• 제목/요약/키워드: Virus Scanning

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Suppression of the ER-Localized AAA ATPase NgCDC48 Inhibits Tobacco Growth and Development

  • Bae, Hansol;Choi, Soo Min;Yang, Seong Wook;Pai, Hyun-Sook;Kim, Woo Taek
    • Molecules and Cells
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    • 제28권1호
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    • pp.57-65
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    • 2009
  • CDC48 is a member of the AAA ATPase superfamily. Yeast CDC48 and its mammalian homolog p97 are implicated in diverse cellular processes, including mitosis, membrane fusion, and ubiquitin-dependent protein degradation. However, the cellular functions of plant CDC48 proteins are largely unknown. In the present study, we performed virus-induced gene silencing (VIGS) screening and found that silencing of a gene encoding a tobacco CDC48 homolog, NgCDC48, resulted in severe abnormalities in leaf and shoot development in tobacco. Furthermore, transgenic tobacco plants (35S:anti-NgCDC48), in which the NgCDC48 gene was suppressed using the antisense RNA method, exhibited severely aberrant development of both vegetative and reproductive organs, resulting in arrested shoot and leaf growth and sterile flowers. Approximately 57-83% of 35S:anti-NgCDC48 plants failed to develop mature organs and died at early stage of development. Scanning electron microscopy showed that both adaxial and abaxial epidermal pavement cells in antisense transgenic leaves were significantly smaller and more numerous than those in wild type leaves. These results indicate that NgCDC48 is critically involved in cell growth and development of tobacco plants. An in vivo targeting experiment revealed that NgCDC48 resides in the endoplasmic reticulum (ER) in tobacco protoplasts. We consider the tantalizing possibility that CDC48-mediated degradation of an as-yet unidentified protein(s) in the ER might be a critical step for cell growth and expansion in tobacco leaves.

Detection of Avian Influenza-DNA Hybridization Using Wavelength-scanning Surface Plasmon Resonance Biosensor

  • Kim, Shin-Ae;Kim, Sung-June;Lee, Sang-Hun;Park, Tai-Hyun;Byun, Kyung-Min;Kim, Sung-Guk;Shuler, Michael L.
    • Journal of the Optical Society of Korea
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    • 제13권3호
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    • pp.392-397
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    • 2009
  • We designed a wavelength interrogation-based surface plasmon resonance (SPR) biosensor to detect avian influenza DNA (AI-DNA). Hybridization reactions between target AI-DNA probes and capture probes immobilized on a gold surface were monitored quantitatively by measuring the resonance wavelength in the visible waveband. The experimental results were consistent with numerical calculations. Although the SPR detection technique does not require the DNA to be labeled, we also evaluated fluorescently-labeled targets to verify the hybridization behavior of the AI-DNA. Changes in resonance were found to be linearly proportional to the amount of bound analyte. A wavelength interrogation-type SPR biosensor can be used for rapid measurement and high-throughput detection of highly pathogenic AI viruses.

Chitosan Nanoparticles as a New Delivery System for the Anti-HIV Drug Zidovudine

  • Dahmane, El Montassir;Rhazi, Mohammed;Taourirte, Moha
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제34권5호
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    • pp.1333-1338
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    • 2013
  • Chitosan-based nanoparticles (CSNP) were prepared through ionic cross-linking and gelation of chitosan (CS) by tripolyphosphate (TPP). CS properties such as molecular weight, and preparation conditions were screened and the resulting nanoparticles were examined by Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR), scanning electron microscopy (SEM) and transmission electron microscopy (TEM). The obtained particles were consistently spherical with an overall diameter of approximately $107{\pm}20$ nm. They were successfully used as a carrier for Zidovudine, an anti-human immunodeficiency virus (HIV) which, to our knowledge, is novel. The encapsulation ability, loading capacity, and controlled release behavior for these CSNP was evaluated. Results indicated that their intrinsic properties were strongly affected by properties inherent to CS such as molecular weight, and by the preparation condition, such as cross-linking density, which depends on the concentration of the cross-linker. In vitro release tests for the entrapped zidovudine showed that the CNNP provided a continuous release that can last upwards 20 h.

Disinfection of various materials with 3-(trimethoxysilyl)-propyldimethyloctadecyl ammonium chloride in hatchery facilities

  • Kim, Yu-Jin;Kim, Jun-Beom;Song, Chang-Seon;Nahm, Sang-Soep
    • Animal Bioscience
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    • 제35권4호
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    • pp.631-637
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    • 2022
  • Objective: Surface disinfection is important in the proper running of livestock farms. However, disinfection of farm equipment and facilities is difficult because they are made of different materials, besides having large surface areas and complex structures. 3-(trimethoxysilyl)-propyldimethyloctadecyl ammonium chloride (Si-QAC) is a quaternary ammonium salt-based disinfectant that attaches to various surfaces by forming covalent bonds and maintains its disinfecting capacity for a considerable time. Our aim was to evaluate the potential use of Si-QAC for disinfection of farm equipment and facilities. Methods: The short- and long-term antimicrobial and antiviral effects of Si-QAC were evaluated in both laboratory and farm settings using modified quantitative assessment method based on the standard operating procedures of the United States Environmental Protection Agency. Results: Si-QAC was highly effective in controlling the growth of the Newcastle disease virus and avian pathogenic Escherichia coli. Electron microscopy revealed that the mechanism underlying the disinfection activity of Si-QAC was associated with its ability to damage the outer membrane of the pathogen cells. In the field test, Si-QAC effectively reduced viral contamination of surfaces of equipment and space. Conclusion: Our results suggest that Si-QAC has great potential as an effective chemical for disinfecting farm equipment and facilities. This disinfectant could retain its disinfection ability longer than other commercial disinfectants and contribute to better farm biosecurity.

개의 실험적 요꼬가와흡충증에서 충체의 자세 (In situ posture of anterior body of Metagonimus yokogawai in experimentally infected dog)

  • 장영기;강신영
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제23권2호
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    • pp.203-213
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    • 1985
  • 요꼬가와흡충을 개에 감염시키고 장점 막에서 분리한 초기 발육단계의 충체가 특이한 자세를 취하고 있음을 관찰하여 이를 보고하고자 한다. 은어에서 분리한 요꼬가와흡충 피낭유충을 개 8마리에 각각 10,000개씩 경구감염시키고, 감염 후 3일, 9일, 4주 및 10주에 2마리씩 도살하였다. 105포르말린으로 고정한 장점 막에서 분리 수집한 요꼬가와흡충의 자세를 광학 및 주사현미경으로 관찰하였다. 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 충체회수율은 감염 3일에 42.6%, 9일에 55.0%, 4주에 33.2%, 및 10주에 8.9%로 감염이 경과할수록 감소하였다. 2. 감염후 3일된 개의 소장 점막의 조직절편에서 미성숙 충체가 융모사이에 위치하거나 장은와에 침입함을 관찰할 수 있었다. 이때 장은와 상부에 침입한 충체절편중에는 하부로 향한 충체 전반부가 2분지된 모양으로 절편이 발견되는 경우가 있었다. 3. 고정한 소장 조직에서 장점막을 분리하고 해부침으로 점막조직을 해부하여 수집한 고정된 충체는 특히 감염 후 3일째에 여러가지 특이한 자세를 보였다. 충체전반부가 앞쪽으로 매우 돌출한 충체가 많았는데 돌출한 형태는 단순히 한가닥으로 돌출한 것에서 2분지, 3분지된 것까지 있어 마치 충체 전반부가 아메바운동을 하는 것 같이 보였다. 4. 이러한 형태의 충체를 주사전자현미경으로 관찰하였던 바 돌출한 충체전반부는 돌출한 전반부의 길이를 따라 길이로 흠이 파져 있음이 관찰되 었다. 5. 감염후 9일, 4주 및 10주된 충체에서는 전반부가 돌출한 충체의 비율은 감염 3일된 충체에 비해 감소하였다. 이상의 결과에서 요꼬가와흡충은 감염초기에 장은와 선강(선륙) 상부에 충체 전반부를 밀어 넣을 때에 전반부를 튜브모양으로 만들어 침 입하며 인근 장은와 선강을 동시에 침 입하기 위하여 한 충체에서 여러개의 튜브모양 돌출부를 만들고 있는 것으로 사료되었다.터 그 다음 날 아침 6시까지 1시간 간격으로 모기를 채집하였다. C. tritaeniorhynchus의 활동이 가장 활발한 시간은 21시에서 22시, 24시에서 1시 사이였으며, 아침 5시 이후에는 한마리도 채집할 수 없었다. 조사 지역에서 채집한 유충은 사육실로 옮겨 종을 동정 하였던 바, 4층 14종이었으며, 매년 사회적으로 문제가 되는 뇌염 매개종인 C. tritaeniorhynchus의 유충서식처는 답, 옹덩이, 작은 연못, 늪, 미나리논 및 소택지 등이었다. 이상의 성적으로 미루어 보아 뇌염 매개 모기, C. tritaeniorhynchus는 6월 중순에 처음으로 출현하며, 8월 하순과 9월 초순에 최대 밀도를 나타내였고, 10월 중순 부터는 채집할 수 없음을 알았다.위분지 이상에서 3%로 자엽절 2분지의 비중이 특히 컸다.스 접종 8일 후의 중장원동세포내에서 A형 및 B형 봉입체가 형성되었음을 확인하였다. 10. FV감염 중장조직세포의 전자현미경 관찰에서는 바이러스 접종 5일 후에 배상세포의 'cytoplasmic wall'이 비대해지고 그 내부에 virus-specific vesicle이 형성되었으며, 바이러스 접종 8일 후에는 virus-specific vesicle, 바이러스 입자, linear structure, tubular structure 및 전자밀도가 높은 matrix 등의 바이러스 감염에 대한 특이적인 구조물이 배상세포의 세포질에서 관찰되었으며, microvilli내에서 바이러스 입자의 존재도 확정되었다. 특히 virus-specific vesicle 주위에서는 전자밀도가 높은 구형의 바이러스 입자 유사체가 관찰되었는데, 이것은 virus-specific vesicle 주위에서 바이러스 조립이 일어나는 것을 추정된다. 한편 원통세포 내에서 봉입체 관찰되고, 변형소구화된 배상세포가 중장강으로 탈락되는 것이 관찰되었다

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Potentiation of Apoptin-Induced Apoptosis by Cecropin B-Like Antibacterial Peptide ABPs1 in Human HeLa Cervical Cancer Cell Lines is Associated with Membrane Pore Formation and Caspase-3 Activation

  • Birame, Basse Mame;Wang, Jigui;Yu, Fuxian;Sun, Jiazeng;Li, Zhili;Liu, Weiquan
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제24권6호
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    • pp.756-764
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    • 2014
  • Apoptin, a chicken anemia virus-encoded protein, induces apoptosis in chicken or human tumor cells, localizing in their nuclei as opposed to the cytoplasm of non-transformed cells. The present study was undertaken to investigate whether ABPs1 could potentiate apoptin-induced apoptosis in HeLa cells. ABPs1 and the apoptin genes were successfully cloned into pIRES2-EGFP expression vector and expressed in HeLa cells. We report that ABPs1 augments apoptin cell growth inhibition in a concentration- and time-dependent manner. The DAPI staining and scanning electron microscopy observations revealed apoptotic bodies and plasma membrane pores, which were attributed to apoptin and ABPs1, respectively. Further, ABPs1 in combination with apoptin was found to increase the expression of Bax and to decrease the expression of survivin compared with either agent alone or the control. The apoptotic rate of HeLa cells treated with ABPs1 and apoptin in combination for 48 h was 53.95%. The two-gene combination increased the caspase-3 activity of HeLa cells. Taken together, our study suggests that ABPs1 combined with apoptin significantly inhibits HeLa cell proliferation, and induces cell apoptosis through membrane defects, up-regulation of Bax expression, down-regulation of survivin expression, and activation of the caspase-3 pathway. Thus, the combination of ABPs1 and apoptin could serve as a means to develop novel gene therapeutic agents against human cervical cancer.

네트워크 보안을 위한 서픽스 트리 기반 고속 패턴 매칭 알고리즘 (High Performance Pattern Matching algorithm with Suffix Tree Structure for Network Security)

  • 오두환;노원우
    • 전자공학회논문지
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    • 제51권6호
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    • pp.110-116
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    • 2014
  • 패턴 매칭 알고리즘은 컴퓨터 네트워크, 유비쿼터스 네트워크, 그리고 센서 네트워크 등을 위한 보안 프로그램에 주로 사용 된다. IT 기술의 발전과 함께 정보의 디지털화가 가속화되면서 네트워크를 통해 전달되는 데이터양이 급증하고 있다. 이에 따라 패턴 매칭 연산의 복잡도도 폭발적으로 증가하고 있다. 따라서 더 많은 패턴을 보다 빠르게 검색할 수 있는 고성능 알고리즘의 개발이 끊임없이 요구되고 있다. 본 논문은 서픽스 트리 기반 패턴 매칭 알고리즘을 새롭게 제안하여 대용량 패턴 매칭 연산의 성능을 높였다. 서픽스 트리는 사전에 정의된 복수 패턴들의 서픽스를 기반으로 생성된다. 이 트리에 쉬프트 노드 개념을 추가하여 기존 패턴 매칭 연산들 중 불필요한 연산의 수행 횟수를 줄였다. 결과적으로 제안하는 구조를 통해 기존 알고리즘 대비 24% 이상의 성능 향상을 이루었다.

Morphological Classification of Trichomes Associated with Possible Biotic Stress Resistance in the Genus Capsicum

  • Kim, Hyun-Jung;Seo, Eun-Young;Kim, Ji-Hyun;Cheong, Hee-Jin;Kang, Byoung-Cheorl;Choi, Do-Il
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제28권1호
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    • pp.107-113
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    • 2012
  • Trichomes are specialized epidermal structure having the functions of physical and chemical block against biotic and abiotic stresses. Several studies on $Capsicum$ species revealed that virus and herbivore resistance is associated with trichome-formation. However, there is no research on the structural characterization of trichomes developed on the epidermis of $Capsicum$ spp. Thus, this study attempts to charaterize the trichome morphologies in 5 species of $Capsicum$ using a Field Emission Scanning Electron Microscopy (FESEM). Six main trichome types were identified by their morphology under FESEM. Both glandular and non-glandular types of trichomes were developed on the epidermal tissues of $Capsicum$ spp. The glandular trichome were further classified into type I, IV and VII according to their base, stalk length, and stalk. Non-glandular trichomes were also classified into type II, III, and V based on stalk cell number and norphology. Almost all the species in $C.$ $chinense$ and $C.$ $pubescens$ had glandular trichomes. To our knowledge, this is the first study on classification of trichomes in the genus $Capsicum$ and, our results could provide basic informations for understanding the structure and function of trichomes on the epidermal differentiation and association with biotic stress tolerance.

산성 pH 조건에서 차아염소산나트륨의 항균 활성 향상 (Enhanced Antibacterial Activity of Sodium Hypochlorite under Acidic pH Condition)

  • 손현빈;배원빈;지광환
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제50권2호
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    • pp.211-217
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    • 2022
  • 차아염소산나트륨(NaClO)은 병원 및 식품산업 분야에서 널리 사용되는 소독제로 세균, 곰팡이, 바이러스에 대해서도 항균 활성이 있다. 차아염소산나트륨의 항균 활성은 용액의 pH에 의해 조절되는 안정적인 HClO 농도의 유지에 있다. 차아염소산(HClO)은 화학적으로 중성이므로 세균의 막에 쉽게 침투할 수 있으며 차아염소산나트륨의 항균 활성은 차아염소산염 이온(ClO-)보다는 용액 내 HClO 농도에 의존하리라 사료된다. 본 연구에서 pH 조절에 따른 차아염소산나트륨의 항균 활성을 time kill test와 차아염소산나트륨 처리 전후의 활성산소종(ROS) 및 ATP 농도 변화로 조사하였다. 또한 전계방출형 주사 전자 현미경(FE-SEM)을 통하여 세포벽의 파괴정도를 확인하였다. pH 5 조건에서 5 ppm 차아염소산나트륨은 Escherichia coli (E. coli), Staphylococcus aureus (S. aureus) 균에 대하여 99.9%의 항균 활성을 나타내었고, ROS 생성량은 pH 7 조건보다 48% 증가하였다. 또한, pH 5 조건의 차아염소산나트륨에 노출된 E. coli와 S. aureus의 ATP 농도가 각각 94%와 91% 감소하였다. FE-SEM 결과, pH 5 조건에 노출된 균의 세포벽이 파괴된 것을 확인하였다. 본 연구결과를 종합해보면, pH를 조절하는 것 만으로 5 ppm 농도의 차아염소산나트륨의 항균 활성을 향상시킬 수 있음을 시사한다.