• 제목/요약/키워드: Seed marker

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Simple Sequence Repeat (SSR) Marker를 이용한 토마토 품종 식별 (Use of Simple Sequence Repeat (SSR) Markers for Variety Identification of Tomato (Lycopersicon esculentum))

  • 권용삼;박은경;배경미;이승인;박순기;조일호
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제33권4호
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    • pp.289-295
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    • 2006
  • 국내에서 유통되고 있는 토마토 품종의 판별 방법에 SSR marker의 이용 가능성에 대한 연구를 수행하여 얻어진 결과를 요약하면 다음과 같다. 토마토 28품종을 18개의 SSR marker를 이용하여 분석하였을 때 대립유전자의 수는 $2{\sim}9$개로 비교적 다양한 분포를 나타내었으며 전체 60개의 대립유전자가 분석되었다. PIC 값은 $0.476 {\sim}0.800$ 범위에 속하였으며 평균값은 0.607로 나타났다. SSR marker를 이용하여 작성된 토마토 28품종의 품종간 유전적 거리는 $0.35{\sim}0.97$의 범위로 나타났고, 유사도 지수 0.36을 기준으로 할 때 28개 품종은 체리형 토마토 그룹과 일반형 토마토 그룹으로 나눌 수 있었으며, 공시 품종 모두 SSR marker의 genotype에 의해 뚜렷이 구분되었다. 이 연구결과는 토마토의 품종식별에 기초 자료로 유용하게 이용될 수 있는 것으로 나타났다.

Simple sequence repeat (SSR) marker를 이용한 벼 품종 식별 (Identification of Rice Variety Using Simple Sequence Repeat (SSR) Marker)

  • 권용삼;박은경;박찬웅;배경미;이승인;조일호
    • 생명과학회지
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    • 제16권6호
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    • pp.1001-1005
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    • 2006
  • SSR markers를 이용하여 벼의 품종간 유전적 유연관계 분석과 품종식별 방법에 대한 연구를 수행하여 얻어진 결과를 요약하면 다음과 같다. SSR primer 50개와 벼 보급종 21품종을 PCR 반응시킨 결과 다형성을 뚜렷하게 나타내는 primer는 23개였으며, 각 marker에 의해 발생된 대립유전자의 수는 $2{\sim}9$까지 검출되었고, 평균값은 3.00개로 나타났다. 유전적 다형성 정도를 나타내어 주는 SSR marker의 PIC 값은 최소 0.091에서부터 최대 0.839까지 다양하게 분석되었다. SSR marker를 이용하여 분석된 벼 21품종에 대한 전체 유전적 유사도는 $0.59{\sim}0.92$의 범위에 속하였고 유사도 지수 0.65를 기준으로 할 때 4개의 그룹으로 구분되었다. SSR marker중에서 RM206, RM225, RM418, RM478은 marker genotype에 의해 21 품종에 대해 각각 고유한 밴드 특성을 나타내어 품종판별이 가능한 것으로 나타났다. 금후 이 연구결과는 벼 보급종의 품종식별을 위해 효과적으로 이용될 수 있는 것으로 나타났다.

RAPD Loci for Seed Protein and Oil Content in Soybean (Glycine max)

  • / J
    • 한국자원식물학회지
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    • 제10권3호
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    • pp.247-249
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    • 1997
  • Seed protein and oil content is important trait in the soybean. Both seed protein and oil content in this plant species is inherited quantitatively. A 68-plant $F_2$ segregation population derived from a mating between Mercury and PI 467.468 was evaluated with random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers to identify QTL related to seed protein and oil content. Marker OPB12 was found to be associated with differences in seed protein content. Four markers, OPA09b, OPM07b, OPC14, and OPN11b had highly significant effects on seed oil content. By interval mapping, the interval between marker OPK3c and OPQ1b on linkage group 13 contained a QTL that explained 25.7% variation for seed oil content.

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DNA marker를 이용한 벼의 조직배양 효율개선 (Improvement of cultural efficiency using DNA markers in anther and seed culture of rice)

  • 김홍집;김태헌;손재근
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제27권
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    • pp.21-28
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    • 2009
  • 벼의 약 및 현미 배양효율과 관련된 DNA marker를 이용하여 인디카형 벼 품종인 'IR 36'의 조직배양 효율을 개선하기 위하여 실험한 결과를 요약하면 다음과 같다. 벼품종 간에 약 및 현미배양 효율을 비교한 결과 자포니카 > 통일형 > 인디카 형의 순으로 나타났다. 그러나 MGRI집단의 약배양에서 식물체분화율이 높은 계통으로 선발된 'MGRI 079'와 'MGRI 036'의 약배양 효율은 각각 19.8%, 19.9%로 가장 높게 나타났다. 'MGRI 079'에 'IR 36'이 여교배되어 양성된 $BC_2F_4$ 90 계통에 대한 marker검정을 실시하여 positive band를 나타내는 34계통을 선발할 수 있었다. 선발된 34계통 중 10 계통의 약배양에서 캘러스 형성률은 'IR 36' 보다 현저히 높았다. 선발된 10 계통의 현미배양에서도 캘러스형성 능력과 식물체재분화율이 'IR 36' 보다 높게 나타났다. $BC_2F_4$ 계통 중에서 식물체분화능력이 높은 계통으로 선발된 $BC_2F_4$-28은 간장이 'IR 36'보다 큰 편이었으나 출수기와 미립특성은 'IR 36'과 비슷하였다.

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DNA marker를 이용한 벼의 조직배양 효율 재선 (Improvement of Cultural Efficiency Using DNA Markers in Anther and Seed Culture of Rice)

  • 김경민
    • 생명과학회지
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    • 제16권3호
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    • pp.527-533
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    • 2006
  • 벼의 약 및 현미 배양효율과 관련된 DNA marker를 이용하여 인디카형 벼 품종인 'IR 36'의 조직배양 효율을 개선하기 위하여 실험한 결과를 요약하면 다음과 같다. MGRI집단의 약배양에서 식물체분화율이 높은 계통으로 선발된 'MGRI 079'와 'MGRI 036'의 약배양 효율은 각각 19.8%, 19.9%로 가장 높게 나타났다. 'MGRI 079'에 'IR 36'이 여교배되어 양성된 $BC_2F_4$ 100 계통에 대한 marker 검정을 실시하여 선발된 34 계통중 약배양에서 캘러스 형성률이 'IR 36'보다 높은 계통은 30계통이었고, 현미배양에서 'IR 36'보다 식물체 분화율이 높은 계통은 $BC_2F_4-28$ 외 14 계통이었다. $BC_2F_4$ 34계통 중에서 식물체분화능력이 높은 계통으로 선발된 $BC_2F_4-28$은 간장이 'IR 36'보다 큰 편이었으나 출수기와 미립특성은 'IR 36'과 비슷하였다. 'MGRI 036'에 'IR 36'을 반복친으로 여교배하여 양성된 $BC_4F_3$ 50계통의 현미배양을 실시한 결과 'IR 36'보다 식물체 재분화율이 높은 계통은 $BC_4F_3-3$ 외 10 계통이었고, 그중 $BC_4F_3-46$의 식물체 재분화율이 11%로 가장 높게 나타났다.

Identification of Quantitative Trait Loci Associated with Seed Size and Weight in Soybean

  • Kim, Hong-Sik;Lee, Suk-Ha;Park, Keum-Yong;Lee, Yeong-Ho
    • 한국작물학회지
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    • 제45권4호
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    • pp.227-231
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    • 2000
  • Small seed size is one of the major traits of soybean cultivars for sprouts with regard to high sprout yield. This study was conducted to identify quantitative trait loci (QTL) for seed size and weight in a set of F 6 seeds of 89 lines derived from a cross between 'Pureunkong', a soybean cultivar developed for sprouts and 'Jinpumkong 2', a soybean cultivar with no beany taste in seed due to the lack of lipoxygenases. The genetic map of 25 linkage groups with a total of 98 markers including RFLP, RAPD, SSR and classical markers was constructed from this F/sbu 5/-derived population and was used for QTL analysis. 'Pureunkong' was significantly smaller (P<0.01) than 'Jinpumkong 2' in seed size and seed weight. Genetic variation was detected and transgressive segregation was common in the population for these traits. Seven DNA markers including opT14-1600 in LG A2, opF02-400 in LG B2, Satt100, opC09-700, opG04-730 and opQll-650 in LG C2, and opY07-1100 & 1000 in LG(unknown) were significantly associated and accounted for 4.7 to 10.9% and 5.1 to 10.1 % of the phenotypic variation in seed size and seed weight, respectively. 'Pureunkong' alleles increased seed size and seed weight at the all four significant marker loci on the LG C2. These marker loci in LG C2 were closely linked and were presumed to be a single QTL. Overall, at least three independent QTLs from 3 linkage groups (A2, B2, and C2) were putatively involved in the control of seed size and seed weight.

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형태학적 특징을 이용한 향상된 치아 검출 방법 (Improved Tooth Detection Method for using Morphological Characteristic)

  • 나승대;이기현;이정현;김명남
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제17권10호
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    • pp.1171-1181
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    • 2014
  • In this paper, we propose improved methods which are image conversion and extraction method of watershed seed using morphological characteristic of teeth on complement image. Conventional tooth segmentation methods are occurred low detection ratio at molar region and over, overlap segmentation owing to specular reflection and morphological feature of molars. Therefore, in order to solve the problems of the conventional methods, we propose the image conversion method and improved extraction method of watershed seed. First, the image conversion method is performed using RGB, HSI space of tooth image for to extract boundary and seed of watershed efficiently. Second, watershed seed is reconstructed using morphological characteristic of teeth. Last, individual tooth segmentation is performed using proposed seed of watershed by watershed algorithm. Therefore, as a result of comparison with marker controlled watershed algorithm and the proposed method, we confirmed higher detection ratio and accuracy than marker controlled watershed algorithm.

콩에서 Microsatellite marker률 이용한 oil 및 단백질 함량의 양적형질 유전자좌의 분석 (Identification of Quantitative Trait Loci (QTLs) Associated with Oil and Protein Contents in Soybean (Glycine max L.))

  • Kim, Hyeun-Kyeung;Kang, Sung-Taeg
    • 생명과학회지
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    • 제14권3호
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    • pp.453-458
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    • 2004
  • 콩의 oil 및 단백질은 식품에서 매우 중용한 영양학적인 구성요소이다. Oil및 단백질과 같은 종자 구성물질들은 polygenetic 형질들로 되어있다. 본 시험은 큰올콩과${\times}$익산10호의 RIL 계통과 SSR marker를 이용하여 유전자 지도를 작성하고, 이를 바탕으로 oil 및 단백질 함량과 관련된 양적형질 유전자좌(QTLs)를 탐색하였다. Oil함량과 관련된 QTLs는 연관군 C2와 satt100과 연관군 DIb+W의 satt546및 연관군 L의 satt418의 세 개의 독립적인 QTLs를 확인하였다. 단백질 함량에 있어서는 연관군 B2와 J 및 L에 각각 satt556과 satt414 및 satt238의 marker에서 독립적인 QTLs를 확인하였다. 본시험의 결과, oil 및 단백질 함량과 관련된 공통의 QTL은 연관군 L이었다. 한편, oil 및 단백질과 같은 종자구성물질은 주로 환경적인 stress및 종자의 크기 등에 의해서 구성되어지는 것으로 생각된다.