (CnPnV), canine hepacivirus (CHeV), canine adenovirus type 2 (CAdV-2), canine herpesvirus-1 (CHV-1) and canine bocavirus (CBoV). Among 300 nasal swab samples, 148 samples (49.3%) were positive for at least one pathogens. CHV-1 was the most common pathogen, found in 95/300 (31.7%) samples. Subsequently, M. cynos (22.0%), B. bronchiseptica (2.3%), CPIV (2.0%), CBoV (1.7%), CCoV (0.7%) were detected. The detection rates of M. cynos and CHV-1 according to the duration of stay in the shelter were statistically significant. Among environmental samples, M. cynos, CCoV, CBoV and CHV-1 were detected in 45/145 (31.0%). These results indicated the need for disease control and prevention systems in the shelter.

핵산증폭시험을 이용한 혈장분획물질에서 HCV RNA 검출 (A Nucleic Acid Amplification Tests for Reliable HCV RNA Detection Method for Plasma-Derived Products)

  • 홍승희
    • 미생물학회지
    • /
    • 제44권4호
    • /
    • pp.293-298
    • /
    • 2008
  • HCV는 HIV등과 함께 수혈이나 혈장된 획물질을 통하여 감염되는 주요 바이러스이다. 주로 혈액이나 혈장에서 HCV에 대한 항체를 검출함으로서 HCV의 감염을 방지하고 있다. 그러나 바이러스에 감염되었으나 항체가 생성되기 이전이나 항체의 양이 적은 경우에는 HCV의 검출이 어렵다. 따라서 핵산중폭시험(nucleic acid amplification tests, NAT)을 이용한 HCV 유전자를 검출하려는 시도들이 진행되고 있다. 이 연구의 목적은 혈장분획물질에서 HCV RNA를 검출할 수 있는 핵산증폭시험 방법을 개발하는 것이다. 5종류의 PCR primer를선별하여 실험에 이용하였다. 혈장분획물질의 HCV RNA 추출에는 컬럼 방법을 이용하는 것이 유용한 것으로나타났다. 핵산중폭시험의 결합 온도는 $48^{\circ}C$가 가장 적절한 것으로 나타났다. 또한 2차 PCR의 경우, 1차 PCR 산물 $1{\mu}l$와 30 pmol의 primer즐 사용하였을 때 높은 민감도와 특이성을 보이는 것을 알 수 있었다. 혈장 분획물질에 HCV를 주입하여 혈장중폭시험을 수행한 결과, 100 IU/ml까지 검출 할 수 있었다. 한편 근육주사용항체(IMIG)의 경우 핵산중폭시험을 통한 검출한계는 100IU/ml로 COBAS amplicor HCV2.0의 500 IU/ml 이상의 검출한계보다 민감도가 더 높은 것으로 나타났다. 이러한 결과들로 보아 본 실험에 이용된 핵산증폭시험이 혈장분획물질에서 HCV RNA를 검출하는데 유용한 방법으로 사용될 수 있을 것으로 생각된다.

시판 고추 종자에서 분리한 Tobamovirus의 병원형 (Pathotype of Tobamovirus Isolates from Commercial Red Pepper Seeds)

  • 한정헌;이철호;나용준
    • 원예과학기술지
    • /
    • 제19권4호
    • /
    • pp.530-534
    • /
    • 2001
  • Nicotiana glutinosa를 이용한 단병반 분리를 통하여 30품종의 시판 고추종자로부터 모두 23개의 Tobamovirus 분이주(分離株)를 얻었다. 병원형(病原型) 판별(判別)고추를 사용하여 조사한 이들 분이주(分離株)의 병원형(病原型)은 P0 또는 P1,2형으로 나타났으며 P1과 P1,2,3형은 관찰되지 않았다. 시판고추 중 한 종류를 제외한 모든 품종이 P0와 P1 병원형에 대해서는 저항성을 보였고 P1,2형에는 모두 감수성이었다. Tobamovirus 병원형(病原型)에 관한 연구결과는 앞으로 우리나라 고추의 Tobamovirus 저항성육종(抵抗性育種)과 Tobamovirus 무감염(無感染) 고추종자의 생산에 널리 이용될 수 있을 것으로 생각된다.

  • PDF

돼지 생식기 및 호흡기 증후군 진단을 위한 in situ hybridization 기법의 응용 (Application of in situ hybridization for diagnosis of porcine reproductive and respiratory syndrome)

  • 김승재;박남용
    • 대한수의학회지
    • /
    • 제37권4호
    • /
    • pp.793-807
    • /
    • 1997
  • We tried to develop detection system of porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) by in situ hybridization(ISH) in the piglets experimentally infected with KPRRS-2, the Korean isolate(12 piglets) or Mn-1b, the American isolate(4 piglets), and in the natural infection suspected 6 piglets. Twelve 30-days-old piglets(two pigs per each inoculated group) were inoculated by nasal instillation of KPRRS-2 virus(total dose $10^{4.5}TCID_{50}$), Six piglets(one pig per each group) were induced contact infection with inoculated piglets, during the experiment, and two piglets were used as control. Inoculated or contacted piglets were euthanized at 1, 3, 5, 7, 14 and 21 days postinoculation(DPI). The respiratory signs such as coughing and nasal discharge were observed on day 3 DPI, and ear cyanosis were on day 5 DPI, including contacted piglets. Through the necropsy, purple discolorization of dorsal part of lung, and hypertrophy of local lymph nodes were observed. The histopathological lesions of lung were interstitial pneumonia characterized by type 2 pneumocyte hyperplasia. We prepared the probe for ISH by RNA isolation from KPRRS-2, RT-PCR, and biotin labeling. We performed the ISH within only 1~2 hours using $Microprobe^{TM}$ capillary action system. As the results, the strong red specific positive signals, means PRRSV distribution, was mainly observed in the cytoplasm of alveolar macrophages. And also signals were detected in some type 2 pneumocytes and bronchiolar epithelium of lung, myocardium, liver, kidney, tonsil, spleen, gastrointestinal mucosa, testis and lymph nodes.

  • PDF