• Title/Summary/Keyword: Satellite RNA

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Cucumber Mosaic Virus-associated Satellite RNA에 의한 Tomato Aspermy Virus의 병징변화 (Modification of Tomato Aspermy Virus Symptom by Cucumber Mosaic Virus- Associated Satellite RNA)

  • 이현숙
    • 한국식물병리학회지
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    • 제2권3호
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    • pp.145-149
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    • 1986
  • Tomato aspermy virus(TAV-B)는 두 개의 다른 CMV균주 D 및 K에서 분리한 satellite RNA의 증식 및 encapsidation에 대하여 helper virus의 역할을 하였다. 이 두 satellite RNA는 역시 ??? system에서 보이는 바와 같이 TAV가 감염된 담배에서 TAV 병징을 크게 감소시켰으며, 이는 감염된 식물내의 Virus 함량의 감소와 관계가 있었다. 또한 CMV가 감염된 토마토에서 lethal necrosis를 유발시킴을 볼 수 있었다.

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Biological Control of n Severe Viral Strain Using a Benign Viral Satellite RNA Associated with Cucumber mosaic virus

  • Montasser Magdy Shaban;Bader Al-Hamar;Bhardwai Radhika Guleri
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제22권2호
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    • pp.131-138
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    • 2006
  • Two strains of Cucumber mosaic virus (CMV) isolated in Kuwait were confirmed their infectivity based on symptomatology and host range on different cultivars of tomato (Lycopersicon esculentum), tobacco(Nicotiana tabacum L.) and squash (Cucurbita pepo). The pattern of symptoms differed for the two CMV strains in tomato and tobacco, showing severe stunting and mosaic symptoms with one strain designated KU2, and almost symptomless with the other strain designated KU1. A satellite RNA 5 (sat-RNA) was found to be associated with the KU1 strain and was characterized as a benign viral satellite RNA. Using reverse transcription and polymerase chain reaction (RT-PCR) with sat-RNA specific primers, an amplified PCR product of about 160bp was determined and analyzed by gel electrophoresis. This naturally occurring benign viral satellite RNA was successfully used as a biological control agent to protect tomato plants against the severe KU2 strain. Tomato plants grown in plant-growth chambers, were preinoculated with KU1 containing the benign viral satellite and then challenge inoculated with the severe KU2 strain at different time intervals. All plants challenged three weeks after preinoculation showed nearly complete protection from subsequent infection by the severe strain. This biological control technology using plant viruses was found protective and could be successfully established sooner after the preinoculation.

오이 모자이크 바이러스 위성RNA의 cDNA가 도입된 형질전환 담배의 육성 (Transgenic Tobacco Plants Introduced with cDNA of Cucumber Mosaic Virus Satellite RNA)

  • 이상용;홍은주;최장경
    • 한국식물병리학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.80-86
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    • 1995
  • The cDNA of CMV-As satellite RNA was introduced into tobacco plants (Nicotiana tabacum cv. Samsun NN) using a binary Ti plasmid vector system of Agrobacterium tumefaciens. The cDNA of satellite RNA introduced into tobacco plants was detected by polymerase chain reaction (PCR) and molecular hybridization analyses. Symptom development was distinctly suppressed in the transgenic tobacco plants when inoculated with CMV-Co. CMV concentration in the transgenic tobacco plants was decreased to 1/40 of non-transgenic tobacco plants. The kanamycin resistance gene of the transgenic tobacco plants was also detected in the progeny.

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Cucumber mosaic virus Paf 계통의 약독 병징과 관련된 satellite RNA의 유전자 해석 (Genomic Analysis of Satellite RNA of Cucumber mosaic virus-Paf Related with Mild Symptoms)

  • 성미영;정민영;이상용;류기현;최장경
    • 식물병연구
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    • 제10권4호
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    • pp.241-247
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    • 2004
  • Cucumber mosaic virus(CMV)-Paf 계통에 포함된 satellite RNA(Paf-satRNA)는 CMV의 병징을 완화시키는 약독병징 관련 유전자로 작용하였다(Choi 등, 2001). 이 연구는 Paf-satRNA의 약독병징 관련 유전자의 도메인을 확인하기 위하여, 고추에서 chlorosis 병징을 발현하는 PepY-satRNA와 키메라 satRNA를 구축하여 분석하였다. 두 종의 satRNA의 염기서열을 비교한 결과, 분자크기가 큰 PepY-satRNA에서 10염기의 삽입이 발견되기는 하였지만, 양 말단영역의 염기는 비교적 안정된 conserved sequence를 보였다. 그러나 이들 satRNA의 중간영역에 존재하는 염기서열, 즉 5' 말단의 81번째 염기로부터 113번째, 그리고 183번째 염기부터 265번째 염기까지의 영역에서는 많은 변화를 나타냈다. 약독병징과 관련된 도메인을 확인하기 위하여 구축한 각 satRNA 및 키메라 satRNA의 cDNA로부터 transcript RNA를 전사시키고, 전사된 각 satRNA transcript를 CMV-Fny의 게놈RNA1, RNA2 및 RNA3의 transcript와 혼합한 후 N. benthamiana에 접종하였다. 그 결과 RT-PCR에 의해서 모든 satRNA-cDNA로부터 전사된 transcript의 감염성이 확인되었으며, Paf-satRNA 및 키메라 Paf(H/N)-satRNA와 PepY(N/A)-satRNA를 접종한 N. benthamiana에서는 모두 약한 모자이크 또는 무병징 감염의 특성을 보였다. 이와는 대조적으로 PepY-satRNA 및 키메라 PepY(H/N)-satRNA와 Paf(N/A)-satRNA를 접종한 식물에서는 전형적인 모자이크 증상과 식물체의 위축을 동반하였다. 이들 각 키메라 satRNA에 감염된 N. benthamiana를 접종원으로 고추에 접종한 결과, Paf-satRNA와 혼합한 CMV-Fny를 접종한 고추에서는 무병징에 가까운 약한 모자이크 증상이 발현되었고, PepY-satRNA를 접종한 고추는 뚜렷한 chlorosis의 모자이크 증상이 발현되었다. 한편 이들 두 종 satRNA의 키메라, Paf(H/N)-satRNA와 PepY(N/A)-satRNA를 접종한 고추에서는 모두 약한 모자이크 또는 무병징 감염의 특성을 보였고, PepY(H/N)-satRNA와 Paf(N/A)-satRNA를 접종한 식물에서는 전형적인 chlorosis의 모자이크 증상과 식물체의 위축을 동반하였다. 이와 같은 결과를 종합해 보았을 때, N. benthamiana에서와 마찬가지로 Paf-satRNA의 약독병징과 관련된 유전자의 도메인은 HpaI-NarI 영역에 존재한다는 것을 나타냈다.

Nitrogen Biofixing Bacteria Compensate for the Yield Loss Caused by Viral Satellite RNA Associated with Cucumber Mosaic Virus in Tomato

  • Dashti, N.H.;Montasser, M.S.;Ali, N.Y.;Bhardwaj, R.G.;Smith, D.L.
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제23권2호
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    • pp.90-96
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    • 2007
  • To overcome the problem of the yield reduction due to the viral satellite mediated protection, a culture mix of three nitrogen-fixing bacteria species of the genus Azospirillum (A. brasilienses N040, A. brasilienses SP7, and A. lipoferum MRB16), and one strain of cyanobacteria (Anabena oryzae Fritsch) were utilized as biofertilizer mixture in both greenhouse and field experiments. When protected plants were treated with biofertilizer mixtures, the fruit yield of biofertilized plants increased by 48% and 40% in a greenhouse and field experiment, respectively, compared to untreated plants inoculated with the protective viral strain alone. Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) analysis of total nucleic acid (TNA) extracts revealed that biofertilization did not affect the accumulation of the viral satellite RNA (CARNA 5) that is required for plant protection against other destructive viral strains of CMV. The yield increment was a good compensation for the yield loss caused by the use of the protective viral strain associated with CARNA 5.

A simple method for detection of CMV viral RNAs and satellite RNAs in Korean pepper.

  • J.H. Sung;Park, J.H.;H.Y. Shin;M.U. Chang;H. Sayama;H. Atarashi
    • 한국식물병리학회:학술대회논문집
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    • 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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    • pp.150.3-151
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    • 2003
  • To analyze the genome of Cucumber mosaic virus(CMV) in pepper, we developed a new extraction method for double-stranded RNA(dsRNA). To isolate the dsRNA, 0.1g of pepper leaves homogenized with 1ml of 5${\times}$EXB extraction buffer[0.5M glycin, 0.5M NaCl, 5mM EDTA(pH9.0/NaOH), 10% Sodium N-lauryl salcosinate(NLS), 10% Sodium dodecylsulfate(SDS)] and purified with the 1/4 volume of phenol: chloroform: isoamylalcohol(25:24:1). dsRNAs from the aqueous phase was precipitated with isopropanol. This procedure was able to detect a minimal amount of dsRNA from CMV infected plant tissue and to distinguish different CMV satellite RNAs by polyacrylamide gel electrophoresis(PAGE). Moreover, this method can be applied CMV infected in pepper or Rice dwarf virus (RDV) infected rice.

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Satellite RNA 보유 Cucumber mosaic virus(CMV)의 고추 CMV병에 대한 교차방어 효과 (Cross-Protection Effectiveness of Cucumber mosaic virus (CMV) Isolates Associated with Satellite RNA for Prevention of CMV Disease in Pepper Plants)

  • 최장경;성미영;정혜진;홍진성;이상용
    • 식물병연구
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    • 제7권3호
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    • pp.155-163
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    • 2001
  • 기주반응 실험을 통하여 무병징 또는 엷은 병징을 발현하는 satRNA 보유 Paf-CMV 및 Rs2-CMV를 고추 CMV병의 방제를 위한 약독바이러스로 공시하여 교차방어효과를 검정하였다. 공시한 satRNA-CMV는 모두 agar gel diffusion test에서 강독계로 공시한 Mf-CMV의 항원과 융합하는 침강선을 나타내 subgroup I의 혈청 형으로 판단되었다. 이들 약독계 satRNA-CMV의 물리적성질은 내희석성이 $10^{-4}$으로, 강독계 Mf-CMV나 satRNA를 보유하고 있는 Ap-CMV보다 낮게 나타났으나, 내열성 및 내보존성 은 차이를 보이지 않았다. 공시한 satRNA의 염기서열을 결정한 결과, Rs2-satRNA는 335염기, Ap-satRNA 347염기, Paf-satNA 386염기로 구성되어 있었다. 이들 염기서열을 이미 보고된 Y-CMV의 satRNA와 비교한 결과, 양 말단 영역 특히 5'말단으로부터 80염기 및 3'말단으로부터 174염기는 안정된 conserved sequence를 나타냈다. 그러나 중간영역의 염기서열에서는 .많은 변이를 나타냈고, 특히 병징과 관련된 domain으로 보고된 영역에서 Paf-satRNA의 염기서열은 다른 계통의 satRNA에 비하여 많은 차이를 보였다. 각 satRNA의 cDNA로부터 전사시킨 transcript RNA를 Mf-CMV의 게놈RNA와 혼합하여 고추에 접종한 결과, 본래의 각 satRNA-CMV를 접종하였을 때와 마찬가지로 Paf-satRNA 및 Rs2-satRNA의 transcript 와 혼합한 Mf-CMV에 감염된 고추의 병징이 약하게 발현되었다. 선발된 약독CMV의 강독계 바이러스에 대한 교차방어효과를 검정하기 위하여 Paf-CMV 및 Rs2-CMV를 접종한 고추와 담배에 강독 Mf-CMV를 challenge한 후 교차방어 지속효과를 검정한 결과, Paf-CMV를 접종한 고추와 담배는 모두 Mf-CMV를 challenge 접종한 3주후까지 병징이 발현되지 않았으나, Rs2-CMV를 접종한 식물은 challenge 2주 후에 약 반수의 개체에서 강독계 병징이 발현되었다. 또한 challenge바이러스의 농도별 교차방어효과에서도 Paf-CMV를 접종한 고추에 정제한 Mf-CMV를 0.2 mg/ml 이하의 농도로 challenge한 경우, 접종 30일이 되었을 때까지 병징이 발현되지 않았으나, Rs2-CMV에서는 일부의 개체에서 병징이 발현되어 강독계에 대한 교차방어의 효과가 일정하게 나타나지 않았다. 한편 고추의 유묘에 약독CMV를 접종한 다음, 포장에 재배하면서 바이러스병징이 발현되는 개체를 조사한 결과, 약독 CMV접종 30-60일 후에 Paf-CMV 접종구에서 1.8-6.4%, Rs2-CMV 접종구에서 8.2-18.3%그리고 무접종구에서 2.7-47.2%의 바이러스병징이 발현됨으로서 Paf-CMV의 강독계 CMV의 감염에 대한 교차방어효과가 안정되고 높게 나타났다..

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Comparative Differential Expressions of Porcine Satellite Cell during Adipogenesis, Myogenesis, and Osteoblastogenesis

  • Jeong, Jin Young;Kim, Jang Mi;Rajesh, Ramanna Valmiki;Suresh, Sekar;Jang, Gul Won;Lee, Kyung-Tai;Kim, Tae Hun;Park, Mina;Jeong, Hak Jae;Kim, Kyung Woon;Cho, Yong Min;Lee, Hyun-Jeong
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제37권4호
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    • pp.225-232
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    • 2013
  • Satellite cells were derived from muscular tissue in postnatal pig. Satellite cell is an important to growth and development in animal tissues or organs. However, the progress underlying induced differentiation is not clear. The aim of this study was to evaluate the morphologic and the transcriptome changes in porcine satellite cell (PSC) treated with insulin, rosiglitazone, or dexamethasone respectively. PSC was obtained from postnatal muscle tissue. In study 1, for study the effect of insulin and FBS on the differentiated satellite cells, cells were cultured at absence or presence of insulin treated with FBS. Total RNA was extracted for determining the expression levels of myogenic PAX3, PAX7, Myf5, MyoD, and myogenin genes by real-time PCR. Myogenic genes decreased expression levels of mRNA in treated with insulin. In study 2, in order to clarify the relationship between rosiglitazone and lipid in differentiated satellite cells, we further examined the effect of FBS on lipid accumulation in the presence or absence of the rosiglitazone and lipid. Significant differences were observed between rosiglitazone and lipid by FBS. The mRNA of FABP4 and $PPAR{\gamma}$ increased in rosiglitazone treatment. In study 3, we examined the effect of dexamethasone on osteogenic differentiation in PSC. The mRNA was increased osteoblasotgenic ALP and ON genes treated with dexamethasone in 2% FBS. Dexamethasone induces osteoblastogenesis in differentiated PSC. Taken together, in differentiated PSCs, FABP4 and $PPAR{\gamma}$ increased to rosiglitazone. Whereas, no differences to FBS and lipid. These results were not comparable with previous reports. Our results suggest that adipogenic, myogenic, and osteoblastogenic could be isolated from porcine skeletal muscle, and identify culture conditions which optimize proliferation and differentiation formation of PSC.

한우의 등심과 사태조직 유래 근육위성세포의 성장단계별 유전발현 차이 분석 (Transcriptomic Analysis of the Difference of Bovine Satellite Cell Between Longissimus dorsi and Semimembranosus on Hanwoo Muscle Tissues)

  • 김휘재;강동훈;박보혜;이원영;최지환;정기용
    • 현장농수산연구지
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    • 제23권1호
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    • pp.117-128
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    • 2021
  • 한우의 성장단계별 부위 근육발달을 이해하는 것은 도체율 개선에 따른 소득증대와 증체율 증가에 따른 생산효율 향상에 긍정적인 영향을 미친다. 본 연구에서는 한우의 등심과 사태 유래 근육위성세포를 분리 후 세포단위의 발달 및 분화를 비교하여 transcriptome 단위의 작용기전을 제시하였다. 한우의 부위별 근육 유래 근육위성세포의 근섬유의 양은 4일에 가장 높게 나타났고 이후 감소하였다. 한우의 근육위성세포의 발달 단계에 따라 발현되는 총 전사체 유전자의 종류는 사태근육 위성세포에서 높게 나타났다. 등심과 사태 근육 유래 위성세포의 발달단계에 따라 유의적인 차등 유전자 453개를 찾아냈고 이를 이용한 기능유 전체 분석이 필요하다. 등심과 사태유래 근육위성세포를 이용한 동일조건 분화 비교에서 사태유래 근육 위성세포의 분화 시 myosin complex, skeletal muscle contraction, troponin complex, skeletal muscle tissue development 와 같은 근섬유 형성관련 유전자의 발현이 높게 나타나는 것으로 보아 같은 개체의 근육조직에서도 부위별로 차등 발달이 되고 있다는 것을 알 수 있다. 기존 연구에서는 근육의 성장에 대한 이해를 위해 사양과 영양관련 시험이 많이 이루어졌다. 향후 세포단위의 연구들이 많이 이루어져 작용기작에 대한 생물정보 자료를 추가로 적용한다면 한우의 정밀사양을 적용할수 있는 바탕이 마련될 것이다. 또한 근육위성세포의 연구는 추후 동물실험 윤리제도 강화에 따른 비동물 전임상 screening 시험 활용과 대체단백질 산업의 주요 이슈인 배양육 소재 개발 연구와 같이 축산시험연구의 지속적인 확장성에 많은 영향을 미칠 것으로 생각된다.