• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제25권8호
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• pp.1324-1327
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• 2015

The nucleotide sequence of the TRP1 gene encoding phosphoribosyl anthranilate isomerase in yeast Saccharomycopsis fibuligera was determined by degenerate polymerase chain reaction and genome walking. Sequence analysis revealed the presence of an uninterrupted open-reading frame of 759 bp, including the stop codon, encoding a 252 amino acid residue. The deduced amino acid sequence of Trp1 in S. fibuligera was 43.5% homologous to that of Komagataella pastoris. The cloned TRP1 gene (SfTRP1) complemented the trp1 mutation in Saccharomyces cerevisiae, suggesting that it encodes a functional TRP1 in S. fibuligera. A new auxotrophic marker to engineer starch-degrading yeast S. fibuligera is now available. The GenBank Accession No. for SfTRP1 is KR078268.

• 한국식품영양학회지
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• 제1권1호
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• pp.25-32
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• 1988

Properties of purified isocitrate lyase from Saccharomycopsis lipolytica ATCC 44601 and MX9-11RX8 temperature-sensitive mutant were investigated. Purified isocitrate lyase from temperature-sensitive mutant was indistinguishable from the wild type enzyme with respect to the isoelectric pH(5.3), the thermostability and Km value for threo-Ds-Isocitrate(about 0.2 mM). When isocitrate lyase induced by acetate minimal medium at 33$^{\circ}C$, MX9-11RX8 mutant did not express enzyme activity but did synthesize polypeptide chain whose electrophoretic mobilities were equal to those of the purified enzymes.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제15권6호
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• pp.414-419
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• 1987

Saccharomycopsis lipolytica의 isocitrate lyase에 대한 온도감수성 변이의 특성과 이 효소의 생화학적성질을 조사하기 위한 기초연구로서 isocitrate lyase 결손변이 균주인 MX9-11(Icl-)로부터 온도감수성을 나타내는 복귀 변이균주를 3균주 분리하고 그중 활성의 회복이 가장 높은 MX9-11RX8 균주의 성질을 조사하였다. MX9-11RX8 복귀 변이균주는 탄소원으로서 초산을 사용하였을 때 온도의 증가에 따라서 isocitrate lyase의 생성량과 비생성 속도가 감소하여 33$^{\circ}C$에서는 거의 효소를 합성하지 않았으며, 온도를 23$^{\circ}C$에서 33$^{\circ}C$로 올렸을 때 효소의 합성은 바로 정지하였지만 균체증식은 계속되었다. 한편 n-hexadecane을 탄소원으로 사용하였을 때에도 온도감수성을 나타내었으며, 온도의 shift up 후에도 isocitric acid 생산은 거의 변화가 없었다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제31권2호
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• pp.137-142
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• 1988

Saccharomycopsis lipolytica ATCC 44601에서 정제한 isocitrate lyase 반응산물의 축합반응과 개열반응은 $30^{\circ}C$, pH 7.0에서 분석되었다. Glyoxylate와 succinate의 축합반응에서 Km값은 각각 0.06 mM과 0.21 mM이었고, 개열 반응에서 glyoxylate는 직선적인 경쟁적 저해를, succinate는 직선적인 비경쟁적 저해를 나타내었으며 이때 Ki 값은 각각 0.22 mM과 0.82 mM이었다. 그러므로 이 kinetic분석은 이 효소가 축합 반응에서 glyoxylate가 succinate보다 먼저 결합하는 정서반응기구인 것을 나타내었다. 3-Bromopyruvate(BrP)의 불활성화는 포화 kinetics를 나타내면서 효소를 불가역적으로 불활성화하였으며 반감기는 0.15분이고 $K_{BrP}$는 0.032 mM이었으며, 기질과 반응생성물들을 불활성화에 대하여 보호작용이 있었다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제17권6호
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• pp.624-628
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• 1989

A study on the citric acid production using Saccharomycopsis lipolytica (NRRL Y7576) was carried out in shake-flasks, air-lift and membrane recycle bioreactors. The cells entrapped in Ca-alginate beads were used in shake-flasks and air-lift reactor. Repeated batch fermentation in shake-flasks was successfully performed for 34 days and resulted in a yield of 54%. Increased yield (63%) was obtained in the air-lift reactor operation using nitrogen deficient medium (NDM). In the membrane recycle bioreactor operation, the maximal dry cell mass concentration was 39 g/1 at a dilution rate of 0.02 h$^{-1}$ and the yield with NDM was higher than that with growth medium. In addition, the yield and volumetric productivity with pure oxygen supply were greatly improved compared with those with air supply.

• Molecules and Cells
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• 제28권4호
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• pp.369-373
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• 2009

Heterologous secretory expression of endoglucanase E (Clostridium thermocellum) and ${\beta}$-glucosidase 1 (Saccharomycopsis fibuligera) was achieved in Saccharomyces cerevisiae fermentation cultures as an ${\alpha}$-mating factor signal peptide fusion, based on the native enzyme coding sequence. Ethanol production depends on simultaneous saccharification of cellulose to glucose and fermentation of glucose to ethanol by a recombinant yeast strain as a microbial biocatalyst. Recombinant yeast strain expressing endoglucanase and ${\beta}$-glucosidase was able to produce ethanol from ${\beta}$-glucan, CMC and acid swollen cellulose. This indicates that the resultant yeast strain of this study acts efficiently as a whole cell biocatalyst.

• 한국균학회지
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• 제27권6호
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• pp.399-405
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• 1999

${\alpha}-amylase$ 생산력이 우수한 야생형인 S. fiburigera의 핵을 순수분리하여 영양요구성 변이주인 S. cerevisiae(tyr-, ura-)의 원형질체에 전달하는 핵전이를 이용하여 종간잡종을 형성시킨 후 이들 형질전환체로부터 ${\alpha}-amylase$ 고생산 균주를 획득하였다. 핵전이를 위한 원형질체 형성 및 재생조건에서는 Novozym 234의 농도 1%, 삼투안정제는 0.6M KC1, 효소처리 시간은 90분, 그리고 최적 pH는 5.8로 나타났다. 핵전이에 의한 형질전환율은 0.25%로 비교적 낮은 편이었으며, 유전적 안정성, 세포크기의 체적, DNA함량의 측정 그리고 핵염색의 결과 형질전환체의 핵형은 aneuploid로 추정되었다. 형질전환 체의 ${\alpha}-amylase$ 활성은 모균주와 비교하여 약 $1.2{\sim}1.9$배 증가하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제31권2호
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• pp.272-279
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• 2021

Two genes encoding probable α-ʟ-arabinofuranosidase (E.C. 3.2.1.55) isozymes (ABFs) with 92.3% amino acid sequence identity, ABF51A and ABF51B, were found from chromosomes 3 and 5 of Saccharomycopsis fibuligera KJJ81, an amylolytic yeast isolated from Korean wheat-based nuruk, respectively. Each open reading frame consists of 1,551 nucleotides and encodes a protein of 517 amino acids with the molecular mass of approximately 59 kDa. These isozymes share approximately 49% amino acid sequence identity with eukaryotic ABFs from filamentous fungi. The corresponding genes were cloned, functionally expressed, and purified from Escherichia coli. SfABF51A and SfABF51B showed the highest activities on p-nitrophenyl arabinofuranoside at 40~45℃ and pH 7.0 in sodium phosphate buffer and at 50℃ and pH 6.0 in sodium acetate buffer, respectively. These exoacting enzymes belonging to the glycoside hydrolase (GH) family 51 could hydrolyze arabinoxylo-oligosaccharides (AXOS) and arabino-oligosaccharides (AOS) to produce only ʟ-arabinose, whereas they could hardly degrade any polymeric substrates including arabinans and arabinoxylans. The detailed product analyses revealed that both SfABF51 isozymes can catalyze the versatile hydrolysis of α-(1,2)- and α-(1,3)-ʟ-arabinofuranosidic linkages of AXOS, and α-(1,2)-, α-(1,3)-, and α-(1,5)-linkages of linear and branched AOS. On the contrary, they have much lower activity against the α-(1,2)- and α-(1,3)-double-substituted substrates than the single-substituted ones. These hydrolases could potentially play important roles in the degradation and utilization of hemicellulosic biomass by S. fibuligera.

• 미생물학회지
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• 제35권4호
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• pp.315-321
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• 1999

핵전이 방법을 이용하여 효모에서 전분분해능이 향상된 새로운 우수 균주를 개발하고자 하였다. Saccharomycopsis fiburigera KCTC 7393과 Saccharomyces cerevisiae KCTC 7049에서 핵을 분리한 후 영양요구 돌연변이주인 S. cerevisiae의 안으로 전달시켜 잡종(MN-16)을 형성하여 전분 분해능이 증가된 잡종을 선별하였다. 세포 배양액으로 조효소 용액을 만든 후 ammonium sulfate 침전, DEE-Sephacel column chromatography, Sephacryl S-200 column chromatography 등의 정제과정을 통해 9.7%의 회수율로 약 10.6배 정제 된 효소를 얻을 수 있었다. 정제된 효소는 SDS-PAGE 전기영동을 통해 단일 band를 보여 주었으며, SDS-PAGE 와 Sephacryl S-200 column chromatography를 통해서 53kDa으로 나타났다. 정제효소의 최적 활성 온도는 40${\circ}C$이고, 안정성은 40~45${\circ}C$로 나타났다. 최적 활성 pH는 5.5이었고, pH 5.0~7.0 정도에서 pH안정성이 80%정도 유지되었다. 가용성 전분에 대한 $K_{m}$ 값은 2.5㎎/㎖이었다. 또한, 정제 효소의 금속 이온의 효과로 $Ca^{2+}, Co^{2+}, EDTA, Mg^{2+}, Mn^{2+}, Zn^{2+}$ 첨가시 활성이 촉진되었고, $Ca^{2+}$의 경우 가장 높은 반면 $Cu^{2+}, Fe^{2+}, Ni^{2+}$의 경우는 오히려 활성이 감소되었다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제42권4호
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• pp.407-412
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• 2014

누룩으로부터 MBY1276, 1280, 1282, 1320, 1322, 1324 및 MBY 1327로 각각 명명된 전분을 분해하는 효모균주를 분리하였다. 이들 균주는 18S rRNA 영역의 ITS 단편 및 26S rDNA 영역의 D1/D2 단편의 염기서열 해석 및 탄소원 대사특성 분석을 통하여 S. fibuligera로 동정하였다. 상주지역에서 수집된 누룩으로부터 분리된 MBY1320 균주는 대조구 균주인 S. fibuligera KCTC7806 및 누룩으로부터 분리된 다른 S. fibuligera 균주에 비해 고온에서 상대적으로 높은 비성장속도를 나타내었다. 전분을 분해하는데 필요한 효소인 ${\alpha}$-amylase 및 glucoamylase 효소활성을 측정한 결과 MBY1320 균주의 ${\alpha}$-amylase 효소활성은 대조구 균주보다 낮지만 glucoamylase 효소활성은 고온에서 상대적으로 우수한 것으로 나타났다. 효소활성 분석결과는 MBY1320 균주가 표준균주 및 다른 S. fibuligera 균주와 비교하여 고온에서 상대적으로 높은 비성장속도를 나타내는 것을 뒷받침하는 결과로 판단되었다. 가용성 전분을 이용한 회분식 배양 결과 MBY1320 균주는 표준균주 보다 $42^{\circ}C$에서 우수한 성장속도 및 에탄올 생산속도를 나타내었다. 본 연구를 통하여 기존에 보고된 S. fibuligera 균주보다 고온에서 glucoamylase 효소활성 및 비성장속도가 우수한 S. fibuligera 균주를 보고하는 바이다.