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Identification of the Marker Genes Related With Chronic Mitral Valve Disease in Dogs

  • Yoon, Byung-Gook;Lee, Dong-Soo;Seo, Kyoung-Won;Song, Kun-Ho
    • 한국임상수의학회지
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    • 제36권4호
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    • pp.190-195
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    • 2019
  • We aimed to identify genomic variations as well as the marker genes related with chronic mitral valve disease (CMVD) in Canis lupus familiaris using whole genome resequencing, which provides valuable resources for further study. Two ten-year old female Canis lupus familiaris English cocker spaniels were used for this study, one control and one who had been diagnosed as CMVD. For the whole genome resequencing, muscles from the left ventricular wall were collected from each dog. With the HiSeq DNA Shotgun library and $HiSeq^{TM}$ 2000 platform, whole genome resequencing was performed. From the results, we identified 5 million and 6 million variants in gene expression in the control and CMVD-diagnosed subject, respectively. We then selected the top 1,000 genes from the SNP, INS, and DEL mutation and 675 genes among them were overlapped for every mutation between the control and CMVD-diagnosed patient. Interestingly, in both groups, the intron variant (91.16 and 91.18%) and upstream variant (3.10 and 3.08%) are most highly related. Among the overlapped 675 genes, gene ontology for intracellular signal transduction is highly counted in INS, and DEL, and SNPs (35, 33, 31, respectively). In this study, we found that the COL and CDH gene families could be key molecules in identifying the difference in gene expression between control and CMVD-diagnosed dogs. We believe further studies will prove the importance of variants in key molecule expression and that these data will serve as a valuable foundation stone the study of canine CMVD.

저병원성 조류인플루엔자와 뉴캐슬 바이러스의 복합감염에 따른 닭 림프조직 병변의 특성 및 바이러스 검출 (Pathology and virus distribution in the lymphoid tissues of chicks co-infection with H9N2 Avian influenza and Newcastle disease virus)

  • 이성민;조은상;최환원;최보현;손화영
    • 한국동물위생학회지
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    • 제42권3호
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    • pp.135-144
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    • 2019
  • Low pathogenic avian influenza (LPAI; H9N2) and Newcastle disease (ND) are economically important poultry diseases in Korea. In this study, we investigated pathological features and virus distribution in the lymphoid tissues of chicks experimentally infected with H9N2 and/or ND virus. Six-weeks-old SPF chickens were divided into 4 groups, Control (C), H9N2 (E1), NDV (E2), and H9N2+NDV (E3). E1 group was challenged with 0.1 ml A/Kr/Ck/01310/01 (H9N2) $10^{5.6}$ $EID_{50}$ intranasally, E2 group was challenged with 0.5 ml KJW (NDV) $10^{5.0}{\sim}10^{6.0}$ $ELD_{50}$ intramuscularly, and E3 group was challenged with H9N2, followed 7 days later by NDV. In histopathological examination, E1 group showed depletion and necrosis in bursa of Fabricius, thymus, cecal tonsil, and spleen, whereas E2 and E3 groups were noted severe lymphocyte depletion and necrosis with destruction of lymphoid organs structures. In TUNEL assay, apoptotic bodies were detected in lymphoid organs of all experimental groups, which was most severe in E3 group. H9N2 and ND viruses were predominantly detected in cecal tonsil of E1, E2, and E3 groups by PCR and immunohistochemistry (ICH). In conclusion, co-infection of H9N2 with NDV caused severe pathologic lesions and apoptosis in lymphoid tissues compared to single infections.

안동댐과 임하댐 퇴적물 및 유입 부유물질의 중금속 특성 연구 (A Study on Heavy metal Characteristics of Sediments and inflow Suspended Solid of Andong and Imha-Dam)

  • 서정민;김영훈;권혁진;김정진
    • 한국광물학회지
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    • 제32권2호
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    • pp.103-111
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    • 2019
  • 본 연구에서는 안동댐과 임하댐의 퇴적물과 유입되는 부유물의 특성을 색도분석, X-선회절분석 및 유도플라즈마/질량분석법을 이용하여 분석하였다. 안동댐과 임하댐으로 유입되는 부유물 및 댐 퇴적물의 광물조성은 석영, 사장석, 녹니석, 일라이트이며 소량의 몬모릴로나이트와 캐올리나이트를 포함하고 있다. 안동댐 퇴적물과 다르게 임하댐 퇴적물에는 다량의 방해석을 포함하고 있다. 색도는 시료에 따라 약간의 차이가 있지만 회갈색에서 어두운 주황색 정도이다. 퇴적물의 중금속 농도는 안동댐이 임하댐보다 더 높다. 안동댐과 임하댐 퇴적물과 유입 부유물질의 주요 중금속 농도는 미국의 국립해양대기관리청의 기준을 적용할 경우 높은 오염도를 나타낸다. 안동댐 퇴적물의 중금속 농도가 임하댐보다 높은 것은 안동댐으로 유입되는 부유물질의 중금속 농도가 임하댐으로 유입되는 부유물질의 중금속 농도보다 높기 때문이다.

식물 병 방제 및 생육촉진 효과를 나타내는 Pseudomonas parafulva PpaJBCS1880균주의 유전체 염기서열 (Complete genome sequencing of Pseudomonas parafulva PpaJBCS1880, a biocontrol and plant growth promoting agent)

  • 더타스와나리;와비오나알렉스;카켐보데이비드;이용훈
    • 미생물학회지
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    • 제55권3호
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    • pp.286-288
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    • 2019
  • 벼 종자에서 분리한 Pseudomonas parafulva PpaJBCS1880 (PpaJBCS1880) 균주는 lipopeptide를 분비하여 식물의 세균 병원균에 대해 강력한 항균력을 나타냈다. 또한, PpaJBCS1880는 콩불마름병의 발생을 억제하였을 뿐만 아니라, 벼의 생육을 촉진하였다. 이에 따라, 본 연구에서는 PpaJBCS1880 균주의 전체염기서열을 해독하고 분석하였는데, 총 염기서열은 5,208,480 bp였고, GC 함량은 63.4%였다. 염색체는 4,487개의 단백질을 암호화하였고, 19개의 rRNA와 74개의 tRNA로 구성되어 있었다. 유전체의 분석을 통해 2차 대사산물인 lipopeptide, pyoverdine, phenazine 및 hydrogen cyanide 등을 생산하는 것을 확인하였는데, 이들 대사산물에 의해 항균력, 생물방제 및 생육촉진 효과를 나타내는 것으로 판단된다.

혼합회귀모형에서 콤포넌트 및 설명변수에 대한 벌점함수의 적용 (Joint penalization of components and predictors in mixture of regressions)

  • 박종선;모은비
    • 응용통계연구
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    • 제32권2호
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    • pp.199-211
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    • 2019
  • 주어진 회귀자료에 유한혼합회귀모형을 적합하는 경우 적절한 성분의 수를 선택하고 선택된 각각의 회귀모형에서 의미있는 예측변수들의 집합을 선택하며 동시에 편의와 변동이 작은 회귀계수 추정치들을 얻는 것은 매우 중요하다. 본 연구에서는 혼합선형회귀모형에서 성분의 개수와 회귀계수에 벌점함수를 적용하여 적절한 성분의 수와 각 성분의 회귀모형에 필요한 설명변수들을 동시에 선택하는 방법을 제시하였다. 성분에 대한 벌점은 성분들의 로그값에 SCAD 벌점함수를 적용하였고 회귀계수들에는 SCAD와 더불어 MCP 및 Adplasso 벌점함수들을 사용하여 가상자료와 실제자료들에 대한 결과를 비교하였다. SCAD-SCAD 벌점함수 조합과 SCAD-MCP 조합의 경우 기존의 Luo 등 (2008)의 방법에서 문제가 되었던 과적합 문제를 해결함과 동시에 선택된 성분의 수와 회귀계수들을 효과적으로 선택하였으며 회귀계수들의 추정치에 대한 편의도 크지 않았다. 본 연구는 성분의 수가 알려져 있지 않은 회귀자료에서 적절한 성분의 수와 더불어 각 성분에 대한 회귀모형에서 모형에 필요한 예측변수들을 동시에 선택하는 방법을 제시하였다는데 의미가 있다고 하겠다.

Assessment of flowing ability of self-compacting mortars containing recycled glass powder

  • Alipour, Pedram;Namnevis, Maryam;Tahmouresi, Behzad;Mohseni, Ehsan;Tang, Waiching
    • Advances in concrete construction
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    • 제8권1호
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    • pp.65-76
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    • 2019
  • This paper investigates the effect of recycled glass powder (RGP) on flowing properties of self-compacting mortars (SCMs) containing different ratios of fillers and superplasticizer dosages. Fly ash (FA), nano-silica (NS), micro-silica (MS), metakaolin (MK) and rice husk ash (RHA) are used as fillers and their synergistic effect with RFP is studied. The effects of fillers and high-range water reducer (HRWR) on flowing ability of mortars are primarily determined by slump flow and V-funnel flow time tests. The results showed that for composites with a higher RGP content, the mortar flowing ability increased but tended to decrease when the composites containing 10% MK or 5% RHA. However, the flowing ability of samples incorporating 5% RGP and 10% SF or 25% FA showed an opposite result that their slump flow spread decreased and then increased with increasing RGP content. For specimens with 3% NS, the influence of RGP content on flowing properties was not significant. Except RHA and MS, the fillers studied in this paper could reduce the dosage of HRWR required for achieving the same followability. Also, the mixture parameters were determined and indicated that the flowability of mixtures was also affected by the content of sand and specific surface area of cement materials. It is believed that excess fine particles provided ball-bearing effect, which could facilitate the movement of coarse particles and alleviate the interlocking action among particles. Also, it can be concluded that using fillers in conjunction with RGP as cementitious materials can reduce the material costs of SCM significantly.

한방치료로 완전 청력회복을 보인 돌발성 난청 환자 치험 3례 (Three Cases of Sudden Sensorineural Hearing Loss with Complete Recovery by Korean Medical Treatment)

  • 김수영;김경한;안재현;황미리;제하경;정현아
    • 한방안이비인후피부과학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.212-223
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    • 2019
  • Objectives : The purpose of this study is to report three cases of Korean medical treatment for sudden sensorineural hearing loss(SSHL). Methods : This study conducted with three sensorineural hearing loss patients who hospitalized in Ophthalmology, Otolaryngology & Dermatology Clinic of Korean Medical Hospital. Three patients were treated with herbal medicine(Sunkihwalhyeol-tang, Ikgibohyeol-tang, Gongjindan) and acupuncture. After treatment, we evaluated Siegel's Criteria with pure tone audiometry and subjective symptoms alteration. Results : All three patients were completely recovery about Siegel's Criteria and improved subjective symptoms after treatment. Conclusions : This study suggests that Korean medical treatment may be effective about SSHL.

배양기법을 활용한 제주도내 내산 및 호염성 미생물의 분리 및 특성 분석 (Isolation and characterization of acid-resistanct and halophilic bacteria using cultivation technique in Jeju island)

  • 한빛;김민지;류다정;이기은;이병희;이은영;박수제
    • 미생물학회지
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    • 제55권3호
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    • pp.248-257
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    • 2019
  • 본 연구에서는 제주 지역의 토양 및 해양 환경으로부터 약 70주의 미생물들을 분리하였으며, 16S ribosomal RNA 유전자 분석을 통하여 최종 21종의 미생물을 발굴하였다. 이들 미생물들은 5 강(Class) 16 속(Genus)에 속하며, 모두 국내 미기록종으로 확인되었다. 분리된 미생물의 기질 특이성 및 고분자 물질 분해능을 바탕으로 내산성과 호염성 미생물들의 생리활성 표현형은 서로 구별되는 것으로 관찰되었다. 본 연구결과는, 국내 미생물 자원활용에 기초적 정보를 제공할 것으로 기대된다.

상황버섯 수집균주로 기능성 우수균주 선발 및 적합 곡물배지 개발 (Selection of good bioactive strains from collected Phellinus sp. and development of suitable grain media)

  • 김정한;백일선;신복음;권희민;이용선
    • 한국버섯학회지
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    • 제17권3호
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    • pp.107-112
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    • 2019
  • 상황버섯 균사체 추출물을 이용한 건강 기능성 소재로 개발하기 위하여 수행한 연구는 다음과 같다. 수집균주 8종 가운데 균사생장과 항산화활성이 우수한 장수상황과 GMPL48007을 선발하였다. 장수상황은 폴리페놀 함량(20.5mg/g)과 환원력이 1.307로 우수하였고, GMPL48007 균주는 DPPH 라디컬 소거능이 89.4%로 우수하였다. 곡물재료별 추출수율은 통밀배지에서 장수와 GMPL이 각각 6.2%, 8.2%로 우수하였고, 베타글루칸 함량은 GMPL48007 균주를 통밀배지에서 배양시에 가장 높은 함량을 보였다.

흑연 코팅 집전체를 이용한 Lithium Terephthalate 기반 리튬-유기 이차전지의 전기화학적 특성 개선 (Improving the Electrochemical Properties of Lithium Terephthalate-based Lithium-Organic Battery with A Graphite Coated Current Collector)

  • 권오현;김종빈;김재광
    • 전기화학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.122-127
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    • 2019
  • 유기이차전지가 가지고 있는 전극 내 낮은 접합력과 높은 계면저항의 단점을 해결하기 위하여 본 연구에서는 흑연 코팅 처리된 집전체를 사용하여 lithium terephthalate (LTA)전지의 전기화학적 특성 변화를 분석하였다. LTA 음극 활물질은 산의 이온 치환반응에 의하여 불순물 없이 합성되어 졌다. 막대 형태의 LTA 활물질로 제작된 전극과 흑연 코팅 처리된 집전체와의 접합특성은 SEM 단면과 EIS를 통하여 확인하였다. 흑연 코팅된 집전체를 사용한 LTA전지의 계면저항은 현저히 감소되었다. 순수한 금속 집전체 LTA 전지와 흑연 코팅 처리된 금속 기판 LTA 전지는 0.1C의 두 번째 사이클에서 107.6 mAh/g와 148.8 mAh/g의 방전 용량을 보인다. 흑연 코팅된 집전체를 사용한 LTA 전지는 순수한 LTA 전지에 비하여 우수한 수명 특성과 높은 방전 용량, 그리고 높은 고율 특성을 가진다.