• 제목/요약/키워드: Shannon diversity index

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오대산국립공원 중대사-비로봉 구간 식물군집구조 (The Structure of Plant Community in Jungdaesa-Birobong Area, Odaesan National Park)

  • 한봉호;최진우;노태환;김동욱
    • 한국환경생태학회지
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    • 제29권5호
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    • pp.764-776
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    • 2015
  • 본 연구는 오대산국립공원 해발 1,000m 이상의 고지대인 중대사~비로봉 구간에 대한 산림식생현황 및 천이계열, 변화양상을 파악하는데 그 목적이 있다. 중대사~비로봉 구간의 식물군집구조를 파악하기 위하여 $20m{\times}20m(400m^2)$의 방형구 17개소를 설정하였다. 설정된 조사구별 상대우점치, 흉고직경급별 분포, 표본목의 생장량 및 수령, 유사도지수, 종다양도지수 등을 분석하였다. DCA분석 결과, 군집 I(신갈나무-피나무군집), 군집 II(신갈나무-낙엽활엽수군집), 군집 III(신갈나무-잣나무군집), 군집 IV(전나무-신갈나무군집), 군집 V(전나무-낙엽활엽수군집) 등 5개 식물군집으로 분류되었다. 조사구별 상대우점치 분석결과, 신갈나무는 해발고가 높을수록, 전나무는 해발고가 낮을수록 군집내 상대 우점치가 높아지는 경향을 나타내었다. 군집 I, 군집 II, 군집 III은 현상태가 지속적으로 유지될 것으로 판단되었으며, 군집 IV, 군집V에서는 신갈나무의 세력이 약화될 것으로 파악되었다. 표본목의 수령은 85~161년(평균 123년)이었다. 유사도지수 분석결과 5개의 군집은 이질성이 강한 것으로 나타났으며, 특히 높은 해발고의 군집 I과 낮은 해발고의 군집 IV, V간의 이질성이 높았다. 단위면적 $400m^2$당 샤논의 종다양도지수를 분석한 결과, 군집 III(1.1109) > 군집 II(1.0475) > 군집 I(1.0125) > 군집 IV(0.9918) > 군집 V(0.8686)의 순으로 높았다. 신갈나무가 우점하는 군집의 종다양도는 과거 연구 및 주변 지역 연구 결과와 비교하여 유사한 반면, 전나무가 우점하는 군집의 경우 다소 낮은 것으로 확인되었다.

VBioindex: A Visual Tool to Estimate Biodiversity

  • Yu, Dong Su;Yoo, Seung Hwa
    • Genomics & Informatics
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    • 제13권3호
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    • pp.90-92
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    • 2015
  • Biological diversity, also known as biodiversity, is an important criterion for measuring the value of an ecosystem. As biodiversity is closely related to human welfare and quality of life, many efforts to restore and maintain the biodiversity of species have been made by government agencies and non-governmental organizations, thereby drawing a substantial amount of international attention. In the fields of biological research, biodiversity is widely measured using traditional statistical indices such as the Shannon-Wiener index, species richness, evenness, and relative dominance of species. However, some biologists and ecologists have difficulty using these indices because they require advanced mathematical knowledge and computational techniques. Therefore, we developed VBioindex, a user-friendly program that is capable of measuring the Shannon-Wiener index, species richness, evenness, and relative dominance. VBioindex serves as an easy to use interface and visually represents the results in the form of a simple chart and in addition, VBioindex offers functions for long-term investigations of datasets using time-series analyses.

강원 중부지역 산림 내 나비류 분포에 관한 연구(II) (Distribution of Lepidoptera on Forest Stand in Central Gangwon Area(II))

  • 장석준;최종운;심상준;김종국
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제22권1호
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    • pp.58-65
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    • 2006
  • 본 연구는 백두대간에 서식하는 나비목 곤충의 분포를 파악하기 위하여 2005년 7월과 8월에 수행되었다. 총 15과 123속 462개체가 채집되었으며, 점봉산(인제군 인제읍 귀둔리) 15과 63속 166개체, 응복산(홍천군 내면 명계리) 15과 65 속 159개체, 오대산(평창군 도암면 병내리) 9과 40속 137개체가 채집되었다. 조사지역에서 채집된 종들 중 우점하고 있는 5종은 머루박각시 (Ampelophaga rubiginosa) 54개체, 참나무산누에나방 (Antheraea yamamai) 35개체, 솔송나방 (Dendrolimus superans) 27개체, 북방뒷노랑밤나방 (Triphaenopsis jezoensis) 14개체, 얼룩매미나방 (Lymantria monacha) 13개체였다. Shannon(H') 지수와 균등도지수 (J') 는 점봉산 1.52, 0.84, 응복산1.69, 0.91, 오대산 1.37, 0.83, 유사도지수 (QS)는 점봉산과 응복산이 0.28로 다소 높았으며, 점봉산과 오대산이 0.11로 낮게 나타났다.

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Geographical Patterns of Morphological Variation in Soybean Germplasm

  • Yoon, Mun-Sup;Ahn, Jong-Woong;Park, Sei-Joon;Baek, Hyung-Jin;Park, Nam-Kyu;Rho, Young-Deok
    • 한국작물학회지
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    • 제45권4호
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    • pp.267-271
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    • 2000
  • A total of 1,830 soybean collections were grown in the field and characterized for 10 morphological traits to determine the diversity and relationship within and among geographical regions. Phenotypic variation was found within all regions for most characters. The Shannon-Weaver diversity index ranged from 0.49 to 0.62 across regions, and 0.09 to 1.00 across characters. Canonical discriminant analysis and clustering of the canonical means delineated 3 regional clusters: (ⅰ) Kyunggi, Chungchong, Kangwon, Chulla, and Kyungsang; (ⅱ) Heilongjiang; and (ⅲ) Jilin, Manchuria, central China, south China, Others (China), Hokkaido, Honshu, and Others (Japan).

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독도의 토양 선충상 (Soil Nematode Fauna in Dokdo Island of Korea)

  • 김동근;박병용;류영현
    • 식물병연구
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    • 제18권4호
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    • pp.381-386
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    • 2012
  • 독도 생태 연구의 일환으로 2008-2009년 2개년간 독도의 토양을 채집하고 선충의 종류, 밀도, 식이습성군, 생태지수 등의 연구를 수행하였다. 독도에서 총 31종의 선충이 발견되었으며 평균 밀도는 $m^2$당 239,500마리(26,000-836,000)였고 biomass는 $103.9mg/m^2$(3.0-388.6)였다. 중요도는 Acrobeloides 속이 Prominence value(PV) 117.8로 가장 높았고 다음으로 Rhabditidae(PV = 81.9), Prismatolaimus(PV = 39.0), Aphelenchoides(PV = 31.4) 순이었다. Feeding Group별로는 세균성선충이 전체 선충 중에서 밀도로는 77%, biomass로는 62%를 차지하여 가장 중요한 그룹이었고 다음으로는 식물기생성선충과 식균성선충류였다. 동도 참소리쟁이에서 발견된 뿌리썩이선충은 신종으로 추정된다. 독도 선충의 생태적 분석 결과 Shannon and Wiener 지수(2.46), Simpson's diversity 지수(0.86), 종 균일도(0.73), 종 풍부성(1.30)을 볼 때 독도의 선충상은 종이 풍부하고, 다양한 것이 특징이며, 독도만의 독특한 생태계를 유지하고 있다고 하겠고 이것은 경작되지 않고 자연 그대로 보존된 원시적 환경의 특징이다. 이번의 조사 결과는 독도의 생태적 모니터링에 기초자료로 활용되어질 수 있을 것이다.

Status, Distribution, Conservation and Use Value of Medicinal and Aromatic Plants (MAPs) in Sagarmatha National Park, Nepal

  • Gaire, Damodar
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제30권3호
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    • pp.253-258
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    • 2014
  • The study attempts to assess the status, distribution, conservation and use value of Medicinal and Aromatic Plant (MAPs) in the Sagarmatha National Park. Altogether 62 species of MAPs belonging to 47 genera and 33 families have been recorded in the study area. 10 species, belonging to 9 families are categorized as the potential species. Out of the these species, most potential in local but threatened species are Allium hypsistum Stearn, Cordyceps sinensis Sacc, Dactylorhiza hatagirea Soo, Nardostachys grandiflora DC, Aconitum orochryseum, Ephedra gerardiana Wall. Ex. Stapf, Swertia multicaulis D. Don, Picrorhiza scrophulariflora Penne, Rheum australe. D. Don, Malva verticillataL and Swertia pedicallata Benerji. By analysis of data using Simpson's diversity index (SI) and Shannon weaver function (H'), there was high diversity (more heterogeneous) MAPs species composition in the Manjo Gate to Large Dobhan. (0.98349). Less diversity (less heterogeneous) MAPs species composition was in Tyanboche to Pangoche (0.90419). Similarly, the Shannon weaver function shows that in plots laying out in Mongla to Phorche are evenly distributed than others However, higher MAPs species (i.e., 31) was found in the way of Manjo Gate to Larja Dobhan than others.

Bacterial Community and Diversity from the Watermelon Cultivated Soils through Next Generation Sequencing Approach

  • Adhikari, Mahesh;Kim, Sang Woo;Kim, Hyun Seung;Kim, Ki Young;Park, Hyo Bin;Kim, Ki Jung;Lee, Youn Su
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제37권6호
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    • pp.521-532
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    • 2021
  • Knowledge and better understanding of functions of the microbial community are pivotal for crop management. This study was conducted to study bacterial structures including Acidovorax species community structures and diversity from the watermelon cultivated soils in different regions of South Korea. In this study, soil samples were collected from watermelon cultivation areas from various places of South Korea and microbiome analysis was performed to analyze bacterial communities including Acidovorax species community. Next generation sequencing (NGS) was performed by extracting genomic DNA from 92 soil samples from 8 different provinces using a fast genomic DNA extraction kit. NGS data analysis results revealed that, total, 39,367 operational taxonomic unit (OTU), were obtained. NGS data results revealed that, most dominant phylum in all the soil samples was Proteobacteria (37.3%). In addition, most abundant genus was Acidobacterium (1.8%) in all the samples. In order to analyze species diversity among the collected soil samples, OTUs, community diversity, and Shannon index were measured. Shannon (9.297) and inverse Simpson (0.996) were found to have the highest diversity scores in the greenhouse soil sample of Gyeonggi-do province (GG4). Results from NGS sequencing suggest that, most of the soil samples consists of similar trend of bacterial community and diversity. Environmental factors play a key role in shaping the bacterial community and diversity. In order to address this statement, further correlation analysis between soil physical and chemical parameters with dominant bacterial community will be carried out to observe their interactions.

희귀수종 먹넌출 엽의 형태적 특성과 유전변이 (Characteristics of Leaf Morphology and Genetic Variation of the Rare Woody Plant, Berchemia racemosa var. magna)

  • 송정호;임효인;장경환;한진규
    • 한국자원식물학회지
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    • 제26권5호
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    • pp.613-618
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    • 2013
  • 우리나라에서 안면도에만 분포하는 먹넌출 집단의 생명자원보존을 위하여 엽의 형태적 특성과 I-SSR 표지자를 이용한 유전변이를 조사하였다. 10가지 엽특성에 대한 ANOVA 분석결과 모든 특성에서 개체 간에 통계적인 유의성이 인정되었다. 조사된 39개체의 평균특성은 엽신장 11.8 cm, 최대엽폭 7.1 cm, 엽지수 1.67, 상1/3폭 5.4 cm, 하1/3폭 6.2 cm, 엽병길이 3.6 cm, 엽두께 0.19 mm, 엽맥수(좌) 11.5개, 엽맥수(우) 11.4개, 엽면적 61.7 $cm^2$로 나타났다. 변이계수 값은 엽두께, 엽병길이, 엽면적이 각각 18.8%, 21.7%, 22.0%로 높게 나타났으며, 나머지 특성들에서는 15% 이내의 비교적 낮은 변이를 나타냈다. 선발된 8개 I-SSR Primer에서 총 50개의 증폭산물을 얻었으며, 유효대립 유전자의 수 1.719개, 다형적 유전자좌의 비율 26.0%, 이형접합도의 기대치 0.410 및 Shannon의 다양성지수 0.598로 각각 나타났다. 안면도 먹넌출 집단은 제한된 지역에 분포하며 개체수가 적음에도 불구하고 높은 유전다양성을 유지하는 것으로 나타났다.

Structure, Alpha and Beta Diversity of Natural Forest Areas in Eco-Zones of Taraba State, Nigeria

  • Dau Henry, Japheth;Bunde Bernard, Meer
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제39권1호
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    • pp.1-12
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    • 2023
  • To understand the health conditions and growth patterns of forest estate for environmental resilience and climate change mitigation, assessment of structure and species diversity is paramount. This study aimed at assessing the structure, alpha, and beta diversities of tree species in three ecological zones in Taraba, Nigeria for management purposes. In recent time, no research has been reported on the structure and beta diversity of the study areas. A systematic sampling design was used for data collection. Five sample plots of 50×50 m were laid in each of the six natural forest areas. The result showed a mean DBH (42.5 cm) and a tree height (15.0 m) from the forests. The forests have a structure of an inverse "J-shape," which is typical of natural forests in the tropics. The southern Guinea savanna zone had the highest mean Shannon-Weiner diversity index (2.8). The least beta diversity index (0.02) was between Baissa and Jen Gininya forest areas. Baissa and Bakin Dutse Protected Forest Areas (PFAs) contained 76.5% of the tree species. There is a high chance of all tree species to be found in these 2 forest areas. Proximity to a location influences how similar two tree species are, according to the least beta diversity index (0.02) recorded. The Federal Government's method of management for the forest, known as Gashaka Gumti National Park, may be responsible for the high beta diversity index in the Montane ecozone. Therefore, it should be strongly encouraged to practice strict oversight of natural areas, as their contributions to reducing climate change in Taraba State, Nigeria, cannot be overstated.

ISSR 마커를 이용한 서식 면적에 따른 퉁퉁마디의 유전적 다양성 (Genetic Diversity of Salicornia herbacea according to Habitat Area by ISSR Markers)

  • 김석규;조윤식;허영백;송재희;정희도;정상옥
    • 한국환경생태학회지
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    • 제31권6호
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    • pp.492-499
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    • 2017
  • 퉁퉁마디 개체군의 서식 면적에 따른 유전적 다양성을 조사하기 위하여 6개 군집 96개체를 대상으로 ISSR marker를 사용하여 분석하였다. 6개 ISSR 프라이머에서 총 49개의 PCR 증폭 밴드가 관찰되었으며 이 중 30개의 밴드가 유전적 다형성을 갖는 밴드로 나타났다. 퉁퉁마디 개체군 전체의 유전적 다양성을 나타내는 지수 I(Shannon's information index)는 0.382로 나타났으며 h(gene diversity)는 0.249으로 나타났다. 군집 크기에 따른 유전적 다양성 지수는 $0.1m{\times}0.1m$에서 0.092(I), 0.058(h)로 가장 낮게 나타났고 $25m{\times}25m$에서 0.338(I), 0.227(h)로 가장 높게 나타나 유전적 다양성이 높은 군집 형성에 적합한 면적이라 할 수 있다. 퉁퉁마디 개체군 간 거리에 따른 유전적 다양성의 상관관계를 UPGMA 방법으로 분석한 결과 퉁퉁마디 개체군 간 거리와는 유의한 상관관계를 보이지 않았다. 본 연구 결과 제한된 환경에서 서식하는 퉁퉁마디는 유전적 다양성을 갖는 군집 형성을 위해 일정한 크기 이상의 면적이 확보되어야 할 것으로 판단된다.