Kim, Dong-Min;Zhang, Shichen;Kim, Minhee;Kim, Dong-Eun
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.30
no.5
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pp.662-667
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2020
Epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations are not only genetic markers for diagnosis but also biomarkers of clinical-response against tyrosine kinase inhibitors (TKIs) in non-small cell lung cancer (NSCLC). Among the EGFR mutations, the in-frame deletion mutation in EGFR exon 19 kinase domain (EGFR exon 19-del) is the most frequent mutation, accounting for about 45% of EGFR mutations in NSCLCs. Development of sensitive method for detecting the EGFR mutation is highly required to make a better screening for drug-response in the treatment of NSCLC patients. Here, we developed a fluorometric tandem gene amplification assay for sensitive detection of low-abundance EGFR exon 19-del mutant genomic DNA. The method consists of pre-amplification with PCR, thermal cycling of ligation by Taq ligase, and subsequent rolling circle amplification (RCA). PCR-amplified DNA from genomic DNA samples was used as splint DNA to conjugate both ends of linear padlock DNA, generating circular padlock DNA template for RCA. Long stretches of ssDNA harboring multiple copies of G-quadruplex structure was generated in RCA and detected by thioflavin T (ThT) fluorescence, which is specifically intercalated into the G-quadruplex, emitting strong fluorescence. Sensitivity of tandem gene amplification assay for detection of the EGFR exon 19-del from gDNA was as low as 3.6 pg, and mutant gDNA present in the pooled normal plasma was readily detected as low as 1% fraction. Hence, fluorometric detection of low-abundance EGFR exon 19 deletion mutation using tandem gene amplification may be applicable to clinical diagnosis of NSCLC patients with appropriate TKI treatment.
Paik, Seung Sook;Hwang, In Kyoung;Park, Myung Jae;Lee, Seung Hyeun
Tuberculosis and Respiratory Diseases
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v.81
no.2
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pp.148-155
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2018
Background: Although targeted therapy and immuno-oncology have shifted the treatment paradigm for lung cancer, platinum-based combination is still the standard of care for advanced non-small cell lung cancer (NSCLC). Pemetrexed continuation maintenance therapy has been approved and increasingly used for patients with nonsquamous NSCLC. However, the efficacy of this strategy has not been proven in patients without driving mutations. The objective of this study was to compare the clinical benefit of pemetrexed continuation maintenance to conventional platinum-based doublet in epidermal growth factor receptor (EGFR)-negative lung adenocarcinoma. Methods: A total of 114 patients with EGFR-negative lung adenocarcinoma who were treated with platinum doublet were retrospectively enrolled. We compared the survival rates between patients received pemetrexed maintenance after four-cycled pemetrexed/cisplatin and those received at least four-cycled platinum doublet without maintenance chemotherapy as a first-line treatment. Results: Forty-one patients received pemetrexed maintenance and 73 received conventional platinum doublet. Median progression-free survival (PFS), which was defined as the time from the day of response evaluation after four cycles of chemotherapy to disease progression or death, was significantly higher in the pemetrexed maintenance group compared to conventional group (5.8 months vs. 2.2 months, p<0.001). Median overall survival showed an increasing trend in the pemetrexed maintenance group (22.3 months vs. 16.1 months, p=0.098). Multivariate analyses showed that pemetrexed maintenance chemotherapy was associated with better PFS (hazard ratio, 0.73; 95% confidence interval, 0.15-0.87). Conclusion: Compared to conventional platinum-based chemotherapy, premetrexed continuation maintenance treatment is associated with better clinical outcome for the patients with EGFR wild-type lung adenocarcinoma.
Kim, Mi-Jeong;Choi, Woo-Gyun;Ahn, Kyung-Ju;Chae, In Gyeong;Yu, Rina;Back, Sung Hoon
Molecules and Cells
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v.43
no.3
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pp.264-275
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2020
Reactive oxygen species (ROS) play a significant role in intracellular signaling and regulation, particularly when they are maintained at physiologic levels. However, excess ROS can cause cell damage and induce cell death. We recently reported that eIF2α phosphorylation protects hepatocytes from oxidative stress and liver fibrosis induced by fructose metabolism. Here, we found that hepatocyte-specific eIF2α phosphorylation-deficient mice have significantly reduced expression of the epidermal growth factor receptor (EGFR) and altered EGFR-mediated signaling pathways. EGFR-mediated signaling pathways are important for cell proliferation, differentiation, and survival in many tissues and cell types. Therefore, we studied whether the reduced amount of EGFR is responsible for the eIF2α phosphorylation-deficient hepatocytes' vulnerability to oxidative stress. ROS such as hydrogen peroxide and superoxides induce both EGFR tyrosine phosphorylation and eIF2α phosphorylation. eIF2α phosphorylation-deficient primary hepatocytes, or EGFR knockdown cells, have decreased ROS scavenging ability compared to normal cells. Therefore, these cells are particularly susceptible to oxidative stress. However, overexpression of EGFR in these eIF2α phosphorylation-deficient primary hepatocytes increased ROS scavenging ability and alleviated ROS-mediated cell death. Therefore, we hypothesize that the reduced EGFR level in eIF2α phosphorylation-deficient hepatocytes is one of critical factors responsible for their susceptibility to oxidative stress.
Chunkookjang, fermented soybean is rich in diverse oligopeptides which derived from cleavage of soybean proteins during fermentation. Microarray data containing differently expressed genes in breast cancer cells treated with fermented soybean extract and well known breast cancer metastasis markers were combined, and a new network was constructed. It is used to check interactions between the marker proteins and the differently expressed genes. Based on the network analysis, PLAU (plasminogen activator, urokinase, uPA) and ERBB2 (epidermal growth factor receptor 2) are chosen as possible metastasis genes. We treated breast cancer MCF7 cells with fermented soybean extract and measured expression levels of PLAU and ERBB2. Fermented soybean extract suppressed PLAU and ERBB2 expressions conspicuously. In the cancer cells treated with fermented soybean extracts, an inflammation marker, NO production was also reduced. It will be interesting to find specific peptides to suppress PLAU and ERBB2 expressions in human breast cancer cells.
Kim, Seo Yun;Myung, Jae Kyung;Kim, Hye-Ryoun;Na, Im Il;Koh, Jae Soo;Baek, Hee Jong;Kim, Cheol Hyeon
Tuberculosis and Respiratory Diseases
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v.82
no.1
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pp.62-70
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2019
Background: Epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations in non-small cell lung cancers have emerged as key predictive biomarkers in EGFR tyrosine kinase inhibitor (TKI) treatment. However, a few patients with wild-type EGFR also respond to EGFR TKIs. This study investigated the factors predicting successful EGFR TKI treatment in lung adenocarcinoma patients with wild-type EGFR. Methods: We examined 66 patients diagnosed with lung adenocarcinoma carrying wide-type EGFR who were treated with EGFR TKIs. The EGFR gene copy number was assessed by silver in situ hybridization (SISH). We evaluated the clinical factors and EGFR gene copy numbers that are associated with a favorable clinical response to EGFR TKIs. Results: The objective response rate was 12.1%, while the disease control rate was 40.9%. EGFR SISH analysis was feasible in 23 cases. Twelve patients tested EGFR SISH-positive, and 11 were EGFR SISH-negative, with no significant difference in tumor response and survival between EGFR SISH-positive and -negative patients. The overall median progression-free survival (PFS) and overall survival (OS) of 66 patients were 2.1 months and 9.7 months, respectively. Female sex and Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) performance status (PS) of 0-1 were independent predictors of PFS. ECOG PS 0-1 and a low tumor burden of extrathoracic metastasis were independent predictors of good OS. Conclusion: Factors such as good PS, female sex, and low tumor burden may predict favorable outcomes following EGFR TKI therapy in patients with EGFR wild-type lung adenocarcinoma. However, EGFR gene copy number was not predictive of survival.
Da-Mi Kim;So-Young Lee;Jae-Cheong Lim;Eun-Ha Cho;Ul-Jae Park
Journal of Radiopharmaceuticals and Molecular Probes
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v.8
no.1
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pp.9-15
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2022
Anti-cancer and therapeutic effects using therapeutic radioisotopes have been demonstrated by various studies, and it is well-known that therapeutic radioisotopes are useful in cancer treatment. Recently, one of the therapeutic radioisotopes, scandium is emerging as a radioisotope applicable to PET imaging (43Sc, 44Sc) and therapy (47Sc) in cancer theranostic approach. However, 47Sc has little known radiobiological and therapeutic efficacy compared to other therapeutic radioisotopes. Here, we investigated the quality and therapeutic efficacy of 47Sc radioisotope produced by our production/isolation technology at the research reactor 'HANARO' in KAERI (Korea Atomic Energy Research Institute). We showed that the therapeutic efficacy of 47Sc, produced by our production/isolation technology, effectively suppressed epidermal growth factor receptor (EGFR)-targeted non-small cell lung cancer (NSCLC) cells. Consequently, these results suggest that the high quality of the produced 47Sc by our production/isolation technology enables the development of therapeutic strategies for cancer treatment and radiopharmaceuticals using 47Sc.
In the present study, an in vitro ELISA system to assess the interaction between Src homology (SH)2 domains and phosphotyrosine that contain peptides was established using purified GST-conjugated SH2 proteins and synthetic biotinylated phosphotyrosine that contain oligopeptides. The SH2 domains bound the relevant phosphopeptides that were immobilized in the streptavidin-coated microtiter plate in a highly specific and dose-dependent manner. The epidermal growth factor receptor (EGFR)-, T antigen (T Ag)-, and platelet-derived growth factor receptor (PDGFR)-derived phosphopeptides interacted with the growth factor receptor binding protein (Grb)2/SH2, Lck/SH2, and phosphatidyl inositol 3-kinase (PI3K) p85/SH2, respectively. No cross-reactions were observed. Competitive inhibition experiments showed that a short phosphopeptide of only four amino acids was long enough to determine the binding specificity. Optimal concentrations of the GST-SH2 fusion protein and phosphopeptide in this new ELISA system for screening the binding blockers were chosen at 2nM and 500nM, respectively. When two candidate compounds were tested in our ELISA system, they specifically inhibited the Lck/SH2 and/or p85/SH2 binding to the relevant phosphopeptides. Our results indicate that this ELISA system could be used as an easy screening method for the discovery of specific binding blockers of protein-protein interactions via SH2 domains.
To investigate the biological functions of the EGF-like domain of mouse betacellulin (BTC), mouse BTC(33-80), a 48-residue peptide corresponding to the EGF-like domain, was synthesized by stepwise solidphase methods using a 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) strategy. The homogeneity of synthetic mouse BTC(33-80) was confirmed by analytical reversed phase (RP)-HPLC, amimo acid analysis, and fast atom bombardment mass spectrometer (FAB-MS). Three disulfide bond pairings of synthetic mouse BTC(33-80) were established by amino acid analysis of cysteine-containing fragments derived from thermolytic digestion. These were consistent with the pairings of EGF and transforming growth factor ($TGF-{\alpha}$). The EGF-Iike domain of mouse BTC showed equipotent activity in both EGF-receptor binding on A-431 epidermoid carcinoma cells, and mitogenesis on NIH-3T3 fibroblast cells, as compared with authentic h-EGF. Results suggest that the EGF-Iike domain of BTC plays a significant role in mitogenic activity with an EGF-receptor mediated system.
In recent years, remarkable progress has been made in the molecular profiling of gastric cancer. This progress has led to the development of various molecular classifications to uncover subtype-specific dependencies that can be targeted for therapeutic interventions. Human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) is a crucial biomarker for advanced gastric cancer. The recent promising results of novel approaches, including combination therapies or newer potent agents such as antibody-drug conjugates, have once again brought attention to anti-HER2 targeted treatments. In HER2-negative diseases, the combination of cytotoxic chemotherapy and programmed cell death-1/programmed cell death ligand-1 (PD-1/PD-L1) inhibitors has become the established standard of care in first-line settings. In the context of gastric cancer, potential biomarkers such as PD-L1 expression, Epstein-Barr virus, microsatellite instability, and tumor mutational burden are being considered for immunotherapy. Recently, promising results have been reported in studies on anti-Claudin18.2 and fibroblast growth factor receptor 2 treatments. Currently, many ongoing trials are aimed at identifying potential targets using novel approaches. Further investigations will be conducted to enhance the progress of these therapies, addressing challenges such as primary and acquired resistance, tumor heterogeneity, and clonal evolution. We believe that these efforts will improve patient prognoses. Herein, we discuss the current evidence of potential targets for systemic treatment, clinical considerations, and future perspectives.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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