• 한국생물물리학회:학술대회논문집
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• 한국생물물리학회 2002년도 제9회 학술 발표회 프로그램과 논문초록
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• pp.55-55
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• 2002

An alternative sigma factor as encoded by the $\sigma$$\^$B/ gene in Streptomyces coelicolor A3(2) was known to be involved in the differentiation and osmotic stress response. Protein expression profiles of wild-type and a $\sigma$$\^$B/ mutant strain of S coelicolor A3(2), which is impaired in defense against osmotic stress, were compared in the absence and presence of osmotic stress, using 2-dimentional gel electrophoresis.(omitted)

• 미생물학회지
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• 제39권2호
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• pp.83-88
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• 2003

streptomyces coelicolor A3(2)의 acetyl xylan esterase 유전자를 Escherichia coli께 클로닝하여 그 발현양상을 조사하였다. 이를 위하여 유전자 전체 DNA를 PCR증폭을 통하여 제조하였다. PCR산물의 염기서열을 분석한 결과 1,008개의 nucleotide로 구성된 하나의 open reading frame이 존재함을 확인하였고, 이것은 335개의 아미노산으로 이루어진 약 38 kDa의 단백질을 생성할 것으로 예측할 수 있었다. 이 유전자의 염기 서열은 streptomyces lividans의 acetyl xylan esterase와 98%의 상동성을 가졌다. 그런데 Escherichia coli (pLacl)에서 IPTG유도에 의해 두가지의 acetyl xylan esterase가 발현되었으며 각각의 분자량은 38 kDa과 34 kDa이었다. 이중에서 38 kDa의 단백질은 N-말단의 signal peptide를 포함한 전체 단백질이고,34 kDa의 단백질은 41번과 42번의 두 알라닌 잔기사이의 펩티드 결합이 끊어져 생산된 것으로 추정되었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제31권5호
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• pp.756-763
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• 2021

Agarose is a linear polysaccharide composed of ᴅ-galactose and 3,6-anhydro-ʟ-galactose (AHG). It is a major component of the red algal cell wall and is gaining attention as an abundant marine biomass. However, the inability to ferment AHG is considered an obstacle in the large-scale use of agarose and could be addressed by understanding AHG catabolism in agarolytic microorganisms. Since AHG catabolism was uniquely confirmed in Vibrio sp. EJY3, a gram-negative marine bacterial species, we investigated AHG metabolism in Streptomyces coelicolor A3(2), an agarolytic gram-positive soil bacterium. Based on genomic data, the SCO3486 protein (492 amino acids) and the SCO3480 protein (361 amino acids) of S. coelicolor A3(2) showed identity with H2IFE7.1 (40% identity) encoding AHG dehydrogenase and H2IFX0.1 (42% identity) encoding 3,6-anhydro-ʟ-galactonate cycloisomerase, respectively, which are involved in the initial catabolism of AHG in Vibrio sp. EJY3. Thin layer chromatography and mass spectrometry of the bioconversion products catalyzed by recombinant SCO3486 and SCO3480 proteins, revealed that SCO3486 is an AHG dehydrogenase that oxidizes AHG to 3,6-anhydro-ʟ-galactonate, and SCO3480 is a 3,6-anhydro-ʟ-galactonate cycloisomerase that converts 3,6-anhydro-ʟ-galactonate to 2-keto-3-deoxygalactonate. SCO3486 showed maximum activity at pH 6.0 at 50℃, increased activity in the presence of iron ions, and activity against various aldehyde substrates, which is quite distinct from AHG-specific H2IFE7.1 in Vibrio sp. EJY3. Therefore, the catabolic pathway of AHG seems to be similar in most agar-degrading microorganisms, but the enzymes involved appear to be very diverse.

• Journal of Microbiology
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• 제45권6호
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• pp.534-540
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• 2007

The Streptomyces coelicolor A3(2) genome contains six operons (rrnA to F) for ribosomal RNA synthesis. Transcription from rrnD occurs from four promoters (p1 to p4). We found that transcripts from the p1 and p3 promoters were most abundant in vivo in the early exponential phase. However, at later phases of exponential and stationary growth, transcripts from the p1 promoter decreased drastically, with the p3 and p4 transcripts constituting the major forms. Partially purified RNA polymerase supported transcription from the p3 and p4 promoters, whereas pure reconstituted RNA polymerase with core enzyme (E) and the major vegetative sigma factor ${\sigma}^{HrdB}$ ($E{\cdot}{\sigma}^{HrdB}$) did not. In order to assess any potential requirement for additional factor(s) that allow transcription from the p3 and p4 promoters, we fractionated a partially purified RNA polymerase preparation by denaturing gel filtration chromatography. We found that transcription from the p3 and p4 promoters required factor(s) of about 30-35 kDa in addition to RNAP holoenzyme ($E{\cdot}{\sigma}^{HrdB}$). Therefore, transcription from the p3 and p4 promoters, which contain a consensus -10 region but no -35 for ${\sigma}^{HrdB}$ recognition, are likely to be regulated by transcription factor(s) that modulate RNA polymerase holoenzyme activity in S. coelicolor.

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1995년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.295.2-295
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• 1995

• 미생물학회지
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• 제31권2호
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• pp.166-174
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• 1993

Streptomyces coelicolor (Muller) 의 세포에 $100 \mu$M 의 과산화수소를 1시간 동안 처리하여 과산화수소 스트레스중에 생성되는 단백질을 L-[$^{35}S$] methionine 을 이용하여 순간 표지하였다. 단백질을 추출하여 2차원 겔 전기영동으로 분석한 결과 지수 성장기의 세포가 가지는 총세포 단백질 중 약 100개의 단백질의 합성이 과산화수소에 의해 증가되는 것을 관찰하였다. 이들을 Pin(peroxide inducible) 단백질이라고 명명하고 과상화수소 처리 후 발현이 증가되는 시간에 따라 세 그룹으로 나누었다. 약 60 개의 Pin 단백질은 과산화수소 처리후 20분 이내에 발현이 증가하여 1시간동안 지속적으로 다량 합성되었다. 정체 성장기의 세포에서는 62개의 단백질의 합성이 과산화수소에 의해 증가되었으며, 이 중 21 개의 단백질은 지수성장기의 Pin 단백질과 일치하였다. 과산화수소에 대한 저항성이 증가한 세가지 돌연변이체의 단백질을 지수 성장기에서 추출하여 2 차원 겔 전기영동으로 분석한 결과, 각각의 경우 15, 17, 15개의 Pin 단백질을 야생형보다 항상적으로 다량합성하는 것을 관찰하였다. 이 pin 단백질 중 9개 (D74.7 a, E76.0c, E23.3, F50.7, F47.2a, F25.5, G39.6b, G24.0, H39.6a) 는 두가지 돌연변이체 모두에게 증가되었다. 따라서 이 단백질들은 S. coelicolor 가 과산화수소 스트레스에 대응하는데 있어 중요한 역할을 담당한다고 추정된다.

• Journal of Microbiology
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• 제33권3호
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• pp.215-221
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• 1995

S. coelicolor A3(2) cells were treated with various redox-cycling agents on nutrient agar plates and examined for their effect on the growth and differentiation. When treated with plumbagin, severe effect on cell viability was observed at concentrations above 250 $\mu$M. However, the surviving colonies differentiated normally. When treated with 100 $\mu$M paraquat, growth rate was decreased and morphological differentiation was inhibited, while the survival rate was maintained at about 100% even at 5 mM paraquat. Menadione or lawsone did not cause any visible changes at concentrations up to 1 mM. The effect of paraquat was also observed when it was added to nutrient agar plate before spore inoculation. Paraquat had also observed when it was added to nutrient agar plate before spore inoculation. Paraquat had no effect on colonies growing on R2YE agar plates. Among the components of R2YE medium selectively added to nutrient agar medium, CaCl$_2$ was found to have some protective function from the inhibitory effect of paraquat. As a first step to study the mechanism of the inhibitory effect of paraquat on differentiation, resistant mutants which sporulate well in the presence of paraquat were screened following UV mutagenesis. Three paraquat-resistant mutants were isolated with a frequency of 3 $\times$10${-5}$. Their mutation sites were determined by genetic crossings. All three mutations were mapped to a single locus near arg4 at about 1 o'clock on the genetic map of S. coelicolor A3(2).

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1994년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.209.2-209
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• 1994

No Abstract, See Full Text

• 미생물학회지
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• 제52권3호
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• pp.243-248
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• 2016

RNase E는 대장균(Escherichia coli)에서 수많은 RNA의 가공 및 분해에 관여하는 필수적인 효소이다. RNase E의 효소 활성은 RraA와 RraB에 의해 조절된다. 그람양성균인 Streptomyces coelicolor는 RNase ES, RraAS1, RraAS2라고 명명되는 RNase E와 RraA의 동족체를 가지고 있다. 이 연구에서는 S. coelicolor 유래의 RraAS1이 E. coli에서 RNase E의 효소활성을 저해하는지 연구하였다. 대장균에서 RraAS1의 발현은 RNase E의 과발현에 의해 감소된 세포생장을 더욱 저하시켰으며, RNase E의 기질인 rpsO, ftsZ, rnhB mRNA의 양을 감소시키는 것을 확인 하였다. 이러한 RraAS1의 효과는 공동면역침전실험을 수행한 결과에서 유추할 수 있듯이, Rne 단백질과 RraAS1의 결합으로 유도되는 것으로 보인다. 이러한 결과는 RraAS1이 대장균에서 RNase E의 리보핵산 가수분해 활성을 유도함을 시사한다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제38권3호
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• pp.273-277
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• 2010

운데실프로지닌과 스트래토루빈 B는 S. coelicolor가 생산하는 붉은색 항생물질이다. 이번 연구에서 이들 붉은색 항생제의 생산성과 pH shock 스트레스와의 상관관계를 연구 하였다. 운데실프로디지닌과 스트랩토루빈 B의 생합성은 고체 R2YE 배지에서 산성 pH shock에 의해 증가되었다. 최적 pH shock은 pH 4로 비교군과 비교하여 각각 1.6배 및 2배 운데실프로디진과 스트랩토루빈 B의 생산성이 증가되었다. 게다가, 산성 pH 4의 세포 추출물은 T. mentagrophytes 에 대한 주목할만한 저항 활성을 나타내었다. 그러나, 중성 및 염기성 pH shock에서는 이들 항생제의 생산성뿐만 아니라 항진균 활성 증가가 일어나지 않았다. 그러므로, 비록 산성 pH shock이 간단하고 쉬운 방법이지만, 이들 붉은색 항생물질과 다른 이차대사산물의 생산성 향상에는 매우 효과적인 접근방법일 것이다.