• 제목/요약/키워드: VIR

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A Structure-Based Activation Model of Phenol-Receptor Protein Interactions

  • 이경희
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제18권1호
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    • pp.18-23
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    • 1997
  • Data from structure/activity studies in vir gene induction system have led to evaluate the working hypothesis of interaction between phenolic inducers and phenol binding proteins. The primary specificity in the association of a phenolic inducer with its receptor in our system is hypothesized to be the hydrogen bonding interactions through the ortho methoxy substituents as well as the proton transfer between the inducer and the binding protein. In this paper the proposed working model for phenol-mediating signal transduction was evaluated in several ways. The importance of the general acid-base catalysis was first addressed by the presence of an acidic residue and a basic residue in the phenol binding protein. Series of compounds were tested for vir gene expression activity to confirm the generation of a strong nucleophile by an acidic residue and an involvement of a basic residue as a proton acceptor. An attempt was made to correlate the pKa values of the phenolic compounds with vir gene induction activities as inducers to further support the proposed proton transfer mechanism. Finally, it was also observed that the regioselectively attached methoxy group on phenol compounds is required as the proper hydrogen bond acceptor.

근접쌍성 AG Virginis의 분광학적 연구 (A SPECTROSCOPIC STUDY OF THE CLOSE BINARY AG VIRGINIS)

  • 김호일;이충욱;이재우;손미림
    • Journal of Astronomy and Space Sciences
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    • 제22권4호
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    • pp.353-362
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    • 2005
  • 2004년 3월 25일부터 4일 동안 보현산천문대의 1.8m 망원경과 BOES(Bohyunsan Optical Echelle Spectrograph)를 사용하여 AG Vir의 고분산 분광관측을 수행하고, 전위상에 걸쳐 총 59개의 스펙트럼을 얻었다. 쌍성계의 시선속도를 얻기 위하여, 교차상관함수(CCF; Cross-Correlation Function) 와 선폭증가함수(BF; Broadening Function)를 관측된 스펙트럼의 분석에 사용하였다. 이때, 교차상관함수 분석을 통하여 주성의 시선속도만을 얻을수 있었던 반면, 선폭증가함수 분석을 통하여 두 성분별의 시선속도를 모두 구할 수 있었다. 우리는 분광 궤도요소($K_1=90.5km/s$$K_2=258.8km/s$)와 Bell, Rainger, & Hilditch(1990)의 측광학적 해로부터 AG Vir의 절대 물리량을 다음과 같이 산출하였다. 즉, $M_1:1.99M_\bigodot,\;M_2:0.62M_\bigodot,\; R_1=2.21R_\bigodot,\;R_2=1.36R_\bigodot,\;L_1=13.17L_\bigodot$, 그리고 $L_2=3.47L_\bigodot$. 우리가 구한 각 성분별의 질량과 반경은 Bell, Rainger, & Hilditch(1990)의 값보다 더 크고, 광도 또한 더 밝다. 발표된 모든 시선속도곡선을 재분석한 결과, AG Vir의 시스템 속도는 약 ${\pm}8km/s$의 비교적 큰 편차를 나타낸다. 그러나 이 변화가 Qian(2001)이 제안한 제3 천체의 광시간 효과에 의해 일어난다고 단정 지을 수 있는 근거를 찾을 수는 없었다.

가상현실 체험형 디바이스를 활용한 콘텐츠 개발 사례 (A Case Study of Virtual Reality Contents Development Using Experience Device)

  • 유명은;이석희;송은지
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
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    • 한국정보통신학회 2019년도 춘계학술대회
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    • pp.208-210
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    • 2019
  • 최근 4차산업혁명의 분야로서 주목받고 있는 가상현실이 활성화되기 위해서는 가상현실 생태계 조성이 무엇보다 중요하다. 가상현실 생태계란 콘텐츠(C), 디바이스(D), 플랫폼(P), 네트워크(N)로 구성된다. 이 중에서 콘텐츠가 핵심이지만 가상현실은 입출력 디바이스에 따라 그 효과가 다르므로 디바이스의 활용이 매우 중요하다. 최근에는 실감 나는 경험을 위해서 체험형 디바이스가 개발되고 있다. 본 연구에서는 VR 콘텐츠의 몰입감과 멀미 저감을 위하여 체험형 디바이스인 VirZOOM을 활용한 콘텐츠 개발사례를 제시한다. 본 연구를 통해 향후 가상현실 콘텐츠의 개발이 더욱 활성화되기를 기대한다.

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Comparative Transcriptome Analysis of Caryophyllene-Treated Helicobacter pylori

  • Woo, Hyun Jun;Yang, Ji Yeong;Kwon, Hye Jin;Kim, Hyun Woo;Kim, Sa-Hyun;Kim, Jong-Bae
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제49권3호
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    • pp.440-448
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    • 2021
  • Helicobacter pylori (H. pylori) establishes long-term infections associated with severe gastric diseases such as peptic ulceration and gastric cancer. Exposure to an antibacterial agent can help regulate the expression levels of its pathogenic genes. In this study, we analyzed the transcriptional changes in H. pylori genes induced by β-caryophyllene. We used next-generation sequencing (NGS) to analyze RNA expression changes, and reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) was performed as required to verify the results. The NGS results showed that 30 out of 1,632 genes were expressed differentially by β-caryophyllene treatment. Eleven genes associated with DNA replication, virulence factors, and T4SS components were significantly downregulated. RT-PCR confirmed that treatment reduced the expression levels of 11 genes. RT-PCR showed the reduced expression of 11 genes (dnaE, dnaN, holB, gyrA, cagA, vacA, secA, flgE, virB2, virB4, and virB8) following β-caryophyllene treatment. These results suggest that β-caryophyllene can modulate various H. pylori pathogenic determinants and be a potential therapeutic agent for H. pylori infection.

저온 관련 유전자를 이용한 상추 (Lactuca sativa L.)의 형질전환 (Transformation of Lettuce (Lactuca sativa L.) Using Cold Regulated Gene (BN115))

  • 정재훈;양덕춘;장홍기;백기엽
    • 식물조직배양학회지
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    • 제27권1호
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    • pp.7-12
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    • 2000
  • 저온관련 유전자인 BN115 gene과 표지유전자인 npt II gene을 함유하고 있는 Agrobacterium tumifacience GV 3101 균주를 이용하여 겨울상추품종인 청치마의 잎절편과 공동배양하는 방법으로 형질전환 시켰다. 상추의 잎절편을 Agrobacterium과 공동배양 후 MS 기본배지에 100 mg/L kanamycin, 500 mg/L carbenicillin, 0.1 mg/L NAA, 0.5 mg/L kinetin을 첨가한 선발배지에 치상하였는데, 치상 후 3-4주부터 절편체로부터 multiple shoot들이 생성되기 시작하였다. 선발배지에서 살아남은 선발체들은 1/2 MS배지에 100 mg/L kanamycin, 250 mg/L carbenicillin이 첨가된 발근배지로 옮겨졌다. 한편, 선발된 shoot들은 PCR반응을 이용하여 도입유전자의 삽입여부를 확인하였다. PCR 반응은 표지유전자인 nptII와 저온관련 유전자인 BN115 및 식물에 도입되지 않는 vir G 유전자를 각각 특이적으로 증폭하는 primer를 가지고 실시하였다. PCR 반응 결과 대조구로 쓰인 정상 상추식물체에서는 nptII와 BNl15유전자의 증폭을 볼 수 없는 반면에 형질전환체에서는 두 유전자 모두 PCR 증폭 산물을 확인할 수 있었다. 또한 확인된 식물체의 DNA에서는 vir G유전자가 발견되지 않아 이는 Agrobacterium의 혼입에 의한 결과가 아님을 다시 한번 증명하였다. 또한 선발된 형질전환체를 이용하여 Southern analysis와 RT-PCR을 실시한 결과 내한성 유전자가 상추 식물에 안정적으로 도입되어 발현됨을 확인하였다.

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PCR 특이검출에 의한 국내 포도나무 혹병(Agrobacterium vitis) 균주의 신속 분리 및 병원학적, 생화학적 특성 비교 (PCR based Rapid Isolation of Agrobacterium vitis Strains in Korea and Their Pathogenical and Biochemical Characteristics)

  • 김종군;임선화;이대성;최재을;윤해근;박상헌;강성수;강희완
    • 식물병연구
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    • 제12권3호
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    • pp.205-212
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    • 2006
  • 2002년에서 2005년 동안 경북김천, 천안, 경기지역의 포도재배지로부터 채집한 300여점의 포도 혹병반으로부터 A. vitis의 PCR 특이검출 Phe A primer를 이용하여 포도혹병균의 대량분리를 실시하여 0.25kb의 PCR 특이밴드가 증폭된 51균주가 포도 혹병균으로 선발되었다. 이 균주들을 Ti-Plasmid 유래의 Vir A primer로 적용한 결과 40균주에서 0.5kb의 특이밴드가 검출되었다. 거봉포도와 당근절편에서 다양한 양상의 병원성을 보였으며 25균주가 거봉포도에 강한 병원성을 나타내었으며, 다른 균주는 약하거나 비 병원성을 보였다. 본 연구에서 분리한 10개 균주를 대상으로한 세균의 이화학적 특성은 균주간에 약간은 달랐으나, 3-Ketolactose의 비생성, 2%NaC 첨가 배지에서의 성장, Melezitose로부터의 산을 생성하지 못하는 등 비교균주와 대체적으로 일치하는 경향을 보였다. 따라서, PheA and Vir A primer를 이용하여 Agrobacterium vitis 균주를 대량 분리할 수 있으며 신속, 정확하게 동정할 수 있을 것으로 생각되었다.

2008-2009년 충북지역 벼 줄무늬잎마름병 발생 요인 분석 (Analysis of the Factors Involved in the Occurrence of Rice Stripe virus in Chungcheongbukdo in 2008 and 2009)

  • 강효중;안기수;한종우;정경헌;박세정;지재준;김정수
    • 식물병연구
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    • 제16권2호
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    • pp.109-114
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    • 2010
  • 충북지역의 벼 줄무늬잎마름병 발생 요인을 분석하기 위하여 2008년과 2009년 충북도내 청원, 진천, 보은 등 3개 지역에서 월동 애멸구 보독충율 및 애멸구 밀도, 자연 기주 식물의 바이러스 감염율, 농가 포장에서의 벼 줄무늬잎마름병 발생율을 조사하였다. 월동 애멸구의 보독충율은 2008년에 0%, 2009년에는 1.1%로 나타났다. 2009년 6월 상순 채집된 시료의 보독충율은 진천 1.4%, 보은 4.2%로 월동 애멸구의 보독충율보다 높게 나타났으며 이는 2009년 중국에서 비래한 애멸구 성충 집단과 관련이 있는 것으로 추정된다. 월동 애멸구 밀도는 2008년에는 청원 3.8, 진천 7.5, 보은 20.8마리/$m^2$, 2009년에는 청원 8.4, 진천 13.1, 보은 14.6마리/$m^2$로 나타났다. 2009년 2차조사(5월 상순)와 3차 조사(6월 상순)에서도 매우 낮은 밀도를 보였으나 3차 조사 시기에 일부 지점에서는 성충 태로 높은 밀도를 나타냈으며 이들은 국내에서 월동한 애멸구가 아닌 2009년 중국에서 비래한 애멸구 집단과 관련이 있는 것으로 추정된다. 자연 기주 식물에서 RSV가 감염된 시료는 없었다. 따라서 이러한 결과로부터 월동애멸구의 낮은 보독충율과 밀도, 자연 기주 식물의 낮은 감염율 및 적절한 재배관리 등 복합적 요인으로 인하여 지금까지 충북지역에서 RSV 발생이 낮았던 것으로 사료된다.

질량비가 작은 접촉쌍성 GR Vir

  • 오규동;김천휘
    • 한국우주과학회:학술대회논문집(한국우주과학회보)
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    • 한국우주과학회 2003년도 한국우주과학회보 제12권2호
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    • pp.21-21
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    • 2003
  • 접촉쌍성 가운데 질량비(q=m$_2$/m$_1$)가 0.2이하로 매우 작은 접촉쌍성은 그리 흔한 접촉 쌍성이 아니다. 현재까지 이러한 질량비가 작은 접촉쌍성들이 30개 정도가 알려져 있으며 이 가운데도 절대량이 잘 알려진 별들은 14개 정도에 불과하다. 이러한 원인은 이 별들에 대한 분광관측이 이루어져 있지 않기 때문이다. 따라서 이러한 접촉쌍성의 진화 상태를 보다 확실하게 이해하기 위하여 이러한 별들의 절대량을 얻는 것이 요구된다. 이번 연구에서는 Cereda at al.(1988)에 의하여 측광관측(B & V) 결과만 이루어진 후 궤도 요소가 알려져 있지 않은 GR Vir의 관측 자료와 함께 최근 Rucinski & Lu(1999)가 발표된 분광관측 결과를 이용하여 WD 프로그램을 적용하여 이 별의 궤도요소와 함께 절대량을 얻고 이로부터 이 별의 진화 상태를 조사하였다.

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