• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제28권1호
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• pp.22-31
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• 2018

Isoflavone itself is less available in the body without the aid of intestinal bacteria. In this study, we searched for isoflavone-transforming bacteria from human fecal specimens (n = 14) using differential selection media. Isoflavone-transforming activity as the production of dihydrogenistein and dihydrodaidzein was assessed by high-performance liquid chromatography and we found Lactobacillus rhamnosus, named L. rhamnosus vitaP1, through 16S rDNA sequence analysis. Extract from Pueraria lobata (EPL) and soy hypocotyl extract were fermented with L. rhamnosus vitaP1 for 24 and 48 h at $37^{\circ}C$. Fermented EPL (FEPL) showed enhanced anti-tyrosinase activity and antioxidant capacities, important suppressors of the pigmentation process, compared with that of EPL (p < 0.05). At up to $500{\mu}g/ml$ of FEPL, there were no significant cell cytotoxicity and proliferation on B16-F10 melanoma cells. FEPL ($100{\mu}g/ml$) could highly suppress the content of melanin and melanosome formation in B16-F10 cells. In summary, Lactobacillus rhamnosus vitaP1 was found to be able to biotransform isoflavones in EPL. FEPL showed augmented anti-melanogenic potential.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제27권5호
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• pp.699-704
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• 2006

Escherichia coli RNase P is a ribonucleoprotein composed of M1 RNA and C5 protein. Previously, analysis of RNA aptamers selected for C5 protein from a synthetic RNA library showed that C5 protein could bind various RNA molecules as an RNA binding protein. In this study, we searched cellular RNA motifs that could be recognized by C5 protein by a genomic SELEX approach. We found various C5 protein-binding RNA motifs derived from E. coli genomic sequences. Our results suggest that C5 protein interacts with various cellular RNA species in addition to M1 RNA.

• 전자공학회논문지SC
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• 제43권3호
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• pp.31-40
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• 2006

이동로봇의 경로 설정과 장애물 회피에 관한 문제는 이동로봇을 제어하기 위한 기본적인 문제로서 지금까지 많은 연구가 진행되어 오고 있다. 다양한 센서들로부터 얻어진 정보는 로봇이 진행하기 위한 경로에 대한 결정과 장애물에 대한 정보를 제공해준다. 제한 조건이 존재하는 경우에서 그 상황에 알맞은 방법들이 대부분이며, 다른 상황을 해결하기에는 어려움이 있다. 또한, 최적화된 경로에 대한 좋은 결과를 만들기 위해서는 복잡한 계산 과정을 통해서 시간 지연이 발생하게 된다. 이와 같은 처리 방법은 움직이는 장애물의 회피와 같이 빠른 처리를 필요로 하는 상황에서 단점으로 작용한다. 본 논문에서는 장애물과 이동 가능한 경로들의 영역을 작은 영역들이 분포하는 공간으로 변형하고 이와 같이 구성된 공간에서 밀도와 연결 상태를 통해 이동 로봇이 진행 할 수 있는 최단 경로를 결정한다. 제안된 방법을 통해 작은 영역들은 자신의 번호를 가지게 되며, 주변 영역들의 개수를 통해 이동 경로를 결정하게 된다.

• 원예과학기술지
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• 제35권4호
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• pp.465-479
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• 2017

Chili pepper (Capsicum annuum L.) is an economically important horticultural crop in Korea; however, various diseases, including Phytophthora root rot, anthracnose, powdery mildew, Cucumber mosaic virus (CMV), Pepper mild mottle virus (PMMoV), and Pepper mottle virus (PepMoV), severely affect their productivity and quality. Therefore, pepper varieties with resistance to multiple diseases are highly desired. In this study, we developed 20 SNP type assays for three pepper populations using Fluidigm nanofluidic dynamic arrays. A total of 4,608 data points can be produced with a 192.24 dynamic array consisting of 192 samples and 24 SNP markers. The assays were converted from previously developed sequence-tagged-site (STS) markers and included markers for resistance to Phytophthora root rot (M3-2 and M3-3), anthracnose (CcR9, CA09g12180, CA09g19170, CA12g17210, and CA12g19240), powdery mildew (Ltr4.1-40344, Ltr4.2-56301, and Ltr4.2-585119), bacterial spot (Bs2), CMV (Cmr1-2), PMMoV (L4), and PepMoV (pvr1 and pvr2-123457), as well as for capsaicinoids content (qcap3.1-40134, qcap6.1-299931, qcap6.1-589160, qdhc2.1-1335057, and qdhc2.2-43829). In addition, 11 assays were validated through a comparison with the corresponding data of the STS markers. Furthermore, we successfully applied the assays to commercial $F_1$ cultivars and to our breeding lines. These 20 SNP type assays will be very useful for developing new superior pepper varieties with resistance to multiple diseases and a higher content of capsaicinoids for increased pungency.

• 한국축산식품학회지
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• 제40권4호
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• pp.512-526
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• 2020

Synthetic nitrite is considered an undesirable preservative for meat products; thus, controlling synthetic nitrite concentrations is important from the standpoint of food safety. We investigated 1,000 species of microorganisms from various kimchi preparations for their potential use as a starter culture for the production of nitrites. We used 16S rRNA gene sequence analysis to select a starter culture with excellent nitrite and nitric oxide productivity, which we subsequently identified as Staphylococcus hominis subspecies hominis WiKim0113. That starter culture was grown in NaCl (up to 9%; w/v) at 10℃-40℃; its optimum growth was observed at 30℃ at pH 4.0-10.0. It exhibited nonproteolytic activity and antibacterial activity against Clostridium perfringens, a bacterium that causes food poisoning symptoms. Analysis of Staphylococcus hominis subspecies hominis WiKim0113 with an API ZYM system did not reveal the presence of β-glucuronidase, and tests of the starter culture on 5% (v/v) sheep blood agar showed no hemolytic activity. Our results demonstrated the remarkable stability of coagulase-negative Staphylococcus hominis subspecies hominis WiKim0113, especially in strain negative for staphylococcal enterotoxins and sensitive to clinically relevant antibiotics. Moreover, Staphylococcus hominis subspecies hominis WiKim0113 exhibited a 45.5% conversion rate of nitrate to nitrite, with nitrate levels reduced to 25% after 36 h of culturing in the minimal medium supplemented with nitrate (200 ppm). The results clearly demonstrated the safety and utility of Staphylococcus hominis subspecies hominis WiKim0113, and therefore its suitability as a starter culture.

• The Plant Pathology Journal
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• 제30권4호
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• pp.367-374
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• 2014

Genomes contain a large number of unique genes which have not been found in other species. Although the origin of such "orphan" genes remains unclear, they are thought to be involved in species-specific adaptive processes. Here, we analyzed seven orphan genes (MoSPC1 to MoSPC7) prioritized based on in planta expressed sequence tag data in the rice blast fungus, Magnaporthe oryzae. Expression analysis using qRT-PCR confirmed the expression of four genes (MoSPC1, MoSPC2, MoSPC3 and MoSPC7) during plant infection. However, individual deletion mutants of these four genes did not differ from the wild-type strain for all phenotypes examined, including pathogenicity. The length, GC contents, codon adaptation index and expression during mycelial growth of the four genes suggest that these genes formed during the evolutionary history of M. oryzae. Synteny analyses using closely related fungal species corroborated the notion that these genes evolved de novo in the M. oryzae genome. In this report, we discuss our inability to detect phenotypic changes in the four deletion mutants. Based on these results, the four orphan genes may be products of de novo gene birth processes, and their adaptive potential is in the course of being tested for retention or extinction through natural selection.

• Mycobiology
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• 제45권2호
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• pp.105-109
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• 2017

Sixteen genomic DNA simple sequence repeat (SSR) markers of Lentinula edodes were developed from 205 SSR motifs present in 46.1-Mb long L. edodes genome sequences. The number of alleles ranged from 3-14 and the major allele frequency was distributed from 0.17-0.96. The values of observed and expected heterozygosity ranged from 0.00-0.76 and 0.07-0.90, respectively. The polymorphic information content value ranged from 0.07-0.89. A dendrogram, based on 16 SSR markers clustered by the paired hierarchical clustering' method, showed that 33 shiitake cultivars could be divided into three major groups and successfully identified. These SSR markers will contribute to the efficient breeding of this species by providing diversity in shiitake varieties. Furthermore, the genomic information covered by the markers can provide a valuable resource for genetic linkage map construction, molecular mapping, and marker-assisted selection in the shiitake mushroom.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제4권3호
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• pp.517-526
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• 2000

본 논문에서는 직접대역확산통신시스템에서 코딩 이득을 향상시키고자 다중 심벌 검파를 수행하는 트렐리스 부호화 변조를 적용하였다. $MDPSK(\pi/4 shift QPSK)$를 트렐리스 부호화된 직접대역확산시스템 적용하고 정보가 인접한 채널 신호의 위상차에 전송된다는 것을 이용하여 1차 위상차 뿐만 아니라 다중위상차를 추출한다. BER특성을 향상시키기 위해, 이러한 다중 위상차를 이용하여 $MDPSK(\pi/4 shift QPSK)$에서 다중 심벌 검파를 수행하는 트렐리스 부호화된 직접대역확산시스템의 비터비 디코더 알고리듬을 설계하여 향상된 코딩 이득을 얻고자 한다. 이러한 시스템을 직접대역확산통신시스템에 적용하였을 때 얻을 수 있는 코딩 이득은 시뮬레이션 결과, AWGN채널에서 TCM의 콘볼류션부호화기의 상태수 4, 8, 16에 따라 3-4dB 정도의 성능향상이 있으며, 레일레이 페이딩 채널에서는 4-5dB정도의 성능 향상이 있음을 알 수 있다. 일반적으로 상태수가 증가할수록 더 큰 코딩 이득을 얻을 수 있다.

• 한국지구과학회지
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• 제31권6호
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• pp.625-636
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• 2010

본 연구에서는 인터넷 메신저를 활용한 수업에서 이루어지는 과학 영재 학생들의 논변활동과 대화의 유형을 분류하여 수업 주제와 형태에 따라 나타나는 차이점을 분석하였다. 수업은 서울대학교 영재센터 학생 가운데 선발된 5명의 남학생을 대상으로 하였으며, 인터넷 메신저 프로그램을 활용하여 진행되었다. 학생들의 논변활동은 Toulmin의 논쟁 틀에 바탕을 두어 분석되었으며, 논변활동 요소의 흐름에 따라 논변활동을 유형화하였다. 연구 결과 학생들의 수업 참여의 기회가 높은 수업에서 상대적으로 높은 수준의 논변활동이 나타났으며, 전체 수업에 걸쳐 4가지의 논변활동 유형이 나타났다. 이러한 결과는 학생들의 논변 능력 향상과 교수자-학습자간의 상호작용 촉진을 위한 수업 모형의 개발과 적절한 주제 선정이 필요함을 시사한다.

• Composites Research
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• 제12권4호
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• pp.42-54
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• 1999

섬유-금속 적층 복합재료(FMLC)는 섬유와 금속 박판으로 구성된 새로운 형태의 구조재로 가볍고 우수한 피로 특성을 가지며 금속과 같이 가소성과 충격저항성이 우수하고, 가공성이 뛰어나다. 본 연구에서는 여러 하중 조건하에 있는 섬유-금속 적층 복합재료를 유전자 알고리듬을 이용하여 최적 설계하였다. 전단변형이론에 근거한 유한요소법을 사용하여 적층판을 해석하였으며, 설계변수로 금속판의 강도와 섬유 층의 수에 따른 적층각도를 두었다. 섬유층과 금속판의 적합도 함수로는 각각 Tasi-Hill failure criterion과 Miser yield criterion을 사용하였다. 유전자 알고리듬의 연산자로는 토너먼트 선택과 균일 교배를 사용하였다. 효율적인 진화를 위해 엘리티스트 모델을 사용하며, 높은 정확도를 가진 해를 얻기 위해 크리프 무작위 탐색(creeping random search) 방법을 통해 더 우수한 자손을 얻었다. 여러 가지 하중 조건에 대하여 최적설계 결과를 나타내었으며, 파괴 지수 측면에서 탄소섬유강화복합재료(CFRP)와 비교하였다. 해석 결과 섬유-금속 적층 복합재료는 탄소섬유강화복합재료에 비하여 집중하중이나 분포하중 형태에 대하여 우수한 특성을 보였으며, 파괴 지수의 편차가 적어 예기치 않은 하중에 잘 견딜 것으로 사료된다.