• Restorative Dentistry and Endodontics
• /
• 제27권1호
• /
• pp.54-65
• /
• 2002

Black-pigmented bacteria have been implicated in the endodontic infections. This group of microorganisms includes Porphyromonas endodontalis, Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia, and Prevotella nigrescens. The organisms display a wide variety of virulence factors that may be pertinent to acute endodontic infections. The aim of this study was to identify P. endodontalis, P. gingivalis, P. intermedia, and P. nigrescens by using special potency disk test, filter paper spot test, 165 rRNA gene-directed PCR, and API 32A. Microbial samples were collected from root canals of 33 intact teeth with necrotic pulp and/or apical periodontitis. Conventional laboratory methods were used for identification of the strains of black pigmented bacteria. Eighteen of 33 samples were positive for the growth of black-pigmented bacteria Five colonies were cultured from each pure cultured colonies from Brucella agar plate. Seventy seven colonies were positive for the growth of black-pigmented bacteria. Thirty three of 77(42.6%) were identifed as P. nigrescens, 10 of 77(12.9%)were P. gingivalis, 6 of 77(7.8%) were P. endodontalis, 10 of 77(12.9%) were P. intermedia. On the contrary the reference strains of P. nigrescens, experimental strains of P nigrescens was sensitive to kanamycin in special potency disk test. 165 rRNA gene PCR and API test after rapid presumptative identification methods, such as special potency disk test and filter paper spot test, would be accurate detection methods for black-pigemented bacteria.

• 융합신호처리학회논문지
• /
• 제9권1호
• /
• pp.1-9
• /
• 2008

2차원 전기영동 영상 분석 프로그램의 반점 검출 단계에서 해결해야할 문제점 중에 하나는 잡영 제거의 문제이다. 전처리과정에서 처리되지 않고 남은 잡영은 영역분할 결과 과분할되는 문제를 낳는다. 과분할된 배경 영역을 구분하고 제외시키기 위해서 일정한 밝기 이상의 영역을 제거하는 고정 문턱값을 사용하여 영역을 제거하면, 육안으로는 보이지 않으나 중요한 기능을 하는 미량의 단백질을 나타내는 반점들이 제외될 수도 있다. 제안 기법은 영역분할 후에 영역들의 첨도의 평균 곡선을 지수함수에 회귀분석하여 매개변수를 구한 다음, 오차의 확률분포에 따라서 매개변수들로 문턱값을 구하여 적용한다. 오차의 확률분포에 따르면 문턱값 적용의 신뢰도는 99.85%이며, 제안기법을 실험 영상으로 실험한 결과로써 적응적 문턱값 결정 기법이 정확함을 보인다.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
• /
• 제27권5호
• /
• pp.1193-1201
• /
• 2016

공간 또는 시공간 데이터에서 다른 지역에 비해 유난히 높은 위험률을 보이는 소위 핫 스팟 (hot spot)으로 불리는 클러스터 (cluster)를 찾으려고 하는 경우가 많다. 기존의 많은 방법들은 이러한 클러스터 패턴이 존재하는지에 대한 해답만 주었지만, 최근의 많은 방법들은 클러스터의 위치, 모양, 크기뿐만 아니라 찾아진 클러스터가 통계적으로 유의한지까지 검정해준다. 본 논문에서는 이러한 다양한 방법 중 가장 많이 사용되는 클러스터 탐색 방법 중 하나인 스캔 통계량을 이용한 방법을 소개하고 그 방법이 구현된 무료 소프트웨어 SaTScan을 이용한 결과를 보여주고 장단점을 논하고자 한다. 미국 국립암센터의 SEER 프로그램에서 제공하는 미국의 각 카운티별 암 사망자 자료 중 2006년 여성 폐암 사망자 데이터를 예시 데이터로 사용하여 스캔 통계량을 이용하여 구한 클러스터 탐색 결과를 제시하고 비슷한 연구를 하고자는 연구자에게 도움을 주고자 한다.

• Journal of Photoscience
• /
• 제12권2호
• /
• pp.87-93
• /
• 2005

A new assay technique to distinguish between pure compounds and the isomeric mixtures has been suggested using single molecule (SM) fluorescence detection technique. Since the number of emission spots in a fluorophorespread film prepared from a genuine dye solution was determined by experimental condition, the deviation of spot numbers from the expected values could be considered to be an indication of lower purity of the sample solution. The lower limit of sample concentration for this assay was determined to be $5{\times}10^{-10}$ M to show uniform number of expected spots within 10% uncertainties in our experimental condition. An individual fluorescence intensity distribution for a mixture of isomers having doubly different emissivities was simulated by adding distributions obtained from Cy3 and nile red (NR) independently. The result indicated that the mixture could be identified from the pure compounds through the difference in the number of Gaussian functions to fit the distribution. This new assay technique can be applied to the purity test for synthetic biofluorophores which are usually prepared in small quantities not enough for classical ensemble assays.

• The Plant Pathology Journal
• /
• 제27권3호
• /
• pp.291-296
• /
• 2011

In order to detect quarantine plant viruses, we developed reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) primer pairs for five single-stranded (ss) plant RNA viruses that are not currently reported in Korea but could be potential harmful plant viral pathogens. Three viruses such as Chilli veinal mottle virus (ChiVMV), Colombian datura virus (CDV), and Tobacco etch virus (TEV) belong to the genus Potyvirus while Chrysanthemum stem necrosis virus (CSNV) and Iris yellow spot virus (IYSV) are members of the genus Tospovirus. To design RT-PCR primers, we used reported gene sequences corresponding to the capsid protein and polyprotein for ChiVMV, CDV, and TEV while using nucleocapsid protein regions for CSNV and IYSV. At least two different primer pairs were designed for each virus. Fifteen out of 16 primer pairs were successfully applied in detection of individual quarantine virus with high specificity and efficiency. Taken together, this study provides a rapid and useful protocol for detection of five quarantine viruses.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
• /
• 제33권1호
• /
• pp.69-75
• /
• 2012

Five-channel electrochemical chips were fabricated based on the Micro-electromechanical System (MEMS) technology and were used as platforms to develop DNA arrays. Different kinds of thiolated DNA strands, whose sequences were related to white spot syndrome virus (WSSV) gene, were separately immobilized onto different working electrodes to fabricate a combinatorial biosensor system. As a result, different kinds of target DNA could be analyzed on one chip via a simultaneous recognition process using potassium ferricyanide as an indicator. To perform quantitative target DNA detection, a limit of 70 nM (S/N=3) was found in the presence of 600 nM coexisting noncomplementary ssDNA. The real samples of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) products were detected by the proposed method with satisfactory result, suggesting that the multichannel chips had the potential for a high effective microdevice to recognize specific gene sequence for pointof-care applications.

• 한국전자통신학회논문지
• /
• 제13권6호
• /
• pp.1281-1286
• /
• 2018

세계적으로 1500 종 이상이 분포하고 있는 해삼은 오랫동안 여러 나라에서 중요한 수산 자원으로 취급되어져 왔고 개체군 보존관리 보호종에 속하는 고부가가치 품종이다. 해삼에 관한 연구는 음식과 추출물의 효능에 관한 것이 대부분이며, 아직까지 해삼 특징 식별에 대한 연구는 이루어지지 않고 있다. 이에 본 연구는 고부가가치 품종인 해삼을 대량으로 포획하기 위하여 해삼의 특징점 추출을 위한 경계 검출 알고리즘을 제안하였으며 향후 해삼 인식 프로그램에 많은 도움이 되리라 생각한다.

• Spatial Information Research
• /
• 제15권1호
• /
• pp.25-33
• /
• 2007

본 연구의 목적은 Landsat과 SPOT 5 위성자료를 이용하여 부유사 알고리즘을 적용한 결과를 바탕으로 임하댐의 수질을 시-공간적으로 평가하는데 연구의 목적이 있다. 임하댐의 부유사 농도 분포를 동시에 관측하기 위해서 위성관측 자료가 분석되었다. 본 연구의 중요한 과정은 위성에서 관측된 반사도와 부유사 농도와의 관계를 파악하는데 있다. 하지만, 부유사 알고리즘은 위성자료에서 계산된 부유사와 동일시점의 현장관측 자료와 비교되어야만 한다는 제한점이 있다. 위성관측 반사도로부터 도출된 상관식을 기초로 한 부유사 알고리즘은 부유사 농도 추정을 위한 경험식으로 유도되고 검증되었다.

• 대한공간정보학회지
• /
• 제17권1호
• /
• pp.61-69
• /
• 2009

최근 위성영상의 공간해상도가 향상됨으로 인해 단일 위성영상이 포함하는 지상영역의 범위가 감소하고 있으며, 따라서 위성영상을 다양한 GIS분야에 활용하기 위해서 효과적인 영상 모자이킹기법의 개발이 요구되고 있다. 본 연구에서는 고해상도 위성영상에서의 경계선 정보(강, 도로, 건물 등)를 이용하여 접합선을 설정함으로써 모자이킹을 수행하는 알고리즘을 제안하였으며, 이를 위해서 경계선 검출 알고리즘을 통해 추출된 단절 경계선들의 추적 및 상호연결기법을 개발하였다. 본 연구에서 제시한 기법을 IKONOS, KOMPSAT-1, SPOT-5 위성영상에 적용하여 가능성을 평가하였으며, 실험 결과 두 영상의 기하학적 차이로 인한 인접부분에서 불연속성이 최소화됨을 알 수 있었다.

• 한국광학회지
• /
• 제16권4호
• /
• pp.345-353
• /
• 2005

포토 다이오드(photodiode) 조정 방식을 이용해서, 비전 시스템을 장착한 고가의 정밀 자동 조립조정 장비 없이 홀로그램 픽업 모듈을 제작하는 새로운 방법을 제안하였다. 저가격화를 위해서 리드 프레임형의 반도체 레이저와 COB(Chip on Board)형의 포토 다이오드를 사용했고, 초점 에러 신호(focus error, FES) 검출방법은 스팟 사이즈 검출법(spot size detection, SSD), 트랙 에러 신호(tracking error, TES) 검출방법은 삼빔법(3 beam method)을 이용했다. 이를 만족하는 픽업 홀로그램 모듈 광학계를 설계하고, 조립조정 프로세스 수립 및 시스템을 제작하였으며, 조립된 홀로그램 모듈을 이용하여 CD에서 데이터를 검출하는 실험을 통해 제안된 포토 다이오드 조정방식의 유용함을 입증하였다.