• 제목/요약/키워드: Similarity determination

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Evaluation of ISSR and RAPD Markers for the Detection of Genetic Diversity in Mulberry (Morus spp.)

  • Venkateswarlu, M.;Nath, B.Surendra;Saratchandra, B.;Urs, S.Raje
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제9권2호
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    • pp.207-215
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    • 2004
  • The present study was carried out to evaluate the ISSR and RAPD markers for their efficiency as genetic marker systems to establish the relationships between 18 mulberry genotypes. A total of 36 from 56 (64%) RAPD primers and 12 from 48 (25%) ISSR primers produced reproducible amplification patterns. A high proportion of polymorphic bands ranging from 44 to 91% was observed respectively with RAPD and ISSR markers. The average Resolving Power (Rp) of ISSR primers was higher than RAPD primers. The ISSR primers, UBC 825, 868 and 873, and RAPD primers, UBC 712, 720 and 729, possessed the highest Rp values and could in each instance distinguish all the 18 genotypes. Similarity matrix values were estimated based on Jaccards coefficient, considering 109 polymorphic ISSR and 212 polymorphic RAPD bands and two dendrograms were constructed. The dendrograms obtained with ISSR and RAPD markers distinguished the eight exotic genotypes from the ten indigenous (Indian) genotypes. A significant correlation value (r=0.959; p=0.001) for the cophenetic matrix between the RAPD and ISSR matrices was observed. The results indicated that the ISSR and RAPD markers could assist in the differentiation of genotypes and permit the determination of genetic distances that might be exploited by mulberry breeders in improvement programs.

위성영상의 통계적 분류를 위한 유효 트레이닝 기법에 관한 연구 (The Effective Training Method for the Statistical Classification of Remotely Sensed Imagery)

  • 이병길;김용일;어양담
    • 한국측량학회지
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    • 제17권3호
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    • pp.225-231
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    • 1999
  • 위성영상의 통계적 분석에서는 트레이닝을 통하여 추정된 각 클래스의 평균과 분산을 통계적 유사성 결정의 근거로 사용한다. 따라서, 트레이닝 작업의 결과는 전체적인 분류정확도에 큰 영향을 주게 된다. 이상적인 위성영상 데이터의 분포는 정규분포에 근사한 것으로 가정되고 있으나, 실제로는 약간의 밀집도와 편의를 보이며 이러한 분포의 이상이 트레이닝 결과 추정되는 분산뿐만 아니라 분류 결과 자체에도 많은 영향을 준다. 본 연구에서는 트레이닝을 통해 추정된 분산의 특성과 이러한 특성이 화소값의 분포와 어떤 관련이 있는지를 규명하고, 그에 따른 분류결과의 변화에 대해 검토하였고, 분산 과소추정의 영향을 최소화할 수 있는 트레이닝 기법을 제시하였다.

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정치 윤리학으로서의 민족주의: 민족과 개인의 욕망 (Nationalism as a Political Ethics: Nation and Individual Desire)

  • 조규형
    • 영미문화
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    • 제10권2호
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    • pp.267-289
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    • 2010
  • Nationalism endorses a collective movement to establish an authentic position in the international cultural and political arena. Arguably the dialectic of nationalism and geopolitics bears a reassuring similarity to the philosophical lineage going back, at least, to Hegelian dialectic of universality and particularity. This dialectic platform has been concerned with sustaining, among other things, the dynamics between the universal and the particular. In practical terms, nationalism prompts increased sensitivity to socio-political pressures coming from abroad to cancel the national particularity into geopolitical, so-called universal, anonymity. Drawing suggestively from psychoanalysis, Lacanian ethics in particular, this discussion articulates the ethics of nationalism. Recounting Kantian self-determination as a reference point for responsible morality, Lacan suggests the problematics of desire as an alternative index for ethics. As individual desire flows from the unfathomable abyss of misrecognition, Lacanian ethics dissuade individuals to unlearn the fantasy that their own real desire, a residue produced by the Symbolic process, can be satisfied with that very socio-cultural Symbolic. Subjecting nationalism to Lacanian implications, Zizek illuminates nationalism as a small screening object which obscures as much as displays the circuits to the individual desire. Psychoanalytic ethics addresses that the ethical base should be found upon the particular, individual, real desire. As far as the nationalist cause also puts emphasis upon particularity rather than universality, nationalism is logically positioned to exert reflective efforts on empowering its constitutive individuals. Lacanian ethics persuades us to challenge the universal claim and to work through to regenerate nationalism in presenting its final contribution towards individual particularities.

Molecular Identification of Cryptosporidium viatorum Infection in a Patient Suffering from Unusual Cryptosporidiosis in West Bengal, India

  • Sardar, Sanjib Kumar;Ghosal, Ajanta;Saito-Nakano, Yumiko;Dutta, Shanta;Nozaki, Tomoyoshi;Ganguly, Sandipan
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제59권4호
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    • pp.409-413
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    • 2021
  • In this study, we have collected and screened a total of 268 stool samples from diarrheal patients admitted to an Infectious disease hospital in Kolkata for the presence of Cryptosporidium spp. The initial diagnosis was carried out by microscopy followed by genus specific polymerase chain reaction assays based on 70 kDa heat shock proteins (HSP70). DNA sequencing of the amplified locus has been employed for determination of genetic diversity of the local isolates. Out of 268 collected samples, 12 (4.48%) were positive for Cryptosporidium spp. Sequences analysis of 70 kDa heat shock proteins locus in 12 Cryptosporidium local isolates revealed that 2.24% and 1.86% of samples were showing 99% to 100% identity with C. parvum and C. hominis. Along with the other 2 major species one recently described globally distributed pathogenic species Cryptosporidium viatorum has been identified. The HSP70 locus sequence of the isolate showed 100% similarity with a previously described isolate of C. viatorum (Accession No. JX978274.1, JX978273.1, and JN846706.1) present in GenBank.

Literature Evaluation: The Focus on the Difference between Job-based Pay and Skill-based Pay Scheme

  • Eungoo KANG
    • 산경연구논집
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    • 제14권7호
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    • pp.1-7
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    • 2023
  • Purpose: The present research is to explore and investigate the meaningful difference between job-based pay and skill-based pay in the current literature to shed light on the advantages and caveats of two compensation approach, providing direction for human resource practitioners looking to develop efficient and fair compensation plans. Research design, data and methodology: The methodology based on Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) was used for this research. The PRISMA technique is generally considered the gold standard since it guarantees openness, repeatability, and rigor. Studies comparing salaries based on work duties versus those based on individual skills published in English and accepted for publication in peer-reviewed journals are eligible for inclusion. Results: According to the comprehensive literature analysis, the present research provides clear comparison between Job-based pay and skilled-based pay, pointing out a similarity and four differences (1. Criteria for pay determination, 2. Flexibility, 2. Job Scope, and 4. Career progression. Conclusions: The result of the current research implies that human resource professionals would be well to learn the effects of various compensation structures on career advancement, and suggests for them that employees can take advantage of chances to advance in their careers based on right compensation schemes.

송도 갯벌과 영일만 조하대 저서동물의 군집조사를 위한 적정 채집면적의 결정 (Determination of the Optimum Sampling Area for the Benthic Community Study of the Songdo Tidal Flat and Youngil Bay Subtidal Sediment)

  • 고철환;강성길;이창복
    • 한국해양학회지:바다
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    • 제4권1호
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    • pp.63-70
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    • 1999
  • 연성저질의 갯벌과 조하대에 서식하는 저서동물의 정점당 채집면적을 제안하고자 인천 송도 1 개 정점에서 0.02 $m^2$ 박스코아를 이용하여 총 250 회 (5 $m^2$), 영일만 조하대 1 개 정점(수심 20 m)에서 0.1 $m^2$ 반빈 채니기를 이용하여 총 50 회(5 $m^2$)의 표품을 반복 채집하였다. 본 연구에서 제안한 채집면적은 모집단으로 설정한 5 $m^2$에 대해서 출현종수와 생태지수(다양성, 종풍부도, 균등도, 우점도지수), 종조성의 유사성(유사도지수 기준)이 75%로 나타나는 수준의 면적으로 설정하였다. 송도갯벌 5 $m^2$에 서식하는 저서동물은 56 종, 영일만 조하대 5 $m^2$에서는 총 60 종이었다. 채집면적 (A; $m^2$)에 따른 저서동물의 누적 출현종수($N_{sp}$)는 송도갯벌에서 $N_{sp}=37.379A^{0.257}(r^2=0.99)$, 영일만 조하대에서 $N_{sp}=40.895A^{0.257}(r^2=0.98)$의 관계식으로 나타낼 수 있었다. 모집단으로 설정한 5 $m^2$에 대해서 출현총수의 75%가 출현하는 채집면적은 송도갯벌과 영일만 조하대에서 각각 1.6 $m^2$ (0.02 $m^2$ 박스코아, 80 회), 1.5 $m^2$ (0.1 $m^2$ 반빈채니기, 15 회)이었다. 0.02 $m^2$과 0.1 $m^2$의 단위표품을 계속 더하여 면적을 증가시키면서 새롭게 증가된 각 면적에서의 생태지수와 유사도를 다시 계산하였다. 그 결과, 5 $m^2$의 생태지수에 75% 근접하는 면적은 송도갯벌에서 < 0.5 $m^2$~1.5 $m^2$, 영일만 조하대에서 < 0.5 $m^2$~1.2 $m^2$이였다. 종조성의 유사성을 75%로 반영하는 면적은 0.3 $m^2$(송도), 0.6 $m^2$(영일만)이었다. 군집분석을 위해 흔히 사용하는 이들 지수의 채집면적에 따른 변화를 추적하여 유사성 75%에 기준을 둔 채집면적으로 송도갯벌에서는 1.5 $m^2$(0.02 $m^2$ 박스 코아, 75 회), 영일만 조하대에서는 1.2 $m^2$(0.1 $m^2$ 반빈 채니기, 12 회)을 제안할 수 있었다. 이들 채집면적은 송도갯벌에서 상위 우점 7 종(개체수 68%를 차지함)의 서식밀도를, 영일만 조하대에서 상위 우점 6 종(개체수 90% 차지함)의 서식밀도를 정밀도 0.2 이내에서 추정할 수 있게 한다.

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하지 보행 불균형 상태에 따른 개인별 보행 특성 분석 (Analysis of Personal Gait Characteristics According to Legs Imbalance Gait)

  • 조우형;김연욱;권장우;이상민
    • 전자공학회논문지
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    • 제54권5호
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    • pp.109-119
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    • 2017
  • 본 논문에서는 기존의 보행 분석의 제한점을 개선한 보행분석 방법으로 보행불균형을 판단하기 위해 자체 제작한 좌 우측 고관절, 슬관절의 각도 측정 장비 및 SI 지표를 활용한 판단 시스템과 개인별 보행 상태의 양상을 분석하기 위해 DTW 유사도 분석 알고리즘을 이용한 보행 분석 방법을 제한한다. 실험은 보행 장애가 없는 총 12명의 피험자를 대상으로 정상 보행 및 불균형 보행 실험을 진행하였다. 실험결과 좌 우측 고관절과 슬관절의 각도 측정을 통한 불균형 판단 SI 지수 산출을 통해 정상 보행과 불균형 보행 모두 판단을 할 수 있었다. 개인별 보행특성 분석에서는 실험에 참여한 12명의 피험자를 대상으로 정상보행과 불균형 보행 시 허리 중앙, 좌 우측 허벅지, 발등의 측정 부위에 대한 유사도를 각각 비교하였다. 피험자별 정상 보행 및 불균형 보행 시 측정한 값에 대한 유사도 분석을 통해 보행 동작을 수행하는 동안 항시 같은 패턴의 보행 동작을 유지하는 것이 아니라는 점을 분석 결과 판단할 수 있었다.

낙동강 유역 지하수위 관리 취약성 평가 (Assessment of the vulnerability of groundwater level management in Nakdong river basin)

  • 양정석;이재범;김일환
    • 한국수자원학회논문집
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    • 제50권12호
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    • pp.815-825
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    • 2017
  • TOPSIS (Techniques for Order Performance by Similarity to Ideal Solution)를 이용하여 낙동강 유역의 21개 시 군을 대상으로 지하수위관리 취약성을 평가하였다. 낙동강 유역 21개 시 군을 대상으로 자연, 인문, 사회적 자료를 수집하여 10개의 지표를 선정하였다. 선정된 지표를 스케일 재조정법을 이용하여 표준화 하고, 전문가 집단의 설문을 반영하여 각 지표에 가중치를 부여하였다. 가중치 산정 설문 결과 연평균 지하수위 지표가 0.157으로 가장 큰 가중치를 받았으며, 연평균 강수량 지표가 0.154, 연도별 지하수함양량 지표가 0.152로 얻어졌다. 가장 적은 가중치를 얻은 지표는 인구 밀도로 0.043 의 가중치를 얻었다. 최종적으로 지하수위 관리 취약성 평가 결과, 상주가 연평균 강수량, 연평균 지하수 함양량, 연평균 지하수 이용량 지표에서 높은 순위의 취약성을 보여 낙동강 유역 21개 시 군 단위 행정구역 중 가장 취약한 것으로 결과가 나타났다. 그 뒤로 예천군, 함안군의 순으로 취약성이 높게 나타났다. 향후 한국의 5대강 유역 지하수위 관리 취약성 평가는 전국 지하수위 관리 정책 수립에 필수적이라고 판단된다.

파주시에서 수집한 폐사체 맹금류의 DNA 바코드 연구 (DNA barcoding of Raptor carcass collected in the Paju city, Korea)

  • 진선덕;백인환;이수영;한갑수;유재평;백운기
    • 한국환경생태학회지
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    • 제28권5호
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    • pp.523-530
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    • 2014
  • 2011년 6월 28일에 파주시 조리읍 장곡리 인근 도로에서 두부쪽이 손상되고, 해당연도에 태어난 맹금류 어린새를 발견하였고, 이를 DNA 바코드 기법으로 동정하였다. Mitochondrial DNA(mtDNA) cytochrome c oxidase I(COI) 유전자의 695bp 절편을 중합효소연쇄반응(polymerase chain reaction, PCR)으로 증폭하고 염기서열을 결정하였다. 결정된 염기서열을 BOLD systems과 NCBI의 BLAST에서 유사도 분석을 수행한 결과 총 5개체의 왕새매가 검색되었고, 염기서열의 동일성은 100%로 조사되었다. 또한, DNA 분자성판별 결과는 해당 개체가 암컷임을 나타내었다. 이러한 결과는 경기도 파주에서 1968년 이후 43년만에 왕새매의 번식이 확인된 중요한 정보로, 향후 광역야생동물구조센터는 야생동물의 사체 수거 시 인근 기탁등록보존기관과 연계하여 DNA시료를 확보하고 보다 정확한 종동정과 성판별 정보를 기록하는 등의 체계적인 관리시스템이 필요할 것으로 사료된다. 또한 이렇게 확보한 왕새매의 DNA 시료와 DNA 바코드 COI 유전자 서열은 유사종 연구의 참조표본(reference standard)로 이용될 수 있을 것이다.

Simultaneous determination and difference evaluation of 14 ginsenosides in Panax ginseng roots cultivated in different areas and ages by high-performance liquid chromatography coupled with triple quadrupole mass spectrometer in the multiple reaction-monitoring mode combined with multivariate statistical analysis

  • Xiu, Yang;Li, Xue;Sun, Xiuli;Xiao, Dan;Miao, Rui;Zhao, Huanxi;Liu, Shuying
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제43권4호
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    • pp.508-516
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    • 2019
  • Background: Ginsenosides are not only the principal bioactive components but also the important indexes to the quality assessment of Panax ginseng Meyer. Their contents in cultivated ginseng vary with the growth environment and age. The present study aimed at evaluating the significant difference between 36 cultivated ginseng of different cultivation areas and ages based on the simultaneously determined contents of 14 ginsenosides. Methods: A high-performance liquid chromatography (HPLC) coupled with triple quadrupole mass spectrometer (MS) method was developed and used in the multiple reaction-monitoring (MRM) mode (HPLC-MRM/MS) for the quantitative analysis of ginsenosides. Multivariate statistical analysis, such as principal component analysis and partial least squares-discriminant analysis, was applied to discriminate ginseng samples of various cultivation areas and ages and to discover the differentially accumulated ginsenoside markers. Results: The developed HPLC-MRM/MS method was validated to be precise, accurate, stable, sensitive, and repeatable for the simultaneous determination of 14 ginsenosides. It was found that the 3- and 5-yr-old ginseng samples were differentiated distinctly by all means of multivariate statistical analysis, whereas the 4-yr-old samples exhibited similarity to either 3- or 5-yr-old samples in the contents of ginsenosides. Among the 14 detected ginsenosides, Rg1, Rb1, Rb2, Rc, 20(S)-Rf, 20(S)-Rh1, and Rb3 were identified as potential markers for the differentiation of cultivation ages. In addition, the 5-yr-old samples were able to be classified in cultivation area based on the contents of ginsenosides, whereas the 3- and 4-yr-old samples showed little differences in cultivation area. Conclusion: This study demonstrated that the HPLC-MRM/MS method combined with multivariate statistical analysis provides deep insight into the accumulation characteristics of ginsenosides and could be used to differentiate ginseng that are cultivated in different areas and ages.