• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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• 제10권5호
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• pp.400-407
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• 2005

Reverse engineering is defined as the process where the internal structures and dynamics of a given system are inferred and analyzed from external observations and relevant knowledge. The first part of this paper surveys existing techniques for biosystem reverse engineering. Network structure inference techniques such as Correlation Matrix Construction (CMC), Boolean network and Bayesian network-based methods are explained. After the numeric and logical simulation techniques are briefly described, several representative working software tools were introduced. The second part presents our component-based software architecture for biosystem reverse engineering. After three design principles are established, a loosely coupled federation architecture consisting of 11 autonomous components is proposed along with their respective functions.

• Genomics & Informatics
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• 제13권4호
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• pp.119-125
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• 2015

RNA is a polymeric molecule implicated in various biological processes, such as the coding, decoding, regulation, and expression of genes. Numerous studies have examined RNA features using whole transcriptome sequencing (RNA-seq) approaches. RNA-seq is a powerful technique for characterizing and quantifying the transcriptome and accelerates the development of bioinformatics software. In this review, we introduce routine RNA-seq workflow together with related software, focusing particularly on transcriptome reconstruction and expression quantification.

• Journal of Power Electronics
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• 제2권4호
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• pp.258-267
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• 2002

This paper presents the principal features of the software modules developed to provide an interactive teaching/learning environment in Power Electronics that can be used by educators and students. The software modules utilize an object oriented programming LabVIEW that provides a highly flexible graphical user interface. The paper highlights the principal features the software components and illustrates a number of highly interactive graphical user interfaces of selected Power Electronics circuits and systems.

• 정보과학회 논문지
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• 제45권2호
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• pp.150-156
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• 2018

소프트웨어 가시화 연구는 개발자들이 소프트웨어 시스템을 이해하고 코드 변경을 수행할 때 도움을 줄 수 있다는 점에서 중요하다. 최근 제시된 상향식 소프트웨어 가시화 도구들은 개발자가 직접 작업하는 코드 정보만을 보여주는 이점으로 개발자들의 작업에 도움을 줄 수 있다는 효과를 입증하고 있다. 하지만 이러한 도구들은 개발자가 탐색한 코드만 한정되게 보여주는 약점이 있다. 본 논문은 상향식 가시화 도구에서 연관이 되는 코드 정보를 제공하여 코드 탐색을 돕기 위하여 소프트웨어 개정 이력을 클래스 다이어그램으로 보이는 도구를 제시한다. 제시 도구는 개발자들이 커밋한 코드 정보를 한 번의 클릭으로 클래스 다이어그램으로 보여줌으로써, 개발자들의 코드 변경에 대한 빠른 이해를 돕는다. 또한 본 논문은 사례 연구를 통하여 개발자들이 수일동안 지속적인 변경 작업을 수행할 때 제시 도구가 유용할 수 있음을 보인다.

• 한국항해항만학회:학술대회논문집
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• 한국항해항만학회 2015년도 추계학술대회
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• pp.51-52
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• 2015

국제해사기구에서는 e-Navigation의 개발과정에 소프트웨어 품질에 대한 고려가 필수적으로 도입될 수 있도록 해양 소프트웨어품질 보증을 진행해오고 있다. 소프트웨어 품질 확보를 위해서는 소프트웨어 개발 프로젝트 전반에 걸쳐 정해진 절차를 따르고, 각 절차를 수행한 결과로 산출물의 작성이 필요하다. 이를 지원하는 도구의 활용은 소프트웨어 개발의 생산성에 중요한 요소가 될 수 있다. 본 논문에서는 실시간 모니터링과 문서의 자동화가 가능한 도구를 활용하여 해양 소프트웨어 개발에 적용하기 위한 사례를 소개한다. 도구 활용에 대한 기대효과 및 해양 SQA에 적용하기 위한 절차의 개선에 대해서도 논의한다. 개선된 절차를 도구에 반영하여 해양 SQA에 맞춤형 도구를 개발하는 것을 향후 목표로 한다.

• Nutrition Research and Practice
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• 제18권2호
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• pp.294-307
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• 2024

BACKGROUND/OBJECTIVES: Dietitians frequently use nutrition education tools to facilitate dietary counselling sessions. Nevertheless, these tools may require adaptation to keep pace with technological advancements. This study had a 2-fold purpose: first, to identify the types of nutrition education tools currently in use, identify their limitations, and explore dietitians' perspectives on the importance of these tools; second, to investigate the features that dietitians prefer in digital nutrition education tools. SUBJECTS/METHODS: A semi-structured face-to-face interview was conducted among 15 dietitians from selected public hospitals, primary care clinics, and teaching hospitals in Malaysia. Inductive thematic analysis of the responses was conducted using NVivo version 12 software. RESULTS: Most dietitians used physical education tools including the healthy plate model, pamphlets, food models, and flip charts. These tools were perceived as important as they facilitate the nutrition assessment process, deliver nutrition intervention, and are time efficient. However, dietitians described the current educational tools as impersonal, outdated, limited in availability due to financial constraints, unhandy, and difficult to visualise. Alternatively, they strongly favoured digital education tools that provided instant feedback, utilised an automated system, included a local food database, were user-friendly, developed by experts in the field, and seamlessly integrated into the healthcare system. CONCLUSION: Presently, although dietitians have a preference for digital educational tools, they heavily rely on physical nutrition education tools due to their availability despite the perception that these tools are outdated, impersonal, and inconvenient. Transitioning to digital dietary education tools could potentially address these issues.

• 인터넷정보학회논문지
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• 제17권5호
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• pp.67-74
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• 2016

Distributed agile software development faces difficulties for instance lack of visibility across development and delivery processes, complex and disjointed development processes, inability to capitalize on business opportunities, lack of communication agility between disconnected owners, development teams, and users or clients. However these difficulties are solved with the help of cloud computing services. This study proposes a framework to provide a skeletal or structural environment for distributed agile software development in cloud computing environment. The framework guide towards the best tooling to deliver a consistent, automated, governed, and unified agile software development process with reduced technical debt, and minimized project backlog. In addition to this, the study highlights the benefits of cloud computing in agile software development.

• Nuclear Engineering and Technology
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• 제36권4호
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• pp.295-303
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• 2004

Software inspection is widely believed to be an effective method for software verification and validation (V&V). However, software inspection is labor-intensive and, since it uses little technology, software inspection is viewed upon as unsuitable for a more technology-oriented development environment. Nevertheless, software inspection is gaining in popularity. KAIST Nuclear I&C and Information Engineering Laboratory (NICIEL) has developed software management and inspection support tools, collectively named "SIS-RT. "SIS-RT is designed to partially automate the software inspection processes. SIS-RT supports the analyses of traceability between a given set of specification documents. To make SIS-RT compatible for documents written in Korean, certain techniques in natural language processing have been studied [9]. Among the techniques considered, case grammar is most suitable for analyses of the Korean language [3]. In this paper, we propose a methodology that uses a case grammar approach to analyze the traceability between documents written in Korean. A discussion regarding some examples of such an analysis will follow.

• 한국컴퓨터정보학회논문지
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• 제3권4호
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• pp.70-77
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• 1998

시스템 성능평가의 대상은 하드웨어와 소프트웨어로 나누어 평가할 수 있다. 현재 하드웨어의 평가는 부문별로 많이 개발되어 왔지만, 소프트웨어의 성능은 그 대응책 없이 개발되어 온 사례가 많다. 물론 외국에서는 소프트웨어 성능공학 쪽으로 많은 관심을 기울러 소프트웨어 개발도구 및 방법론이 성능공학 문제와 연관하여 제안되고 있다. 그러나 우리나라에서는 거의 전무한 상태인 것은 사실이다. 그래서 본 연구에서는 소프트웨어개발 도구 및 개발방법론을 정의하여 그 내용을 비교하고자 한다.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제7권3호
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• pp.408-417
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• 2004

유전체 분석 과정은 여러 단계를 걸쳐 다양한 소프트웨어 분석 도구가 사용되는 복잡한 작업을 수반한다. 유전체 분석과 관련된 기존의 소프트웨어 도구들은 대부분 리눅스나 유닉스 기반 프로그램 이므로 생물학자가 이들을 설치하고 사용하는데 어려움과 불편함이 많은 실정이다. 또한, 분석의 각 단계별로 생산되는 파일은 수작업을 통한 변환을 거쳐야만 다음 단계의 입력으로 사용될 수 있다. 근래에 웹을 기반으로한 도구들이 개발되고 있으나 한번에 하나의 서열을 처리하는 방식이므로 대량의 실험 데이터를 분석하는 경우에는 반복 작업으로 인한 시간과 노력이 요구되는 단점을 갖고 있다. 본 논문에서는 유전체 분석에 필요한 여러 도구들을 웹 환경에서 하나의 그래픽 사용자 인터페이스로 통합하여 생물학자들이 보다 쉽게 서열과 기능을 분석할 수 있도록 한 WGAT(Web-based Genome Analysis Tool)를 제안한다. WGAT는 리눅스 서버에 유전체 데이터 분석프로그램을 구동하고, 클라이언트 웹 (web)에서 데이터 파일과 분석에 필요한 선택사항들을 입력함으로써 한번에 여러 단계의 분석 작업을 수작업 없이 자동으로 처리할 수 있다. WGAT시스템의 생산성을 분석하기 위하여 기존의 방식과 WGAT를 이용한 방식의 서열분석 처리 시간을 비교한 결과 서열 단편의 개수가 1000개인 경우 기존의 방식보다 20배 이상 분석 능력이 향상됨을 확인할 수 있었다.