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3D Structure of STAM1 UIM-ubiquitin Complex Using RosettaDock

  • Lim, Jong-Soo;Yi, Jong-Jae;Ahn, Hee-Chul;Rhee, Jin-Kyu;Son, Woo-Sung
    • 한국자기공명학회논문지
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    • 제15권1호
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    • pp.80-89
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    • 2011
  • 3D structures of STAM1 UIM-ubiquitin complex were presented to predict and analyze the interaction between UIM and ubiquitin. To generate the protein-peptide complex structure, the RosettaDock method was used with and without NMR restraints. High resolution complex structure was acquired successfully and evaluated electrostatic interaction in the protein-peptide binding with several charged residues at the binding site. From docking results, the Rosettadock method could be useful to acquire essential information of protein-protein or protein-peptide interaction with minimal biological evidences.

보조벡터기로를 사용한 토양수리계수 추정을 위한 로제타 개관 (Overview of Rosetta for Estimation of Soil Hydraulic Parameters using Support Vector Machines)

  • 정덕영
    • 한국토양비료학회지
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    • 제42권Spc호
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    • pp.8-13
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    • 2009
  • 심층토 내에서의 흐름과 이동과정을 포함하는 연구와 관리 측면에서 수학모델에 대한 관심도가 점점 증가하고 있다. 로제타는 토성이나 용적밀도 자료와 같은 대체 토양자료로부터 불포화수리특성에 대한 자료를 추정하는 프로그램이다. 이와 같은 형태의 모델은 애초 기본 토양자료를 수리특성자료로 전환하기 시작한 이래 대체 측정수단으로서 PTF라 불리워졌다. 이러한 기능은 유사-실험모델을 사용하여 예측한 자료를 근간으로 하여 직간접적으로 토양수분을 추정할 수 있다.

열가압 리튬 디실리케이트 전장도재와 지르코니아 하부구조의 전단결합강도 평가 (Adhesion between heat-pressed lithium disilicate veneer and zirconia framework: Shear bond strength evaluation)

  • 김재홍
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제21권3호
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    • pp.335-341
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    • 2020
  • 본 연구의 목적은 shear bond strength을 이용하여 pressed lithium disilicate 전장도재와 zirconia core의 접착을 비교 분석하는 것이다. Zirconia blank(Zirtooth, HASS, Gangneung, Korea)에 각 pressed ceramic(IPS e.max Zirpress, Vita PM9, GC Initial IQ, HASS Rosetta UP)이 적용된 시편을 제작하였다(N=40). 전단결합강도를 비교 평가하기 위해 The Schmitz-Schulmeyer test method을 이용하였고 산출된 파괴하중의 값을 분석했다. 산출된 네 가지 전단결합강도 값들 간의 평균 비교는 일원분산분석(one-way ANOVA)을 통해 이루어졌고, Tukey의 사후검정을 실시하여 서로 간의 평균 차이가 통계적으로 유의함을 검증하였다. 또 파절면의 3D 분석을 통하여 파괴 표면을 관찰하여, 그 파괴 양상도 분류하였다. 실험군별 전단결합강도는 IPS e.max Zirpress 16.69±3.11MPa, VITA PM9 14.21±3.63MPa, GC Initial IQ 11.17±2.92MPa, HASS Rosetta SM 27.90±5.71MPa이었으며, Lithium disilicate ceramic veneer(HASS Rosetta SM)의 결합 강도는 다른 제품들보다 통계적으로 유의하게 높았다(p<0.05). 또, 파괴면의 유형 분류 결과, 모든 시편에서 cohesive 파괴는 관찰되지 않았고 주로 adhesive와 cohesive가 같이 조합된 파괴 유형이 관찰되었다. 본 연구 결과에 의해서 pressed lithium disilicate 전장도재가 기존의 pressed to zirconia system보다 나은 접착력을 보여주었다.

Aspergillus niger의 Epoxide Hydrolase 고효율 발현 및 라세믹 에폭사이드의 입체선택적 가수분해 (Enhanced Heterologous Expression of Aspergillus niger Epoxide Hydrolase and Its Application to Enantioselective Hydrolysis of Racemic Epoxides)

  • 이수정;김희숙;이은열
    • 공업화학
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    • 제17권5호
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    • pp.557-560
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    • 2006
  • Aspergillus niger LK의 epoxide hydrolase (EH)를 codon usage를 고려한 Escherichia coli 균주에서 고효율로 발현할 수 있었다. E. coli에서 잘 사용되지 않는 rare codon에 대한 tRNA 유전자 정보가 들어있는 plasmid를 함유한 E. coli 균주인 Rosetta (DE3)PLysS를 숙주세포로 사용하였다. A. niger EH를 발현시킨 재조합 E. coli를 생촉매로 사용하여 라세믹 styrene oxide 혼합물과 반응시켰을 때, (R)-styrene oxide에 대한 입체선택적 가수분해활성이 향상됨을 확인할 수 있었다. 또한 라세믹 기질로부터 입체적으로 고순도인 99% ee 값을 갖는 광학적으로 순수한 (S)-styrene oxide를 얻을 수 있었다.

전자상거래 통합을 위한 XML 매핑 정형화 기법 (A Method of XML Mapping Canonicalization for E-Business Integration)

  • 안우영;홍창범
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제9권1호
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    • pp.1-8
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    • 2004
  • XML을 핵심 기술로 사용하는 RosettaNet이나 BizTalk 등의 다양한 전자상거래 프레임워크들이 생겨나기 시작하면서 프레임워즈들은 각자의 표준에 따라 파트너간에 비즈니스 프로세스를 수행하게 된다. 이러한 프레임워크간의 상이함은 전자상거래시 기업 간의 문서의 다양성으로 인하여 문서 교환에 어려움이 따르게 된다. 본 논문에서는 XML문서의 정보를 추출 단계를 거쳐 문서정보를 기반으로 매핑 정보를 생성한 후 문서간의 매핑룰을 적용하여 변환할 수 있도록 설계하였다. 따라서 전자상거래 프레임워크 간 정보의 손실 없이 상호 문서 교환이 가능할 뿐만 아니라 신뢰할 수 있는 교환이 가능하다.

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E-Transformation from EDI to Web-based B2B Frameworks

  • Kim, Minsoo;Ock, YoungSeok;Kim, Dongsoo
    • Industrial Engineering and Management Systems
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    • 제7권2호
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    • pp.150-159
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    • 2008
  • Lots of EDI-VAN companies are in need of transforming their business transaction systems into Web-based e-Business frameworks because of high cost and closed structure of EDI systems. This research proposes several e-Transformation strategies for EDI-VAN companies to adopt Web-based e-Business frameworks such as ebXML and RosettaNet. Four transformation alternatives are presented and transformation procedure for a medium-sized company is described. The result of this work can be used as a practical guideline for EDI companies to develop their own transformation strategy suitable to its scale and capability, while minimizing the impacts on the pre-existing business processes and information systems.

Rhodotorula glutinis의 epoxide hydrolase 고효율 발현 유전자 재조합 Escherichia coli 생촉매 개발 (Development of Recombinant Escherichia coli Expressing Rhodotorula glutinis Epoxide Hydrolase)

  • 이수정;김희숙
    • 생명과학회지
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    • 제16권3호
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    • pp.415-419
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    • 2006
  • 방향족 에폭사이드 기질에 대한 입체선택적 가수분해능이 우수한 Rhodotorula glutinis의 epoxide hydrolase (EH)를 codon usage를 고려한 Escherichia coli 균주에서 고효율로 발현할 수 있었다. 효모인 R. glutinis와 박테리아인 E. coli에서의 codon usage 선호도를 분석하고 그 차이를 고려하여 E. coli 에서 잘 사용되지 않는 rare codon에 대한 tRNA유전자정보가 들어 있는 pRARE plasmid를 함유한 E. coli 균주인 Rosetta(DE3)pLysS를 숙주세포로 사용하였다. R. glutinis EH를 발현시킨 재조합 E. coli를 생촉매로 사용하여 라세믹 styrene oxide 혼합물과 반응시켰을 때, (R)-styrene oxide에 대한 입체선택적 가수분해활성이 wild type R. glutinis 대비 매우 향상됨을 관찰할 수 있었다. 또한 라세믹 기질로부터 입체적으로 고순도인 99% ee 값을 갖는 광학적으로 순수한 (S)-styrene oxide를 얻을 수 있었다.

제조 기업의 대응성 향상을 위한 로제타넷 기반 비즈니스 통합 모델 (RosettaNet based Business Integration Model for Enhancing Manufacturing Firm's Responsiveness)

  • 박목민;박정호;신기태;박진우
    • 한국전자거래학회지
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    • 제15권1호
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    • pp.89-101
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    • 2010
  • 치열한 글로벌 경쟁에서 기업의 경쟁력이 제품 측면에서 점차 서비스 측면으로 옮겨가고 있다. 이는 치열한 경쟁 상황 등으로 인해 제품 생산 비용이나 제품의 품질에서 차별화를 확보하기 힘들어지고 수요의 불확실성과 동적인 시장 상황으로 인해 점차 유연성과 대응성 등 서비스 측면이 차별화 요인으로 대두되고 있기 때문이다. 기업의 유연성과 대응성은 기업의 판매주문처리를 통해 다른 기업들에게 평가된다. 따라서 기업은 판매주문처리에 관심을 가져야 한다. 그러나 기존의 판매주문처리 관련 연구들은 주로 생산 비용을 최소화하기 위한 납기 결정과 생산 일정 수립 및 납기 준수를 위한 리드타임 결정에 비중을 두고 있다. 이는 지금까지 판매주문처리 관련 연구들이 대상으로 하는 목적함수가 비용 관련 요소에 비중을 두고 있었으며, 유연성과 대응성 향상을 위한 고객과의 유연하면서 긴밀한 연결 비용과 실시간 주문 관련 정보 취득 비용이 높았기 때문이다. 그러나 정보 기술(IT)과 유비쿼터스 기술(UT)의 발전으로 점차 연결성과 가시성 확보와 관련한 비용이 줄었으며 기술적으로 구현 가능해지고 있다. 본 연구에서는 정보 기술과 유비쿼터스 기술의 발전으로 인해 변화된 기업의 판매주문관리에서의 유연성과 대응성 향상을 위해 납기를 재협의하는 프로세스와 이를 지원하기 위해 로제타넷 PIP(Partner Interface Process) 기반의 비즈니스 통합 모델을 제안하고자 한다.