• 제목/요약/키워드: Tryptophan synthase $\alpha$ subunit

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트립토판 중합효소 $\alpha$ 소단위체의 폴딩에 미치는 24번 잔기 치환효과 (Effect of Substituted Residue 24 on Folding of Tryptophan Synthase $\alpha$ Subunit)

  • 박후휘;김종원;신혜자;임운기
    • 생명과학회지
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    • 제9권2호
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    • pp.146-152
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    • 1999
  • 본 연구에서는 대장균 트립토판 중합효소(tryptophan synthase) $\alpha$ 소단위체의 폴딩에 있어 24번 잔기의 역할을 보고자 하였다. 24번 잔기인 트레오닌이 메티오닌, 알라닌, 세린, 류신 또는 리신으로 치환된 단백질를 대장균내에서 과량 발현시켜 수용성 구조의 양과 비수용성인 inclusion body양을 조사하였다. 그 결과 메티오닌이나 류신으로 치환된 $\alpha$ 소단위체는 트레오닌이 있는 소단위체와 마찬가지로 수용성 구조가 대부분을 차지하였다. 반면, 세린이나 알라닌 또는 리신으로 치환된 단백질들은 많은 양이 inclusion body로 발현되었다. 이 결과는 트립토판 중합효소 $\alpha$ 소단위체의 폴딩에 있어서 24번 잔기가 관여하고 있음을 제시하고 있다.

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트립토판 합성효소 α 소단위체의 다양한 단백질 덩어리 형성 (Various Aggregate Forms of Tryptophan Synthase α-Subunit)

  • 박명원;임운기
    • 생명과학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.319-323
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    • 2013
  • 단백질 덩어리는 질환의 원인이 되기도 하고, 유용한 유전자 재조합 단백질의 생산시 문제를 야기하기도 한다. 본 연구에서는 조건을 달리함으로 트립토판 합성효소 ${\alpha}$ 소단위체로부터 적어도 3가지 이상 다른 종류의 덩어리가 생길 수 있음을 보여주고 있다; (1) 불투명 흰색 침전 가능한 덩어리 (2) 투명하고 겔 유형의 침전 가능한 덩어리 (3) 불침전 덩어리. 이런 다른 종류의 덩어리 형태는 다른 기작을 통해 일어날 것으로 추정된다.

트립토판 중합효소 알파 소단위체의 in vitro 구조재형성시 $Ca^{2+}과; Mg^{2+} $ 이온의 단백질 응집체형성 촉진 효과 (The Stimulatory Effect of $Ca^{2+}and; Mg{^2}+ $ lons on the Formation of Protein Aggregate during in vitro Refolding of Tryptophan Synthase $\alpha$-Subunit)

  • 천광호;김종원;신혜자;임운기
    • 생명과학회지
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    • 제9권3호
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    • pp.328-332
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    • 1999
  • The effect of cations on the formation of protein aggregates was examined by in vitro refolding of mutant tryptophan synthase $\alpha$-subunit in which Pro 24 was replaced by Leu. $NH^{4+},; K{^+}; and; Na^{+}$ and no effect, but $Mg^{2+}; and; Ca^{2+}$stimulated the formation of protein aggregates in dose-dependent manner. It is suggested that $Mg^{2+} and Ca^{2+}$ may be implicated in the formation of protein aggregates in vivo.

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트립토판 중합료소 $\alpha$ 소단위체의 대장균내 구조형성과정에서의 Ser-33과 Asp-112 잔기의 역할 (Role of Ser-33 and Asp-112 Residues in In vivo Folding of E, coli Tryptophan Synthase $\alpha$ Subunit)

  • 유충배;신혜자;임운기
    • 생명과학회지
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    • 제6권4호
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    • pp.304-312
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    • 1996
  • 최근에 발표된 연구 결과에 의하면 대장균 트립토판 중합효소(tryptophan synthase) $\alpha$ 소단위체에서 33번 잔기의 세린과 112번 잔기의 아스팔산은 이 효소의 구조 형성 과정(folding)에 관여하는 것으로 보여진다. 이들 효소를 대장균내에서 과발현시켰을 때, SL33(잔기 33번의 세린이 류신으로 치환) 효소는 대부분 웅집된 덩어리형태의 효소로 생성되고, DG112(잔기 112번의 아스팔산이 글리신으로 치환) 효소와 DN112(아스랄산이 아스파라진으로 치환) 효소는 야생형 효소와 비슷한 양의 수용성형태로 생성된다고 보고된 바 있다. 본 연구에서는 이 효소의 구조 형성 과정동안 33번 잔기와 112번 잔기가 상호 작용하는 가를 조사하기 위하여 주 자리 잔기 치환 단백질을 만들어 이들의 성질을 단일 잔기 치환 단백질들과 비교하였다. 이들을 대장균내에서 젖당으로 과생산하여 전기영동으로 조사하여 본 결과 SL33 단일 잔기 치환 효소에 비해 SL33/DG112 이중 치환 효소는 현격히 보다 많은 양이 응집된 형태의 불용성 효소로 생성 되며, SL33/DN112효소는 많은 양의 효소들이 가용성 효소로 생성되었다. Densitometer로 정량한 결과 SL33/DN112 치환 소단위체는 SL33 치환 소단위체에 비해 가용성 형태의 양에 대한 응집된 형태의 양의 비가 6시간 젖당처리시 약 5배, 22시간 젖당처리시 약 13배 증가하였으며, SL33/DN112 치환 $\alpha$ 소단위체는 그 비가 1/4-1/3로 감소했다. 이러한 결과는 331번 위치에서 세린이 류신으로 치환되었을 때 나타나는 구조 형성 과정의 변화를 112번 위치에 새로 치환된 글리신 또는 아스파라진이 영향을 미쳐, 구조 형성 솨정 변화가 더욱 더 변화했거나 원상태로 어느 정도 회복되었음을 의미한다. 이 결과는 대장균 트립토판 중합효소 $\alpha$ 소단위체의 N 말단 도메인(N-terminal domain)의 구조 형성 과정시 33번 잔기와 112번 잔기가 상호작용을 하고 있음을 시사해 주고 있다.

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24번 잔기가 치환된 트립토판 중합효소 $\alpha$ 소단위체들의 구조풀림 성질 (Unfolding Property of Residue 24-Substituted Tryptophan Synthase $\alpha$-Subunits)

  • 정지은;박후휘;신혜자;임운기
    • 생명과학회지
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    • 제9권6호
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    • pp.733-736
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    • 1999
  • 대장균 트립토판 중합요소 (tryptophan synthase) $\alpha$ 소단위체의 24번 잔기인 트레오닌이 메티오닌, 알라닌 또는 세린으로 치환되고 잔기 139에 트립토판이 있는 단백질를 정제하여, 여러가지 요소 농도에 대한 트립토판 형광값의 변화를 측정하여 변성곡선을 얻었다. 이들 단백질들은 모두 F139W 단백질에 비해 구조형성 성질에 큰 변화를 일으켰으며, 잔기 24번은 구조형성에 중요한 것으로 추정된다.

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트립토판 중합요소 알파 소단위체 $Pr28$longrightarrowLeu 잔기 치환체의 구조 변화

  • 김은주;신혜자;임운기
    • 생명과학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.43-47
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    • 2001
  • A mutant tryptophan synthase $\alpha$-subunit, where Pro28 was replaced with Leu, tends to be expressed in recombinant E. coli. CD and fluorescence spectra of this protein indicate some changes in secondary and tertiary structure. Wild type protein was more or less affected by {TEX}$Ca^{2+}${/TEX} ion in regards of the fluorescent properties of its native, unfolded and intermediate forms, but the mutant protein was not at all. The dramatic structural changes may be related to the aggregation of this mutant protein.

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Crystallization and X-Ray Crystallographic Studies of Wild-Type and Mutant Tryptophan Synthase α-Subunits from Escherichia coli

  • Jeong, Mi Suk;Jang, Se Bok
    • Molecules and Cells
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    • 제19권2호
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    • pp.219-222
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    • 2005
  • The a-subunit of Escherichia coli tryptophan synthase (${\alpha}TS$), a component of the tryptophan synthase ${\alpha}_2{\beta}_2$ complex, is a monomeric 268-residues protein (Mr = 28,600). ${\alpha}TS$ by itself catalyzes the cleavage of indole-3-glycerol phosphate to glyceraldehyde-3-phosphate and indole, which is converted to tryptophan in tryptophan biosynthesis. Wild-type and P28L/Y173F double mutant ${\alpha}$-subunits were overexpressed in E. coli and crystallized at 298 K by the hanging-drop vapor-diffusion method. X-ray diffraction data were collected to $2.5{\AA}$ resolution from the wild-type crystals and to $1.8{\AA}$ from the crystals of the double mutant, since the latter produced better quality diffraction data. The wild-type crystals belonged to the monoclinic space group C2 ($a=155.64{\AA}$, $b=44.54{\AA}$, $c=71.53{\AA}$ and ${\beta}=96.39^{\circ}$) and the P28L/Y173F crystals to the monoclinic space group $P2_1$ ($a=71.09{\AA}$, b=52.70, $c=71.52{\AA}$ and ${\beta}=91.49^{\circ}$). The asymmetric unit of both structures contained two molecules of ${\alpha}TS$. Crystal volume per protein mass ($V_m$) and solvent content were $2.15{\AA}^3\;Da^{-1}$ and 42.95% for the wild-type and $2.34{\AA}^3\;Da^{-1}$ and 47.52% for the double mutant.

대장균 트립토판 생성효소의 소단위체간 상호조절 (Intersubunit Communication of Escherichia coli Tryptophan Synthase)

  • 조원진;임운기
    • 생명과학회지
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    • 제27권12호
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    • pp.1410-1414
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    • 2017
  • 대장균 트립토판 생성효소는 ${\alpha}_2{\beta}_2$ 복합체로 구성되며, 트립토판 생합성에서 최종 2 단계의 반응에 관여한다. 두 개의 소단위체는 분자 터널로 연결되어 있어, 기질 채널링이 일어난다. 활성 부위간 상호 조절하는 정교한 조절 기작에는 ${\alpha}$-루프 L6(${\alpha}L6$), ${\alpha}L2$, ${\alpha}L3$이 관여한다. 본 연구에서는 이 자리의 잔기치환체를 써서 소단위체에 특이적으로 결합하는 리간드의 영향을 조사하여 소단위체간 상호 조절기작에 따른 구조 변화를 살펴보았다. ${\alpha}TS$의 활성부위에 결합하는 D,L-${\alpha}$-glycerophosphate(GP)는 모든 잔기치환체를 야생형 수준으로 회복시켰다. ${\beta}TS$의 기질인 L-Ser는 다양한 효과를 나타낸다. 야생형과 NS104에서는 속도가 감소한 반면, GD51과 PH53에서는 거의 영향이 없었고, PT53와 DG56은 증가하였다. 이는 반응 중간 화학종의 분포의 변화와 연관될 가능성을 제시한다. GP와 L-Ser를 동시에 처리했을 때는 특이하게도 PH53는 가장 안정한 잔기치환체였다. 이는 Pro53가 소단위체간의 조절기작에서 중요한 역할을 하는 것을 시사한다.

고 함량 트립토판 생산 GM 벼 개발 및 전사체 분석 (Development of high tryptophan GM rice and its transcriptome analysis)

  • 정유진;;조용구;강권규
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제42권3호
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    • pp.186-195
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    • 2015
  • Anthranilate synthase (AS)는 트립토판(Trp)과 indole-3-acetic acid, indole alkaloids의 생합성 경로에서 중요한 효소로 작용한다. 트립토판 생합성 상에서 feedback inhibition에 민감하게 반응하는 AS alpha-subunit 관련 OASA2 유전자 영역의 single (F124V) 및 double (S126F/L530D) 점돌연변이로 변형된 유전자의 재조합운반체를 작성하고 이들 유전자들을 Agrobacterium 방법으로 동진벼에 도입하여 형질전환체를 육성하였다. Single 및 double 돌연변이 OsASA2 유전자가 도입된 형질전환 벼 계통들은 nos gene probe를 이용한 TaqMan PCR 방법으로 single copy를 선발하였고, intergenic 계통을 선발하기 위해서 Bfa I 제한효소를 이용하여 RB와 LB 인접서열로부터 IPCR을 통한 FST 분석을 수행하여 4 개의 intergenic 계통을 선발하였다. 도입된 유전자의 발현으로 형질전환 벼는 Trp, IAN 및 IAA가 잎에 가장 많이 축적되었고, 종자의 트립토판 함량도 증가되었다. 후대에서 tryptophan 함량이 높은 S-TG와 D-TG의 두 호모 이벤트 계통을 육성하여 트립토판 함량을 분석한 결과 대조구에 비하여 13~30배 이상 높게 나타났으며, 유리아미노산의 함량도 증가하였다. 이벤트 계통을 이용하여 microarray 분석을 수행한 결과 세포 내 이온 수송, 영양분 공급 등에 영향을 주는 유전자군들이 up-regulation 되었고, 세포 내 기능유전자의 역할을 담당하는 조효소 등이 down-regulation 된 것을 확인 할 수 있었다. 이러한 결과는 선발된 두개의 상동성 이벤트 계통들이 고함량의 유리 트립토판 생산 벼의 육종에 효과적으로 이용될 수 있음을 보여준 결과로 생각된다.

트립토판 중합효소 α 소단위 잔기 치환체 Pro96→Leu의 구조 변화에 영향을 미치는 139 및 258 잔기의 치환 효과 (Effect of Substituted Residue 139 and 258 on Structural Changes of Mutant Tryptophan Synthase Pro96→Leu α-Subunit)

  • 이주연;정재갑;신혜자;임운기
    • 생명과학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.464-468
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    • 2002
  • 대장균 트립토판 중합효소(tryptophan synthase) $\alpha$ 소단 위체의 96번, 139번 과 258번 자리를 돌연변이 시킨 이중 돌연변이체 P96L/F139W, P6L/F258W와 삼중 돌연변이체 P96L/F139W/F258W의 효소 활성도와 형광 분광계를 이용한 분광학적 성질을 조사하였다. 이중 돌연변이체의 효소 활성도는 야생형과 유사하나 삼중 돌연변이체는 40% 감소된 활성도를 가진다. P96L/F139W 와 P96L/F258W의 형광세기는 야생형에 비해 감소하였으나 P96L/F139W/F258W는 야생형에 비해 증가하였다. 효소 활성도와 형광 결과는 96번의 치환이 8번 알파구조와 4번 베타 구조와 4번 알파구조 사이의 loop의 안정성에 영향을 준 것을 나타낸다. 이 결과로부터 P96L/F139W/F258W는 야생형과 다른 3차 구조를 가지나 139번과 258면 주위는 더 조밀한 구조를 가지고 있다는 것을 보여준다.