A DNA profile database was constructed to investigate the genetic relatedness of 72 germplasm samples of Pyrus and related cultivars using microsatellite markers. Three P. pyrifolia, four P. commus, and one P. betulifolia cultivars with different morphological traits were screened using 387 pairs of microsatellite primers. A core set of 11 primer pairs was selected to obtain 133 polymorphic amplified fragments meeting three criteria: high polymorphism information contents (PIC), high repeatability, and distinct allele patterns. The number of alleles per locus ranged between 4 and 22. Average PIC was 0.743 (range: 0.557 - 0.879). Cluster analysis using the unweighted pair - group method with arithmetical average (UPGMA) separated the 72 pear cultivars and germplasm samples into four major groups: Chinese, European pears, and a cluster of 55 Asian pears that could be reclassify into two subcluster, I - $1^{st}$ and II - $2^{nd}$, according to pedigree information. Almost all of the cultivars were discriminated by 11 microsatellite marker genotypes. The microsatellite DNA profile database may be utilized as tool to verify distinctness, uniformity, and stability between candidate cultivar, and to verify in the distinctness of existing cultivars.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
/
v.32
no.1
/
pp.1-7
/
2003
Radiation induced markers were investigated for the detection of irradiated oranges imported from America. In the DNA comet assay, the non-irradiated and irradiated samples showed the comets with long tails in both seed and flesh. Though this tendency was maintained for 6 weeks, identification of non-irradiated or irradiated samples was impossible. In the thermoluminescence (TL) measurement, the non-irradiated samples revealed a glow curve with low intensity at about 28$0^{\circ}C$, while the irradiated samples showed with higher intensity at around 18$0^{\circ}C$. There were no remarkable changes in detection properties for 6 weeks after irradiation. The TL ratio of area for TL$_1$ glow curve to TL$_2$ was below 0.1 for the non-irradiated samples and 0.5 or more for the irradiated ones during storage. In the electron spin resonance (RSR) measurement, irradiated oranges showed an unspecific central signal in all parts (seed, flesh and peel), so the detection for radiation treatment of oranges was impossible. Based on the results, DNA comet assay and ESR were not useful for the detection, but TL was appropriate to search radiation induced markers of oranges during storage period. The detectable period during storage is confirmed by sensory evaluation.
Seo, MinJung;Kang, Sung-Taeg;Moon, Jung-Kyung;Lee, Seukki;Kim, Yul-Ho;Jeong, Kwang-Ho;Yun, Hong-Tae
Korean Journal of Breeding Science
/
v.41
no.4
/
pp.456-462
/
2009
Bacterial pustule (BP), caused by Xanthomonas axonopodis pv. glycines, is prevalent disease in major soybean production areas. BP can reduce seed yield as well as seed quality. To identify the genomic region associated with the resistance to BP, QTL analysis was conducted using $F_{10}$ RIL (recombinant inbred lines) population, Keunolkong${\times}$Shinpaldalkong. Four QTLs for BP disease were identified on the linkage group B2, D2, I and K in field accounts for 36.4% of the phenotypic variation. Especially, QTL at near of Satt135 on LG D2 was identified in green house experiment explaining 20.9% of the phenotypic variation was found to be a major QTL conferring BP. One of these QTLs, Satt135 on the LG D2, was also identified in green house experiment. In both field and green house condition, the position of major QTL for BP was detected between Satt135 and Satt397 on the LG D2. The major QTL for BP may be used for minimizing soybean BP through effective marker-assisted selection (MAS).
Kim, Kyung-Ryun;Kim, Kyung Hye;Go, Hong Min;Lee, Ju Seok;Moon, Jung-Kyung;Ha, Bo-Keun;Jeong, Soon-Chun;Kim, Namshin;Kang, Sungtaeg
Proceedings of the Korean Society of Crop Science Conference
/
2017.06a
/
pp.146-146
/
2017
The pod shattering or dehiscence is essential for the propagation of pod-bearing plant species in the wild, but it causes significant yield losses during harvest of domesticated crop plants. Identifying novel molecular makers, which are linked to seed-shattering genes, is needed to employ the molecular marker-assisted selection for efficiently developing shattering-resistant soybean varieties. In this study, a genetic linkage map was constructed using 115 recombinant inbred lines (RILs) developed from crosses between the pod shattering susceptible variety, Keunol, and resistant variety, Sinpaldal. A 180 K Axiom(R) SoyaSNPs data and pod shattering data from two environments in 2001 and 2015 were used to identify quantitative trait loci (QTL) for pod shattering. A major QTL was identified between two flanking single nucleotide polymorphism (SNP) markers, AX-90320801 and AX-90306327 on chromosome 16 with 1.3 cM interval, 857 kb of physical range. In sequence, genotype distribution analysis was conducted using extreme phenotype RILs. This could narrow down the QTL down to 153 kb on the physical map and was designated as qPDH1-KS with 6 annotated gene models. All exons within qPDH1-KS were sequenced and the 6 polymorphic SNPs affecting the amino acid sequence were identified. To develop universally available molecular markers, 38 Korean soybean cultivars were investigated by the association study using the 6 identified SNPs. Only two SNPswere strongly associated with the pod shattering. These two identified SNPs will help to identify the pod shattering responsible gene and to develop pod shattering-resistant soybean plants using marker-assisted selection.
Lee, Jeong-Dong;Bilyeu, Kristin D.;Shannon, James Grover
Journal of Crop Science and Biotechnology
/
v.10
no.4
/
pp.201-210
/
2007
Soybean [Glycine max(L.) Merr.] oil is versatile and used in many products. Modifying the fatty acid profile would make soy oil more functional in food and other products. The ideal oil with the most end uses would have saturates(palmitic + stearic acids) reduced from 15 to < 7%, oleic acid increased from 23 to > 55%, and linolenic acid reduced from 8 to < 3%. Reduced palmitic acid(16:0) is conditioned by three or more recessive alleles at the Fap locus. QTLs for reduced palmitic acid have mapped to linkage groups(LGs) A1, A2, B2, H, J, and L. Genes at the Fad locus control oleic acid content(18:1). Six QTLs($R^2$=4-25%) for increased 18:1 in N00-3350(50 to 60% 18:1) explained four to 25% of the phenotypic variation. M23, a Japanese mutant line with 40 to 50% 18:1 is controlled by a single recessive gene, ol. A candidate gene for FAD2-1A can be used in marker-assisted breeding for high 18:1 from M23. Low linolenic acid(18:3) is desirable in soy oil to reduce hydrogenation and trans-fat accumulation. Three independent recessive genes affecting omega-3 fatty acid desaturase enzyme activity are responsible for the lower 18:3 content in soybeans. Linolenic acid can be reduced from 8 to about 4, 2, and 1% from copies of one, two, or three genes, respectively. Using a candidate gene approach perfect markers for three microsomal omega-3 desaturase genes have been characterized and can readily be used in for marker assisted selection in breeding for low 18:3.
Paprika (Capsicum annuum L.), a colored bell-type sweet pepper, is one of the most important money making vegetable crops in Korea. The cultivation area, total production, and exports of paprika are gradually getting increased, but the paprika cultivars used in Korea are all imported. It was well-known that the genic male sterility (GMS) is the main way to produce paprika hybrid seeds. However, it is little known that how many and what kinds of ms genes are used for breeding of paprika $F_1$ varieties. In this study, eight paprika cultivars ('Special', 'Debla', 'Plenty', 'Fiero', 'Boogie', 'Fiesta', 'Derby', and 'Minibell'), popularly cultivated in Korea and three different genic male sterile lines ('GMSP', 'GMS3', and 'GMSK') were used. For allelism test among the $F_1$ cultivars, half diallel crosses were performed. The result demonstrated that the most of the GMS in paprika cultivars except for 'Minibell' were same allele. To identify which GMS gene(s) were used for paprika $F_1$ cultivars, top crosses between previously known GMS lines and the $F_1$ cultivars were performed. As a result, we found that the $ms_k$ and the $ms_p$ genes were alleles for the GMS of 'Minibell' and for the other cultivars, respectively. We also confirmed that the GMS gene identification using GMSK-CAPS marker linked to the $ms_k$ gene and the PmsM1-CAPS marker linked to the $ms_p$ gene in $F_2$ progenies of 'Minibell' and 'Fiesta' and 'Derby' cultivars, respectively. In addition, we developed the PmsM2-CAPS marker for 'Plenty', 'Fiero', and 'Boogie' cultivars. We expect that these markers will be very useful for breeding new maternal (male sterile) line of paprika.
Sarath Ly;Hyeon Su Oh;Se Yeong Kim;Jeong Hwan Lee;Jong Il Chung
KOREAN JOURNAL OF CROP SCIENCE
/
v.68
no.3
/
pp.114-120
/
2023
Soybean is the one of the most important crops for providing quality vegetable protein to umans and livestock. Soybean cultivars with a brown seed coat have a wide range of antioxidant benefits because of the flavonoid components. However, they also contain lectin, 7S α′ subunit, lipoxygenase, and Kunitz trypsin inhibitor (KTI) proteins that can be allergenic and digestive inhibitors and reduce processing aptitude. Genetic removal of these four proteins is necessary in soybean breeding. Therefore, this study was conducted to select a new line with brown seed coat, green cotyledon, and tetra-null genotype (lecgy1lox1lox2lox3ti) for lectin, 7S α′ subunit, lipoxygenase, and KTI proteins in the mature seed. Five germplasms were used to create breeding population. From a total of 58 F2 plants, F2 plants with lele genotype were selected using a DNA marker, and F3 seeds with a brown seed coat, green cotyledon, and the absence of 7S α′ subunit protein were selected. Three lines (S1, S2, and S3) were developed. Genetic absence of lectin, 7S α′ subunit, lipoxygenase, and KTI proteins was confirmed in F6 seeds of the three lines, which had a brown seed coat, green cotyledons, and a white hilum. The 100 seed weights of the three lines were 26.4-30.9 g, which were lower than 36 g of the check cultivar - 'Chungja#3'. The new S2 line with 30.9 g hundred seed weight can be used as a parent to improve colored soybean cultivars without antinutritional factors such as lectin, 7S α′ subunit, lipoxygenase, and KTI proteins.
We conducted this study to examine the effects of safflower seed granular tea containing physiologically active polyphenols on antioxidative activities and bone metabolism. Forty postmenopausal women ages 49 to 64-years were recruited from Daegu and Gyeongbuk and were randomly assigned to either a safflower tea supplement (Saf-tea) group (n=27) or a placebo group (n=13). The Saf-tea group received 20 g of safflower seed granule tea per day containing a 13% ethanol extract of defatted safflower seeds, whereas the placebo group received a similar type of tea that lacked the ethanol extract. No significant changes in nutrient intake for either the placebo or Saf-tea groups were observed before or after the study period, except vitamin A intake increased after 6 months in the Saf-tea group. Dietary phytoestrogen intakes were similar in the Saf-tea group (60.3 mg) and placebo group (52.5 mg). Significant increases in plasma genistein and enterolactone were observed in the Saf-tea group. After 6 months of supplementation, serum levels of antioxidant vitamins such as a-tocopherol and ascorbic acid increased significantly, and TBARS levels decreased in the Saf-tea group compared to the placebo group. Serum osteocalcin levels were reduced (P<0.05) in the Saf-tea group after 6 months, whereas serum osteocalcin did not change in the placebo group. Urinary deoxypyridinoline/creatinine excretion was not different between the two groups at baseline, and did not change in either group after 6 months. Bone mineral density decreased significantly in the placebo group (P<0.01) but not in the supplemented group. It was concluded that polyphenols (72 mg/day), including serotonin derivatives, in the Saf-tea had both antioxidant and potential bone protecting effects in postmenopausal women without liver toxicity.
Jo, Ara;Shin, Ji hun;Song, Hwa young;Lee, Ye Eun;Jeong, Da Eun;Oh, Sung Hwa;Mun, Myung Jae;Lee, Mina
Natural Product Sciences
/
v.26
no.1
/
pp.64-70
/
2020
Citrus junos seeds (CS) have been traditionally used for the treatment of cancer and neuralgia. They are also used to manufacture edible oil and cosmetic perfume. A large amount of CS shells without oil (CSS) are discarded after the oil in CS is used as foods or herbal remedy. To efficiently utilize CSS as a by-products, it needs to be studied through chemical analysis. Therefore, we developed an ultra-performance liquid chromatography (UPLC)-diode array detection (DAD) method for simultaneous determination and quantitative analysis of five components (two flavonoids and threes limonoids) in CSS. A Waters Acquity UPLC HSS T3 column C18 (2.1 × 100 mm, 1.8 ㎛) was used for this separation. It was maintained at 40 ℃. The mobile phase used for the analysis was distilled water and acetonitrile with gradient elution. To identify the quantity of the five components, a mass spectrometer (MS) with an electrospray ionization (ESI) source was used. The regression equation showed great linearity, with correlation coefficient ≥ 0.9912. Limits of detection (LOD) and limits of quantification (LOQ) of the five compounds were 0.09 - 0.13 and 0.26 - 0.38 ㎍/mL, respectively. Recoveries of extraction ranged from 97.45% to 101.91%. Relative standard deviation (RSD) values of intra- and inter-day precision were 0.06 - 1.15% and 0.19 - 0.25%, respectively. This UPLC-DAD method can be validated to simultaneously analyze quantities of marker flavonoids and limonoids in CSS.
We previously used Southern blot analysis to detect restriction-length polymorphisms between male fertile and cytoplasmic male sterile (CMS) cytoplasms at the coxII and atp6 loci of the mtDNA of Capsicum annuum L. Two copies of atp6 were found in each male fertile and CMS pepper lines. Interestingly, one of the copies of atp6 in CMS pepper was a 3'-truncated pseudogene. The open reading frame of the coxII gene was the same in the fertile (N-) and CMS (S-) lines. However, the nucleotide sequence in the S-cytoplasm diverged from that in the N-cytoplasm 41 bp downstream of the stop codon. To develop CMS-specific sequence-characterized amplified region (SCAR) markers, inverse PCR was performed to characterize the nucleotide sequences of the 5' and 3' flanking regions of mitochondrial atp6 and coxII from the cytoplasms of male fertile (N-) and CMS (S-) pepper plants. Based on these data, two CMS-specific SCAR markers, 607 and 708 bp long, were developed to distinguish N-cytoplasm from S-cytoplasm by PCR. The CMS-specific PCR bands were verified for 20 cultivars containing either N- or S-cytoplasm. PCR amplification of CMS-specific mitochondrial nucleotide sequences will allow quick and reliable identification of the cytoplasmic types of individual plants at the seedling stage, and assessment of the purity of $F_1$ seed lots. The strategy used in this report for identifying CMS-specific markers could be adopted for many other crops where CMS is used for F1 seed production.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.