• 제목/요약/키워드: SR protein

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20 MHz pulsed NMR을 이용한 국내산과 수입산 콩의 판별 (Discriminating Domestic Soybeans from Imported Soybeans by 20 MHz Pulsed NMR)

  • 노정해;이선민;김영붕;이택수
    • 한국식품과학회지
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    • 제35권4호
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    • pp.653-659
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    • 2003
  • 황색콩과 검은콩의 원산지를 판별하기 위하여 일반성분 및 20 MHz pulsed NMR을 이용하여 자기완화시간을 측정하였다. 일반성분으로는 황색콩은 조지방 함량 만이 원산지별 차이를 나타내었고, 검은콩의 경우에는 수분과 단백질 함량이 원산지별 차이를 보였다. 20 MHz pulsed NMR을 이용하여 자기완화시간 및 고형지방함량을 측정한 결과 황색콩은 고형지방함량과 $T_2-CPMG$ 측정시 원산지에 따라 유의적인 차이를 나타내었으며, 검은콩은 $T_1-SR$을 제외한 모든 측정항목에서 원산지별 차이를 나타내었다. 황색콩과 검은콩의 원산지 판별 분석시 일반성분만으로 정준판별분석을 시행한 결과 $70{\sim}91.7%$의 정확도를 나타내었으나, NMR 자기완화시간 및 고형지방함량을 이용한 경우 100%의 정확성으로 원산지를 판별해낼 수 있었다.

시스템 약리학적 분석에 의한 황금의 항균효과 (Systemic Analysis of Antibacterial and Pharmacological Functions of Scutellariae Radix)

  • 김효진;박세림;하희정;김윤숙;이부균;안원근
    • 동의생리병리학회지
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    • 제34권4호
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    • pp.184-190
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    • 2020
  • This study was performed to find antibacterial substances contained in Scutellariae Radix (SR) using a systems pharmacological analysis method and to establish an effective strategy for the prevention and treatment of infectious diseases. Analysis of the main active ingredients of SR was performed using Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology (TCMSP) Database and Analysis Platform. 36 active compounds were screened by the parameter values of Drug-Likeness (DL), Oral Bioavailability (OB), and Caco-2 permeability (Caco-2), which were based on the drug absorption, distribution, metabolism, and excretion indicators. The UniProt database was used to obtain information on 159 genes associated with active compounds. The main active compounds with antibacterial effects were wogonin, β-sitosterol, baicalein, acacetin and oroxylin-A. Target proteins associated with the antibacterial action were chemokine ligand 2, interleukin-6, tumor necrosis factor, caspase-8,9 and mitogen-activated protein kinase 14. In the future, systems pharmacological analysis of traditional medicine will be able to make it easy to find the important mechanism of action of active substances present in natural medicines and to optimize the efficacy of medicinal effects for combinations of major ingredients to help treat certain diseases.

북방전복 (Haliotis discus hannai) 의 mitochondrial DNA 영역별 유전적 변이성 분석 (Analysis of genetic divergence according to each mitochondrial DNA region of Haliotis discus hannai)

  • 박철지;남원식;이정호;노재구;김현철;박종원;황인준;김성연
    • 한국패류학회지
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    • 제29권4호
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    • pp.335-341
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    • 2013
  • 본 연구는 우리나라의 주요양식 품종인 북방전복을 대상으로 지금까지 전복류에서는 사용되지 않았던 mtDNA의 protein coding 영역 ND2, ND5, ND4, ND4L, ND6, ND1의 6개영역과 protein noncoding 영역인 12SrRNA(ribosomal RNA) 을 포함해 총 7개 영역을 이용하여 각 영역의 유전적 변이성 및 개체간 유전적 유연관계 등을 분석하여 각 영역별 특성을 파악하고 이러한 특성을 고려하여 유전학적 분석에 적합한 분자유전마커를 개발하였다. 유전적 변이성은 ND4 영역 (Haplotype diversity = 1.000, Nucleotide diversity = 0.010823) 이 가장 높게 나타났으며, 개체간의 유전적 차이는 ND2 및 ND1 영역이 각각 90% 및 87%로 유의적으로 명확히 구분할 수 있었다. 따라서 유전적 변이성이 가장 높은 ND4 영역과 영역내의 클러스터 간의 유전적 차이가 명확한 ND2 및 ND1 영역을 복합적으로 활용할 경우 북방 전복의 집단유전학 및 계통분류학 분석에 유용한 분자유전마커로 사용할 수 있을 것이라 생각된다.

Metformin Down-regulates $TNF-{\alpha}$ Secretion via Suppression of Scavenger Receptors in Macrophages

  • Hyun, Bobae;Shin, Seulmee;Lee, Aeri;Lee, Sungwon;Song, Youngcheon;Ha, Nam-Joo;Cho, Kyung-Hea;Kim, Kyungjae
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제13권4호
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    • pp.123-132
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    • 2013
  • Obesity is consistently increasing in prevalence and can trigger insulin resistance and type 2 diabetes. Many lines of evidence have shown that macrophages play a major role in inflammation associated with obesity. This study was conducted to determine metformin, a widely prescribed drug for type 2 diabetes, would regulate inflammation through down-regulation of scavenger receptors in macrophages from obesity-induced type 2 diabetes. RAW 264.7 cells and peritoneal macrophages were stimulated with LPS to induce inflammation, and C57BL/6N mice were fed a high-fat diet to generate obesity-induced type 2 diabetes mice. Metformin reduced the production of NO, $PGE_2$ and pro-inflammatory cytokines ($IL-1{\beta}$, IL-6 and $TNF-{\alpha}$) through down-regulation of $NF-{\kappa}B$ translocation in macrophages in a dose-dependent manner. On the other hand, the protein expressions of anti-inflammatory cytokines, IL-4 and IL-10, were enhanced or maintained by metformin. Also, metformin suppressed secretion of $TNF-{\alpha}$ and reduced the protein and mRNA expression of $TNF-{\alpha}$ in obese mice as well as in macrophages. The expression of scavenger receptors, CD36 and SR-A, were attenuated by metformin in macrophages and obese mice. These results suggest that metformin may attenuate inflammatory responses by suppressing the production of $TNF-{\alpha}$ and the expressions of scavenger receptors.

Salmonella Enteritidis와 Salmonella Gallinarum의 세균막 스트레스를 인식하는 spy-gfp 오페론 융합 (The spy-gfp Operon Fusion in Salmonella Enteritidis and Salmonella Gallinarum Senses the Envelope Stress)

  • 강보경;방일수
    • Journal of Dairy Science and Biotechnology
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    • 제36권4호
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    • pp.208-219
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    • 2018
  • 낙농업 및 유가공 제품의 생산과 유통에서 살모넬라 감염에 의한 살모넬라증의 발생은 빈번하며, 이 세균의 항미생물 제제에 대한 내성 증가 현상 또한 지속되고 있어 새로운 항미생물 제제의 수요는 감소하지 않는다. 세균막의 훼손은 세균 생존을 쉽게 위협할 수 있기 때문에 개발되는 항미생물 제제들은 주로 세균의 막을 표적으로 삼지만, 개발되는 제제들이 실제로 세균막의 훼손을 초래하는지 구별하는 것은 많은 노력과 비용을 수반한다. 본 연구에서는 E. coli 세포막 스트레스에 의해 발현이 유도되고, 세균막 외부공간에서만 위치하며, 그 구조상 많은 단백질의 구조 안정화에 기여할 것으로 예상되는 chaperone 단백질 Spy(spheroplast protein Y)의 유전자에 상응하는 살모넬라 spy 유전자에 gfp(green fluorescence protein) 오페론 융합체를 제조하여, 이 융합체가 Salmonella enterica의 두 혈청형 Enteritidis와 Gallinarum의 세포막 스트레스를 인지하여 GFP 발현량이 크게 증가하는 것을 확인하였다. 또한 세균막 스트레스 신호를 특이적으로 인지하는 이인자 신호전달 체계(two component signal transduction system)인 Bae와 Cpx들이 두 살모넬라 혈청형의 spy 유전자 전사 유도에 필수적임을 확인하였다. 따라서 본 연구에서 사용한 spy-gfp 오페론 융합체는 S. Enteritidis와 S. Gallinarum의 세포막 훼손을 특이적이고 신속하게 인식하는 biosensor로서 활용될 수 있을 것으로 판단된다.

사육 수온이 연어(Oncorhynchus keta) 치어의 성장 및 생리반응에 미치는 영향 (Effect of rearing water temperature on growth and physiological response of juvenile chum salmon(Oncorhynchus keta))

  • 장석우;강한승;강동양;조규석
    • 환경생물
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    • 제40권4호
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    • pp.651-659
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    • 2022
  • 본 연구는 연어(Oncorhynchus keta) 치어의 성장, 생존 및 혈액 성상에 미치는 사육수온(8, 11, 14 및 17℃)의 영향을 연구하기 위해 수행되었다. 실험 종료 시 연어의 체중(body weight, BW)은 14℃ 실험구에서 가장 높았을 뿐 아니라, 특이성장률(specific growth rate, SGR), 사료전환 효율(feed conversion ratio, FCR), 사료효율(feed efficiency, FE), 증중률(weight gain, WG) 및 비만도(condition factor, CF)와 같은 성장지표에서도 14℃ 실험구가 가장 높은 경향을 나타내었다. 생존율(survival rate)은 8℃와 11℃ 실험구에서 100%를 보였고, 14℃ 실험구에서는 96% 및 17℃ 실험구에서는 98%를 각각 나타내었다. 혈장 성분 중 알라닌 아미노전이효소(alanine aminotransferase, ALT)는 17℃ 실험구에서 유의한 감소를 보였으나, 알부민(albumin), 총단백질(total protein, TP), 나트륨(sodium, Na+), 칼륨(potassium, K+) 및 염소(chloride, Cl-)는 유의한 변화를 보이지 않았다. 실험 종료 시 연어의 체성분 조사를 실시한 결과, 수분(moisture), 단백질(crude protein) 및 회분량(crude ash)은 수온에 따른 유의한 변화는 보이지 않았으나, 지질(crude lipid)은 다른 실험구에 비해 8℃ 실험구에서 유의하게 높은 경향을 보였다. 결론적으로 연어 치어가 성장하는데 필요한 최적의 사육 수온은 14℃로 보이나, 혈액 성상 등 생리적인 영향은 향후 추가적인 연구가 필요한 것으로 판단된다.

With the greatest care, stromal interaction molecule (STIM) proteins verify what skeletal muscle is doing

  • Cho, Chung-Hyun;Lee, Keon Jin;Lee, Eun Hui
    • BMB Reports
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    • 제51권8호
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    • pp.378-387
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    • 2018
  • Skeletal muscle contracts or relaxes to maintain the body position and locomotion. For the contraction and relaxation of skeletal muscle, $Ca^{2+}$ in the cytosol of skeletal muscle fibers acts as a switch to turn on and off a series of contractile proteins. The cytosolic $Ca^{2+}$ level in skeletal muscle fibers is governed mainly by movements of $Ca^{2+}$ between the cytosol and the sarcoplasmic reticulum (SR). Store-operated $Ca^{2+}$ entry (SOCE), a $Ca^{2+}$ entryway from the extracellular space to the cytosol, has gained a significant amount of attention from muscle physiologists. Orai1 and stromal interaction molecule 1 (STIM1) are the main protein identities of SOCE. This mini-review focuses on the roles of STIM proteins and SOCE in the physiological and pathophysiological functions of skeletal muscle and in their correlations with recently identified proteins, as well as historical proteins that are known to mediate skeletal muscle function.

골격근 망상체 $Ca^{2+}$유리 Channel[Raynodine receptor]의 $Mg^{2+}$에 의한 유리 억제 (Inhibitory Effect of $Mg^{2+}$ on the Release of $Ca^{2+}$ from Ryanodine Receptor of the Sarcoplasmic Reticulum in the Skeletal Muscle)

  • 이철주
    • Journal of Chest Surgery
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    • 제25권4호
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    • pp.347-355
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    • 1992
  • The precise mechanism of the Excitation-Contraction Coupling is still uncertain. But the concept that Ca2+ induced Ca2+ release [CICR] from the Ryanodine receptor in the sarcoplasmic reticulum [foot structure] may play a major role in E-C coupling has been widely accepted since 1970`s. It is believed that increased cytosolic Ca2+ followed by CICR is main contributor for E-C coupling of striated muscle. Resulting phenomena of ischemic /post-reperfusion myocyte is increased cytosolic Ca2+, even to the absence of Ca2+ in reperfusate. So intracellular inhibitor to CICR might prevent the ischemic and reperfusion damage of myocardial cells. The relatively purified foot protein, especially heavy sarcoplasmic reticulum rich, of the skeletal muscle was incorporated into the black lipid bilayer [Phosphatidyl ethanolamine: Phosphatidyl serine=l: 1]. Under the steady state of membrane potential [+20 mV], ionic current through Ryanodine receptor was measured with Cs+ as charge carrier. In the cis chamber [Cytoplasmic side], Mg2+ strongly inhibited CICR of Ryanodine receptor[Kd=6.2 nM]. In conclusion, naturally existing intracellular free Mg2+ can inhibit CICR from intracellular Ca2+ reservior [heavy SR]. So post-ischemic or post-reperfusing myocardium could be preserved using additional free Mg2+ in cardioplegic solution or reperfusate, otherwise the optimal concentration is undetermined.

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Characterization of Biochemical Properties of Feline Foamy Virus Integrase

  • Lee, Dong-Hyun;Hyun, U-Sok;Kim, Ji-Ye;Shin, Cha-Gyun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권6호
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    • pp.968-973
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    • 2010
  • In order to study its biochemical properties, the integrase (IN) protein of feline foamy virus (FFV) was overexpressed in Escherichia coli, purified by two-step chromatography, (Talon column and heparin column), and characterized in biochemical aspects. For the three enzymatic reactions of the 3'-processing, strand transfer, and disintegration activities, the $Mn^{2+}$ ion was essentially required as a cofactor. Interestingly, $Co^{2+}$ and $Zn^{2+}$ ions were found to act as effective cofactors, whereas other transition elements such as $Ni^{2+}$, $Cu^{2+}$, $La^{3+}$, $Y^{3+}$, $Cd^{2+}$, $Li^{1+}$, $Ba^{2+}$, $Sr^{2+}$, and $V^{3+}$ were not. Regarding the substrate specificity, FFV IN has low substrate specificities as it cleaved in a significant level prototype foamy virus (PFV) U5 LTR substrate as well as FFV U5 LTR substrate, whereas PFV IN did not. Finally, the 3'-processing activity was observed in high concentrations of several solvents such as CHAPS, glycerol, Tween 20, and Triton X-100, which are generally used for dissolution of chemicals in inhibitor screening. Therefore, in this first report showing its biochemical properties, FFV IN is proposed to have low specificities on the use of cofactor and substrate for enzymatic reaction as compared with other retroviral INs.

피부에서 분리한 Staphylococcus aureus JJ-11이 생산하는 collagenase의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of Collagenase Produced by Staphylococcus aureus JJ-11 Isolated from the Human Skin)

  • 이진경;김해남;강호영;전홍기
    • 생명과학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.245-252
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    • 2006
  • 피부 트러블을 가진 남,여 40명의 피부에서 분리한 collagenase를 생산하는 균주를 분리, 동정한 결과 Staphylococcus aureus로 판명되었으며 이를 S. aureus JJ-11이라 명명하였다. S. aurells JJ-11 균주의 collagenase의 최적 생산 조건은 1.5%(w/v) gelatin, 1%(w/v) yeast extract, 0.4% (w/v) $K_2HPO_4$, 0.005%(w/v) $NiSO_4{\cdot}6H_2O$를 함유한 배지 (pH 7.0)에서 $37^{\circ}C$, 200 rpm으로 18시간 동안 배양하는 것이다. 분리 균주가 생산하는 collagenase를 정제하기 위해서 amberlite IRA-900과 sephacryl S-300 HR columns를 이용하였고, 6.66-folds로 정제되었다. S. allreus JJ-11 균주가 생산하는 collagenase를 정제한 결과 분자량은 약 62 kDa이었으며, pH 7.0과 $37^{\circ}C$에서 각각 최대의 활성을 가졌고, pH와 온도에 대한 안정성은 pH 4.0-8.0, $40^{\circ}C$까지 100%의 활성이 있었다. 금속이온에 대해서는 $Fe^{2+},\;Co^{2+},\;Ba^{2+}$ 존재 하에서는 5 mM 농도에서도 활성을 유지하였다. $Sr^{2+},\;Hg^{2+}$에서는 30% 이상이 저해를 받는 것으로 확인되었다. 또한 EDTA와 O-phenanthroline에 의해 65% 이상이 저해되는 일 반적인 collagenase의 특정인 metalloproteinase의 특정을 보였으며, 그리고, 여러 가지 기절에 대해 효소활성을 비교한 결과, insoluble collagen (type I)에 대해 효소 활성이 가장 높았다.