• The Plant Pathology Journal
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• 제30권1호
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• pp.68-74
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• 2014

Chrysanthemum stunt viroid (CSVd), a noncoding infectious RNA molecule, causes seriously economic losses of chrysanthemum for 3 or 4 years after its first infection. Monomeric cDNA clones of CSVd isolate SK1 (CSVd-SK1) were constructed in the plasmids pGEM-T easy vector and pUC19 vector. Linear positive-sense transcripts synthesized in vitro from the full-length monomeric cDNA clones of CSVd-SK1 could infect systemically tomato seedlings and chrysanthemum plants, suggesting that the linear CSVd RNA transcribed from the cDNA clones could be replicated as efficiently as circular CSVd in host species. However, direct inoculation of plasmid cDNA clones containing full-length monomeric cDNA of CSVd-SK1 failed to infect tomato and chrysanthemum and linear negative-sense transcripts from the plasmid DNAs were not infectious in the two plant species. The cDNA sequences of progeny viroid in systemically infected tomato and chrysanthemum showed a few substitutions at a specific nucleotide position, but there were no deletions and insertions in the sequences of the CSVd progeny from tomato and chrysanthemum plants.

• 한국응용곤충학회지
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• 제35권3호
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• pp.209-215
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• 1996

복숭아혹진딧물(Myzus persicae Sulzer)은 두가지 서로 다른 기주선호성을 가지는데 이 기주선호성과 형태적 특징에 기초하여 담배진닷물(Myzus nicotinae Blackman)과 담배 이외의 다른 채소류에 서식하는 복숭아 혹진딧물(M. persicae)로 분류하였지만(Blachmean, 1987) 이 분류 방법에 동의하지 않는 학자들도 많다. 이런 이유로 RAPD-PCR 기법을 이용하여 한국에 서식하는 복숭아혹진딧물에 대하여 그들의 2차 숙주선호성에 따른 DNA의 변이 정도를 살펴보았다. 실험곤충으로는 담배와 배추에서 채집하여 사육한 진딧물 각 4 clones 씩을 사용하였다. 각 clone은 한 개체를 사육하여 얻은 자손들과 그들의 후손으로 이루어졌으며, 사육한 진딧물에서 핵 DNA를 추출하고, 10개 nucleotide 길이의 random primer 100가지를 사용하여 PCR한 후 1 % agarose gel 전기영동법으로 분석하였다. 사용한 100종류의 random primer 중 83가지에서 DNA 단편이 합성되었다. 증폭된 1개의 primer당 단편의 수는 1개에서 22개였고 평균 단편 수는 약 13개였으며, 각 각 단편의 길이는 500에서 20,000 base pair사이에 분포하였다. 82가지 primer의 경우에 일부 단편의 짙기에는 차이가 있었으나 단편종류의 분포는 동일하게 나타났다. 한가지 primer경우에만 담배섭식형 1개 c clone에서 다른 7가지 clones에 없는 band가 1개 나타났다. 이때 나머지 7 clones의 단편 분포 형태는 모두 동일하였다. 따라서 이 band는 숙주 선호성과는 무관한 것으로 보인다. 결국 이 실험에 사용한 100종류의 primer에 기초하여 RAPD-PCR기법으로 DNA를 증폭한 결과 복숭아혹진딧물의 숙주선호성이 개체군간의 유전적인 차이점에 기인한다는 가설을 뒷받침할 만한 증거를 찾지 못하였다.

• 한국가금학회지
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• 제35권1호
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• pp.9-13
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• 2008

양계 산업에서 살모넬라에 의한 질병들 중 가장 중요한 원인체는 S. Gallinarum, S. Purollum, S. Enteritidis로 간주된다. 생화학적 검사에 의한 직접적인 균 분리.동정과 같은 이들 질병에 대한 종래의 진단법은 많은 시간이 소요되며, 특이성 또한 낮다. 본 연구는 3종의 살모넬라균에 의해 야기되는 이들 질병에 대한 빠르고 정확한 진단을 위한 효율적인 진단법에 초점을 두었다. 먼저 종래의 생화학적 검사를 대신하여 새로 고안된 ITSF/ITSR PCR primer를 이용하여 살모넬라균임을 확인하였으며, 증폭된 phase 1 flagellin (fliC) 유전자를 BpmI 또는 BfaI 제한 효소로 처리하여 S. Gallinarum, S. Purollum, S. Enteritidis를 상호 용이하게 감별하였다. 이상의 결과는 3종의 살모넬라균을 효율적으로 진단하기 위해 신속하게 검출하고 감별할 수 있는 유용한 진단법임을 알 수 있었다.

• Weed & Turfgrass Science
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• 제2권2호
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• pp.191-197
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• 2013

한국 잔디 신품종 개발 목적으로 전라남도 장성군 삼서면 일대 한국잔디 중지류 생산포장에서 선발한 생육 및 피복속도가 빠르고 밀도 또는 가을철 녹색기간이 긴 2개 우량계통을 대상으로 DNA 수준에서 기존 중지류 또는 한국잔디들과 차이를 살펴보고 신품종 특이적으로 차이를 보이는 DNA 염기서열을 기반으로 RAPD-SCAR 마커를 개발하고자 본 연구를 실시하였다. RAPD 프라이머를 스크리닝 한 결과 N8021와 N8001 프라이머가 CY6069와 CY6097 품종 각각에 특이적인 DNA 절편을 약 600 bp와 700 bp 부근에서 발견할 수 있었다. 특이 밴드는 TA-cloning vector에 삽입 후 대장균에 형질전환하여 배양하였고, 이로부터 추출된 플라스미드 DNA의 염기서열 분석을 실시하여 최종적으로 중지류 신품종 특이 SCAR 마커 프라이머를 작성하였다. CY6069 선발 품종 특이 SCAR 마커(CY6069_550)는 다른 한국잔디 들잔디(야지), 한국잔디 중지, 갯잔디, 금잔디에서는 보이지 나타나지 않았던 식별 가능한 밴드를 보였고(550 bp), CY6097 선발 품종 식별을 위한 SCAR 마커(CNU70-6_1500)도 CY6097 계통에서만 특이적으로 나타나는 DNA 밴드를 약 700 bp 부근에서 증폭할 수 있었다. 형태 및 생육특성 차이와 함께 본 연구를 통해 개발된 RAPD-SCAR 마커를 활용하면 선발된 중지류 한국잔디 CY6069와 CY6097 계통을 실험실내에서 PCR을 통해 유전자원 식별 및 원산지 증명이 가능해졌고 영양번식을 통해 주로 번식하는 난지형 잔디 생산 포장에서 품종의 혼입으로부터 정확하게 분리해 낼 수 있을 것으로 판단된다.

• 한국어병학회지
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• 제18권1호
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• pp.39-48
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• 2005

'Brown ring disease (BRD)'의 원인균인 Vibrio tapetis (NCIMB 13622)의 바지락(Ruditapes philippinarum)에서의 병원성을 조사하고, 바지락 조직 내의 균의 존재를 PCR법으로 진단하였다. 실온에 12시간 노출시킨 바지락 개체당 1.0$\time$$10^7 cells과 1.0$\time$$10^4 cells의 V. tapetis를 멸균주사기를 사용하여 인위감염 시켰을 때의 누적폐사율은 각각 67.5%와 7.5%로 나타났다. 폐사개체에서 BRD의 특징적인 증상인 패각내면의 chonchiolin 침착에 의해 형성되는 갈색반점은 관찰되지 않았으나, PCR법에 의해 균의 존재를 확인할 수 있었다.10종의 Vibrio균을 대상으로 PCR법의 검출 특이성을 조사한 결과 V. tapetis에 대해서만 414 bp의 특이밴드가 검출되었다. 또 V. tapetis를 개체당 1.0$\time$$10^4 cells과 1.0$\time$$10^8 cells 접종시킨 다음 사육하면서 경시적으로 균의 동태를 조사한 결과 개체당 1.0$\time$$10^4 cells을 접종하였을 때는 1일 후에는 아가미에서만 특이밴드가 검출되었고, 3일 후에는 모든 조직에서 검출되지 않았다. 한편 개체당 1.0$\time$$10^8 cells을 접종하였을 때 1일 후에는 아가미와 소화관, 3일 후에는 모든 조직에서 검출되었으며, 5일과 7일 후에는 외투막과 발, 9일 후에는 아가미와 발에서 검출되어, 검출장기로는 아가미가 가장 효과적인 것으로 판명되었다. PCR법으로 태안과 고창 지역의 바지락, 동죽, 굴 및 피뿔고둥의 조직내 V. tapetis의 존재를 검사한 결과 바지락과 피뿔고둥에서는 전혀 검출되지 않은 반면 굴과 동죽에서 각각 23.1%, 와 9.4% 검출되어 바지락 이외의 다른 패류의 진단에도 유용한 방법으로 판단되었다.

• BMB Reports
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• 제36권5호
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• pp.508-513
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• 2003

The bacterium Bacillus thuringiensis produces toxin inclusions that are deleterious to target insect larvae. These toxins are believed to interact with a specific receptor protein(s) that is present on the gut epithelial cells of the larvae. In various insect species (in particular those belonging to the lepidopteran class), aminopeptidase N (APN) is one of the two receptor proteins that are considered to be involved in toxin-receptor interactions. However, in mosquitoes, the nature and identity of the receptor protein is unknown. Here, using RT-PCR, we identified two isoforms of the APN transcripts in the Aedes aegypti mosquito larval midgut. These results are congruent with a previous report of multiple isoforms of the APN gene expression in lepidopteran larvae. Which of the two isoforms (or other yet unidentified receptor proteins) is involved in the killing of mosquito larvae remains to be elucidated.

• 한국동물번식학회:학술대회논문집
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• 한국동물번식학회 2004년도 춘계학술발표대회
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• pp.196-196
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• 2004

By use of RT-PCR coupled with DHPLC technique (WAVE analysis), pattern of isoforms of porcine cytochrome P450 aromatase gene was investigated. Relatively higher expression of aromatase mRNA was observed in testis than in ovary and this result accounted for the previous findings of higher blood estrogen level in male compared with female in this species. (omitted)

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권1호
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• pp.39-44
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• 2010

Acidithiobacillus caldus is an acidophilic, chemolithotrophic bacterium that plays an important role in bioleaching. Gene transformation into A. caldus is difficult, and only the conjugation method was reported successful, which was a relatively sophisticated method. In this research, electrotransformation of A. caldus species was achieved for the first time using A. caldus Y-3 and plasmid pJRD215. Transformants were confirmed by colony PCR specific to the str gene on pJRD215, and the recovery of the plasmid from the presumptive transformants. Optimizations were made and the transformation efficiency was increased from 0.8 to $3.6{\times}10^4$ transformants/${\mu}g$ plasmid DNA. The developed electrotransformation method was convenient in introducing foreign genes into A. caldus.

• 산업기술연구
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• 제37권1호
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• pp.16-20
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• 2017

A new putative laccase gene (soncotA) which show 78% homology with that from Bacillus licheniformis (liccotA) was isolated from draft genome sequence of Bacillus sonorensis KCTC 13918. A 1,545 bp of PCR product corresponding 514 amino acids was cloned into NdeI-NotI site of pET21c and expressed as soluble form in E. coli. About 59 kDa size of recombinant laccase was purified into homogenity by Ni-NTA column and laccase activity was confirmed by zymography. The enzymatic properties of recombinant laccase were characterized. The specific activity of B. sonorensis laccase was 0.033 fold lower than that of Bacillus licheniformis laccase. The finding of new laccase gene broadened the enzymatic diversity of Bacillus species laccases.

• 대한수의학회지
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• 제50권1호
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• pp.55-57
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• 2010

Torque teno virus (TTV), a species of Anellovirus, is a non-enveloped single stranded DNA virus with a wide range of animal hosts. The incidence of TTV is quite ubiquitous throughout the world. A total of 235 serum samples obtained from 137 pigs and 98 cattle at slaughterhouses in Korea during April 2005 to May 2005 were tested by TTV-specific PCR as to monitor prevalence of TTV among swine and cattle. As a result, the prevalent rates of TTVs in pigs and cattle were 43.1% and 4.1%, respectively. It seems that TTV infection is quite prevalent in swine population.