• BMB Reports
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• 제32권5호
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• pp.436-439
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• 1999

Shigella sonnei is an important cause of human enteric infections. S. sonnei KNIH104S was previously reported to be isolated from Korean shigellosis patients. We cloned a 2.8-kb KpnI fragment containing the recA gene encoding a recombinase from the chromosomal DNA of S. sonnei KNIH104S. This recombinant plasmid was named pRAK28. E. coli HB101, a recA mutant, cannot grow on Luria-Bertani medium in the presence of the alkylating agent methylmethane sulfonate, however, E. coli HB101 harboring pRAK28 was found to grow on this medium. As far as we know, we are the first to sequence the recA gene from S. sonnei. This gene is composed of 1062 base pairs with an ATG initiation codon and a TAA termination codon. Nucleotide sequence comparison of the S. sonnei recA gene exhibited 99.7% and 99.5% identity with those of S. flexneri and E. coli, respectively.

• 미생물학회지
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• 제35권1호
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• pp.13-17
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• 1999

Shigella sonnei 는 인체의 장내 감염을 일으키는 병원균의 일종이며, 본 연구에 사용된 S.sonnei KNIH104S는 국내에서 쉬겔라증을 나타내는 환자로부터 분리하였다. S. sonnei KNIH104s의 염색체로부터 aspartate $\beta$-semial-dehyde dehydrogenase를 암호화하는 asd 유전자를 포함하는 1.7 kb BamHI 절편을 pBluescript SK(+) 벡터를 이용하여 클로닝하였으며 pSAB17이라 명명하였다. asd 결실돌연변이주인 E.coli $\chi$6097은 세포벽을 구성하는 중요한 성분인 DL-$\alpha$, $\varepsilon$-diaminopimelic acid가 없는 Luria-Bertani 배지에서 생장함을 확인하였다. 클로닝된 asd 유전자의 염기서열 분석결과 ATG 개시코돈 및 TAA 종결코돈을 지니는 1,104 bp 로 이루어져 있으며, 여기서 유추한 아미노산은 367개로 분자량 40.0 kDa 의 폴리펩타이드를 만들어내고 있다. 염기서열은 대장균의 asd 유전자와 한 부위에서 다르게 나타났지만 아미노산의 서열은 동일함을 알 수 있었다. 그리고 pBluescript SK(+) 벡터와 본 연구에서 클로닝된 asd 유전자를 이용하여 balanced-lethal vector인 pSKA47 및 pSKA47A를 제조하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제33권2호
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• pp.130-135
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• 2005

본 연구에서는 식중독 유발세균에 대한 항균활성이 우수한 천연 항균성 물질을 검색하기 위해 예로부터 민간과 한방에서 널리 이용되어 온 패장을 각종 유기용매로 추출하여 식중독 유발세균에 대한 항균활성을 조사해 보았다. 패장을 petroleum ether, chloroform, ethly acetate, methanol을 이용하여 실온에서 각각 용매별로 계통 분획하고, 열수추출물을 얻은 후, 9종의 식중독 유발세균(S. aureus, S. epidermidis, Salmonella paratyphimurium, S. flexneri, E. coli, Salmonella typhimurium, S. dysenteriae, P. aeruginosa, S. sonnei)에 대하여 항균효과를 조사하였다. 패장 추출물의 농도별 항균 활성 검색에서는 패장의 ethyl acetate 추출물이 가장 큰 항균 효과를 보였으며 E. coli와 S. sonnei가 가장 민감하게 반응하는 균주였다. 패장의 ethyl acetate 추출물과 연교의 물 추출물을 혼합하여 항균력을 측정해 본 결과 두 추출물을 섞어 첨가했을 경우가 단독으로 사용했을 시 보다 약 $20\%$ 정도의 더 큰 상승효과를 나타내었다. 또한 패장의 ethyl acetate 추출물이 식중독 유발세균의 성장에 미치는 효과를 검정하기 위해 S. epidermidis 및 S. sonnei의 배양액에 패장의 ethyl acetate 추출물을 각각 4,000 ppm 농도로 첨가했을 시, S. epidermidis의 생육이 72시간 이상까지 억제됨을 관찰할 수 있었고, S. sonnei의 생육도 72시간까지 지연시킬 수 있었다. 이상의 결과 패장의 ethyl acetate 추출물은 S. epidermidis와 S. sonnei의 성장을 효과적으로 억제시킴을 알 수 있었다.

• 대한미생물학회지
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• 제22권1호
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• pp.35-53
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• 1987

Multiply resistant Shigella strains isolated in Taegu area were subjected for the characterization of R plasmids. All strains isolated in 1984 and 1985 were susceptible to gentamicin, amikacin, and cephalothin, and most strains were susceptible to kanamycin (Km) and rifampin by agar dilution antimicrobial susceptibility test. The resistance frequency of S. flexneri against ampicillin (Ap) was higher than that of S. sonnei. The strains resistant to sulfisomidine (Su) and trimethoprim (Tp) were found at higher frequency in S. sonnei than in S. flexneri. The most prevalent resistance pattern of S. flexneri was chloramphenicol (Cm) tetracycline (Tc) streptomycin (Sm) Ap, followed by the pattern of CmTcSmSuApTp, CmTcSmSuApTp nalidixic acid, and CmTcSmSuAp in the decreasing order. The antibiogram of CmTcSmSuTp was found to be the most frequent pattern in S. sonnei. The ratio of conjugal transfer of S. flexneri was 47% and 75% of S. sonnei. The average number of plasmid harboring in Shigella was 4 and the size of plasmid ranged 1.3 to 134 megadalton (Mdal). Most S. flexneri carried plasmids of 2 to 3 Mdal and S. sonnei carried those of 3 to 4 Mdal size. The sizes of conjugative plasmids ranged 40-90 Mdal. The incompatibility group (Inc) F II plasmids (54-59 Mdal) were most frequent and rare Inc B plasmids (60 Mdal) of isolates in 1979 and 1980 and Inc FI (87 Mdal) of 1983 isolates were able to be classified by the colony test with standard reference plasmids. The R plasmids of known Inc group were tested for the restriction endonuclease analysis. The pattern of plasmids digested by EcoRl were apparently different by the Inc group but there was no significant difference between species or by the resistance patterns. Nonconjugative plasmids and their phenotypes were identified by transformation test. The transformants were resistant to less than two drugs. Colicin producing transformants carried the Col plasmid of 3.7 or 3.9 Mdal size. $Ap^r$ plasmids derived from S. sonnei were found to be mobilized by transfer factor RT641 to E. coli #CS100. $Ap^r$ plasm ids of same size shared by S. flexneri, S. sonnei, and E. coli were digested with Pstl. All of them showed two restriction fragments of 2.8 kilobase(kb) and 0.7kb. Other plasmids ($Sm^r\;Su^r$) derived from S. flexneri, S. boydii, and S. sonnei were digested with Pstl and they showed same restriction fragment patterns of 3.1kb and 2.9kb. The plasmid profiles of three strains of S. sonnei producing colicin and showing same resistance pattern of CmTcSmSuApTpKm appeared to be similar. Restriction patterns by EcoRl and the behavior of plasmids in conjugation or transformation process were also similar between those plasmids. The restriction patterns were significantly different between the plasmids of Inc FI group and those of unclassified Inc group.

• 한국식품영양과학회지
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• 제40권12호
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• pp.1787-1792
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• 2011

연구는 식품으로부터 Shigella spp.를 분리하기 위해서 현재 사용되고 있는 증균배지를 대상으로 증균성능을 비교하였다. GN broth, Shigella broth, SF broth, SC broth 총 4개의 증균배지를 비교하였다. S. sonnei에 대해 각 접종 수준에 대한 성장은 Shigella broth에서 $10^1$ cfu/mL 낮은 수준의 존재 시에도 성장이 확인되었다. 분리배지에서 거의 구분이 되지 않는 Morganella spp.에 대한 증균은 Shigella broth를 사용할 경우 성장이 저해되었다. 식품을 대상으로 한 S. sonnei의 증균성능은 돼지고기에서 GN broth와 SF broth가 높은 증균능력을 보였으며 소고기에서는 GN broth에서의 증균능력이 높게 나타났으나 Shigella broth에서 증균능력이 높지 않았다. 실험에 사용된 배지는 식품 종류에 따라 증균되는 특성이 상이하므로 식품에서 Shigella spp.를 분리하고자 할 경우 우선적으로 식품 특성을 고려하여 증균배지를 선택하는 것이 바람직할 것으로 생각되었다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제48권10호
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• pp.1107-1115
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• 2005

목 적 : ESBL 생산 S. sonnei에 의한 장염의 대규모 발생은 과거 국내는 물론 세계에서도 유래를 찾아볼 수 없었다. 저자들은 집단 발생한 ESBL 생산 S. sonnei에 의한 장염 환자의 임상적 특징과 치료에 대한 반응 등을 분석하여 ESBL 생산 S. sonnei 감염증에 대한 치료 지침을 마련하는데 도움이 되고자 한다. 방 법 : 연구 대상은 2004년 11월 충주 ${\bigcirc}{\bigcirc}$초등학교를 중심으로 집단 발생한 급성 장염 환자 중 분변 배양 검사상 S. sonnei가 검출되어 치료받은 환자 103명을 대상으로 하였다. 환자에서 분리된 S. sonnei에 대해 항생제 감수성 검사와 DNA 염기 서열 검사를 시행하였고, 환자들의 임상적 특징과 검사 소견, 그리고 항생제에 대한 반응 등을 후향적으로 분석하였다. 결 과 : 임상 증상은 발열 96.1%, 설사 93.2%, 복통 76.7%, 두통 71.8%, 구토 65.0%, 그리고 구역 41.7% 순으로 나타났다. 발열은 평균 2.0일간 지속되었고, 설사는 평균 3.9일간 지속되었다. 설사의 양상은 수양성 설사는 69%, 점액성 설사는 26%, 그리고 혈변은 5%에서 관찰되었다. 말초 혈액 검사에서 백혈구 증다증을 보이는 경우는 53.4%이었고, 혈청 검사에서 CRP 양성을 보이는 경우는 78.6%이었다. 대변 직접 도말 검사에서 백혈구가 고배율 당 50개 이상인 경우가 11.7%, 그리고 5-20개인 경우 9.7%이었다. 대변 잠혈 반응은 71%에서 양성이었다. 본 유행에서 분리된 ESBL의 유형은 염기 서열을 분석한 결과 CTX-M-14 유형으로 밝혀졌다. 항생제 투여에 대한 미생물학적 치료 결과는 ciprofloxacin 투여자 중 100%(9/9), azithromycin 투여자 중 100%(5/5), cefdinir 투여자 중 6.9%(5/72), ceftriaxone 투여자 중 0%(0/8), ceftizoxime 투여자 중 12.5%(1/8), TMP/SMX 투여자 중 0%(0/8), ampicillin/sulbactam 투여자 중 42.9%(3/7), amoxicillin/clavulanic acid 투여자 중 20%(1/5), 그리고 imipenem/cilastatin 투여자 중 68.8%(11/16)에서 추적 검사상 음전 되었다. 결 론 : 소아에서 발생한 ESBL 생산 S. sonnei에 의한 세균성 이질에 대한 항생제 선택에서 비용-효과 면이나 안전성 면에서 azithromycin이 매력적인 일차 선택약일 수 있을 것으로 사료된다. Ciprofloxacin은 비용-효과 면에서는 우수한 약제일 수는 있으나 소아에서의 사용은 아직 이르다고 생각된다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제16권1호
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• pp.27-32
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• 2001

장감염성 설사환자의 가검물로부터 분리된 30균는 모두 Shigella sonnei로 동정되었다. 이들 균주의 항생제 내성을 조사한 결과 30균주 중 27균주가 Tr(Trimethoprim-sulfamethoxazol)에서 내성을 보였고, 이들 중 SG-48균주는 Ap(Ampicillin), Cp(Cephalothin); Pi(Fiperacillin)에 대해서도 내성을 보인 반면, 나머지 3균주는 모든 항생제에 감수성을 나타내었다. 분리된 30균주 중 4균주를 선발하여 성장 검사를 실시한 결과 선발된 S. sonnei는 pH 4와 pH 9의 조건에서는 모두 성장이 저해되었으며, NaCl 9%첨가구의 경우 4균주의 성장이 저해되었으나 SG-73균주는 배양24시간 이후부터 성장하였다. 선발된 S. sonnei를 4$^{\circ}C$에서 배양한 경우 모든 균의 성장이 저해되었으나, 1$0^{\circ}C$에서 배양한 경우 배양 5일 이후부터 성장하였으며 영양결핍환경에서는 배양 15일까지 높은 균수를 유지하였다. 선발된 S. sonnei를 6$0^{\circ}C$에서 30분간 가열처리 한 경우 4~5 log cycle 감소하였으며, 7$0^{\circ}C$에서 5분 가열처리에 의해서는 검출되지 않았다.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제5권1호
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• pp.136-138
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• 1998

Shigella spp. cause classic bacillary dysentery that rarely result in extraintestinal complications. Urinary tract infections(UTIs) due to Shigella spp. are rare, and Shigella sonnei UTIs are extremely rare. We report a case of symptomatic UTI due to S. sonnei. A 9-year-old female presented with a history of fever, abdominal pain, loose form diarrhea, vomiting, and dysuria for 1 day. S. sonnei was identified from urine culture and stool culture result was no Salmonella and Shigella isolated. She was treated with gentamicin and cefuroxime intravenously for 5 days, which suscessfully controlled clinical features of infections.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제12권1호
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• pp.106-113
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• 2002

One-hundred and twenty-four trimethoprim-resistant Shigella sonnei isolates extracted in Korea during the last two decades were investigated for their epidemiological relationship and mechanisms of resistance to trimethoprim. The S. sonnei isolates were distributed into two groups by three different epidemiological tools: biotyping, antibiogram, and pulsed-field gel electrophoresis. One group contained the isolates from the 1980s and the other group included the isolates from the 1990s. The geometric mean MICs of trimethoprim in S. sonnei isolates from the 1980s and 1990s were found to be $672.9{\mu}g/ml\;and\;>2,048{\mu}g/ml$, respectively. Trimethoprim resistance was associated with dfrA5, dfrA12, and dfrA13 genes in the isolates from the 1980s, dfrA1, dfrA5, and dfrA12 in the isolates from 1991, and dfrA1 and dfrA12 in the isolates from 1992 to 1999. The dfrA1 gene was located downstream of the intI2 gene in Tn7, which was located on chromosome. Some dfrA12 genes were found as gene cassettes in the class 1 integron. The dfrA5 and dfrA13 genes were located on conjugative plasmids. These results suggested that a clonal change occurred in S. sonnei isolates in Korea during the last two decades and that dfr genes located on different transposable genetic elements had gradually changed.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제22권8호
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• pp.1113-1117
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• 2012

Shigella sonnei is a causal agent of fever, nausea, stomach cramps, vomiting, and diarrheal disease. The present study describes a quantitative polymerase chain reaction (qPCR) assay for the specific detection of S. sonnei using a primer pair based on the methylase gene for the amplification of a 325 bp DNA fragment. The qPCR primer set for the accurate diagnosis of Shigella sonnei was developed from publically available genome sequences. This quantitative PCR-based method will potentially simplify and facilitate the diagnosis of this pathogen and guide disease management.