• 한국미생물·생명공학회지
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• 제46권1호
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• pp.68-76
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• 2018

Actinobacterial strains isolated from Cow feces were studied for their antifungal attributes against phytopathogens and industrially important enzymes. A total of 30 Actinobacterial strains were obtained from 10 samples of cow feces. All the strains were belonging to the genera Streptomyces on the basis of morphological and chemotaxonomic analysis. During preliminary screening, out of 30 strains, 15 strains (50%) showed antifungal activity against five fungal phytopathogens including Aspergillus niger, Fusarium solani, Fusarium oxysporum, Macrophomina phaseolina and Rhizoctonia solani. While, isolate GBTCF-26 was found to be most active against R. solani with 62.2% inhibition of fungal mycelium, GBTCF-09 was prominent against F. solani and F. oxysporum with percent inhibition of 61.1% and 58.8%, respectively. Out of 30 strains, 19 (63.3%), 16 (53.3%), 11 (36.7%), 10 (33.3%), 4 (13.3%) and 8 (26.7%) strains were producing amylase, caseinase, gelatinase, lipase, chitinase and cellulose, respectively. The selected strains, GBTCF-09, GBTCF-21 and GBTCF-26, were identified as Streptomyces sp. on the basis of their 16S rDNA sequence. The study supports the idea that the Actinobacteria from unique niches (Cow feces) possess the production potential of industrially important enzymes including bioactive molecules.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제8권2호
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• pp.125-133
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• 1980

토양으로부터 분리한 포도당 이성화효소를 강하게 생산하는 방사균을 Bergey's manual 8판에 따라 동정한 결과 Streptomyces antibioticus 근록의 균주이었다. 본 균의 배양액으로부터 균체를 모아서 해사를 넣고 파쇄 하여 증류수로 추출하고 Mn-처리를 하여 핵단백질을 제거한 후 황산 ammonia 분획침전(0.5∼0.8포화), 수석, DEAE-cellulose column chromatography, DEAE-sephadex (A-50) column chromatography 및 sephadex G-200에 의한 gel filtration을 거쳐 비활성도로 약 380배, 회수율 25％ 정도로 분리 정제하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제24권1호
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• pp.101-104
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• 1996

During the screening of inhibitor of DNA topoisomerase I from microbial secondary metabolites, Streptomyces melanosporofaciens 7489 which was capable of producing high level of inhibitor was selected from soil. The active compound (7489-1) was purified from the culture broth by solvent extraction, silica gel column chromatography and HPLC. The inhibitor was identified as dibutyl phthalate by spectroscopic methods of UV, $^{1}H$-NMR, $^{13}C$-NMR, DEPT and EI-MS. 7489-1 showed a strong inhibitory activity against topoisomerase I with 10 ${\mu}$M of $IC_{50}$ value.

• 한국약용작물학회지
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• 제14권4호
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• pp.202-205
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• 2006

인삼의 안정적인 생산 및 합리적인 병해방제에 기여하기 위하여 연구를 실시한 결과 갈잎 퇴비에서 분리된 Streptomyces lauretii B8180과 Bacillus subtilis B8856, Burkholderia cepacia B7944 세 균주의 인삼병원균 5종에 대한 항균력이 인정되었으며, 특히 실내실험을 통하여 높은 역병 방제효과가 인정되었다. 그러나 이 실험에서와 같이 식물의 지상부에 길항균을 살포하는 방법을 통하여 역병 방제효과를 높일 수 있을 것으로 생각된다. 이 길항균들은 갈잎 퇴비에서 분리되었기 때문에, 갈잎 퇴비에서 증식시켜 인삼재배 예정지에 투입하면, 억제형 토양 (suppressive soil) 조성을 통한 주요병해 방제가능성도 클 것으로 생각된다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제20권2호
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• pp.115-126
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• 2004

The actinomycete strain PK-A41 was isolated from a soil sample from pepper fields in Ko-yang, Korea. The strain PK-A41 inhibited the mycelial growth of some plant pathogenic fungi and oomycete, Alternaria mali, Colletotrichum orbiculare, Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici, Magnaporthe grisea, Rhizoctonia solani, and Phytophthora capsici. The presence of LL-diaminopi-melic acid in the cell wall extract and the nucleotide sequence of the 16S rDNA region of the strain PK-A41 was assigned to Streptomyces scabiei. Further morpho-logical, biochemical, and pathological analyses also confirmed the strain PK-A41 to be S. scabiei, which is pathogenic to potato tubers. The maximum antibiotic production of the strain PK-A41 was achieved when grown on the glycerol peptone broth (GPB) medium for 9 days.

• Journal of Microbiology
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• 제45권3호
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• pp.262-267
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• 2007

During a screening program, an actinomycete strain isolated from the Egyptian soil was investigated for its potential to show antimicrobial activity. The identification of this isolate was performed according to spore morphology and cell wall chemo-type, which suggested that this strain is a streptomycete. Further cultural, physiological characteristics and the analysis of the nucleotide sequence of the 16S rRNA gene (1480 bp) of this isolate indicated that this strain is identical to Streptomyces violaceusniger (accession number EF063682) and then designated S. violaceusniger strain HAL64. In its culture supernatant, this organism could produce one major compound strongly inhibits the growth of Gram-positive but the inhibition of Gram-negative indicator bacteria was lower. The antibiotic was separated by silica gel column chromatography and then purified on a sephadex LH-20 column and finally the purity was checked by HPLC. The chemical structure of the purified compound was determined using spectroscopic analyses (molecular formula of $C_{33}H_{32}N_{2}O_{10}$ and molecular weight of 617.21) and found to be identical to the kosinostatin, a quinocycline antibiotic which is known to be produced by Micromonspora sp. TP-A0468 (Igarashi et al., 2002) and to quinocycline B isolated from Streptomyces aureofaciens (Celmer et al., 1958). Although the antibiotic is known, the newly isolated strain was able to produce the antibiotic as a major product providing an important biotechnological downstream advantage.

• The Plant Pathology Journal
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• 제35권5호
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• pp.473-485
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• 2019

Kiwifruit (Actinidia spp.) is an economically important crop and a bacterial canker disease, caused by Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa), is the most destructive disease in kiwifruit production. Therefore, prevent and control of the disease is a critical issue in kiwifruit industry worldwide. Unfortunately, there is no reliable control methods have been developed. Recently, interest in disease control using microbial agents is growing. However, kiwifruit microbiota and their roles in the disease control is mainly remaining unknown. In this study, we secured bacterial libraries from kiwifruit ecospheres (rhizosphere, endospere, and phyllosphere) and screened reliable biocontrol strains against Psa. As the results, Streptomyces racemochromogenes W1SF4, Streptomyces sp. W3SF9 and S. parvulus KPB2 were selected as anti-Psa agents from the libraries. The strains showed forcible antibacterial activity as well as exceptional colonization ability on rhizosphere or phyllosphere of kiwifruit. Genome analyses of the strains suggested that the strains may produce several anti-Psa secondary metabolites. Our results will contribute to develop biocontrol strains against the kiwifruit canker pathogen and the disease management strategies.

• 미생물학회지
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• 제40권3호
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• pp.183-188
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• 2004

TNT 분해 세균 Stenotrophomonas sp. OK-5는 세 개의 다른 NAD(P)H-nitroreductase의 활성 fractions (NTR fractions I, II, III)을 갖고 있는 것으로 확인된 바 있다. 본 연구에서는 NTR fractions I, II, III에 대한 생리학적 특성과 분자생물학적 특성을 규명하고자 하였다. TNT에 대한 균주 OK-5의 NTR fractions I, II, 그리고 III의 활성은 억제 물질인 $\beta$-mercaptoethanol의 첨가 시에 효소의 활성 이 모두 억제되는 것으로 확인되었다. TNT와 그 유사 기질을 이용하여 균주 OK-5에서 분리된 NTR의 기질 특이성을 조사한 결과, nitrobenzene, 그리고 RDX에 대 해서는 비교적 활성 이 높게 나타났으나 2,6-DNT와 2,4-DNT에서는 낮은 활성을 나타내는 것으로 확인되었다. 균주 OK-5에서 정제된 NTR fraction I의 N-말단 아미노산 서 열은 $^1MSDLLNADAVVQLFRTARDS^20$로 분석되었고, Xanthomonas campestris의 NTR과 X. axonopodis의 NTR에서 각각 70%와 65%로 비교적 높은 유사성을 가지는 것으로 나타났다. 균주 OK-5의 NTR fraction I의 효소를 암호화하는 SmOK5nrI 유전자의 염기서열을 확인하고 분석된 유전자로부터 유추되는 아미노산 서열을 각각 비교한 결과 X. campestris의 NTR과 81%, X. axonopodis의 NTR과 75%,그리고 Streptomyces avermitilis의 NTR과 30%의 유사성이 있는 것으로 조사되었으나, Pseudomonas putida KT2440의 NTR (pnrB)과는 16%로 낮은 유사성이 있는 것으로 확인되었다.

• 미생물학회지
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• 제54권2호
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• pp.126-135
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• 2018

여러 종류의 mannanase를 생산하는 Cellulosimicrobium sp. YB-43으로부터 mannanase B를 암호하는 manB 유전자와 효소의 특성이 보고된 바 있다. Mannanase C (ManC)로 명명한 효소의 유전자가 manB 유전자의 하류에 위치한 것으로 예상되어 이를 중합효소 연쇄반응으로 클로닝하여 manC 유전자의 염기서열을 결정하였다. ManC는 448 아미노산 잔기로 구성된 것으로 확인되었으며 glycosyl hydrolase family 5에 속하는 mannanase와 상동성이 높은 활성영역과 탄수화물 결합영역(CBM2)이 존재하였다. ManC의 활성영역은 Streptomyces sp. SirexAA-E (55.8%; 4FK9_A) 및 S. thermoluteus (57.6%; BAM62868)의 mannanase와 아미노산 배열의 상동성이 55% 이상으로 가장 높았다. Signal peptide 영역이 제거되고 카르복실 말단에 hexahistidine이 연결되도록 제조한 His-tagged ManC (HtManC)의 유전자를 재조합 대장균에서 발현하여 균체 파쇄액으로부터 HtManC를 정제하였다. HtManC은 $65^{\circ}C$와 pH 7.5에서 최대 활성을 보였으며 pH 7.5~10범위에서 활성에 큰 변화가 없었다. HtManC는 locust bean gum (LBG)과 konjac에 대한 분해 활성이 guar gum과 ivory nut mannan (ivory nut)에 비해 높았다. 최적 반응조건에서 LBG를 기질로 하여 반응 동력학적 계수를 측정한 결과 Vmax와 Km이 68 U/mg과 0.45 mg/ml로 나타났다. HtManC에 의한 만노올리고당(MOS)과 mannan의 분해산물을 TLC로 관찰한 결과 mannobiose 보다 중합도가 큰MOS로부터 mannobiose와 mannotriose가 주된 분해산물로 생성되었다. 또한 LBG, konjac과 ivory nut의 분해산물로 mannobiose와 소량이 mannose가 공통적으로 관찰되었다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제7권3호
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• pp.149-155
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• 1979

자연계에서 진균류와 절족동물의 외피를 이루는 주된 다당류인 chitin(N-acetyl glucosamine polymer)의 $\beta$-1, 4-lingkage를 가수분해하는 Strepto-myces sp. 115-5 균주로부터 생성되는 chitinase를 정제하여 그 성질을 조사하였다. 48시간 진탕배양하여 생성된 chitinase를 ammonium sulfate처리, 1차 Sephadex G-100, DEAE-Cellulose, 2차 Sephadex G-100 column chromatography하여 정제하였으며 그 순도를 CM-Sephadex C-50 column chromatography 및 polyacryla-mide gel electrophoresis로서 확인하였다. 이 chitinase는 chitin과 chitosan을 가수분해 할수 있었으나 cellulose는 분해할수 없었고 chitin을 기질로서 사용하였을 경우 Km value가 3.6mg/ml이며 Vmax가 100 $\mu$mole/hr였다. Activation energy는 산 가수분해보다 훨씬 낮은 3.66kca1/mole이었고 분자량은 Sephadex G-100을 사용한 column chromatography에서 56,000 daltons으로 나타났으며, 이 chitinase의 등전점은 pH3.0에서 보여졌다.