• Journal of Acupuncture Research
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• 제25권1호
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• pp.139-154
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• 2008

목적 : 홍화(紅花)는 활혈거어(活血祛瘀), 해독지통(解毒止痛)의 효능이 있어 관절염, 동맥경화(動脈硬化), 종양(腫瘍), 월경부조(月經不調), 뇌혈전(腦血栓)에 사용되어 왔다. 이에 홍화약침액(紅花藥鍼液)의 분자생물학적 효능 분석을 하고자 Lipopolysaccharide(LPS)로 염증을 유발한 RAW 264.7 cell의 유전자(遺傳子) 발현(發顯)에 미치는 영향을 Microarray를 통하여 관찰하였다. 방법 : RAW cell을 배양하고 홍화약침액(紅花藥鍼液)의 세포 독성을 확인한 후 (1) LPS, (2) 홍화약침액(紅花藥鍼液), (3) 홍화약침액(紅花藥鍼液)과 LPS를 처치했을 때의 유전자 발현양상을 microarray를 이용하여 관찰하였다. 대조군에 비해 2배 이상 발현의 차이가 있는 경우를 유의한 것으로 보았다. 결과 : 8,170개의 유전자 중 (1) LPS를 처치하였을 경우 35개의 유전자에서 발현이 상승되었고, (2) 홍화약침액(紅花藥鍼液)을 처치하였을 경우 11개의 유전자에서 발현이 상승되고 53개의 유전자에서 발현이 억제되었으며, (3) 홍화약침액(紅花藥鍼液)과 LPS를 동시에 처치하였을 경우에는 47개의 유전자에서 발현이 상승되었고 11개의 유전자에서 발현이 억제되었다. LPS 자극으로 발현이 상승되었지만 홍화약침액(紅花藥鍼液)을 처치할 때 발현이 억제되는 유전자는 SUMO1/sentrin specific protease 7(SENP7), Serine(or cysteine) proteinase inhibitor, clade B(ovalbumin), member 7(SERPINB7), M-phase phosphoprotein, mpp8(HSMPP8), Glycogenin 2(GYG2), InaD-like(Drosophila)(INADL), Copine III(CPNE3), Loss of heterozygosity, 11, chromosomal region 2, gene A(LOH11CR2A), Chromosome 9 open reading frame 33(SHC3), NADH dehydrogenase(ubiquinone) 1 beta subcomplex, 2, 8kDa(NDUFB2)로 9개가 있었다. 요약 : 홍화약침액(紅花藥鍼液)이 LPS로 염증을 유발시킨 RAW 264.7 cell의 유전자 발현에 미치는 영향을 Microarray를 통해 분석하였다. 홍화약침액(紅花藥鍼液)이 LPS로 발현을 항진시킨 35개의 유전자 중 9개를 효과적으로 억제하는 것을 확인하여 염증 치료 기전을 시사하는 유용한 자료를 얻을 수 있었으며 홍화약침액(紅花藥鍼液)이 발현을 항진시킨 유전자들을 통해 혈관생성과 종양억제 등 보다 넓은 범위에 대한 연구가 가능할 것으로 사료된다.

• 한국자연치유학회지
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• 제7권1호
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• pp.20-25
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• 2018

본 연구의 목적은 Salmonella 표준균주 4(ATCC 3종, KCTC 1종)와 분리균주 2종 모두 6종을 대상으로 Thin aggregative fimbriae(박층 응집 섬모)에 해당하는 유전자 csgA와 csgB 를 각각 비교하여 아미노산 돌연변이와 염기서열 돌연변이를 유전자 서열분석법으로 관찰하는 것이었다. 균주들의 유전자 서열을 분석한 후에 분석한 결과는 비교적 적은 아미노산 돌연변이가 관찰되었다. Salmonella csgA 유전자에서는 Ser20→Gly(AGT→GGT), csgB 유전자에서는 Asp25→Ala(GAT→GCT)와 Lys66→Thr(AAA→ACA)으로 각각 아미노산 돌연변이와 뉴클레오티드 서열(nucleotide sequence) 돌연변이가 관찰되었다. Salmonella 6종의 균주에서 S. typhimurium - TH 균주에서 높은 비율인 2개의 아미노산 돌연변이가 관찰되었으며, 반면에 S. typhimurium ATCC 13311 균주와 S. typhimurium KCTC 1925 균주에서는 nucleotide sequence 변이가 관찰되지 않았다. 이상의 결과로 볼 때에 아미노산 돌연변이 탐색연구에 S. typhimurium - TH 균주의 csgA & csgB 유전자는 유전자서열 연구에 유용하다고 판단한다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제16권5호
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• pp.363-368
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• 1988

반합성 베타 락탐 항생물질의 가수분해 및 합성을 촉매하는 효소인 $\alpha$-acylamino-$\beta$-lactam acylhydrolase(ALAH)의 유전자를 Acetobacfer turbidans로부터 클론화하기 위한 연구를 수행하였다. 우선 순수 분리 정제된 효소에 대한 항혈청 (폴리클론 항체)을 제조한 다음 이를 probe로 하여 면역화학적 방법으로 유전자의 선별을 시도하였다. 이러한 용도로 개발된 운반체인 λ gtll에다 A. turbidans의 유전자 단편들을 삽입하여 genomic library를 제조한 후 이 library에서 유전자를 선별한 결과 두개의 positive clone을 얻을 수 있었다. 그러나. 이 두 clone들은 면역화학적으로 서로 다른 반응을 나타내었는데, 그 중 하나는 효소의 항혈청과는 잘 결합하나 융합되어진 베타 갈락토시다아제에 대한 항체와는 잘 결합하지 못하였고(λ gtll dn1), 또 다른 clone 은 이와 반대의 양상을 보여주었다(λ gtll dn2). 더구나 이들 clone을 여러 제한효소들로 분석해본 결과, 유전자가 삽입된 부분인 Eco RI 부위중 하나가 없어진 것을 알 수 있었다. 따라서 A. turbidans의 효소에 대한 유전자가 λ gtll에 클론화 되었으나 이 유전자와 베타 갈락토시다아제의 유전자(lacZ)간에 염기배열상 동위성이 있은 부위가 존재하여 재조합된 λ gtll 파지의 복제과정에서 삭제되어진 것으로 간주되어진다.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• 제21권1호
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• pp.21-26
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• 2006

본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UV150과 UV200을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. 분리한 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선 조사 1시간 후부터 발현이 증가되었다. 또한 알킬화제인 Methyl Methanesulfonate (MMS) 처리에 의해서도 발현이 증가되었다. 이 결과 다른 UV-inducible유전자와는 다르게 분리한 UV150유전자는 UV에 UV200유전자는 MMS에 의하여 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 유전자의 기능을 알기 위하여 URA4 유전자를 이용하여 null-mutant 세포주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 분리한 UV150 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

• 미생물학회지
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• 제47권3호
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• pp.268-274
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• 2011

남조세균 Anabaena (Cyanobacteria, Nostocales)는 담수 생태계에서 녹조 현상을 유발하거나 일부 종은 간독소(hepatotoxin)를 갖고 있어 수질관리 차원에서 주목 받아 왔다. 본 연구는 Anabaena RNA polymerase beta subunit (rpoB) 유전자 염기서열을 규명하였으며, 분류학적 분자 마커로 사용하기 위하여 이들 염기서열의 특성을 평가하였다. Anabaena rpoB 유전자는 16S rRNA 유전자와 비교하여 염기 유사도가 낮으며 유전자 변이가 큰 것으로 분석되었으며, 통계적으로 유의한 차이를 보였다(Student t-test, p<0.01). Parsimony 분석을 통해 rpoB 유전자가 4.8배의 속도로 빠르게 진화하는 것으로 파악되었다. 또한 rpoB 유전자 phylogeny 분석에서 16S rRNA tree보다 높은 해상도로 Anabaena 균주를 명확하게 구분해 주었다. 본 연구 결과는 Anabaena의 종 식별, 분자계통 분류, 분자적 검출을 위해 rpoB 유전자가 매우 효과적이라는 것을 제시해 준다.

• 정보처리학회논문지B
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• 제18B권3호
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• pp.157-164
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• 2011

본 논문은 유전자 알고리즘을 이용해서 동적으로 변하는 네트워크상에서 빠르게 최단 경로를 재탐색할 수 있는 알고리즘을 제안한다. 제안 알고리즘은 다익스트라 알고리즘과 유전자 알고리즘을 통합한 형식의 알고리즘이다. 이 제안 알고리즘은 최초 탐색 시 다익스트라(Dijkstra) 알고리즘을 이용해서 유전자 알고리즘의 초기화 과정을 용이하게 하는 선행자 배열을 정의한다. 그 후 유전자 알고리즘은 적절한 유전 연산자를 통해 동적으로 변하는 트래픽 상황에서 최적의 경로를 재탐색한다. 실험 결과를 통해 제안 알고리즘이 거대한 네트워크 데이터에 대해서 다른 유전자 알고리즘 기반의 최단경로 찾기 알고리즘이나 다익스트라 알고리즘보다 적은 계산시간으로 더 짧은 주행시간의 경로를 제시한다는 것을 보였다.

• 미생물학회지
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• 제42권2호
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• pp.153-155
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• 2006

mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 관여하는 발아효모 Saccharomyces cerevisiae의 SAC3유전자와 유사한 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 유전자 (spSac3로 명명)의 결실돌연변이주 (knockout mutant)를 제조하여 그 특성을 조사하였다. S. pombe의 이배체 (diploid) 균주에서 한 spSac3 유전자만을 결실시킨 후 4분체분석 (tetrad analysis)을 수행한 결과, 이 유전자는 성장에 필수적이었다. 또한 in situ hybridization을 통해 세포 내의 poly(A)+ RNA분포를 살펴본 결과, spSac3 유전자의 결실돌연변이주는 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 이상이 있었다. 이와 같은 결과들은 spSac3 유전자 역시 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 매우 중요한 역할을 담당하고 있음을 시사한다.

• 미생물학회지
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• 제31권3호
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• pp.197-202
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• 1993

출아법으로 분열하는 S. cerevisiae 는 mother cell 과 bud cell 과의 연결부위근처의 원형질막 내부에 10-nm filament ring 이 존재한다. CDC3, CDC10, CDC11, CDC12 유전자가 이 filament 를 암호화할 가능성이 많은 것으로 알려져 있으며, 근래에 CDC3 와 CDC12 유전자의 생성물들이 filament ring 에 존재한다는 것이 형광현미경을 이용하여 밝혀졌으나 그 기능은 밝혀지지 않았다. 이에 본인은 10-nm filament ring 의 지능을 알아보기 위하여 ring을 이루고 있는 S. cerevisiae 의 CDC3유전자와 유사한 S. pombe 유전자의 clone 을 시도하였다. 이를 위하여 .lambda. gt11 expression vector 에 S. pombe genomic library 를 만들고 CDC3 항채를 이용하여 screen 하였다. Screen 된 유전자를 sequencing 하여 본 결과, 2개 이상의 intron 이 존재하는 것이 밝혀졌으나, 일부 부위의 아미노산 서열과 CDC3 아미노산 서열을 비교하여 본 결과, 약 62%의 유사성이 존재하였다.

• 한국발생생물학회:학술대회논문집
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• 한국발생생물학회 2001년도 전기 제11차 학술대회 논문집
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• pp.35-37
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• 2001

인간 Lactadherin은 비유 개시와 동시에 mammary gland의 epithelial cell에 의해 생성되는 46 Kd의 glycoprotein이다. 이 단백질은 성장기 어린이의 diarrheal disease의 원인이 되는 rotavirus에 specific하게 결합하여 그 증식을 억제시켜서 바이러스성 설사를 예방한다. 본 연구에서는 한국 여성의 lactadherin gene을 cloning 하여 그 sequence를 분석 비교하고 서양 여성과의 유전자 변이를 조사하였다. 보고된 서양 여성의 lactadherin 유전자와 비교하여 한 여성의 유전자에는 silent mutation을 포함하여 3 곳의 mutation이 있었고, 또 다른 여성의 유전자에서 새로운 3 곳의 mutation이 존재하여 이 유전자의 SNP가 여러 곳에 산재되어 있음이 관찰되었다.

• 생명과학회지
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• 제5권4호
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• pp.211-217
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• 1995