• 제목/요약/키워드: Redundant Resources

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EST-based Identification of Genes Expressed in the Muscle of Olive Flounder, Paralichthys olivaceus

  • Park, Eun-Mi;Kim, Young-Ok;Nam, Bo-Hye;Kong, Hee Jeong;Kim, Woo-Jin;Lee, Sang-Jun;Choi, Tae-Jin
    • 한국해양바이오학회지
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    • 제2권3호
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    • pp.168-173
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    • 2007
  • of expressed sequence tags (ESTs) is an efficient approach for gene discovery, expression profiling, and development of resources useful for functional genomics. To analyze the transcriptome of olive flounder, Paralichthys olivaceus, we have conducted EST analysis using cDNA libraries made from muscle of P. olivaceus. Redundant ESTs were assembled into overlapping contigs by using the assembly program ICAtools software. We found that the 221 ESTs were composed of 21 clusters and 35 singletons, suggesting that the overall redundancy of the library was 74.7%. Of the 221 clones, 218 clones (98.6%) were identified as known genes by BLAST searches and 3 clones (1.4%) did not match to any previously described genes. Based on major functions of their encoded proteins, the identified clones were classified into 13 broad categories. Sequence analysis of the ESTs revealed the presence of microsatellite-containing genes which may be valuable for further gene mapping studies. This study contributes to the identification of many EST clones that could be useful for genetics and developmental biology of olive flounder.

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NSIS 프로토콜을 이용한 사전자원예약 방안 (A Pre-Resource Reservation Mechanism using NSIS protocol)

  • 김선영;변해선;이미정
    • 한국정보과학회논문지:정보통신
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    • 제35권6호
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    • pp.538-548
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    • 2008
  • IETF(Internet Engineering Task Force) NSIS(Next Step in Signaling) 워킹그룹에서는 MN(Mobile Node)의 핸드오버로 인해 데이타 전달 경로가 변경된 경우, 이전 경로와 새로운 경로가 분기 또는 통합되는 지점에 있는 노드인 CRN(Crossover Node)을 발견하는 방안을 제안하였다. 이 방안에서는 CRN 발견을 통해 새로운 경로 상에 자원예약 시그널링 지연을 줄이고 이전 경로와 새로운 경로의 공통경로 상에 중복 자원예약을 피함으로써 핸드오버 이후의 자원예약을 효율적으로 수행한다. 그러나 MN이 핸드오버하는 동안 지속적으로 QoS(Quality of Service)를 보장받기 위해서는 핸드오버 이전에 새로운 경로 상의 사전자원예약이 이루어져야 한다. 그런데 아직 핸드오버하지 않은 MN이 새로운 경로 상에 사전자원예약을 수행하려는 경우에는 기존의 CRN 메커니즘을 적용하기 어렵다. 이에 본 논문에서는 현재 자인이 예약된 경로와 MN이 핸드오버 할 가능성이 있는 하나 이상의 지역의 새로운 경로 상에 CRN이 될 가능성이 있는 노드인 PCRN(Passive Crossover Node)을 발견하고, 이후 새로운 경로 상에 사전자원예약을 수행하는 방안을 제안한다.

네트워크 이동성을 위한 자원 관리 구조의 설계와 분석 (Design and Analysis of Resource Management Architecture for Network Mobility)

  • 백은경;조호식;최양희
    • 한국통신학회논문지
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    • 제29권7B호
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    • pp.628-640
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    • 2004
  • 이동 네트워크는 네트워크 단위로 이동하는 구조로서, 이동 라우터에 연결된 이동 노드들의 이동을 통합하여 관리한다. 이동 네트워크 내의 노드들은 이동 라우터를 통하여 인터넷과 무선 연결되며, 모든 통신이 이동 라우터를 거쳐서 이루어지므로, 이동 라우터에서의 대역폭 관리 및 신뢰성 제공이 중요하다. 또한 이동 네트워크는 이동한다는 본질적 특성에 의하여 내부의 모든 노드들에 대한 위치 관리 및 이에 따른 전력 소비 관리를 필요로 한다. 본 논문에서는 자동차나 기차와 같은 운송체에 구성되는 이동 네트워크에서의 전력 및 대역폭 자원을 효율적으로 관리하기 위한 기법을 제안한다. 제안하는 기법은 이동 네트워크가 구성되는 운송체와 승객의 이동 특성을 이용하여, 불필요한 위치 관리 신호를 생략함으로써 전력을 절약한다. 또한 다중 이동 라우터를 이용한 멀티호밍기법에 의하여 대역폭 자원을 관리한다. 제안한 전력 관리 기법을 수학적으로 분석한 결과는 정지 상태의 이동기기 뿐 아니라 활성 상태의 이동 기기 전력도 현저하게 절약할 수 있음을 보인다. 제안한 다중 이동 라우터 선택 기법에 대한 시뮬레이션 결과는, 이 기법이 기존의 단순 라우터 중복 구조에 비하여 무선 대역폭 자원을 효율적으로 활용함을 보여준다.

커뮤니티 그룹 통신을 위한 효율적인 데이터 전달 트리 구성 방안 (An Efficient Scheme to Create Data Delivery Tree for Community Group Communication)

  • 오제준;강남희;김용혁;김영한
    • 대한전자공학회논문지TC
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    • 제44권10호
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    • pp.55-63
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    • 2007
  • 멀티캐스트는 커뮤니티 기반의 그룹 통신에 효과적인 전달 수달이 되고, MANET은 최근 유비쿼터스 컴퓨팅을 지원하는 하부 네트워킹 기술로 주목받고 있다. 하지만 MANET은 한정된 무선 채널 자원 및 이동노드들의 제한된 에너지 용량과 같은 문제를 가지고 있으므로 멀티캐스트 메커니즘을 적용 할 경우 이러한 사항들이 충분히 고려되어야 한다. 이를 해결하기 위해 기존 MANET에서의 여러 멀티캐스트 프로토콜들이 제안되었다. 특히 최근 제안되고 있는 응용 계층에서의 오버레이 멀티캐스팅 기술은 네트워크 계층에서의 멀티캐스팅보다 많은 장점을 제공하고 있다. 하지만 여전히 데이터 전달시 많은 불필요한 전송이 일어난다. 이는 네트워크의 자원을 낭비할 뿐만 아니라 전달하는 노드들의 에너지 소모를 가중시킴으로써 네트워크 성능 저하를 가져온다. 본 논문에서는 이러한 불필요한 전송을 없애기 위해 분기 노드를 제안하고 이를 통해 효율적인 멀티캐스트 데이터 전달 구조를 생성하는 방안을 제안한다. 네트워크 시뮬레이션을 통한 검증결과 제안하는 방안은 기존 방안 대비 패킷 전달율이 향상되었고 전송 비용은 감소했다.

Simple sequence repeat marker development from Codonopsis lanceolata and genetic relation analysis

  • Kim, Serim;Jeong, Ji Hee;Chung, Hee;Kim, Ji Hyeon;Gil, Jinsu;Yoo, Jemin;Um, Yurry;Kim, Ok Tae;Kim, Tae Dong;Kim, Yong-Yul;Lee, Dong Hoon;Kim, Ho Bang;Lee, Yi
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제43권2호
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    • pp.181-188
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    • 2016
  • In this study, we developed 15 novel polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers by SSR-enriched genomic library construction from Codonopsis lanceolata. We obtained a total of 226 non-redundant contig sequences from the assembly process and designed primer sets. These markers were applied to 53 accessions representing the cultivated C. lanceolata in South Korea. Fifteen markers were sufficiently polymorphic, and were used to analyze the genetic relationships between the cultivated C. lanceolata. One hundred three alleles of the 15 SSR markers ranged from 3 to 19 alleles at each locus, with an average of 6.87. By cluster analysis, we detected clear genetic differences in most of the accessions, with genetic distance varying from 0.73 to 0.93. Phylogenic analysis indicated that the accessions that were collected from the same area were distributed evenly in the phylogenetic tree. These results indicate that there is no correlative genetic relationship between geographic areas. These markers will be useful in differentiating C. lanceolata genetic resources and in selecting suitable lines for a systemic breeding program.

EST-based Survey of Gene Expression in Seven Tissue Types from the Abalone Haliotis discus hannai

  • Park, Eun-Mi;Nam, Bo-Hye;Kim, Young-Ok;Kong, Hee-Jeong;Kim, Woo-Jin;Lee, Sang-Jun;Kong, In-Soo;Choi, Tae-Jin
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제10권3호
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    • pp.119-126
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    • 2007
  • The analysis of expressed sequence tags (ESTs) is an efficient approach for gene discovery, expression profiling, and the development of resources for functional genomics. To analyze the transcriptome of the abalone Haliotis discus hannai, we conducted EST analysis using seven cDNA libraries made from gill, gut, hepatopancreas, skin, muscle, testis, and ovary. Redundant ESTs were assembled into overlapping contiguous sequences using the assembly program ICAtools. We found that the total 1,393 ESTs formed 135 clusters and 951 singletons, indicating that the overall redundancy of the library was 22%. Of the 1,393 clones, BLAST identified 1,278 clones (91.7%) as known genes; 115 clones (8.3%) did not match any previously described gene. Based on the major functions of their encoded proteins, the identified clones were classified into 16 broad categories. Sequence analysis revealed the presence of micro satellite-containing genes that may be valuable for further gene mapping studies. This study contributes to the identification of numerous EST clones that can be applied to further clarifying the genetics and developmental biology of abalone.

이기종 플랫폼을 지원하는 온톨로지 기반 스마트러닝 시스템 설계 및 구현 (Design and Implementation to Support Cross-Platform Smart Learning System based on Ontology)

  • 전승연
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
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    • 한국정보통신학회 2013년도 추계학술대회
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    • pp.960-963
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    • 2013
  • 정보통신기술의 급격한 발전에 의해 교육은 스마트러닝으로 접어들고 있다. 학습자는 종이책을 내려놓고 다양한 스마트 디바이스를 활용한 학습을 하고 있으며, 이 순간에도 수없이 많은 플랫폼에 각각 들어맞는 학습 시스템이 등장하고 있다. 플랫폼 종속적인 시스템이 이기종 플랫폼에 적용되기 위해서는 많은 시간과 비용이 필요하며, 시스템이 보유하고 있는 학습 콘텐츠의 양이 많아질수록 이러한 현상은 더욱 심화된다. 불필요한 자원의 낭비를 줄이고 학습 콘텐츠를 효과적으로 제공하기 위해서 이기종 플랫폼을 지원하는 러닝 시스템의 연구가 필요하다. 이를 실현하기 위해서는 기존에 존재하는 수많은 학습 콘텐츠를 불필요한 중복 없이 통합할 수 있는 데이터베이스 모델의 연구가 선행되어야 한다. 이에 본 논문에서는 기존의 학습 콘텐츠를 통합할 수 있는 데이터베이스의 대안으로 온톨로지 기반의 메타데이터 모델을 제안하고, 이를 활용해 이기종 플랫폼을 지원하는 스마트러닝 시스템을 설계하고 구현한다.

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통합보안관리시스템의 보안성 메트릭 개발 (Development of Security Metrics of Enterprise Security Management System)

  • 양효식
    • 디지털융복합연구
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    • 제15권12호
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    • pp.303-311
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    • 2017
  • 신생 정보기술의 등장에 따른 새로운 보안 위협에 대처하기 위해 기업은 통합보안괸리(Enterprise Security Management)시스템을 도입하고 솔루션 간 상호연동을 통해 중복투자나 자원 낭비를 줄이고 보안 위협에 대처하고 있다. 이에 따라 통합보안관리시스템이 보안성을 충족시킴을 입증하기 위해 관련 표준을 근거로 한 보안성 평가 메트릭의 구축이 필요한 실정이다. 따라서 본 연구에서는 통합보안괸리시스템에 대한 보안성을 평가할 수 있는 메트릭을 구축하기 위해 통합보안괸리시스템의 보안성 품질 관련 요구사항을 분석하고 총족 정도를 측정할 수 있는 메트릭을 구축하였다. 본 메트릭을 통해 ISO/IEC 15408과 ISO/IEC 25000 표준에 부합하는 보안성 평가의 일원화를 통한 시너지 효과를 얻을 수 있다. 이를 통해 통합보안관리시스템의 보안성 품질수준을 평가하는 모델을 구축하고, 향후 통합보안괸리시스템에 대한 평가방법의 표준화를 기할 수 있을 것으로 사료된다.

De novo Assembly and Analysis of Amur Sturgeon (Acipenser schrenckii) Transcriptome in Response to Mycobacterium Marinum Infection to Identify Putative Genes Involved in Immunity

  • Zhang, Qianqian;Wang, Xiehao;Zhang, Defeng;Long, Meng;Wu, Zhenbing;Feng, Yuqing;Hao, Jingwen;Wang, Shuyi;Liao, Qian;Li, Aihua
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제29권8호
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    • pp.1324-1334
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    • 2019
  • Fish mycobacteriosis is a common bacterial disease in many species of freshwater and marine fish and has caused severe loss of fish production. Mycobacterium marinum has been the most prevalent pathogen observed in several outbreaks of mycobacteriosis of farmed sturgeons in China. However, the immune responses and pathology of sturgeons in mycobacterial infection are rarely studied. Therefore, we used the Illumina RNA-seq method to analyze the transcriptome profile of Acipenser schrenckii challenged with Mycobacterium marinum. To begin, 168,220 non-redundant contigs were acquired from the infection and control groups, and among these, 33,225 contigs have acquired annotations. A total of 4,043 differently expressed (DE) contigs between the two groups were identified, and among these, 2479 were up-regulated and 1564 were down-regulated in the infected fish. A total of 1,340 DE contigs with acquired annotations in KEGG were enriched for 124 pathways including the TNF signaling pathway, and the Toll-like receptor signaling pathway. The roles of DE genes involved in significant pathways and other processes were discussed. The 2,209 DE contigs that have yet to acquire proper annotation may represent candidate genes associated with infection in sturgeons and are expected to serve as immunogenetic resources for further study. To our best knowledge, this is the first transcriptome study on sturgeons under bacterial infection.

MRI 외부병원 판독 수가 인상의 효과 분석: 뇌 관련 자기공명영상을 중심으로 (An Analysis on the Effect of the Increase in the Fee of Magnetic Resonance Imaging Deciphering of the External Hospital: Focusing on the Brain Magnetic Resonance Imaging)

  • 김록영;사공진;조민호;위세아;이진용;김용규
    • 보건행정학회지
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    • 제31권3호
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    • pp.261-271
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    • 2021
  • Background: In 2018, the government increased the fee for the magnetic resonance imaging (MRI) image deciphering services of the external hospital to discourage the redundant MRI scan and to induce appropriate use of the MRI services. It is important to evaluate the effect of the policy to provide the basis for establishing other MRI-related policies. Methods: The healthcare data of the patients who had brain MRI scans were organized by episode and analyzed using the panel study in order to find out the effect of the MRI-related policy on the substitution effect and the medical expenses. Results: As a result of the increase in the fee of deciphering the MRI image, there has been an uplift in deciphering the MRI scan of the external hospital. It implies that more hospitals chose to use the MRI scan taken by other clinics or hospitals, rather than the MRI scan taken at their own facilities. Conclusion: The research results imply that a policy that facilitates the exchange of the medical image data between the hospitals is needed in order to establish an efficient management system of the healthcare resources. Such improvement is expected to reduce the social cost and contribute to the stability in the finance of national health insurance.