• 제목/요약/키워드: TOF

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Compressed sensing을 이용한 TOF MRA 검사에서 Flow rate와 CS factor의 변화에 따른 영향 (Effects of Flow Rates and CS Factors on TOF MRA using Compressed Sensing)

  • 김성호;정현근;유세종
    • 한국방사선학회논문지
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    • 제15권3호
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    • pp.281-291
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    • 2021
  • 본 연구는 자기공명영상을 이용한 TOF MRA 검사에서 flow rate 2.0 ml 이하의 유속을 표현함에 있어 Compressed sensing의 사용에 따른 영상의 변화를 정량적으로 측정하고자 하였다. Auto-injector와 Flow phantom을 이용하여 각각의 혈류속도 구간을 설정하고 CS를 사용하지 않은 TOF without CS 기법과 CS를 이용한 TOF with CS 기법에서 CS factor의 변화에 따른 SNR, CNR, SSIM, RMSE 등을 측정하여 비교하였다. CS factor의 증가에 따라 나타나는 영상의 영향을 검증하고자 일원배치 분산분석(One-way ANOVA)을 시행하였다. 실험 결과 CS를 사용한 TOF MRA는 CS를 사용하지 않은 TOF MRA와 비교하여 SNR 및 CNR의 유의한 차이 없이 scan time이 현저하게 감소하였다. 반면 CS factor의 증가에 따라 SSIM 및 RMSE는 TOF without CS 영상과의 차이가 증가함을 나타내었다. 따라서 TOF MRA 검사 시 CS 기법을 통해 scan time을 효율적으로 감소시키되 적절한 CS factor의 범위를 충분히 고려해야 한다. 또한 CS factor와 영상의 유사도, 정밀성에 대한 지속적인 연구가 필요할 것으로 사료된다.

Analysis of Entamoeba histolytica Membrane via LC-MALDI-TOF/TOF

  • Ujang, Jorim Anak;Noordin, Rahmah;Othman, Nurulhasanah
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제10권3호
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    • pp.84-87
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    • 2019
  • Liquid chromatography mass spectrometry is widely employed in proteomics studies. One of such instruments is the Liquid Chromatography (LC)-Matrix-assisted laser desorption ionisation (MALDI)-Time of flight (TOF) or LC-MALDI-TOF/TOF. In this study, this instrument was used to identify the membrane proteins of a protozoan parasite namely Entamoeba histolytica. It causes amoebiasis in human. The E. histolytica trophozoites were cultured prior to the membrane protein extraction using the conventional method, $ProteoPrep^{(R)}$ and $ProteoExtract^{(R)}$ kits. Then, the membrane protein extracts were trypticdigested and analysed by LC-MALDI-TOF/TOF. Approximately, 194 proteins were identified and 27.8% (54) were predicted as membrane proteins having 1 to 15 transmembrane regions and signal peptides by combining all three extraction methods. Also, this study has discovered 3 unique proteins as compared to our previous study which merit further investigation.

뇌경색 환자의 3Tesla CE-TOF-MRA에서 MT 펄스의 유용성 (Evaluate the Possibility of MT Pulse at 3T CE-TOF-MRA in Patients with Cerebral Infarction)

  • 배성진
    • 대한방사선기술학회지:방사선기술과학
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    • 제30권3호
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    • pp.265-270
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    • 2007
  • 뇌경색환자들에 있어서 CE-TOF-MRA에서 MT 펄스사용의 유용성을 알아보고자 하였다. 2007년 5월에서 6월까지 뇌경색 증상 발현 후 최소 4시간에서 최대 5일 이내에 환자 10명을 대상으로 3Tesla 자기공명영상기기를 사용하여 조영제 주입 후 offset frequency 0, 600, 1,200, 1,800 Hz의 MT 펄스를 사용한 CE-TOF-MRA을 획득하였다. TOF-SPGR기법인 CE-TOF-MRA영상에서 정상혈관의 경우 SNR이 감소되었지만 CNR은 증가를 보였다. 좁아진 혈관부위는 MT 펄스 600 Hz, 1,200 Hz에서 최고의 CNR을 보였고, 협착된 혈관에서는 MT 펄스 강도와 비례하여 CNR이 증가 하였다. 혈관이 폐색된 경우에는 폐색범위가 명확하게 나타났고 MT 펄스 1,800 Hz에서 최고의 CNR로 평가되었다. 좁아지거나 보이지 않는 혈관에서는 형태변화가 없었고, 혈관이 폐색되어 평가가 불가능한 혈관에서 MT 펄스 후 혈관과 배후조직 SNR은 다소 감소하였지만 두 조직간 CNR은 증가되었다.

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Free Radical Initiated Peptide Sequencing Using MALDI-TOF/TOF Mass Spectrometry

  • Song, Insu;Lee, Jae-ung;Baek, Jaehyeon;Cha, Sangwon;Han, Sang Yun;Oh, Han Bin
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제9권2호
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    • pp.56-60
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    • 2018
  • In this study, matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) was applied to the TEMPO-assisted FRIPS for the first time. We found that 3-HPA is the optimal matrix for the analysis of p-TEMPO-Bz-Sc-peptides, which gives minimal precursor fragmentations. MALDI-TOF/TOF experiments on p-TEMPO-Bz-Sc-peptides yielded mainly $[a_n+H]^+$, $[z_n+H]^+$, and $[y_n]^+-type$ products, indicating that radical-driven peptide fragmentation occurs in MALDI-TOF/TOF-MS.

$\alpha_1$(I)및 $\alpha_2$(I)사슬 콜라겐의 질량분석법 개발 연구 (Development of mass spectrometric analysis of $\alpha_1$(I) and $\alpha_2$(I) chain Collagen)

  • 김광연;조선영;이상한;남해선;김성호
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제6권2호
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    • pp.134-143
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    • 2005
  • 포유동물에서 중요한 구조단백질인 콜라겐은 다양한 조직내 단백질 조성과 사슬간 복잡한 가교결합의 존재로 인해 그 구조가 복잡하고 다양하여, 직접적으로 분석할 적당한 방법이 없었다. 본 연구에서는 간단한 전처리만으로 다수의 생체분자 시료에 대해 정확한 분자량 측정이 가능한 매트릭스 보조 레이저 탈착/이온화 비행시간 질량분석법(MALDI-TOF MS)을 이용하여 콜라겐과 조각화된 콜라겐을 분석하고 이의 아미노산 서열을 사중극자-비행시간 직렬 질량분석법(Q-TOF MS/MS)으로 확인하여, 시료 중의 콜라겐의 종류에 대한 정보를 확인하여, MALDI-TOF 질량분석을 이용한 콜라겐 분석에서 콜라겐의 종류를 쉽게 예측할 수 있는 방법을 제시하고자 하였다. 쥐의 꼬리에서 분리한 콜라겐을 SDS-PAGE로 분리한 결과 10개의 band를 얻을 수 있었는데, 같은 시료를 MALDI-TOF MS로 확인하여 각 band의 정확한 분자량을 결정할 수 있었다. SDS-PACE상의 10개의 분리된 band에 대해 각각 tryptic digestion후 MALDI-TOF 질량분석을 수행한 결과 4개의 band에서 type I 콜라겐의 $\alpha_1$-chain내의 fragment인 Gly1056-Arg1073을 확인할 수 있었고, 5개의 band에서 type I 콜라겐의 $\alpha_2$-chain내의 fragment인 Gly985-Arg1002을 확인하였다. 잔재한 콜라겐의 가교결합으로 인해 예상되는 fragment중 둘만이 확인되었지만, 확인된 fragment를 통해 적어도 7개의 band에서는 type I콜라겐이 존재함을 확인할 수 있었다. 확인된 두 콜라겐 flagment의 아미노산 서열을 Q-TOF MS/MS로 분석한 결과 MALDI-TOF MS에서의 예측과 일치함을 확인할 수 있었으며, 이를 통해 확인된 두 fragment에 의한 peak을 지문으로 하여 MALDI-TOF MS측정시에 시료내의 type I 콜라겐의 존재를 쉽게 확인할 수 있음을 볼 수 있었다.

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가상 터치스크린 시스템을 위한 TOF 카메라 기반 3차원 손 끝 추정 (3D Fingertip Estimation based on the TOF Camera for Virtual Touch Screen System)

  • 김민욱;안양근;정광모;이칠우
    • 정보처리학회논문지B
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    • 제17B권4호
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    • pp.287-294
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    • 2010
  • TOF(Time of Flight) 기술은 물체의 3차원 깊이 정보 추출을 가능케 하는 기술 중의 하나이다. 하지만, TOF의 카메라의 출력인 깊이 영상을 이용한 물체의 3차원 위치 추출은 몸이나 손 등 크기가 큰 물체의 경우에는 비교적 신뢰성 있는 결과를 얻을 수 있는데 비하여 크기가 작은 손 끝의 경우에는 신뢰할 수 있는 값을 얻기 힘들다. 본 논문에서는 TOF 카메라에서 육면체 손 모델을 이용하여 수정된 손의 영상에서의 위치 정보와 팔 모델을 이용하여 손 끝의 3차원 좌표를 추정한다. 제안된 방법으로 실험을 한 결과 TOF 카메라의 깊이 영상만을 사용하여 인식한 손 끝의 3차원 위치정보와 비교하여 훨씬 더 향상된 결과를 얻을 수 있었다.

말디토프 질량분석을 이용한 고분자의 특성분석 (Analysis of Polymer Characteristics Using Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-flight Mass Spectrometry)

  • 강민정;성윤서;김문주;김명수;변재철
    • 공업화학
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    • 제28권3호
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    • pp.263-271
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    • 2017
  • 최근에, 질량분석기술의 폴리머 분석에의 응용은 MALDI-TOF MS 개발 이후 급속도로 발전하였다. 이 리뷰 논문은 현재까지 연구된 MALDI-TOF MS의 폴리머 특성분석에의 응용에 관한 최신 논문을 정리하였다. MALDI-TOF MS는 바이오 폴리머와, 합성 폴리머의 평균분자량 분석, 폴리머의 시퀀스 분석을 통한 구조의 해석, 모노머의 조성분석에까지 이용되고 있다. 엔드그룹의 특성과 농도를 분석하는 연구도 많이 진행되었고, 복잡한 폴리머의 분자량의 분석에는 SEC와 MALDI-TOF MS를 연결한 분석법을 추천한다. MALDI에 tandem MS를 결합한 분석기술이나, 이온 모빌리티를 응용한 질량분석기, TOF-SIMS, MALDI-TOF-Imaging 기술도 급격히 발전하고 있으며, 이의 폴리머 특성분석에의 응용은 별도의 분리기술이 필요 없어 앞으로 더 많이 이용될 것으로 생각된다. 분자량, 시퀀스, 그리고 모노머의 조성을 정확하게 계산해주는 소프트웨어와 고분자량(> 100 kDa)의 분석을 가능하게 해주는 기술이 개발된다면, 폴리머를 연구하는 과학자들에게 MALDI-TOF MS의 이용은 문제점을 해결하고, 목적하는 폴리머를 합성하는 데 중요한 수단이 될 것이다.

4차원 TRICKS 자기공명혈관조영술과 기존 TOF 자기공명혈관조영술의 비교 및 유용성 (The Value of Comparison with Four Dimension Time Resolved Imaging of Contrast Kinetics(TRICKS) MRA by Time of Flight(TOF) MRA)

  • 배성진;임청환;박병래;신운재;김정삼
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제10권3호
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    • pp.215-221
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    • 2010
  • Time Resolved Imaging of Contrast Kinetics 기법을 이용한 4차원 자기공명혈관조영술 (TRICKS-MRA)영상과 기존 TOF-MRA영상을 비교하여 임상적 유용성에 대해 알아보고자 하였다. 총17명 중 뇌혈관 질환이 의심되는 11명과 뇌종양을 의심하는 6명을 대상으로 TOF-MRA와 TRICKS-MRA을 시행한 후 17 대상자 중 11명에서 DSA를 추가적으로 시행하였다. TOF-MRA는 공간해상력보다 시간해상력이 부족하였고, TRICKS-MRA에서는 TOF-MRA보다 공간분해능은 부족한 점이 많지만 영상판독에 큰 영향은 없었고 모든 대상자에서 동맥과 정맥의 구별이 가능하여 시간분해능이 우수한 것을 나타났다. 또한 종양과 혈관과의 관계성 평가에서 TOF-MRA보다 좋은 것으로 나타났다. TRICKS-MRA방법은 시간대별로 동맥, 모세혈관, 정맥기를 신속하면서 쉽게 4차원적으로 영상화가 가능하여 앞으로 임상에서 이용도가 더욱 증가 할 것으로 사료된다.

Effect of Cationization Agent Concentration on Glycan Detection Using MALDI TOF-MS

  • Kim, Inyoung;Shin, Dongwon;Paek, Jihyun;Kim, Jeongkwon
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제8권1호
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    • pp.14-17
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    • 2017
  • The effect of cationization agent concentration on glycan detection via matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) was investigated using $Na^+$ ions in the form of NaCl as the cationization agent. NaCl solution concentrations ranging from 1 mM to 1 M were investigated. Glycans from ovalbumin were mixed with the cationization agent solution and the 2,5-dihydroxybenzoic acid (2,5-DHB) matrix solution in a volume ratio of 1:1:1. The resulting mixture was loaded onto the MALDI plate. Two MALDI-TOF MS instruments (Voyager DE-STR MALDI-TOF MS and Tinkerbell RT MALDI-TOF MS) were used for detection of glycans. The best detection, in terms of the number of identified glycans, the peak intensity, and the signal-to-noise (S/N) ratio, was obtained with NaCl concentrations of 0.01-0.1 M for both MALDI-TOF MS instruments.

Detailed Analysis of the KAERI nTOF Facility

  • Kim, Jong Woon;Lee, Young-Ouk
    • Journal of Radiation Protection and Research
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    • 제41권2호
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    • pp.141-147
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    • 2016
  • Background: A project for building a neutron time-of-flight (nTOF) facility is progressing. We expect that the construction will start in early 2016. Before that, a detailed simulation based on the current architectural drawings was performed to optimize the performance of our facility. Materials and Methods: Currently, several parts had been modified or changed from the original design to reflect requirements such as the layout of the electron beam line, shape of the vacuum chamber producing a neutron beam, and the underground layout of the nTOF facility. Detailed analysis for these modifications has been done with MCNP simulation. Results and Discussion: An overview of our photo-neutron source and KAERI nTOF facility were introduced. The numerical simulations for heat deposition, source term, and radiation shielding of KAERI nTOF facility were performed and the results are discussed. Conclusion: We are expecting that the construction of the KAERI nTOF facility will start in early 2016, and these results will be used as basic data.