• 한국환경과학회지
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• 제8권2호
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• pp.205-209
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• 1999

Iron hydroxides are good adsorbents for uncomplexed metals, some metal-ligand complexes and many metal oxyanions. However, their adsorption properties of these precipitations are not fully exploited in wastewater treatment operations because of difficulties associated with their separation from the aqueous phase. This study describes experiments in which iron hydroxides were coated onto the surface of ordinary adsorbents(Sea sand) that are very resistant to acids, The coated adsorbents were used in adsorption of oxyanionic metals. The process was successful in removing some anions such as $SeO_3(-II)$ over a wide range of metal concentrations and sorption of oxyanionic metals increased with decreasing pH. Formation of two surface complexes for oxyanionic metals adsorption on iron hydroxides comprise (1) complexation of the free anion by a positively charged surface site, and (2) protonation of the adsorbed anion (or alternatively adsorption of a protonated form from solution) The coated adsorbents are inexpensive to prepare and could serve as the basis of a useful oxyanionic metal removal.

• 미생물학회지
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• 제48권3호
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• pp.187-191
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• 2012

Two component system (TCS)인 ZraS/R 및 CusS/R의 zraP와 cusC 유전자의 프로모터에 의해 green fluorescent protein (GFP)이 발현되도록 제작된 박테리아 바이오센서의 성능을 인공폐수에서 평가하였다. 제작된 박테리아 바이오센서는 실제 폐수를 모사한 인공폐수에서도 시료 중의 $Zn^{2+}$와 $Cu^{2+}$를 인지하여 GFP를 효율적으로 발현시키는 것을 확인할 수 있었다. 두 번째는 세포 표면에 금속 친화성 펩타이드가 표현되도록 제작된 구리 및 아연 제거 박테리아를 인공폐수 조건에서 평가하였다. 제작된 박테리아는 각각 ZraS/R 및 CusS/R TCS에 의해 주변의 $Zn^{2+}$와 $Cu^{2+}$를 인지하여 세포 표면에 OmpC-ZBP와 OmpC-CBP 융합 단백질을 발현시키는 시스템이다. 실험을 통해 표면에 금속 흡착 펩타이드가 발현된 재조합 균은 인공폐수 조건에서도 효과적으로 구리 및 아연을 흡착시키는 것을 확인하였다. 따라서 본 연구에서 개발된 TCS 기반 재조합 균은 인공폐수 조건에서 중금속의 인지 및 제거 기능이 효과적으로 작동하는 것이 확인되었다.

• 대한의생명과학회지
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• 제14권1호
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• pp.47-53
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• 2008

Hox genes are known to be transcription factors controlling vertebrate pattern formation along the anteroposterior body axis by regulating many target gene expressions during vertebrate embryogenesis. In order to isolate in vivo Hox responsive target genes, ChIP-cloning technique has been applied using Hoxc8 antibody. Here murine embryo of day 11.5 post coitum (E11.5) highly expressing Hoxc8 gene was used after removing head and tail portions where Hoxc8 is rarely expressing. After fixation with formaldehyde, the chromatin DNAs harboring bound proteins were isolated. After sonication, about 0.5- to 1 Kb chromatin DNAs were immunoprecipitated with anti Hoxc8 antibody. After removing the bound proteins with proteinase K, DNAs were isolated, cloned into the pBluescsript II SK vector, and then sequenced. Total 33 random clones sequenced were anlalyzed to be located at 12 different genomic regions. Among these, 8 turned out to be introns and 4 were intergenic regions localized in random chromosomes. The base composition of total cloned genomic sequences (6608 bp) were AT-rich, i.e., 40% GC. When the Hoxc8 core binding sites, such as TAAT, ATTA, TTAT, and ATAA were analyzed total number of 55, 45, 54, and 55 were found, respectively, which are than twice as many as expected number of 26. Although this in silico analysis does not mean that the ChIP-cloned sequence is real Hoxc8 regulatory element in vivo, these results strongly imply that the DNA fragments cloned through chromatin immunoprecipitation could be very much likely the putative Hoxc8 downstream target genes.

• 한국통신학회논문지
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• 제28권12A호
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• pp.964-974
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• 2003

계층적 이동 IPv6는 MAP(Mobility Anchor Point)을 통해 이동 IPv6를 계층적으로 확장시킨 개념의 마이크로 망 지원의 프로토콜로 이동 IPv6에 비해 빠른 이동성과 이동 노드의 데이터 전송 지연을 줄여주지만 네트워크망에서 동작하는 활동상태 노드와 비활동상태 노드를 구분하여 망의 부하와 노드의 전력낭비 문제를 해결해 주는 페이징 기법이 적용되어 있지 않기 때문에 본 논문에서는 계층적 이동 IPv6에 페이징을 적용하는 방법 제안하였다. 기존 IPv6에서 사용되는 패킷 해더의 목적지 옵션과 제어 메시지의 확장을 통해서 계층적 이동 IPv6에 페이징을 적용하였으며 비활동 상태의 이동 노드를 찾는 알고리즘으로 최종 지역 알고리즘을 사용하였다. 시뮬레이션 결과 제안된 방법은 기존의 페이징이 적용되지 않은 계층적 이동 IPv6보다 비활동 상태인 이동 노드의 핸드오프 시 불필요한 바인딩 업데이트 메시지를 제거함으로써 이동 IPv6 전체 망의 트래픽을 줄일 수 있음을 확인할 수 있었다. 또한 페이징 영역의 크기가 클수록 마이크로 망의 바이딩 업데이트 메시지가 더욱 감소하여 망의 신호 트래픽이 감소함도 알 수 있었다.

• 한국가축번식학회지
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• 제25권2호
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• pp.163-169
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• 2001

본 연구는 마우스 정자-난자 결합분석 법(oocytes-sperm binding assay; OSBA)을 이용하여 단백질원, 배양액의 질, 난자의 성숙도에 따라서 정자와 난자의 결합능력을 알아보고 그 유용성을 알아보기 위하여 실시하였다. 4~5주령의 hybrid(C57BL/6 $\times$ CBA/N) F$_1$ 암컷에서 회수된 미수정란에 0.1% hyaluronidase를 이용하여 난구세포를 제거하였으며, 제1극체의 존재유무에 따라 Met. II(mature)와 Met. I(intermediate mature)로 구분하였다. 암컷과 동일 계통의 8주령 이상 된 수컷에서 회수된 정소상체 미부정자를 37$^{\circ}C$에서 10분간 배양하였다. 배양된 정자부유액은 단백원 무첨가배양액과 1:5로 희석하여 10분간 배양한 다음 3 ${\mu}\ell$를 10$\pm$2개의 난자를 들어있는 배양액 소적(30 ${\mu}\ell$)에 넣어서 정자와 난자의 결합을 유도하였다. 정자 주입 후 3시간 혹은 24시간째에 난자를 뽑아내어 세척하였으며, 도립현미경(100$\times$)에서 난자에 부착된 정자의 수를 세었다. 수정란을 이용한 정도관리를 위하여 과배란이 유도된 암컷은 수컷과 합사시켰으며, hCG 주사 16~18시간째에 전핵기의 1세포 수정란을 회수하였다. 단백질원의 종류에 대한 효과를 확인하기 위하여 OSBA를 실시한 결과, 수정 3시간째에 난자당 하나 이상의 정자가 부착된 난자의 비율은 BSA첨가군, 무첨가군, FBS 첨가군의 순으로 유의한 차이를 나타내었다(100% vs. 60.2% vs. 2.1%). 한편, BSA 첨가군에서 정자의 결합능력이 우수하였으나 FBS는 매우 유해하였으며 FBS의 농도가 5%까지는 증가함에 따라 유의한 차이를 나타내었다. 따라서 투명대에 정자가 부착에 있어서 단백원이 매우 중요한 역할을 하며, OSBA는 정자와 난자의 결합에 결정적인 영향을 미칠 수 있는 배양조건을 명확히 판별할 수 있음을 시사하였다. Met. II(mature)와 Met. I(intermediate mature) 난자를 단백원 무첨가, 15% FBS, 0.4% BSA 및 10% AF(양수)가 첨가된 Ham's F-10 배양액에서 OSBA를 실시한 결과, 난자의 성숙도에 상관없이 정자의 결합능력은 비슷한 양상을 보였으며, BSA첨가군, 양수첨가군, 무첨가군, FBS첨가군 순으로 높게 나타났다. 이러한 결과는 OSBA에서 Met. II 난자 대신에 Met. I난자를 이용해도 비슷한 결과를 얻을 수 있음을 시사한다. 생쥐 1세포기배에서 배반포까지의 배발달율을 기준으로 Ham's F-10배양액을 평가하여 일련번호 151은 불량(poor), 152는 양호(good)로 판정한 다음, 동일한 배양액에 OSBA를 실시한 결과 생쥐 1세포기배의 결과와 마찬가지로 일련번호 152 배양액이 151 배양액보다 유의하게 높게 나타났다. 따라서 OSBA는 기존의 정도관리 방법과 동일한 효과를 기대할 수 있을 것이다. 결론적으로, OSBA는 배양액 조건에 따라 정자의 결합능력이 다르다는 것을 보여주었으며, 정토관리 방법으로서의 유용성을 확인시켜 주었다. 또한 쉽게 준비할 수 있는 생쥐의 난자와 정자를 이용하였으며, 배양시간이 3시간으로 짧고, 평가방법이 간편해 시간적, 경제적으로도 효율성이 높다고 사료된다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제33권9호
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• pp.3048-3054
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• 2012

The use of aspirin is widely recommended for the prevention of heart attacks owing to its ability to inhibit platelet activation by irreversibly blocking cyclooxygenase 1. However, aspirin also affects the fibrinolytic and hemostatic pathways by mechanisms that are not well understood, causing severe hemorrhagic complications. Here, we investigated the ability of aspirin and aspirin metabolites to inhibit thrombin-activatable fibrinolysis inhibitor (TAFI), the major inhibitor of plasma fibrinolysis. TAFI is activated via proteolytic cleavage by the thrombin-thrombomodulin complex to TAFIa, a carboxypeptidase B-like enzyme. TAFIa modulates fibrinolysis by removing the C-terminal arginine and lysine residues from partially degraded fibrin, which in turn inhibits the binding of plasminogen to fibrin clots. Aspirin and its major metabolites, salicylic acid, gentisic acid, and salicyluric acid, inhibit TAFIa carboxypeptidase activity. Salicyluric acid effectively blocks activation of TAFI by thrombin-thrombomodulin; however, salicylates do not inhibit carboxypeptidase N or pancreatic carboxypeptidase B. Aspirin and other salicylates accelerated the dissolution of fibrin clots and reduced thrombus formation in an in vitro model of fibrinolysis. Inhibition of TAFI represents a novel hemostatic mechanism that contributes to aspirin's therapy-associated antithrombotic activity and hemorrhagic complications.

• 한국재료학회지
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• 제28권7호
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• pp.376-380
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• 2018

Microalgae produce not only lipids for biodiesel production but also valuable biochemicals which are often accumulated under cellular stress mediated by certain chemicals. While the microcarriers for the application of drug delivery systems for animal cells are widely studied, their applications into microalgal research or biorefinery are rarely investigated. Here we develope dual-functional magnetic microcapsules which work not only as flocculants for microalgal harvesting but also potentially as microcarriers for the controlled release of target chemicals stimulating microalgae to enhance the accumulation of valuable chemicals. Magnetic microcapsules are synthesized by layer-by-layer(LbL) coating of PSS-PDDA on $Fe_3O_4$ nanoparticle-embedded $CaCO_3$ microparticles followed by removing $CaCO_3$ sacrificial templates. The positively charged magnetic microcapsules flocculate microalgae by electrostatic interaction which are sequentially collected by the magnetophoretic separation. The microcapsules with a polycationic outer layer provide efficient binding sites for negatively charged microalgae and by that means are further utilized as a chemical-delivery and flocculation system for microalgal research and biorefineries.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제30권12호
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• pp.1919-1926
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• 2020

CRISPR interference (CRISPRi) has been developed as a transcriptional control tool by inactivating the DNA cleavage ability of Cas9 nucleases to produce dCas9 (deactivated Cas9), and leaving dCas9 the ability to specifically bind to the target DNA sequence. CRISPR/Cas9 technology has limitations in designing target-specific single-guide RNA (sgRNA) due to the dependence of protospacer adjacent motif (PAM) (5'-NGG) for binding target DNAs. Reportedly, Cas9-NG recognizing 5'-NG as the PAM sequence has been constructed by removing the dependence on the last base G of PAM through protein engineering of Cas9. In this study, a dCas9-NG protein was engineered by introducing two active site mutations in Cas9-NG, and its ability to regulate transcription was evaluated in the gal promoter in E. coli. Analysis of cell growth rate, D-galactose consumption rate, and gal transcripts confirmed that dCas9-NG can completely repress the promoter by recognizing DNA targets with PAM of 5'-NGG, NGA, NGC, NGT, and NAG. Our study showed possible PAM sequences for dCas9-NG and provided information on target-specific sgRNA design for regulation of both gene expression and cellular metabolism.

• Molecules and Cells
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• 제45권11호
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• pp.792-805
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• 2022

Repairing damaged DNA and removing all physical connections between sister chromosomes is important to ensure proper chromosomal segregation by contributing to chromosomal stability. Here, we show that the depletion of non-SMC condensin I complex subunit H (NCAPH) exacerbates chromosome segregation errors and cytokinesis failure owing to sister-chromatid intertwinement, which is distinct from the ultra-fine DNA bridges induced by DNA inter-strand crosslinks (DNA-ICLs). Importantly, we identified an interaction between NCAPH and GEN1 in the chromatin involving binding at the N-terminus of NCAPH. DNA-ICL activation, using ICL-inducing agents, increased the expression and interaction between NCAPH and GEN1 in the soluble nuclear and chromatin, indicating that the NCAPH-GEN1 interaction participates in repairing DNA damage. Moreover, NCAPH stabilizes GEN1 within chromatin at the G2/M-phase and is associated with DNA-ICL-induced damage repair. Therefore, NCAPH resolves DNA-ICL-induced ultra-fine DNA bridges by stabilizing GEN1 and ensures proper chromosome separation and chromosome structural stability.

• 생명과학회지
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• 제18권7호
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• pp.940-946
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• 2008

신경전달물질을 수송하는 신경전달물질 수송체는 연접전막에서 신경전달물질의 농도를 조절한다. 신경세포에 발현하는 GATs들은 연접에서 억제성 신경전달물질인 GABA의 재흡수에 관여한다. GAT2/BGT1가 어떻게 연접전막에 안정적으로 존재하는지, 어떤 결합단백질과 결합하여 조절을 받는지는 알려져 있지 않다. 본 연구에서 효모 two-hybrid system을 사용하여 GAT2의 C-말단과 특이적으로 결합하는 mammalian Lin-7 (MALS)-2을 분리하였다. GAT2의 C-말단에 존재하는 "T-X-L"아미노산 배열이 MALS-2와의 결합에 필수적으로 관여하였다. 또한 이 단백질간의 결합을 pull-down assay로 확인한 결과 MALS는 glutathione S-transferase (GST)와는 결합하지 않으나 GST-GAT2와는 결합하였다. 또한 생쥐의 뇌 균질액에서 GAT2는 MALS와 함께 침강함을 면역침강으로 확인하였다. 이러한 결과들은 MALS가 GAT2와 결합하여 GAT2를 연접전막에서 안정화시키는 역할을 함을 시사한다.