Shiitake (Lentinula edodes) is the most economically important cultivated mushroom, but yields are impacted by its competitor, Trichoderma spp. We previously found two unidentified Trichoderma species growing in bedlogs and sawdust shiitake media in Korea. Here, we identify and re-describe those two species based on molecular sequence data, morphology, and culture characteristics. Well-supported clades based on phylogenetic analyses of internal transcribed spacer, translation elongation factor 1-${\alpha}$, and RNA polymerase subunit II sequences grouped one of the unidentified Trichoderma spp. with Hypocrea pseudogelatinosa and the other with Hypocrea pseudostraminea, and their morphologies matched well with the original descriptions of the two Hypocrea species. This study reports the first phylogenetic analyses of H. pseudogelatinosa and Japanese strains of H. pseudostraminea. Based on the phylogenetic results, we redescribed these two species using modern taxonomic concepts in Hypocrea/Trichoderma.
Dipterans are excellent insects to serve as forensic indicators to determine the postmortem interval of a human corpse. Therefore, we undertook a study to identify the major dipterans that are attracted to and develop in vertebrate carcasses. To determine what dipterans occur in Korea, chicken carcasses were placed in various habitats including the forest, open field, stream bank, greenhouse, rooftop, rice paddy, Chinese cabbage field, vacant hut, and pond at different times of the year. The dipterans were collected at various time intervals after placement in each habitat until the end of decomposition and identified. Our results showed that 49 identified and unidentified dipteran species from 36 genera in 19 families were collected from the carcasses. Habitat placement influenced the number of species isolated from the carcasses. For example, 39 species were collected from the forest habitat, 28 species from the open field, stream bank, or greenhouse each, 16 species from a vacant home, and 12 species from the pond. The dipteran species that were collected from all habitats were Phaenicia sericata, Lucilia illustris, and Lucilia sp. in the family Calliphoridae and Boettcherisca peregrine in the family Sarcophagidae. Other dipteran species that were isolated depended on carcass placement that is, fewer dipteran species were observed from carcasses in the backpack and much more species were recorded from unburied carcasses than buried carcasses. P. sericata, L. illustris, Lucilia sp., B peregrine and an unidentified sarcophagid species were observed year round, but some dipterans showed seasonal differences.
Objectives : The purpose of this research is to identify the actual origin species imported as Aquilaria malaccensis from Indonesia. Methods : After producing the permanent preparat by cutting off the specimen thinly, we observed its characteristics. Results : The imported ones have not interxylary parenchyma, so none is in the genus aquilaria. Since the aliform parenchyma is mostly observed around the vessel pore, they are in the genus gonystylus, and the rest have no aliform parenchyma, so their specimen is unidentified. Conclusion : The imported as A. malaccensis are not in the genus aquilaria, but most of them are in the genus gonystylus and, for the rest, the specimen is unidentified.
thirteen dictyostelid cellular slime molds were isolated from forest soils, cattle dung and manure inisland Ulneungdo, South Korea. They were ten species including Dictyostelium aureo-stipes var. aureo-stipes, D. brefeldianum, D. macrocephalum, D. caudabasis, D. sphaerocephalum, D. giganteum, D. crassicaule, Polysphondylium pallidum, P. violaceum and P. tenuissimum as well as three species unidentified. D. aureo-stipes var. aureo-species of genus Polysphondylium distributed widely. It was thought that species diversi쇼 was considerabley higher.
Two species of myxosporean parasites - Parvicapsula anisocaudata and an unidentified myxosporean were found in the lumina of renal tubules and the tubular epithelium, respectively, from cultured olive flounder, Paralichthys olivaceus in Korea. The latter was also seen in interstitial tissue of spleen and interrenal gland of the head kidney. Group of pseudoplasmodia of P. anisocaudata were firmly attached on the epithelium of renal tubules through pseudopodia. In the renal tubule epithelium, a group of unidentified myxosporean trophozoites, which were 2-3 times larger than intraluminal trophozoites of P. anisocaudata, was observed. The parasites being burst out into the lumen was occasionally encountered with partial break of the epithelium. Although infection of P. anisocaudata and unidentified myxosporean parasites did not induce any cellular reaction of the host, occlusion of renal tubules and rupture of renal epithelium would impact negatively on the renal functions of severely infected fish.
Ve Van Le;So-Ra Ko;Mingyeong Kang;Hee-Mock Oh;Chi-Yong Ahn
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제32권12호
/
pp.1553-1560
/
2022
A Gram-stain-negative, rod-shaped bacterial strain, JC4T, was isolated from a freshwater sample and determined the taxonomic position. Initial identification based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain JC4T is affiliated to the genus Mucilaginibacter with a sequence similarity of 97.97% to Mucilaginibacter rigui WPCB133T. The average nucleotide identity and digital DNA-DNA hybridization values between strain JC4T and Mucilaginibacter species were estimated below 80.92% and 23.9%, respectively. Strain JC4T contained summed feature 3 (C16:1 ω7c and/or C16:1 ω6c) and iso-C15:0 as predominant cellular fatty acids. The dominant polar lipids were identified as phosphatidylethanolamine, one unidentified aminophospholipid, one unidentified phospholipid, and two unidentified lipids. The respiratory quinone was MK-7. The genomic DNA G+C content of strain JC4T was determined to be 42.44%. The above polyphasic evidences support that strain JC4T represents a novel species of the genus Mucilaginibacter, for which the name Mucilaginibacter aquariorum sp. nov. is proposed. The type strain is JC4T (= KCTC 92230T = LMG 32715T).
We analyzed partial sequences of cytochrome b (cyt-b), a mitochondrial DNA (mtDNA) gene, to determine the genetic relationships between six horsehead fish species: Branchiostegus japonicus, Branchiostegus albus, Branchiostegus auratus, Branchiostegus argentatus, Branchiostegus wardi, and an unidentified Branchiostegus species. The specimens were collected in Korea, China, Japan, and Vietnam. We compared their molecular phylogenetic relationships inferred from mtDNA cyt-b sequences with an osteological analysis. The unidentified species, B. sp., was similar to B. albus in terms of the lack of triangular silver-white dot at the posterior region of eyes (vs. large one present in B. japonicus), but was also similar to B. japonicus in terms of the presence of a straight-shaped first hemal spine (vs. a curve-shaped hemal spine in B. albus). Analysis of the mtDNA cyt-b sequences indicated that the smallest estimated sequence divergence was between the B. japonicus and B. sp. (0.70-0.94%), whereas the largest difference was between B. auratus and B. argentatus (23.06-23.36%). Both the maximum parsimony and maximum likelihood trees showed that the B. sp. was closely clustered with B. japonicus, and that B. auratus was most distant from the other species. When comparing the osteological characters, UPGMA tree showed that the B. japonicus and B. sp. were the most closely clustered species, and B. auratus was the most distantly clustered fish relative to the other species. The shape of the nasal, otolith and first hemal spine was informative for distinguishing B. auratus from the other species. These osteological differences were consistent with the differences in mtDNA.
인공용승류 해역에서 난자치어의 종조성 및 시공간 변동을 파악하기 위하여 2012년 6월 13일, 9월 21일 및 25일에 난자치어 네트를 이용하여 조사하였다. 조사기간 동안 출현한 어란은 4,849 ind./$1,000m^3$, 자치어는 641 ind./$1,000m^3$이였다. 출현한 어란 중 가장 우점한 종은 멸치(Engraulis japonicus)로써 총 출현량의 약 57.5 %를 차지하였다. 그 외 미동정(Unidentified) 어란 I, II, III, IV이 출현하였다. 자치어는 청베도라치(Pictiblennius yatabei)가 가장 우점하였으며, 그 다음으로 돛양태류(Repomucenus sp.A, sp.B), 고등어(Scomber japonicus), 멸치(Engraulis japonicus), 전어(Konosirus punctatus) 등의 순으로 나타났다. 그리고 미동정(Unidentified) 자치어 I, II가 출현하였다. 대조구 해역에서는 어란은 멸치, 자치어는 돛양태류가 출현하였다. 시기별 변동에서는 어란 및 자치어 모두 7월에 가장 많았으며, 8월에 가장 낮았다. 정점별 변동에서는 인공용승이 일어나는 인근 정점인 2, 3번에서 어란 및 자치어의 출현량이 가장 많았다. 대조구 해역과의 비교하여 정점당 약 4배 이상 많은 어란 및 자치어가 출현하였다. 인공용승에 의한 영양염류 및 먹이생물의 증가로 인하여 어란 및 자치어의 출현량이 증가한 것으로 판단된다.
The ichthyoplanktons were sampled by Bongo net to study the distribution of the eggs and larvae in the West coastal waters of Korea during the study period (February, May, August and October of 2017). Collected fish eggs were divided into Engraulis japonicus and unidentified species. The most dominant species, Engraulis japonicus accounted for 79.52% of the total fish egg, which was followed by unidentified species (20.48%). The total of 36 taxa in fish larvae were identified based on morphological and molecular characteristics. Fish larvae were dominant by Gobiidae species. 48.30% of the total catch in abundance, which was followed by Engraulis japonicus (31.86%). These two taxa composed 80.16% of the total collected fish larvae. The seasonal diversity index of species from the collected fish larvae in the West coastal waters in 2017 was 0.625-1.883 and the evenness index was 0.380-0.865. In addition, dominance index was 0.618-0.920 and richness was 0.573-3.189.
Genetic variation and molecular phylogeny of 22 taxa representing 14 extant species and 3 unidentified taxa of Boesenbergia in Thailand and four outgroup species (Cornukaempferia aurantiflora, Hedychium biflorum, Kaempferia parviflora, and Scaphochlamys rubescens) were examined by sequencing of 3 chloroplast (cp) DNA regions (matK, psbA-trnH and petA-psbJ). Low interspecific genetic divergence (0.25-1.74%) were observed in these investigated taxa. The 50% majority-rule consensus tree constructed from combined chloroplast DNA sequences allocated Boesenbergia in this study into 3 different groups. Using psbA-1F/psbA-3R primers, an insertion of 491 bp was observed in B. petiolata. Restriction analysis of the amplicon (380-410 bp) from the remaining species with Rsa I further differentiated Boesenbergia to 2 groupings; I (B. basispicata, B. longiflora, B. longipes, B. plicata, B. pulcherrima, B. tenuispicata, B. thorelii, B. xiphostachya, Boesenbergia sp.1 and Boesenbergia sp.3; phylogenetic clade A) that possesses a Rsa I restriction site and II (B. curtisii, B. regalis, B. rotunda and Boesenbergia sp.2; phylogenetic clade B and B. siamensis; phylogenetic clade C) that lacks a restriction site of Rsa I. Single nucleotide polymorphism (SNP) and indels found can be unambiguously applied to authenticate specie-origin of all investigated samples and revealed that Boesenbergia sp.1, Boesenbergia sp.2 and B. pulcherrima (Mahidol University, Kanchanaburi), B. cf. pulcherrima1 (Prachuap Khiri Khan) and B. cf. pulcherrima2 (Thong Pha Phum, Kanchanaburi) are B. plicata, B. rotunda and B. pulcherrima, respectively. In addition, molecular data also suggested that Boesenbergia sp.3 should be further differentiated from B. longiflora and regarded as a newly unidentified Boesenbergia species.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.