DNA methylation is a well-characterized epigenetic modification that plays central roles in mammalian development, genomic imprinting, X-chromosome inactivation and silencing of retrotransposon elements. Aberrant DNA methylation pattern is a characteristic feature of cancers and associated with abnormal expression of oncogenes, tumor suppressor genes or repair genes. Ten-eleven-translocation (TET) proteins are recently characterized dioxygenases that catalyze progressive oxidation of 5-methylcytosine to produce 5-hydroxymethylcytosine and further oxidized derivatives. These oxidized methylcytosines not only potentiate DNA demethylation but also behave as independent epigenetic modifications per se. The expression or activity of TET proteins and DNA hydroxymethylation are highly dysregulated in a wide range of cancers including hematologic and non-hematologic malignancies, and accumulating evidence points TET proteins as a novel tumor suppressor in cancers. Here we review DNA demethylation-dependent and -independent functions of TET proteins. We also describe diverse TET loss-of-function mutations that are recurrently found in myeloid and lymphoid malignancies and their potential roles in hematopoietic transformation. We discuss consequences of the deficiency of individual Tet genes and potential compensation between different Tet members in mice. Possible mechanisms underlying facilitated oncogenic transformation of TET-deficient hematopoietic cells are also described. Lastly, we address non-mutational mechanisms that lead to suppression or inactivation of TET proteins in cancers. Strategies to restore normal 5mC oxidation status in cancers by targeting TET proteins may provide new avenues to expedite the development of promising anti-cancer agents.
Seong, Eui Sun;Youn, Hye Jin;Park, Min Kyung;Boo, Hye Yeon;Lee, Bom Yi;Ryu, Hyun Mee;Han, You Jung
Journal of Genetic Medicine
/
v.15
no.1
/
pp.8-12
/
2018
Purpose: This study aimed to investigate fetal ultrasonographic findings in cases of prenatally diagnosed de novo balanced translocations and the role of fetal ultrasound in prenatal genetic counseling. Materials and Methods: We collected cases with de novo balanced translocations that were confirmed in chorionic villus sampling, amniocentesis, and cordocentesis between 1995 and 2016. A detailed, high-resolution ultrasonography was performed for prediction of prognosis. Chromosomes from the parents of affected fetuses were also analyzed to determine whether the balanced translocations were de novo or inherited. Results: Among 32,070 cases with prenatal cytogenetic analysis, 27 cases (1/1,188 incidence) with de novo balanced translocations were identified. Fourteen cases (51.9%) showed abnormal findings, and the frequency of major structural anomalies was 11.1%. Excluding the major structural anomalies, all mothers who continued pregnancies delivered healthy babies. Conclusion: Results of a detailed, high-resolution ultrasound examination are very important in genetic counseling for prenatally diagnosed de novo balanced translocations.
Kim, Min Kyung;Kim, Bongjun;Kwon, Jun-Oh;Song, Min-Kyoung;Jung, Suhan;Lee, Zang Hee;Kim, Hong-Hee
Molecules and Cells
/
v.42
no.11
/
pp.810-819
/
2019
For physiological or pathological understanding of bone disease caused by abnormal behavior of osteoclasts (OCs), functional studies of molecules that regulate the generation and action of OCs are required. In a microarray approach, we found the suppression of tumorigenicity 5 (ST5) gene is upregulated by receptor activator of nuclear $factor-{\kappa}B$ ligand (RANKL), the OC differentiation factor. Although the roles of ST5 in cancer and ${\beta}-cells$ have been reported, the function of ST5 in bone cells has not yet been investigated. Knockdown of ST5 by siRNA reduced OC differentiation from primary precursors. Moreover, ST5 downregulation decreased expression of NFATc1, a key transcription factor for osteoclastogenesis. In contrast, overexpression of ST5 resulted in the opposite phenotype of ST5 knockdown. In immunocytochemistry experiments, the ST5 protein is colocalized with Src in RANKL-committed cells. In addition, ST5 enhanced activation of Src and Syk, a Src substrate, in response to RANKL. ST5 reduction caused a decrease in RANKL-evoked calcium oscillation and inhibited translocation of NFATc1 into the nucleus. Taken together, these findings provide the first evidence of ST5 involvement in positive regulation of osteoclastogenesis via Src/Syk/calcium signaling.
Lee, Jisun;Jung, Ilseon;Choi, Ji Won;Lee, Chang Won;Cho, Sarang;Choi, Tae Gyu;Sohn, Minn;Park, Yong Il
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.29
no.5
/
pp.704-712
/
2019
Although nanometric dead Lactobacillus plantarum has emerged as a potentially important modulator of immune responses, its underlying mechanism of action has not been fully understood. This study aimed to identify the detailed biochemical mechanism of immune modulation by micronized and heat-treated L. plantarum LM1004 (MHT-LM1004, <$1{\mu}m$ in size). MHT-LM1004 was prepared from L. plantarum LM1004 via culture in a specifically designed membrane bioreactor and heat treatment. MHT-LM1004 was shown to effectively induce the secretion of $TNF-{\alpha}$ and IL-6 and the mRNA expression of inducible nitric oxide synthase (iNOS). MHT-LM1004 enhanced the expression of TLR-2, phosphorylation of MAPKs (ERK), and nuclear translocation of $NF-{\kappa}B$ in a dose-dependent manner. Oral administration of MHT-LM1004 ($4{\times}10^9$ or $4{\times}10^{11}cells/kg$ mouse body weight) increased the splenocyte proliferation and serum cytokine levels. These results suggested that MHT-LM1004 effectively enhances early innate immunity by activating macrophages via the TLR-2/MAPK/$NF-{\kappa}B$ signalling pathway and that this pathway is one of the major routes in immune modulation by the Lactobacillus species.
Gyusang Jeong;Seung Hyun Shin;Su Na Kim;Yongjoo Na;Byung Cheol Park;Jeong Hun Cho;Won-Seok Park;Hyoung-June Kim
Journal of Ginseng Research
/
v.47
no.3
/
pp.440-447
/
2023
Background: The human hair follicle undergoes cyclic phases-anagen, catagen, and telogen-throughout its lifetime. This cyclic transition has been studied as a target for treating hair loss. Recently, correlation between the inhibition of autophagy and acceleration of the catagen phase in human hair follicles was investigated. However, the role of autophagy in human dermal papilla cells (hDPCs), which is involved in the development and growth of hair follicles, is not known. We hypothesized that acceleration of hair catagen phase upon inhibition of autophagy is due to the downregulation of Wnt/β-catenin signaling in hDPCs, and that components of Panax ginseng extract can increase the autophagic flux in hDPCs. Methods: We generated an autophagy-inhibited condition using 3-methyladenine (3-MA), a specific autophagy inhibitor, and investigated the regulation of Wnt/β-catenin signaling using the luciferase reporter assay, qRT-PCR, and western blot analysis. In addition, cells were cotreated with ginsenoside Re and 3-MA and their roles in inhibiting autophagosome formation were investigated. Results: We found that the unstimulated anagen phase dermal papilla region expressed the autophagy marker, LC3. Transcription of Wnt-related genes and nuclear translocation of β-catenin were reduced after treatment of hDPCs with 3-MA. In addition, treatment with the combination of ginsenoside Re and 3-MA changed the Wnt activity and hair cycle by restoring autophagy. Conclusions: Our results suggest that autophagy inhibition in hDPCs accelerates the catagen phase by downregulating Wnt/β-catenin signaling. Furthermore, ginsenoside Re, which increased autophagy in hDPCs, could be useful for reducing hair loss caused by abnormal inhibition of autophagy.
The aim of this study was to investigate the effects of red ginseng-derived non-saponin fraction (NSF) on inflammatory responses and monocyte-to-macrophage differentiation in RAW264.7 and THP-1. NSF effectively inhibited inflammatory responses by downregulating nitric oxide (NO) production and protein levels of inducible nitric oxide synthase (iNOS) and cyclooxygenase-2 (COX-2). NSF ($2000{\mu}g/mL$) decreased the levels of NO, iNOS, and COX-2 by 33, 83, and 64%, respectively. NSF inhibited the differentiation of monocyte-to-macrophage by decreasing cell adherence along with downregulation of the cluster of differentiation molecule $11{\beta}$ ($CD11{\beta}$) and CD36. In addition, pro-inflammatory cytokines, such as tumor necrosis factor-alpha, interleukin 6, and monocyte chemoattractant protein 1 (MCP-1), were significantly reduced with NSF treatment. The NSF-mediated inhibition of inflammatory responses was due to the regulation of nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells ($NF-{\kappa}B$) and nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 (Nrf2). NSF effectively suppressed the translocation of $NF-{\kappa}B$ into the nucleus, while nuclear Nrf2 and its target protein, heme oxygenase-1, levels were significantly increased.
This experiment was conducted to evaluate the effects of high temperature on the stem, leaf and grain of barley during the ripening period and to provide information for the development of high-temperature cultivation techniques and adaptive varieties. We used an artificial climate control facility, to provide a temperature $3^{\circ}C$ higher than the normal average temperature during the ripening stage. Although the maximum rate of starch synthesis was increased at high temperature by approximately 11%, the starch content was decreased, because the period of starch synthesis ended 4 days earlier. As in the case of starch synthesis, the expression of genes related to starch synthesis was increased at the early ripening stage in the high temperature treatment, however, the duration of expression tended to decrease rapidly. Furthermore, the partitioning rate of assimilation products in the panicle increased to a greater extent in the high temperature treatment than in the control. In contrast, for the stem and leaf, the partitioning rate of assimilation products decreased more rapidly in the high temperature treatment than in the control. On the basis of these results, it can be considered that the translocation rate of assimilation products increased to a greater extent in the high temperature treatment than in the control at the early ripening stage. These results indicate that the decrease in grain weight at high temperature during the ripening stage is attributable to an increase in the speed of starch synthesis at high temperature, but the increase in ripening speed does not compensate for the shortening of the ripening period. Finally to develop varieties and cultivation techniques suited to high temperature, we need to focus on physiological characteristics related to the duration of starch synthesis.
Polychlorinated biphenyls (PCBs) are ubiquitous environmental contaminants, found in the many environments. PCBs exerts various toxicological effects, including endocrine-disrupting activity. Most researches with these toxicants performed with soil matrix with mixtures of congeners, namely Aroclor, while the biological activities have been tested with animals. However, studies with pure congeners are limited. In this study, 5 congeners were synthesized and their fates (bioaccumulation, degradation, kinetics) were studied in carrot-soil system. The soil half-lives of biphenyl, PCB-1, PCB-3, PCB-77, and PCB-126 were 20.2, 16.0, 11.6, 46.5, 198.0 days, respectively. In general, the longer half-lives were observed with the higher hydrophoicity of PCBs. Times, required for maxium accumulation of PCBs in carrot (Tmax) were 10-20 days for most congeners and the concentrations were 0.4-2.6 mg/kg. The concentrations of PCBs in carrot were kept as constant after Tmax, except PCB-126. The concentration ratio between carrot and soil after 90 days of treatment were 1.7, 8.1, 1.9, 1.8, and 5.9 for biphenyl, PCB-1, PCB-3, PCB-77, and PCB-126. Because of the increase of biomass, the total residual amount of PCBs in carrots however, increased till the end of experiment. The portions of PCB-126 in carrot were 1.1% of the soil residues at 90 days after planting.
This study was conducted to detect lead which is exhausted with gas from running automobiles and is considered to accumulate in cropping lands. Soil samples were taken from uplands and paddy fields with different distance from highways. atonic absorption spectrophotometer was applied for analysis. Results obtained are summarized as follows: 1. In the areas of Seoul toll gate and Jookjeon, Gyeonggi province, soils of fields within $3\~5$ meters from highway appeared to contain $11\~110\;ppm$ of lead. On the other hand, soils outside of $3\~5$ meters showed only natural background level of lead. 2. The maximum concentration of lead in Hwoedeuk area (Choong-nam p개vince) was 16.3 ppm and those of Kimhae and Dongrae areas were about 12 ppm. Low concentration of $1\~4\;ppm$ was observed in the areas, south of Daejeon along the Honam and Namhae highways. 3. Lead seemed to accumulate in the soil surface within the range of 0 to 5 centimeters which anable to expect little translocation to deeper layer of the soil. 4. lost of arable lands locates at least 15 meters apart from highways so that lead concentrations were lower than expected. No damage could be speculated with the present concentration of lead analyzed. This does not deny the necessity to the long term dectect of the possible pollutant.
Background: Pediatric acute lymphoblastic leukemia (pALL) patients at King Abdulaziz Medical City represent a pure Saudi Arabian population. ETV6-RUNX1 positive pALL patients have good prognosis as compared to ETV6-RUNX1 negative counterparts. Therefore, frequencies of these two patient groups have a huge consideration in treatment strategies of pALL in a given population. Different geographical locations have been reported to have different frequencies of ETV6-RUNX1 ranging from 10% in Southeast Asia to 30% in Australia. Aim: Therefore, the objective of this study was to establish the ETV6-RUNX1 status of Saudi Arabian pALL patients and its association with clinical parameters and early remission. Materials and Methods: Clinical parameters and ETV6-RUNX1 status (using FISH technique) of pALL patients attending the Pediatric Oncology Clinic, King Abdulaziz Medical City, Riyadh from 2006 to 2011 were studied. Comparisons between ETV6-RUNX1 positive and negative groups were accomplished using chi-square test or Fisher's exact test. All statistical analyses were performed using SAS version 9.2 (SAS Institute, Inc., Cary, NC). Results: Out of 54 patients, 33 were male and 21 were females (ratio 1.57:1). B- and T-cell lineages were found in 47 (87%) and 7 (13%) patients respectively. Only 5 (9.3%) patients were ETV6-RUNX1 positive while 49(80.7%) were ETV6-RUNX1 negative. All ETV6-RUNX1 patients (100%) were of B-cell lineage and 80% (4/5) were in the 3-7 year age group. None of the ETV6-RUNX11 patients had ${\geq}5%$ blasts (no remission) at day 14 as compared with 9% in the ETV6-RUNX1 negative group (Figure 1). Conclusions: Frequency of ETV6-RUNX1 positive patients (less than 10%) in our pALL patients is much lower than reported for most European countries, North America, Australia and Japan while it is in accordance with ETV6-RUNX1 frequencies from Egypt (11.6%), Pakistan (10%), Spain (2%) and India (5-7%). This shows ethnic differences in genetics of pALL as well as higher frequencies of ETV6-RUNX1 positive pALL mostly in more industrialized countries, probably due to some industrial pollutants or westernized lifestyle.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.