• 한국작물학회지
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• 제47권6호
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• pp.465-470
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• 2002

맥주보리 교배모본(Crossing block) 380품종 및 계통을 공시재료로 esterase 동위효소 가운데 4개의 loci에 대한 allele의 종류, 발견빈도, 유전자형 등을 분석한 결과는 다음과 같다. 1. 조사한 380 계통중 Est1 locus에서는Pr, Al, Ca, Af등 4개의 alleles이 있는 것으로 관찰되었으며 그 중 Pr allele이 약 70%, Ca allele이 28.4%로 대부분을 차지하였고, Ca 및 기타 Al allele은 2% 미만이었다. 2. Est2 locus에서는 Dr, Fr, Sp, Un, null 등 5개의 allele이 있는 것으로 나타났고 allele이 84.5%로 가장 높은 비율을 차지하였고, null allele가 10%이었다. 3. Est4 locus에서는 Nz, Su, At, null 등 4개의 allele이 발견되었는데 Su allele가 약 84%로 대부분을 차지하였으며, Nz, allele가 10.5%, At allele가 4.2%의 빈도를 보였다. 4. Est5 locus에서는 Mi, Pi, Te, od(null) 등 4개의 allele이 발견되었으며 Pi allele이 61.0% Mi allele이 34.2%이었다. 5. 4개의 Esterase loci에서 나타나는 pattern을 기준으로 한 유전자형은 25가지의 유형으로 분류할 수 있었으며, G1형(Pr-Fr-Su-Mi)이 28.1%, G2형(Pr-Fr-Su-Pi)이 39.5%로 대부분을 차지하였고 다음으로 12형(Ca-Fr-Su-Pi)이 약 8.1%의 비율로 나타났다. 기타의 유전자형들은 그 발견 빈도가 극히 낮은 편이었다.

• BMB Reports
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• 제30권1호
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• pp.18-20
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• 1997

Lycopersicon peruvianum shows a gametophytic self-incompatibility (GSI). GSI is controlled by a single locus (S locus) with multiple alleles. S ribonucleases encoded in S alleles cosegregate with their phenotypes of GSI in genetic cross. To understand the genetic role of S allele in L peruvianum, two large genomic fragments isolated previously were analyzed with total genomic DNAs from several tomato lines generated by cross-pollination. Southern blot analysis with the S allele fragments as probes revealed that the flanking region of S allele contained the highly homologous regions. It is speculated that they may play an important role to prevent genetic cross by self-pollination.

• 한국동물위생학회지
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• 제31권4호
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• pp.485-492
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• 2008

Salmonella enterica serovars Gallinarum(SG, causative agent of fowl typhoid) and S Pullorum(SP, causative agent of pullorum disease) are very important bacterial pathogens in poultry industry. They share some common antigenic properties though the characteristics of outbreaks are quite different. To discriminate between SG and SP, we developed two rapid diagnostic methods, allele-specific real-time PCR and 3'-tailed PCR over 2 single nucleotide polymorphisms ($237^{th}\;and\;598^{th}$). In both methods, $237^{th}$ allele was found to be a good target for differential diagnosis, while $598^{th}$ allele produced some non-specific reactions.

• Genomics & Informatics
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• 제5권2호
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• pp.61-67
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• 2007

The allele frequencies of markers as well as linkage disequilibrium (LD) can be changed in cases due to the LD between markers and the disease allele, exhibiting spurious associations of markers. To identify the true association, classical statistical tests for dealing with confounders have been applied to draw a conclusion as to whether the association of variants comes from LD with the known disease allele. However, a more direct test considering LD using estimated haplotype frequencies may be more efficient. The null hypothesis is that the different allele frequencies of a variant between cases and controls come solely from the increased disease allele frequency and the LD relationship with the disease allele. The haplotype frequencies of controls are estimated using the expectation maximization (EM) algorithm from the genotype data. The estimated frequencies are applied to calculate the expected haplotype frequencies in cases corresponding to the increase or decrease of the causative or protective alleles. The suggested method was applied to previously published data, and several APOE variants showed association with Alzheimer's disease independent from the APOE ${\varepsilon}4$ variant, rs429358, regardless of LD showing significant simulated p-values. The test results support the possibility that there may be more than one common disease variant in a locus.

• Journal of Nutrition and Health
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• 제29권6호
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• pp.642-650
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• 1996

ApoE 유전자의 다형성은 인체 혈중 콜레스테롤 농도의 정상분포를 설명하는 중요한 인자이다. 특히, E2 와 E4 allele들은 고지혈증환자의 혈중에 현저히 나타나며, 각 다른 인종간의 이틀의 상대빈도수가 관상 동맥 질환 유발 위험도와의 상관관계가 아주 높다. Apo E 유전자의 다형성이 혈중 지질 대사변화 에 미치는 영향에 관한 실험은 105명의 건강한 한국여성을 대상으로 시행되었다. Apo E alleles의 한국 인 상대빈도수는 E3가 0.848, E4가 0.087, 그리고 E2는 0.067이었다. 본 연구에서는 E2/2 표현형이 나 타나지 않았지만, 중국 및 일본인과 같이 E4와 E2 allele가 아주 낮았다 최고및 최저혈압, 맥박(p

• 생명과학회지
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• 제19권2호
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• pp.174-178
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• 2009

본 연구는 2006년 8월경에 어획된 서해, 남해 및 동해 멸치집단을 분석하기 위하여 6종류의 microsatellite로 하였다. 서해멸치의 경우, 샘플수 72마리에 대한 allele 범위가 19-41로 평균 28.5를 보였다. 특히 EJ9 locus에서 평균보다 약 1.4배 많은 41를 나타내었다. 남해멸치의 평균 allele는 24.5로 서해보다는 적었고, EJ2, EJ9, EJ27.1 loci는 평균보다 높은 29-37의 범위를 보였다. 동해멸치는 평균 allele가 25.0으로 EJ35를 제외하면 대부분의 loci에서 평균 이상을 보였다. 그러나 서해, 남해 및 동해멸치의 allele 빈도율은 대부분 0.24 이하로 나타났다. 또한 Hobs보다 Hexp에서 0.5 정도 높은 값을 보였으나 유의성은 없었다(p>0.05). 유전적 다양성도 0.9 이상으로 매우 높은 값을 보였다. 6종류의 microsatellite에 대한 지역간의 유전적 차이 및 거리는 0.258과 0.019로 유의적으로 차이는 없었다 (p>0.05). 따라서 서해, 남해 및 동해 멸치계군은 유전적으로 동일한 집단을 형성하고 있는 것으로 판단된다.

• Journal of Nutrition and Health
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• 제49권4호
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• pp.223-232
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• 2016

Purpose: We investigated the potential interaction between the G-protein beta-3 subunit gene (GNB3) C825T polymorphism, a risk factor for chronic disease in various ethnicities, and obesogenic environments in overweight/obese Korean children. Methods: The present study was conducted as a cross-sectional study using measures of anthropometry, blood pressure (BP), and fasting blood samples as well as 3-day food records. Subjects were recruited from seven elementary schools in an urban district in Seoul, South Korea, between 2007 and 2008. A total of 1,260 children aged 8-9 years were recruited in the study, including 633 boys (50.3%) and 627 girls (49.7%). Results: The allele frequencies of the GNB3 polymorphism were C allele = 49.7% and T allele = 50.3% in subjects. In general, boys with T allele had higher BMI, systolic BP (SBP), and triglycerides, although their energy intake was not significantly different from boys with C allele. In contrast to boys, girls with T allele had lower BMI but higher SBP and energy intake than those with C allele. The girls with T allele had a significantly lower BMI and waist circumference in both the normal weight group and obese group (OB). T allele carriers in both genders had significantly higher TC than C allele carriers in the OB group. At last, girls with T allele in OB appeared to have significantly lower HOMA-IR than those with C allele. Conclusion: Unlike higher risk for negative health outcomes by the GNB3 polymorphism in various ethnicities, GNB3 polymorphism did not influence obesogenic environments in overweight/obese Korean children.

• Journal of Nutrition and Health
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• 제41권8호
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• pp.767-775
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• 2008

1) 연구대상자 중 비만아동 빈도수 분석 결과, BIA법에서는 70.0%, BMI에 의한 비만도에서는 32.7%, 신장별 체중에 의한 비만도에서는 23.6%로 BAI법에 의해 비만아동의 빈도수가 가장 많았다. 혈청 생화화적 분석 결과는 NCEP의 이상지혈증 기준 이하로 나타났다. 2) UCP-1 유전자 다형성에 의한 신체계측의 결과의 분포는 정상형과 변이형에서 차이를 나타내지 않았고 혈중 생 화학 결과에서는 LDL (p = 0.039)과 TC (p = 0.063)이 정상형에 비해 변이형에서 유의적으로 증가하였다. 3) LDL을 130 mg/dL 기준으로 고LDL 콜레스테롤혈증과 정상으로 나누었을 때 각각에서 UCP-1 유전자 다형성의 분포는 고LDL 콜레스테롤혈증에서 A allele는 5.4%, G allele는 13.0%로 G allele의 빈도가 높게 분포하였고, 정상에서는 각각 94.6%, 87%의 분포를 나타내었다 (p = 0.062, ORs 2.640). LDL의 농도를 백분위수에 따라 4집단으로 나누고 UCP-1 유전자의 A allele와 G allele에서 LDL 농도의 빈도수를 나타내었을 때 G allele에서는 빈도수가 25th, 50th, 75th, 100th에 따라 유의적으로 증가하였다 ($r^2$ = 0.7995, p-trend = 0.032). 따라서 UCP-1 유전자 변이형은 정상형에 비해 고LDL-콜레스테롤혈증의 발병을 증가시키는 것으로 나타났다. UCP-1 유전자의 다형성은 이상지혈증의 위험인자인 LDL 농도를 증가시키는 위험요인으로써 나타났고, 체중을 감안할 때는 이상지혈증의 위험도가 더욱 증가할 것으로 생각되어진다. 따라서 UCP-1 유전자 변이형을 가지는 비만아동은 고LDL-콜레스테롤혈증의 발병과 관련된 식이 및 환경적 인자를 적절히 통제하는 예방 대책을 마련하여야겠다.

• 한국동물학회지
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• 제25권3호
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• pp.123-129
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• 1982

한국산 초파리집단의 유전적 특성을 생화학적으로 분석하여 분자유전학적 측면에서 집단 유전학적 체계를 확립하기 위하여 한국산 노랑초파리 (Drosophila melanogaster)의 11개 지역의 자연집단 (청량리, 등촌동, 신촌, 용산, 부천, 춘천, 대전, 대구, 광주, 나주 및 노화도)의 $\\alpha$-glycerophosphate dehydrogenase (\\alpha-GPDH) 인자형을 agarose gel 전기영동법에 의하여 조사 분석한 결과는 다음과 같다. 1. 한국산 노랑초파리 11가지 자연집단에서 $\\alpha$-GPDH allele는 상당한 다형현상을 이루고 있다. 2. $\\alpha$-GPDH allele의 heterozygosity는 $45\\sim50%$로서 상다히 높은 값을 보여주고 있다. 3. $\\alpha$-GPDH allele의 FF 인자형의 빈도는 SS인자형과 비슷하나 FS 인자형보다는 낮은 값을 보이고 있다. 4. $\\alpha$-GPDH allele의 F, S 두인자가 거의 비슷한 빈도를 보이고 있다.

• 생물정신의학
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• 제13권3호
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• pp.170-177
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• 2006

Objectives : Disturbances of serotonergic system might be related to the possible mechanism of social phobia. This study was to investigate the association of serotonin transporter gene and social phobia. Methods : Sixty nine patients with social phobia(51 male(73.9%), mean age $35.17{\pm}11.89$ years) and seventy four normal controls(54 male(73.0%), mean age $33.46{\pm}9.63$ years) were tested for serotonin transporter gene-linked polymorphic region(5-HTTLPR) polymorphism. Additionally, patients were grouped into 46 generalized(GEN) and 23 nongeneralized(NGEN) subgroups and 5-HTTLPR polymorphism was compared with that of normal controls. The genotypes and allele frequencies of the 5-HTTLPR polymorphism between social phobia and the control group were compared. Genomic DNA was extracted from their blood and 5-HTTLPR polymorphisms were determined by using polymerase chain reaction. Results : Significant association was observed between the S(ss) genotype and social phobia, by functional classification(p=.010). In allele frequency analysis, a significant association was also observed between the short allele and social phobia(p=.030). A significant associations between S genotype and each subgroup were observed(GEN p=.045 ; NGEN p=.033), but there were no differences in allele frequency. And, no differences in genotype and allele distribution between two subgroups were found. Conclusion : The results in our Korean sample suggest that S genotype of 5-HTTLPR may be associated with social phobia and s allele may be an important genetic factor that activates social phobic symptoms. But, further studies including large number of samples are necessary to elucidate these present findings.