• 제목/요약/키워드: Tm3+

검색결과 2,033건 처리시간 0.025초

Computational Identification and Comparative Analysis of Secreted and Transmembrane Proteins in Six Burkholderia Species

  • Nguyen, Thao Thi;Lee, Hyun-Hee;Park, Jungwook;Park, Inmyoung;Seo, Young-Su
    • The Plant Pathology Journal
    • /
    • 제33권2호
    • /
    • pp.148-162
    • /
    • 2017
  • As a step towards discovering novel pathogenesis-related proteins, we performed a genome scale computational identification and characterization of secreted and transmembrane (TM) proteins, which are mainly responsible for bacteria-host interactions and interactions with other bacteria, in the genomes of six representative Burkholderia species. The species comprised plant pathogens (B. glumae BGR1, B. gladioli BSR3), human pathogens (B. pseudomallei K96243, B. cepacia LO6), and plant-growth promoting endophytes (Burkholderia sp. KJ006, B. phytofirmans PsJN). The proportions of putative classically secreted proteins (CSPs) and TM proteins among the species were relatively high, up to approximately 20%. Lower proportions of putative type 3 non-classically secreted proteins (T3NCSPs) (~10%) and unclassified non-classically secreted proteins (NCSPs) (~5%) were observed. The numbers of TM proteins among the three clusters (plant pathogens, human pathogens, and endophytes) were different, while the distribution of these proteins according to the number of TM domains was conserved in which TM proteins possessing 1, 2, 4, or 12 TM domains were the dominant groups in all species. In addition, we observed conservation in the protein size distribution of the secreted protein groups among the species. There were species-specific differences in the functional characteristics of these proteins in the various groups of CSPs, T3NCSPs, and unclassified NCSPs. Furthermore, we assigned the complete sets of the conserved and unique NCSP candidates of the collected Burkholderia species using sequence similarity searching. This study could provide new insights into the relationship among plant-pathogenic, humanpathogenic, and endophytic bacteria.

Cow's Milk-Related Symptom Score in Presumed Healthy Polish Infants Aged 0-6 Months

  • Bigorajska, Karolina;Filipiak, Zuzanna;Winiarska, Paulina;Adamiec, Anita;Trent, Bogumila;Vandenplas, Yvan;Ruszczynski, Marek;Szajewska, Hania
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
    • /
    • 제23권2호
    • /
    • pp.154-162
    • /
    • 2020
  • Purpose: The Cow's Milk-related Symptom Score (CoMiSSTM), which considers crying, regurgitation, stools, skin and respiratory symptoms, was developed as an awareness tool for evaluating cow's milk-related symptoms. The scoring ranges from 0 to 33. A score ≥12 was proposed as being likely cow's milk-related and suggestive of allergy to cow's milk. This study aimed to determine the age-related CoMiSSTM values in presumed healthy infants in Poland. Methods: This was a cross-sectional study conducted in well-child clinics in two locations. Parents of the presumed healthy infants aged ≤6 months were approached during a routine checkup/vaccination visit. The exclusion criteria were as follows: presence of acute or chronic diseases, preterm delivery, treatment with therapeutic formula, and use of any food supplements (except vitamins) or medications. Results: Data from 226 infants were obtained (median age [Q1-Q3], 4 months [3-4]). The overall median (Q1-Q3) and mean (standard deviation) CoMiSSTM values were 4 (2-7) and 4.7 (3.5), respectively. The 95th percentile was 11. Scores on some, albeit not all, components of the CoMiSSTM significantly differed between age groups (crying, stools) or feeding type groups (stools and skin symptoms). Eleven children (4.9%) scored ≥12. Conclusion: This study adds to earlier age-related CoMiSSTM data by providing CoMiSSTM values in presumed healthy infants in Poland.

그래픽 사용자 인터페이스 기반 항공자력탐사 전처리 S/W, KMagLevellingTM (Aeromagnetic Pre-processing Software Based on Graphic User Interface, KMagLevellingTM)

  • 고광범;정상원
    • 지구물리와물리탐사
    • /
    • 제17권3호
    • /
    • pp.171-178
    • /
    • 2014
  • 항공자력탐사의 전처리(pre-processing)는 육상탐사에 비해 손품이 많이 들어가는 복잡한 과정이 더 많아 그래픽 사용자 인터페이스 기반의 전용 처리도구를 이용하는 것이 가장 효율적이다. 본 글에서는 항공자력자료의 전처리 전용 소프트웨어, $KMagLevelling^{TM}$을 개발하고 그 주요 기능을 간략히 소개하였다. $KMagLevelling^{TM}$은 전처리 과정을 크게 세부분으로 구분하여 구현하였다. 세부기능별 사용자 인터페이스 중 편의성과 독창성 측면에서 주목할 만한 기능으로서는 (1) 방대한 양의 항공자력자료 D/B를 비행경로 형태로 시각화하여 표현하는 기법 (2) 취합자료 중 특정 영역의 필요한 자료만의 발췌 (3) 자력자료 내의 원치 않는 부분을 선택적으로 쉽게 제거하는 사용자 인터페이스의 세 가지로 요약된다.

마이와이 표준의 열 센서망의 3차원 실시간 자료 시각화를 위한 가상 현실 모델링 언어 데이터베이스 액세스 (VRML Database Access for 3D Real-time Data Visualization in MiWiTM Thermal Wireless Sensor Network)

  • 만설분;양의;최검;정도;마려
    • 전자공학회논문지
    • /
    • 제49권12호
    • /
    • pp.164-170
    • /
    • 2012
  • 본 논문에서는 중국 현지 염색 기업의 열 센서망에 적용 가능한 원격 가상 현실 제어 플랫폼에서 실행할 수 있는 데이터베이스 액세스를 가상 현실 모델링 언어 (VRML)를 소개하였다. 또한, 3차원 실시간 자료 시각화를 위한 가상 현실 모델링 언어-액티브엑스 서버 페이지(VRML-ASP)를 소개하였다. 나아가 이와 관련된 스크립트도 다루었을 뿐만 아니라, 열 센서 노드와 센서 영역에서의 움직임을 분석하였다. 이 데이터베이스 프레임워크는 마이크로칩에서 발표한 마이와이$^{TM}$($MiWi^{TM}$)의 표준에 최적화되었다. 이러한 분석 결과를 근거로, 시스템 구성에 따라 가상 현실 모델링 언어-액티브엑스 서버 페이지(VRML-ASP) 데이터 액세스 프레임워크가 가상 현실 원격 산업 공정 제어 시스템을 위한 하나의 경쟁력 있는 데이터 관리 해결책이 될 수 있음을 확인할 수 있었다.

PLD법을 이용한 $TmBa_{2}Cu_{3}O_{7-x}$ 초전도 선재 제작 및 전류전송특성 평가 (Fabrication and Current Transport Properties of $TmBa_{2}Cu_{3}O_{7-x}$ Coated Conductor by PLD Process)

  • 권오정;고락길;구현;배성환;정명진;오상수;박찬
    • 전기학회논문지
    • /
    • 제58권11호
    • /
    • pp.2209-2213
    • /
    • 2009
  • $REBa_{2}Cu_{3}O_{7-d}$(REBCO) coated conductors(REBCO CCs) have been studied for electric power applications which require high current density wires. As long as the critical transition temperature(Tc) is concerned, REBCO CCs with large $RE^{3+}$ ions have been expected to have better current transport properties than those with smaller $RE^{3+}$ ions. For this reason, REBCO's with large $RE^{3+}$ ions which include GdBCO, NdBCO and SmBCO have been mainly considered as the superconducting layer of CCs. On the other hand, REBCO's with smaller $RE^{3+}$ions are expected to have advantages in the fabrication process of CCs because of the lower melting temperature. But it has not yet been made clear which REBCO is the most suitable for the superconducting layer of CCs. In this study, we investigated the current transport properties of REBCO CCs with small $RE^{3+}$ ion and advantages of using that in the CC fabrication process. Thin films of TmBCO, which has smaller $RE^{3+}$ion than most other $RE^{3+}$ ions, were fabricated on buffered metal substrate as the superconducting layer of CC by PLD process. TmBCO CC shows critical current density (Jc (77 K, sf) = $2.3\;MA/cm^2$) high enough to be utilized for application in electric power devices. Compared with previous experiments using the same PLD system, deposition temperature was approximately $20^{\circ}C$ lower than NdBCO thin films on buffered metal substrates.

Resazurin(alarmar Blue$^{TM}$)을 이용한 효적인 in vitro항비듬력 측정법 (The Effective in vitro Anti-dandruff Test Method with Resazurin(alarmar Blue$^{TM}$))

  • 박병덕;흥선영;정세규;조인식;구형서;한일민;이상명;이완규
    • 대한화장품학회지
    • /
    • 제25권3호
    • /
    • pp.47-66
    • /
    • 1999
  • Resazurin(alarmar Blue$^{TM}$)을 이용하여 in vitro 적으로 P. ovale의 최소 발육저지농도 (Minimum Inhibitory Concentration , MIC)를 측정함으로써 여러 가지 조성의 항비듬제의 항비듬 효과를 측정하고자 하였다. 최적의 실험 조건을 결정하기 위한 기초 실험 결과, 약 2.6$\times$$10^{5}$ cfu/$m\ell$ 이상의 농도로 P. ovate가 주입되는 경우 alarmar Blue$^{TM}$ 흡광도의 변화를 정 하게 관찰할 수 있었고 alannar Blue$^{TM}$ 자체의 희석 배율이 1:1-1:4이며, 16시간과 24 시간 배양을 하여야 비교적 정량적인 결과를 얻을 수 있었다. alarmar Blue$^{TM}$ 가 균체의 증식에 미치는 영향을 고찰하여 본 결과 1:1의 희석 용액에서도 alarmar Blue$^{TM}$가 균체의 증식에 영향을 미치지 못함을 알 수 있었다. Zinc pyrithione과 Climbazole의 혼합계에서 항비듬 효과를 관찰하여 본 결과 일정 혼합비에서 효과적인 항비듬 효과를 관찰할 수 있었고, 현미경 관찰에 의한 MIC 측정법과,SDDM(Skin-Disk Diffusion Method)법에 의한 항비듬 효과와 비교하여 본 결과 유사한 경향성을 관찰할 수 있었다. 이상의 결과를 종합해볼 때 alarmar Blue$^{TM}$를 사용한 in vitro 항비듬 효과 측정법은 시료나 배지의 탁도에 크게영향을 받지 않으며, Micro-plate reader를 사용함으로써 많은 종류의 시료에 대한 결과를 마르고 정확하게 얻을 수 있다는 장점을 가지고 있으므로, 향후 효율적인 in-vitro 항비듬 평가 방법으로 활용이 기대된다.

  • PDF

한국 전통식품 중 미생물 분석을 위한 건조필름법 평가 (Evaluation of Dry Rehydratable Film Method for Enumeration of Microorganisms in Korean Traditional Foods)

  • 김관식;배은경;하상도;박영서;목철균;홍관표;김상필;박지용
    • 한국식품위생안전성학회지
    • /
    • 제19권4호
    • /
    • pp.209-216
    • /
    • 2004
  • 우리나라 전통식품인 김치, 된장, 고추장, 간장. 탁주, 식혜, 수정과에 있는 미생물 분석을 위하여 건조필름법과 전통적인 미생물 분석법을 비교하였다. 일반세균 분석에는 plate count agar 법과 $Petrifilm^{TM}$ aerobic count plate 법을 비교하였고, 대장균군과 대장균의 분석에는 most probable number (MPN) 법과 $Petrifilm^{TM}$ coliform count plate 및 $Petrifilm^{TM}$ E. coli/colmfom count plate 법을 각각 비교하였으며, 효모와 곰팡이의 분석에는 potato dextrose agar 법과 $Petrifilm^{TM}$ yeast and mold count plate 법을 비교하였다. 황색포도상구균의 분석에는 coagulase 시험법과 $Petrifilm^{TM}$ Staph express fount plate 법을 비교하였다. 두 방법간의 상관계수는 일반세균이 0.974-0.998, 대장균군이 0.955-0.978, 대장균이 0.968-0.986, 효모와 곰팡이가 0.913-0.995, 황색포도상구균이 0.998-0.999로 두 방법간의 상관성이 매우 높았으며, 평균 미생물수에 있어서도 유의적인 차이가 없었다(p>0.05). 이러한 결과로부터 건조필름법이 기존의 전통적인 방법을 대체할 수 있는 미생물 분석법임이 확인되었다.

MiriChekTM Oral Bacter test kit를 활용한 개 치주염의 임상적 평가 (Clinical assessment of periodontitis in dogs using the MiriChekTM Oral Bacter test kit: An in vivo study)

  • Choi, Hyuck;Roh, Jae-Hee;Kim, Yun-Jeong;Hwang, In-Soo;Park, Woo-Dae;Kim, Min-Seok;Jeong, Young-Eui
    • 한국치위생학회지
    • /
    • 제21권4호
    • /
    • pp.337-348
    • /
    • 2021
  • 연구목적: 본 연구는 개 치주염 평가에서 MiriChekTM Oral Bacter test kit의 임상적 유용성을 판단하기 위해 실시하였다. 연구방법: 개 61두를 공시하여 품종, 연령(개월), 성별, 체중, 질병 유무, 임상적 치주염 단계를 수의 임상 진단 후 상악 왼쪽 전구치의 치태를 채취하여 MiriChekTM Oral Bacter test kit를 이용하여 진단검사를 수행하였다. 연구결과: 대상 개 61두 중 건강한 개는 31두, 치주염 개는 30두였고, 치주염은 젊은 개보다 나이 든 개에게서 더 흔하게 나타났다. MiriChekTM Oral Bacter test kit의 양성 평균 73.3%, 음성 평균 80.7%의 민감도를 보였고, 치주염의 심각도와 높은 상관관계를 확인하였으며, 그 결과 MiriChekTM Oral Bacter test kit는 개 치주염 평가에 유용한 진단검사 방법임을 확인하였다. 결론: MiriChekTM Oral Bacter test kit와 같은 새로운 진단 보조 기구의 활용은 개에게서 발생하는 치주질환 진단의 신뢰성과 정확성을 높일 것으로 판단된다.

호로파와 야관문 복합추출물이 과산화수소로 산화적 스트레스가 가해진 TM3 세포의 테스토스테론 합성에 미치는 영향 (Effects of the mixture of fenugreek seeds and Lespedeza cuneata extracts on testosterone synthesis in TM3 cells oxidative stressed with H2O2)

  • 이경수;이은경;서윤희;최수영
    • Journal of Applied Biological Chemistry
    • /
    • 제59권4호
    • /
    • pp.305-311
    • /
    • 2016
  • 본 연구는 야관문과 호로파 복합추출물인 YHM이 과산화수소($H_2O_2$)로 산화적스트레스를 가한 TM3 세포의 테스토스테론 발현에 미치는 영향을 확인하고자 수행되었다. 세포독성 시험을 수행하여 YHM의 경우 $40{\mu}g/mL$을 최고 농도로 중농도 $20{\mu}g/mL$, 저농도 $10{\mu}g/mL$ 처리군을 설정하였고, TM3 세포에 산화적 스트레스를 주기 위해서는, serum free 배지에 $50{\mu}M$의 과산화수소를 4시간 동안 처리하였다. 산화적 스트레스가 가해진 TM3 세포에 YHM 시료를 처리하여 세포 생존률에 미치는 영향을 평가하였을 때 모든 농도 처리군에서 세포증식이나 독성이 없었다. 테스토스테론은 과산화수소를 처리하였을 때 감소하였다가 YHM 시료를 처리하였을 때 control 수준으로 회복되거나, control 보다 더 증가하였다. 또한 시료에 의한 테스토스테론 양의 증가원인을 확인하기 위하여, 테스토스테론 합성 및 분해에 관여하는 효소들의 발현량을 ELISA와 Real-time PCR을 통해 알아보았다. 테스토스테론 합성에 관여하는 $3{\beta}$-HSD4와 17,20-desmorase는 과산화수소 처리 시 감소하였다가, YHM을 처리하였을 때는 control 수준으로 회복하였다. 테스토스테론을 estradiol 및 dihydrotestosterone로 변환시키는 aromatase와 $5{\alpha}$-reductase2는 과산화수소를 처리하였을 때 증가하였다가 YHM 시료를 처리하면 control 수준이나 그 이하로 감소하였다. 이 결과들로 보았을 때 YHM 시료는 TM3 세포의 증식에는 영향을 미치지 못 하지만, 산화적 스트레스에 의해 감소된 테스토스테론 합성 효소의 발현을 증가시키고, 반대로 증가되는 테스토스테론 분해 효소의 발현은 감소시켜, 결국 산화적 스트레스에 의해 저하된 테스토스테론의 양을 회복시키거나 증가시키는 효과가 있는 것으로 판단된다.

3차원 초음속 터빈의 노즐-로터 상호작용에 관한 수치적 연구 (A Numerical Analysis on the Nozzle-Rotor of a 3-D Supersonic Turbine)

  • 윤원근;신봉근;김귀순;김진한;정은환
    • 한국추진공학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국추진공학회 2005년도 제24회 춘계학술대회논문집
    • /
    • pp.413-422
    • /
    • 2005
  • 본 연구에서는, 먼저 $Fine^{TM}/Turbo$의 신뢰성을 확보하기 위해 초음속 터빈의 실험 결과와 비교 해석하였다. 그 결과 $Fine^{TM}/Turbo$는 초음속 유동 현상을 비교적 정확하게 해석함을 알 수 있었다. 다음으로 Grid Independency Test를 통하여 3차원 터빈의 적합한 격자계를 선정하여. 3차원 초음속 터빈의 노즐-로터 상호작용에 관해 유동해석을 실시하였다. 터빈의 노즐-로터간의 축방향 간격은 점점 커질수록 높은 추력을 나타냈으며, 로터 블레이드의 Chamfering Angle 또한 Blade-Edge가 날카로워 질수록 추력이 증가하였다.

  • PDF