• 한국식품위생안전성학회지
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• 제32권6호
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• pp.500-506
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• 2017

본 연구는 자가제조퇴비를 사용하는 유기농가와 관행농가로 구분하여 생산되는 배추와 토양의 위생지표세균(Aerobic plate count, coliform count, yeast & mold)과 식중독발병 가능성이 있는 유해미생물(Staphylococcus aureus, Environmental listeria, Bacillus cereus)의 밀도를 분석하였다. 그 결과, 토양과 식물체 모두 식품에서 위해균 허용한계치인 5.0 Log CFU/g 이하로 검출되었다. 또한 토양에서 위해균 검출량과 식물체 표면의 위해균 검출량간의 상관 관계를 분석한 결과 정의 상관관계에 있었다. 또한 토양과 식물의 중금속 오염도를 조사한 결과 검출되지 않거나 허용한계치 이하로 검출되었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제29권2호
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• pp.244-255
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• 2019

Xylose isomerase (XI; E.C. 5.3.1.5) catalyzes the isomerization of xylose to xylulose, which can be used to produce bioethanol through fermentation. Therefore, XI has recently gained attention as a key catalyst in the bioenergy industry. Here, we identified, purified, and characterized a XI (PbXI) from the psychrophilic soil microorganism, Paenibacillus sp. R4. Surprisingly, activity assay results showed that PbXI is not a cold-active enzyme, but displays optimal activity at $60^{\circ}C$. We solved the crystal structure of PbXI at $1.94-{\AA}$ resolution to investigate the origin of its thermostability. The PbXI structure shows a $({\beta}/{\alpha})_8$-barrel fold with tight tetrameric interactions and it has three divalent metal ions (CaI, CaII, and CaIII). Two metal ions (CaI and CaII) located in the active site are known to be involved in the enzymatic reaction. The third metal ion (CaIII), located near the ${\beta}4-{\alpha}6$ loop region, was newly identified and is thought to be important for the stability of PbXI. Compared with previously determined thermostable and mesophilic XI structures, the ${\beta}1-{\alpha}2$ loop structures near the substrate binding pocket of PbXI were remarkably different. Site-directed mutagenesis studies suggested that the flexible ${\beta}1-{\alpha}2$ loop region is essential for PbXI activity. Our findings provide valuable insights that can be applied in protein engineering to generate low-temperature purpose-specific XI enzymes.

• 미생물학회지
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• 제32권3호
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• pp.232-237
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• 1994

Glutaryl 7-aminodeacetoxycephalosporanic acid(GL-7-ADCA)로부터 7-aminodeacetoxycephalosporanic acid(7-ADCA)를 생성하는 GL-7-ADCA acylase생산균을 자연계에서 폭넓게 검색하여 한균주를 선정하고 분리균의 형태 및 생리적 성질들을 조사하여 Alcaligenes sp.로 동정하였다. 분리균의 효소생산을 위한 배양조건을 검토한 결과 탄소원으로는 glucose, 질소원으로는 yeast extract, monosodium L-glutamate가 우수하였다. 효소의 작용최적 pH는 8.0이며, pH7.0~pH11.0 번위에서 비교적 안정하였다. 5l jar fermentor에서 배양경과를 조사한 결과 효소이 활성은 $37^{\circ}C$, 교반속도 300rpm, 통기량 1vvm 조건에서 20시간~30시간 배양시 가장 높았다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제16권12호
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• pp.1868-1873
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• 2006

A novel microorganism that could degrade high molecular weight gellan was screened and isolated from soil. On gellan plate, the microorganism grew well and completely liquefied the plate. The gellan-degrading microorganism was isolated by pure culture on glucose and nutrient agar medium afterwards. The 16S rDNA sequence analysis and biochemical tests using an API 50CHB/20E kit revealed that the strain belonged to Bacillus sp. The isolate, named as Bacillus sp. YJ-1, showed optimum gellan-degrading activity in 0.5% gellan medium at pH 7.5 and 37$^{\circ}C$. The activity was measured and evaluated by the thiobarbituric acid and thin-layer chromatography method. Mass spectrometry revealed that the major gellan.. depolymerized product was an unsaturated tetrasaccharide consisting of $\Delta$4,5-glucuronic acid-(1$\rightarrow$4 )-$\beta$-D-glucose-(1$\rightarrow$4)- $\alpha$-L-rhamnose-(1$\rightarrow$3)-$\beta$-D-glucose, which is a dehydrated repeating unit of gellan, thus the enzyme was identified as gellan lyase. When the gellan was present in the medium, the gellan-degrading activity was much higher than that in glucose-grown cells. These results indicate that in the presence of gellan, Bacillus sp. YJ-1 is able to metabolize the gellan by inducing gellan-degrading enzymes that can degrade gellan into small molecular weight oligosaccharides, and then the gellan. depolymerized products are taken up by the cells and utilized by intracellular enzymes.

• Applied Biological Chemistry
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• 제11권
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• pp.43-47
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• 1969

본(本) 연구(硏究)에서 얻어진 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1. Glucose Isomerizing Enzyme을 분비(分泌)하는 Actinomyces과(科) 균주(菌株)를 토양(土壤)으로부터 분리(分離)하였으며 2. 본(本) 균주(菌株)가 생성(生成)하는 Glucose Isomerizing Enzyme를 Glucose에 작용(作用)시킨 결과(結果) 생성(生成)된 당(糖)은 Fructose 일종(一種)만을 생성(生成)하였으며 그외(外)의 당(糖)의 부생물(副生物)은 검출(檢出)되지 아니 하였다.

• Journal of Species Research
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• 제7권3호
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• pp.210-221
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• 2018

Eight bacterial strains assigned to the phylum Firmicutes were isolated from the soil samples in Korea. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that strains 18JY14-16, 18JY14-35, 18JY42-5, 18JY12-20, 18JY35-8, 18JY76-9, 18JY39-1 and 18JY54-12 were most closely related to Paenibacillus lupini (MH497638; 99.4%), Paenibacillus illinoisensis (MH497643; 99.8%), Paenibacillus tundrae (MH497658; 99.7%), Paenibacillus selenitireducens (MH497639; 99.4%), Paenibacillus eucommiae (MH 497640; 99.9%), Paenibacillus vini (MH497654; 99.4%), Paenibacillus gorillae (MH497647; 99.5%), and Paenibacillus macquariensis (MH497649; 99.9%) respectively. These Paenibacillus species were Gram-stain-positive, rod-shaped and radiation resistant bacteria. This is the first report of these nine bacterial species in Korea.

• 산업식품공학
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• 제14권1호
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• pp.7-13
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• 2010

호열성 미생물을 검토하기 위하여 전국 각지로부터 토양과 두엄을 채취하여 그로부터 호열성 미생물을 분리하였다. 토양과 두엄으로부터 분리된 호열성 미생물 1250여 균주를 선별하였고, 이들을 대상으로 미생물이 생산하는 효소 활성을 검토하여 호열성 전분 분해 효소를 생산하는 1주의 미생물을 확인하였다. 확인된 1주의 미생물을 strain 2719라 명명하였다. Strain 2719 균주는 형태학적으로 gram 양성 간균의 특징을 나타냈고, 균주의 표면은 매끄럽지 않았으며, 비교적 다양한 길이를 가지고 있었다. 또한 다른 gram 양성 간균들에 비해서 많은 수의 균사들이 각 균주들 사이에 복잡하게 얽혀있었다. 생화학적 특성을 확인한 결과 catalase 양성, glucose 발효, arabinose 발효, mannitol 발효, casein gelatin starch 가수분해의 특징을 가지고 있었으며, 이는 Bacillus sp.로 추정되었다. 생육 pH의 범위는 pH 6-pH 8범위에서 생육이 가능했으며, 생육 온도의 범위는 50-70${^{\circ}C}$였다. 16S rDNA sequence 분석결과 Bacillus thermoglucosidasius의 16S rDNA와 99.52%가 일치하였으나, sequence의 일부분이 다른 부분이 있고, 생육 특성에서 약간의 차이를 보였다. 또한 gene bank에 등록되어 있는 균주들의 16S rDNA sequence들과 비교하여도 일치하는 균주는 확인되지 않았다. 이와 같은 실험결과에 따라 2719 균주는 기존에 발표되지는 않았으나, Bacillus thermoglucosidasius와 매우 유사한 균주로 판단되어 Bacillus thermoglucosidasius 2719로 명명하였다.

• 산업식품공학
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• 제14권3호
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• pp.263-270
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• 2010

Xylanase를 생산하는 호알칼리성 균주를 토양으로부터 분리하여 동정하였다. 토양으로부터 분리한 호알칼리성 균주 3000여종 중 xylanase 활성이 가장 높은 균주인 strain DK-2386 균주를 선별하였다. Gram 염색과 SEM을 통한 형태학적 특성을 관찰하였으며, Methods for General and Molecular Bacteriology와 Bergey's manual of systematic bacteriology, 그리고 Biochemical tests for identification of medical bacteria에 준하여 생화학적 특성을 확인한 결과 배양액의 색은 붉은 빛을 나타내었으며, Gram양성 간균, 내생포자형성, catalase 양성, oxidase 양성, 혐기성 양성, glucose로부터 gas 형성 양성, casein 가수분해 양성, starch 가수분해 양성, CMC 가수분해 양성, xylan 가수분해 양성, nitrate 환원능 양성이며 10% NaCl 농도에서도 생육하는 것을 확인하였다. 균체의 지방산 조성 분석 결과 $C_{15:0\;ISO}$ 27.35%와 $C_{15:0\;ANTEISO}$ 31.54%, $C_{16:0}$ 9.70%로 이루어져 Bacillus속으로 동정되었으며, 16S rDNA 염기서열 분석결과 B. agaradhaerens와 100%의 유사성을 갖는 것을 확인하였다. (사)한국종균협회로부터 분양받은 Bacillus agaradhaerens 40952, B. alcalophilus와 strain DK-2386 균주사이의 생화학적 특성을 비교한 결과 B. agaradhaerens와 속과 종이 같으나 미세하게 특성이 다른 균주로 판단되어 B. agarad haerens DK-2386이라 명명하였다.

• 한국환경과학회지
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• 제11권1호
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• pp.33-40
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• 2002

An antimicrobial substance-producing microorganism was isolated from soil samples. Based of the taxonomic characteristics of its morphological, cultural, physiological properties and 16s rRNA sequence alignment, this microorganism was identified as Pseudomonas aeruginosa, and we named Pseudomonas aeruginosa EL-KM. The optimal culture condition for production of antimicrobial substance was 1% mannitol, 0.4% yeast extract, 0.5% Nacl, 0.2% $K_2SO_4$, 100$\mu$M $MgSO_4$.$7H_2O$, 10$\mu$M $CaCl_2$.$2H_2O$, 1$\mu$M $FeSO_4$.$7H_2O$, 1$\mu$M $MnSO_4$.$4-5H_2O$, initial pH 7 and 200 rpm at 3$0^{\circ}C$. The purification of the antimicrbial substance was performed by silica gel column chromatographys, and fraction with TLC $R_f$ 0.77 value represented good antimicrobial activity. The crude antimicrbial substance was stable within a pH range of 3-10 and temperature range of 4$^{\circ}C$-121$^{\circ}C$ autoclaving. This crude antibacterial substance acted as bacteriolytic agent against Vibrio cholerae non-Ol ATCC 25872, and also exhibited excellent properties, when the substance was demonstrated against many other gram-positive, gram-negative bacteria, yeast and fungi.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제19권6호
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• pp.543-547
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• 1991

토양으로부터 호알칼리성 미생물을 분리하여 동정 한 결과, Bacillus속의 특성을 나타내어 Bacillus sp. SH-8로 명명하였다. Bacillus sp. SH-8은 초기 pH 9.0이상의 알칼리에서만 생육이 가능하였으며 중성 pH에서는 불가능하였다. Bacillus sp. SH-8로부터 U.V.조사에 의해 중성배지에서도 생육이 가능한 변이주를 분리하여 Bacillus sp. SH-8M으로 명명하였으며, 초기 pH 6.9부터 11.0까지 생육이 가능하였다. 따라서 이들 두 균주는 pH 변화에 따른 생육과 효소생산을 비교, 검토하는데 적합한 균주로 생각된다.