• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제13권1호
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• pp.119-124
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• 2003

This study was conducted to evaluate the practical usefulness of the sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PACE) fingerprinting of whole cell proteins far the identification of lactic acid bacteria in Kimchi. SDS- PACE of whole cell proteins of the reference strains and lactic acid bacteria isolated from Kimchi yielded differential banding patterns that were highly specific fingerprints, thus making it possible to identify. Identification of the isolates from Kimchi was achieved by comparing the SDS-PAGE fingerprints of isolates to those of reference strains. In addition, the reliability of SDS-PAGE was examined by comparing the results with those of the APL 50 CHL system assay and 16S rRNA gene sequence. SDS-PACE assay showed a different identity to reference strains, while the APL 50 CHL system and 16S rRNA gene sequence could not distinguish a few strains. Therefore, SDS-PAGE of the whole cell proteins is a specific and a reliable method that will be useful for the identification of lactic acid bacteria in Kimchi to the species level, and can be used as an alternative or complementary identification method.

• 생명과학회지
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• 제17권5호
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• pp.658-663
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• 2007

B. thuringiensis는 많은 해로운 곤충들을 박멸시키는데 널리 사용되는 생물학적 살충제로 잘 알려져 있다. 그것은 측포자 형태의 결정체($\delta$-내독소)를 생산하고 내생포자들을 형성한다. 본 논문에서는 B. thuringiensis BT-1과 BT-2에 의해 생산되는 내독소의 특성을 주사전자현미경(SEM), 투과전자현미경(TEM), SDS-PACE, 알칼리 용액에서의 용해 활성을 통하여 규명하였다. BT-1, BT-2 균주는 GBY 배지에서 배양되었고, 두 균주의 내독소는 당밀도구배법을 이용하여 정제되어, 주사전자현미경(SEM), 투과전자현미경(TEM)으로 관찰하였다. 형태학적으로, BT-1의 내독소는 사각형 및 납작형이고 크기는 $1.73{\mu}m{\times}0.7{\mu}m$, 그리고 BT-2 내독소는 구형이며 $1.1{\mu}m$, 폭이 $0.9{\mu}m$인 것으로 밝혀졌다. SDS-PACE 방법으로 분석한 결과, BT-1의 분자량은 28 kDa, 21 kDa, 반면에 BT-2의 분자량은 50 kDa, 35 kDa, 22 kDal으로 밴드가 형성되었다. 이들의 결정체는 알칼리 완충용액 내에서 시간에 지나감에 따라서 점차로 용해되었으며 3시간 후에는 거의 완전하게 용해되었다. 이 결과들을 통하여 BT1과 BT-2 결정체의 내독소가 곤충의 중장 내에서 시간이 흐름에 따라 비활성 상태에서 활성상태로 전환되는 것으로 보여진다.

• 생명과학회지
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• 제12권5호
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• pp.555-560
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• 2002

연접후치밀질(PSD)의 분자조성은 아직 대체로 알려져 있지 않다. 본 연구에서는 다양한 크기의 연접후치밀질 단백질들을 효율적으로 SDS-겔에서부터 추출하는 방법을 제시하고, 이를 이용하여 연접후치밀질의 1% n-octyl glucoside에 용해되지 않는 분핵에 존재하는 31kDa크기의 단백직(PSD31로 명명)을 SDS-겔로부터 분리하고, trypsin 처리하여 생성되는 펩티드의 아미노산 서열을 결정하였다. PSD31의 아미노산 서열은 adenine nucleotide translocator 1(ANT1)과 매우 상동성이 높았다. 연접후치밀질에 ANT1이 존재함은 신경조직의 세포외 공간에 adenosine nucleotide를 유리할 수 있는 기구가 연접에 존재함을 시사한다.

• 생명과학회지
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• 제14권1호
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• pp.193-197
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• 2004

A continuous enrichment culture procedure was used to isolate bacteria from various soil sources capable of suppressing large patch disease of turfgrass. Six isolates consistently suppressed large patch in turfgrass, and ranged in the spectrum of extracellular enzymes that they expressed. The best disease- suppressing isolate, TBM912, expressed protease, CMCase, and pectinase activity and inhibited the growth of Rhizectonin solani and Betrytis cinerea in vitro. Here we show that this strain also produces an antibiotic that was identified by TLC, SDS-PACE and HPLC analysis as lipopeptide.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제30권4호
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• pp.320-324
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• 2002

우리나라 연안에 주로 발생되는 적조인 Cochlodinium polykrikoides를 빠르고 정밀한 생화학적인 방법으로 측정하기 위한 일종의 maker로서 C. polykrikoides의 세포막에 존재하는 특이 항원성을 가진 막 단백질을 분리하였다. 먼저, C. polykrikoides와 gymnodium sangineum의 세포를 삼투압으로 터뜨린 후 원심분리하여 세포막을 모았다. 그 후 양 적조생물의 세포막은 1 mM DTT가 함유된 50 mM Na-carbonate로 용해하고 SDS-PAGE행하여 용해된 막 단백질을 분리하였다. SDS-PAGE로 분리된 막 단백질은 C. polykrikoides의 세포 막 단백질로 제조한 항혈청을 사용하여 immune-blot한 결과 C. polykrikoides의 120 kDa의 단백질이 G. sangineum의 동일한 크기의 막 단백질과는 서로 다른 항원성을 나타내었다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제4권1호
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• pp.39-44
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• 2002

The fast-migrating cationic peroxidase isozyme, named RC3, was purified from rice (Oryza sativa cv. Nak-Dong) callus. Purification of the enzyme was accomplished by ammonium sulfate fractionation, CM-cellulose ionexchange chromatography, and Sephacryl S-100 gel filtration. The molecular mass of the enzyme was about 34 KDa as determined by SDS-PACE and 38 KDa by Sephacryl-100 gel filtration. The pI value of the enzyme was 8.9. Antiserum against RC3 was raised in rabbits, and anti RC3 antiserum reacted with RC3 isozyme by Ouchterlony double immunodiffusion. The optimum pHs and Km values of the enzyme for various substrates were determined. Kinetic studies with various substrates showed that RC3 had very low Km value of 0.01 mM for ferulic acid and ascorbic acid. However, the enzyme did not use esculetin as a substrate.

• 생명과학회지
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• 제14권1호
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• pp.121-125
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• 2004

E. coli에서 B. macerans 유래 cyclodextrin glucanotransferase (CGTase)의 활성형 생산에 GroEL/ES chaperone과의 공발현과 저온 배양의 공동작용 효과에 대해 조사하였다. 실험에 사용된 cgt와 groEL/ES 유전자를 발현하는 pTCGTl과 pGroll은 각각 T7 promoter와 Pzt-1 promoter에 의해 조절되고 이들을 E. coli에 도입시켰다. 대수증식기 초기(2 hr)와 대수증식기 중기(3 hr)에 tetrarycline 10 ng/ml 과 IPTG 1 mM을 첨가하여 각각의 유전자를 발현시켰다. CGTase활성과 specific artivity 측정 시 $37^{\circ}C$에서 pTCGTl 단독 발현 보다 $25^{\circ}C$에서 chaperone과 함께 발현시킨 경우 2배나 높은 활성이 측정됐으며, SDS-PACE 분석결과 $37^{\circ}C$에서 단독 발현 시킬경우 20% 정도 가용성 형태로 발현되던 것이 $25^{\circ}C$에서 chaperone과 공발현 시에는 거의 3.5배가 넘는 69%가 가용성으로 전환됨을 알 수 있었다. 이와 같이 분자 chaperone과 $25^{\circ}C$에서의 저온 배양은 E. coli에서 활성형질 가용성 CGTase의 생산 증가에 큰 영향을 미치는 것으로 나타났다.

• 한국축산식품학회지
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• 제26권1호
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• pp.113-120
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• 2006

젖소 초유 whey 내에 존재하는 IGF-I을 분리하기 위하여 ultrafiltration을 사용하여 30과 1 kDa 사이의 IGF-I rich fraction을 분획하였다. 분획한 IGF-I rich fraction내에 IGF-I의 존재 여부는 SDS-PACE와 western blotting으로 확인하였고, sandwich ELISA로써 분획 내 IGF-I을 정량하였다. 그 결과 IGF-I은 단백질 mg당 10 ng으로 측정되었다. 분획한 IGF-I rich fraction을 마우스 복강 macrophge의 면역 활성에 미치는 영향 즉, IL-6, NO, $TNF-{\alpha}$, Phagocytosis, $H_{2}O_{2}$,의 분비 유도 및 생성량을 측정하였고, splenocyte의 면역 활성으로는 splenocyte의 증식 효과와 natural killer cell의 항암작용을 측정하였다. 실험 결과 IGF-I rich fraction $1{\mu}g/mL$ 투여군에서 IL-6의 생성량은 9.85 ng, NO의 생성량은 $17.1{\mu}M$, phagocytosis는 양성 대조구에 대비하여 78.3%의 탐식작용을 나타내었고 $TNF-{\alpha}$와 $H_{2}O_{2}$의 생성량은 대조구에 대비하여 각각 34.5 및 6% 더 많은 양을 생산하였다. Splenocyte 면역활성에 미치는 영향으로 T cell과 B cell 증식은 대조군에 대비하여 각각 36 및 76%로 더 높은 증식 효과를 나타내었고, NK cell의 활성은 대조군보다 55.4%의 높은 활성을 보였다.

• 생명과학회지
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• 제16권7호
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• pp.1199-1206
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• 2006

Plasminogen kringle 5는 plasminogen kringles 1-4로 구성된 내생의 혈관 신생 억제제인 angiostatin과 같이 내피세포의 분열을 강력하게 억제한다고 알려져 있다. 본 연구에서는 plasminogen kringle 5의 재조합 단백질을 효모 발현 체계에서 생산하여 내피세포의 이동에 대한 저해 효과와 이에 대한 작용기전을 조사하였다 재조합 단백질 PK5는 plasminogen의 Thr456에서 Phe546까지 이르는 cDNA 부분을 ${\alpha}-factor$ prepro-peptide의 분비 신호 서열 뒤에 도입하여 Pichia pastoris GS115에서 발현시켰다. 메탄올 유도 후 얻은 배양액을 S-spin column을 이용하여 정제하였다. 정제된 단백질을 SDS-PACE하였을 때 약 10kDa의 단일 밴드를 나타냄을 확인할 수 있었다. 정제된 PK5는 bFGF나 VEGF에 의해 유도된 인간의 제대 유래 내피 세포의 이동을 약 500nM의 $IC_{50}$ 값으로 농도 의존적으로 감소시켰다. 내피 세포에 PK5 500M을 처리한 결과 bFGF에 의해 유도된 ERK1/2의 인산화를 감소시켰다 또한, PK5는 bFGF에 의해 유도된 내피세포의 골격 재형성을 강력하게 억제하는 것으로 관찰되었다. 따라서, 이러한 결과들은 효모 생산 PK5가 내피세포의 이동을 효과적으로 억제하며, 이는 ERK1/2의 활성과 세포골격의 재배열을 억제함으로써 나타나는 것으로 부분적으로 설명될 수 있다.

• 생명과학회지
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• 제17권10호
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• pp.1321-1329
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• 2007

사슴뿔은 동물세계에서 가장 빨리 성장하는 조직이다. 따라서 성장중인 사슴뿔은 뼈 성장을 촉진하는 인자가 풍부하게 포함된 것으로 생각된다. 이들 성장인자들 중 IGF-1은 뼈를 자라게 하는 조골세포의 대사에 중요한 역할을 한다고 알려져 있어 이를 정제하고자 하였다. IGF-1의 정제는 상대라고 불리는 신선한 사슴뿔을 유안침전, DEAE-Sepharose CL-6B 이온교환수지, CM-Sepharose CL-6B 양이온교환수지, Sephadex G-50의 순차적인 방법으로 할 수 있었다. 각 과정마다 IGF-1의 거동을 HPLC, SDS-PAGE, Dot blot, 그리고 western blot으로 분석하였다. IGF-1의 정량은 ELISA기술로 재조합 인간 IGF-1을 이용하여 계산되었으며, 최종 분별 액은 두 개의 단백질을 보였으나, Western-blot에서 작은 분자량인 12 kDa으로 최종 판명할 수 있었다. 정제된 단백질은 HPLC에서 retention 시간 8분만에 검출되었으며, 총 농도는 2910 ng/ml 이고 중량은 0.291 g 이었다.