• 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지
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• 제22권1호
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• pp.56-60
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• 2016

탠덤 질량 분석에서는 신뢰도 높은 펩타이드 동정을 위해 목표 데이터베이스의 참조 단백질 순서를 재배치한 디코이 데이터베이스가 주로 이용된다. 한편 목표 데이터베이스와 디코이 데이터베이스 사이 혹은 디코이 데이터베이스 내부에 서열이 동일한 중복 펩타이드가 존재할 수 있으며, 이는 단백질 동정을 어렵게 하는 요인이 된다. 따라서 디코이 데이터베이스의 중복성을 최소화하는 것은 중요한 문제이다. 본 논문에서는 디코이 데이터베이스 생성에 널리 사용되는 의사셔플(pseudo-shuffling)과 의사역순(pseudo-reversing) 방법이 디코이 데이터베이스의 중복성에 미치는 영향을 조사하였다. 실험 결과, 목표 데이터베이스 크기와 데이터베이스 생성 시 허용되는 'missed cleavage site'의 최대 개수는 중복성을 증가시킴을 확인하였다. 또한 동일한 조건에서는 의사역순 방법이 의사셔플보다 항상 낮은 수준의 중복성을 가지는 디코이 데이터베이스를 생성하였다.

• 한국컴퓨터산업학회논문지
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• 제6권3호
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• pp.509-518
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• 2005

원격 모니터링 시스템(RMS; Remote Monitoring System)은 산업의 자동화 과정에 따라 다양한 분야에 적용되고 있으며, 단순한 상태 감시기능에서 멀티미디어 인터페이스 기반의 실시간 제어 기능을 갖는 복합 응용시스템으로 발전하고 있는 추세이다. 본 연구에서는 네트워크로 연동된 원격 사이트의 타겟 시스템(target system)을 클라이언트의 웹 브라우저에서 모니터링 할 수 있는 감시기능과 특정 동작을 제어할 수 있는 제어기능을 갖는 웹 기반 모니터링 시스템을 개발하였다. 개발 시스템은 클라이언트가 웹 브라우저에서 타겟 시스템의 상태를 실시간으로 감시할 수 있는 모니터링 기능, 클라이언트가 모니터링 화면에서 특정 모듈의 값을 설정함으로써 시스템의 상태를 제어하는 출력제어 기능, 클라이언트가 웹 환경에서 타겟 시스템의 환경 변수를 직접 설정 또는 변경할 수 있는 환경설정 기능, 네트워크에 연동된 화상카메라를 이용하여 타겟 시스템 주변 환경을 비디오로 감시할 수 있는 비디오 감시기능 등으로 구성되어 있다. 본 RMS는 웹 기반의 인터페이스로 타겟 시스템에 쉽게 접근 및 관리가 가능하며, 특히, 무인 자동화 설비 및 폐쇄 공간 등에서 유용하게 활용될 수 있다.

• Molecules and Cells
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• 제44권9호
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• pp.627-636
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• 2021

The three-dimensional organization of chromatin and its time-dependent changes greatly affect virtually every cellular function, especially DNA replication, genome maintenance, transcription regulation, and cell differentiation. Sequencing-based techniques such as ChIP-seq, ATAC-seq, and Hi-C provide abundant information on how genomic elements are coupled with regulatory proteins and functionally organized into hierarchical domains through their interactions. However, visualizing the time-dependent changes of such organization in individual cells remains challenging. Recent developments of CRISPR systems for site-specific fluorescent labeling of genomic loci have provided promising strategies for visualizing chromatin dynamics in live cells. However, there are several limiting factors, including background signals, off-target binding of CRISPR, and rapid photobleaching of the fluorophores, requiring a large number of target-bound CRISPR complexes to reliably distinguish the target-specific foci from the background. Various modifications have been engineered into the CRISPR system to enhance the signal-to-background ratio and signal longevity to detect target foci more reliably and efficiently, and to reduce the required target size. In this review, we comprehensively compare the performances of recently developed CRISPR designs for improved visualization of genomic loci in terms of the reliability of target detection, the ability to detect small repeat loci, and the allowed time of live tracking. Longer observation of genomic loci allows the detailed identification of the dynamic characteristics of chromatin. The diffusion properties of chromatin found in recent studies are reviewed, which provide suggestions for the underlying biological processes.

• 한국항행학회논문지
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• 제25권3호
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• pp.217-222
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• 2021

EOTS(electro-optical tracking system)는 유도무기의 성능 평가를 위해 유도무기를 추적하여 영상을 획득하는데 활용되고 있다. 유도무기에 대한 추적을 잃어버렸을 경우 유도무기가 매우 빠르게 비행하기 때문에 운용자가 이를 다시 포착하는 것은 거의 불가능하다. 레이더나 텔레메트리 데이터를 활용하여 재 포착 하는 방법이 활용되고 있으나 데이터를 실시간으로 수신할 수 있는 통신망의 설치가 수반되어야하기 때문에 장소에 대한 제약이 따른다. 하지만 유도무기 비행시험 수행 시 계산되는 예상 궤적은 실시간으로 수신할 필요 없이 저장해두었다가 사용할 수 있기 때문에 통신망 설비와 관계없이 활용이 가능하다. 본 논문에서는 미리 알고 있는 비행체의 예상 궤적을 활용하여 비행체를 잃어버렸을 시 비행체의 위치를 예상하는 방법을 제안한다. DTW (dynamic time warping)를 통해 예상궤적과 추적궤적을 비교하여 비행체의 각속도를 추정하고 이를 Kalman Filter의 보정단계에서 관측 값으로 활용하여 비행체의 다음 상태를 예측한다. 제안한 방법의 타당성을 실제 비행체 궤적에 적용하여 검증하였다.

• 한국환경복원기술학회지
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• 제20권6호
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• pp.1-19
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• 2017

This study set out to identify problems with amphibian habitation by the wetland types and improve their habitation environment in urban forest wetlands, thus creating a habitat for amphibians. Study site include forest swamps in Jatjul Park as well as Yeoji neighborhood Park in Guro-gu, and in Choansan neighborhood Park in Dobong-gu. The forest swamp in Jatjul Park gets its water from Mt. Maebong and it is a former escalated farmland-turned wetland. The swamp area is $2,500m^2$, a forest zone and a landscape planting site are 83.27% and 6.70% each. Target species Seoul pond frogs are inseparable from rice fields because they live in a short radius of and lay eggs in or near paddy fields, and Rana nigromaculata have similarities with Rana plancyi chosenica in choosing their habitats. There was need for paths that would lead to other paths so amphibians would spread to other parts of the forest and for measures to secure open water. Modifying a variety of routes for water, human and animals along with building a buffer to keep the core habitation zones were required. The forest swamp in Yeonji neighborhood Park used to be a water reservoir on the foot of Mt. Gunji. The swamp area is $1,980m^2$, a forest zone and farmland account for 80.61% and 4.88% each. Non-point pollutants from upstream along run into the subject forest marsh, bare ground on the around swamp and steep stone embankments obstructed amphibians. Target species was Bufo gargarizans that live in forests and edges of hills and spawn in deep water. The forest swamp in Choansan neighborhood Park gets its water from Mt. Choan and it is close to its water source that it is a mountain stream forest wetland. The basin and the swamp are $35,240m^2$ and $250m^2$ in size respectively. A forest zone accounts for 90.20%, high stone embankments laid in refurbishing the valley obstruct amphibians and there is water shortage in times of droughts. Target species were Rana coreana, Rana dybowskii and Hynobius leechii that live in mountain valleys, streams and wetlands and lay eggs in forest marshes and rocks in valleys. Looking into the three swamps of amphibian habitation, I came to conclusions that those wetlands were suitable for their amphibians but man-made facilities blocked their corridors leading to other corridors and even killed off target species in some parts of those swamps by destroying those parts. Amphibians live in water, on ground and underground at different stages of life. Hence, we should take this fact into consideration when planning their habitats and design core habitation zones, buffers zone and use zones accordingly. Buffer zones ought to be between core habitation zones and surrounding trees. Aiming at protecting core habitation zones, buffers should be in harmony with habitation zones. Use zones should be minimized in size and not in direct contact with core habitation zones.

• 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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• 제8권2호
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• pp.206-218
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• 2002

본 논문에서는 서로 다른 플랫폼으로 구성된 허브 사이트 가맹점들이 지역적으로 분산되어 있는 분산 이기종 환경에서 각 가맹점들의 기존 플랫폼을 통일시키지 않고 독립적으로 고객이 관심을 가질만한 맞춤 정보 및 광고를 선정하여 제공하기 위한 시스템 설계 및 구현 내용을 서술한다. 본 논문에서 제안하는 시스템은 각 가맹점을 방문하는 고객들의 정보를 수집하기 위한 모니터링 기능, 고객 개개인의 특성에 맞는 서비스를 선정하기 위한 벡터 모델, 그리고 벡터 모델을 이용하여 선정된 서비스를 허브사이트 또는 각 가맹점을 방문하는 고객 개개인에게 제공하기 위한 기능을 지원한다. 본 시스템은 상점 입장에서는 허브 사이트 가맹점이 됨으로써 기존 플랫폼을 바꾸지 않고도 통합 서비스 및 개인화 서비스 제공이 가능하며, 고객 입장에서는 한번의 고객 등록으로 맞춤 서비스를 제공받을 수 있다는 장점을 갖는다.

• 한국지진공학회:학술대회논문집
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• 한국지진공학회 2000년도 춘계 학술발표회 논문집 Proceedings of EESK Conference-Spring
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• pp.367-374
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• 2000

This study investigates the effect of hysteretic characteristics to the Inelastic Demand Spectrum (IDS) which was expressed by an acceleration(Sa) and a displacement response spectrum (Sd). Elasto Perfectly Plastic(EPP) model is used in this study and inelastic demand spectrum (Sa vs, Sd) are obtained from a given target ductility ratio. For a given target ductility ratio IDS can be obtained by using nonlinear time history analysis of single degree of system with forth five recorded earthquake ground motions for stiff soil site. The effect EPP model under demand spectrum is investigated by ductility factor and natural frequency. According to the results obtained in this study IDS has dependency on ductility factor and natural frequency.

• 한국정보시스템학회:학술대회논문집
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• 한국정보시스템학회 2005년도 춘계학술대회 발표 논문집
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• pp.79-92
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• 2005

To query the vast amount of web pages which are available i]l the Internet, it is necessary to extract the encoded information in the web pages for converting it into structured data (e.g. relational data for SQL) or semistructured data (e.g. XML data for XQuery), In this paper, we propose a new web information extraction system, PIES, to convert web information into XML documents. PIES is based on a user-specified target schema and HTML tag pattern descriptions. The web information is extracted by the pattern descriptions and validated by the target schema. We designed a new language to describe extraction rules, and a new regular expression to describe HTML tag patterns. We implemented PIES and applied it to the US patent web site to evaluate its correctness. It successfully extracted more than thousands of US patent data and converted them into XML documents.

• Molecules and Cells
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• 제41권11호
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• pp.933-942
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• 2018

Traditionally, small-molecule or antibody-based therapies against human diseases have been designed to inhibit the enzymatic activity or compete for the ligand binding sites of pathological target proteins. Despite its demonstrated effectiveness, such as in cancer treatment, this approach is often limited by recurring drug resistance. More importantly, not all molecular targets are enzymes or receptors with druggable 'hot spots' that can be directly occupied by active site-directed inhibitors. Recently, a promising new paradigm has been created, in which small-molecule chemicals harness the naturally occurring protein quality control machinery of the ubiquitin-proteasome system to specifically eradicate disease-causing proteins in cells. Such 'chemically induced protein degradation' may provide unprecedented opportunities for targeting proteins that are inherently undruggable, such as structural scaffolds and other non-enzymatic molecules, for therapeutic purposes. This review focuses on surveying recent progress in developing E3-guided proteolysis-targeting chimeras (PROTACs) and small-molecule chemical modulators of deubiquitinating enzymes upstream of or on the proteasome.

• 한국군사과학기술학회지
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• 제14권4호
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• pp.622-629
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• 2011

In this paper, you can see the structure of data slaving software module that is in use on flight test and result of the test with the slaving. The data slaving software module has many functions, data slaving for various instrumentation systems(instrumentation radars, telemetry systems for missile, aircraft and so on), setting some slaving group for multi-target, communicating with the instrumentation systems in a far away site and sending a specific value as slaving data. This fits the requests for flight test that is being performed and improves performance of the instrumentation systems.