• 한국균학회지
• /
• 제41권3호
• /
• pp.200-204
• /
• 2013

일부 자낭균류는 Dihydroxynaphthalene(DHN) 멜라닌을 가지고 있다. 본 연구는 배에 검은별무늬병을 일으키는 V. nashicola 균이 어떠한 형태의 멜라닌을 가지고 있는지 확인하고자 DHN 멜라닌 합성유전자중의 하나인 scytalone dehydratase(SD) 유전자의 부분 염기서열을 국내 여러 지역과 일본에서 분리된 11개 균주로부터 분석하였다. PCR 방법을 사용하여 429 bp 크기의 반응산물을 11개 균주 모두로부터 증폭하였고 염기서열을 분석하였다. 증폭된 PCR 산물은 GenBank database에 비교 탐색한 결과 SD 유전자로 판정되었다. 분석된 11개 균주의 SD 유전자에는 모두 1개의 인트론과 122개 아미노산을 코딩하는 2개의 엑손이 존재하였다. 이들 11개 SD 유전자 간에 염기서열은 100% 상동성을 보였다. 결정된 V. nashicola SD 유전자의 아미노산 서열의 유사도는 다른 곰팡이와 비교할 때 69~73%로 수준이었다. 본 연구 결과는 V. nashicola 균이 DHN 멜라닌 생합성 단계를 운영하고 있음을 입증하였다.

• 한국균학회지
• /
• 제37권2호
• /
• pp.155-160
• /
• 2009

The production of dihydroxynaphthalene (DHN) melanin is known to be essential factor for pathogenicity in Colletotrichum lagenarium. However, the genetic diversity of melanin genes was not much known among Colletotrichum spp. To investigate the variability of melanin gene in Colletotrichum spp. that cause anthracnose on diverse crops including tomato, we cloned and sequenced partial sd, one of DHN melanin genes encoding for scytalone dehydratase, from eight strains of C. coccodes, C. acutatum, C. truncatum C. caricae, and C. musae. The size of PCR-amplified sd ranged 437 bp to 545 bp. The nucleotide sequence identity of sd among the Colletotrichum strains tested varied from 49% to 99%. All of the PCR-amplified sd from eight strains contain an intron and have two exons coding for 122 amino acids. Overall, the size and nucleotide sequence of sd varied among the five Colletotrichum spp. Sequence identity of the predicted scytalone dehydratase protein of 122 amino acids ranged 50 to 99%. Phylogentic analysis based on the sd nucleotide sequences revealed that the five Colletotrichum spp. could be genetically divided.