Woo, Soo Ji;Jang, Hee Young;Lee, Hyung Ho;Chung, Joon Ki
Fisheries and Aquatic Sciences
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v.19
no.4
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pp.18.1-18.10
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2016
In this study, to clarify the function of $PoPLC-{\beta}1$, in response to stress challenge, we examined the $PoPLC-{\beta}1$ expression pattern in response to external stress (pathogen-associated molecular pathogen challenge and environmental challenge including temperature and salinity). $PoPLC-{\beta}1$ expression analysis of tissue from olive flounder showed that the messenger RNA (mRNA) was predominantly expressed in the brain, heart, eye, liver, spleen, and stomach. We also tested the mRNA expression of the $PoPLC-{\beta}1$ in the spleen and kidney of olive flounder by RT-PCR and real-time PCR following stimulation with lipopolysaccharide (LPS), concanavalin A (ConA), or polyinosinic:polycytidylic acid (PolyI:C) and compared with the inflammatory cytokines IL-1b and IL-6 in the stimulated flounder tissues. Each of the spleen and kidney and mRNA transcripts of $PoPLC-{\beta}1$ were increased 30- and 10-fold than normal tissue at 1-6 h post injection (HPI) with PolyI:C when the expression of $PoPLC-{\beta}1$ transcript was similar to LPS and ConA. We also tested the expression of $PoPLC-{\beta}1$ in response to temperature and salinity stress. The expression of $PoPLC-{\beta}1$ also was affected by temperature and salinity stress. Our results provide clear evidence that the olive flounder $PLC-{\beta}1$ signal pathways may play a critical role in immune function at the cellular level and in inflammation reactions. In addition, $PLC-{\beta}1$ appears to act as an oxidative-stress suppressor to prevent cell damage in fish.
Background: Extracellular sulfatases (Sulfs), sulfatase 1 (Sulf1) and sulfatase 2 (Sulf2), play a pivotal role in cell signaling by remodeling the 6-O-sulfation of heparan sulfate proteoglycans on the cell surface. The present study examined the effects of Sulfs on angiotensin II (Ang II)-induced hypertensive mediator expression and vascular smooth muscle cells (VSMCs) proliferation in spontaneously hypertensive rats (SHR). Methods: Ang II receptors, 12-lipoxygenase (12-LO), and endothelin-1 (ET-1) messenger RNA (mRNA) expressions in SHR VSMCs were analyzed by real-time polymerase chain reaction and Western blotting. VSMCs proliferation was determined by [$^3H$]-thymidine incorporation. Results: Basal Sulfs mRNAs expression and enzyme activity were elevated in SHR VSMCs. However, Sulfs had no effect on the basal or Ang II-induced 12-LO and ET-1 mRNA expression in SHR VSMCs. The inhibition of Ang II-induced 12-LO and ET-1 expression by blockade of the Ang II type 2 receptor ($AT_2\;R$) pathway was not observed in Sulf1 siRNA-transfected SHR VSMCs. However, Sulf2 did not affect the action of $AT_2\;R$ inhibitor on Ang II-induced 12-LO and ET-1 expression in SHR VSMCs. The down-regulation of Sulf1 induced a reduction of $AT_2\;R$ mRNA expression in SHR VSMCs. In addition, the inhibition of Ang II-induced VSMCs proliferation by blockade of the $AT_2\;R$ pathway was mediated by Sulf1 in SHR VSMCs. Conclusion: These findings suggest that extracellular sulfatase Sulf1 plays a modulatory role in the $AT_2\;R$ pathway that leads to an Ang II-induced hypertensive effects in SHR VSMCs.
Aims: Early diagnosis is important for cervical cancer treatment. This study aimed to characteriz the microRNA profile and target gene protein levels of cervical cancers in Uygur women for application in early diagnosis. Methods: The profiles of miRNA in cervical cancer and chronic cervicitis were analyzed with miRNAmicroarray V4.0. The expression of miR-101 was detected by real-time PCR and locked nucleotide acid in situ hybridization (LNA-ISH). Cox-2 protein levels were assessed by immunohistochemistry. Results: The microarray identified a set of 12 miRNAs significantly decreased in cervical cancer in comparison to the control group. Quantitative RT-PCR analysis showed miR-101 to be significantly downregulated in cancer tissues (p<0.05) while LNA-ISH showed miR-101 positive rates of 80% (20/25) and 8% (5/25) (p<0.05) in the control and cervical cancer groups. Cox-2 positive rates of cervical cancer and control groups were 84% (21/25) and 8% (2/25) (p<0.05). Conclusions: Use of down-regulation of miR-101 and up-regulation of Cox-2 as markers may play a role in early diagnosis of cervical cancer in Uygur women.
Background: Chronic myeloid leukemia (CML) is a myeloproliferative disorder of hematopoietic stem cell scarrying the Philadelphia (Ph) chromosome and an oncogenic BCR-ABL1 fusion gene. The tyrosine kinase inhibitor (TKI) of BCR-ABL1 kinase is a treatment of choice for control of CML. Objective: Recent studies have demonstrated that miRNAs within exosomes from cancer cells play crucial roles in initiation and progression. This study was performed to assess miRNAs within exosomes of K562 cells. Methods: miRNA microarray analysis of K562 cells and K562 cell-derived exosomes was conducted with the 6th generation miRCURYTM LNA Array (v.16.0). Gene ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analyses were also carried out. GO terms and signaling pathways were categorized into 66 classes (including homophilic cell adhesion, negative regulation of apoptotic process, cell adhesion) and 26 signaling pathways (such as Wnt). Results: In exosomes, 49 miRNAs were up regulated as compared to K562 cells, and two of them were further confirmed by quantitative real-time PCR. There are differentially expressed miRNAs between K562 cell derived-exosomes and K562 cells. Conclusion: Selectively expressed miRNAs in exosomes may promote the development of CML via effects on interactions (e.g. adhesion) of CML cells with their microenvironment.
An underwater sound surveillance system detects and tracks enemy ships in real-time using hydrophone arrays, in which seabed-mounted sensor arrays play a pivotal role. In this paper the conceptual design of seabed-mounted, cylindrical hydrophone arrays for use in shallow coastal waters is performed via finite element calculations. To stabilize the receiving characteristics under the ocean ambient noise, a technique for whitening the ambient noise spectrum using a metal baffle is proposed. Optimization of the array configuration is performed to achieve the directivity in the vertical and azimuthal directions. And the effects of the sonar dome shape and material on the structural vibration and sound scattering properties are studied. It is demonstrated that a robust hydrophone array, having a sensitivity deviation less than 4 dB over the frequency range of interest, can be obtained through the whitening of the ambient noise, the optimization of the array configuration, and the design of acoustically transparent sonar domes.
Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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v.9
no.7
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pp.1588-1593
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2005
In coagulant control of water treatment plants, rule extraction, one of datamining categories, was performed for coagulant control of a water treatment plant. Clustering methods were applied to extract control rules from data. These control rules can be used for fully automation of water treatment plants instead of operator's knowledge for plant control. To perform fuzzy clustering, there are some coefficients to be determined and these kinds of studies have been performed over decades such as clustering indices. In this study, statistical indices were taken to calculate the number of clusters. Simultaneously, seed points were found out based on hierarchical clustering. These statistical approaches give information about features of clusters, so it can reduce computing cost and increase accuracy of clustering. The proposed algorithm can play an important role in datamining and knowledge discovery.
Kim, Jin-Su;Lee, Han-Na;Lee, Heung-Shick;Kim, Pil;Kim, Eung-Soo
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.23
no.10
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pp.1365-1371
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2013
The Streptomyces coelicolor wblA gene is known to play a negative role in both antibiotic biosynthesis and the expression of genes responding to oxidative stress. Recently, WhcA, a WblA ortholog protein, was confirmed to interact with dioxygenase-encoding SpiA ($\underline{s}$tress $\underline{p}$rotein $\underline{i}$nteracting with Whc$\underline{A}$) in Corynebacterium glutamicum. We describe here the identification of a SpiA ortholog SCO2553 protein ($SpiA_{sc}$) that interacts with WblA in S. coelicolor. Using heterologous expression in E. coli and in vitro pull-down assays, we show that WblA specifically binds $SpiA_{sc}$, and is influenced by oxidants such as diamide. These data indicate that the interaction between WblA and $SpiA_{sc}$ is not only specific but also modulated by the redox status of the cell. Moreover, a $spiA_{sc}$-disruption mutant exhibited a less sensitive response to the oxidative stress induced by diamide present in solid plate culture. Real-time RT-PCR analysis also showed that transcription levels of oxidative stress response genes (sodF, sodF2, and trxB) were higher in the $spiA_{sc}$-deletion mutant than in wild-type S. coelicolor. These results show that $SpiA_{sc}$ negatively regulates WblA during oxidative stress responses in S. coelicolor.
There have been many solar tracking systems developed for the high accuracy in solar tracking. One of the key components of any motion control system is software. LabVIEW offers an ideal combination of flexibility, ease-of-use and well-integration with other I/O pieces for developing solar tracking system. Real-time solar positions which vary with GPS's data are used simultaneously to control the solar tracker by a chain of operating modes between the open and closed loops. This paper introduces a step by step procedure for the fabrication and performance assessment of a precision solar tracking system. The system developed in this study consists of motion controllers, motor drives, step-motors, feedback devices and application. CRD sensors are applied for the solar tracking system which play a primary role in poor conditions for tracking due to a gear backlash and a strong wind. Mini-dish was used as a concentrator for collecting sun light. The solar position data, in terms of azimuth and elevation, sunrise and sunset times was compared with those of KASI(Korea Astronomy & Space Science Institute). The results presented in this paper demonstrate the accuracy of the present system in solar tracking and utilization.
Games such as sports, RTS, RPG, which teams of players play, require advanced artificial intelligence technology for team management. The existing artificial intelligence enables an intelligent agent to have the autonomy solving problem by itself, but to lack interaction and cooperation between agents. This paper presents "Level Unified Approach Method" with effective role allocation and autonomy in multiagent system. This method allots sub-goals to agents using role information to accomplish a global goal. Each agent makes a decision and takes actions by itself in dynamic environments. Global goal of Team coordinates to allocated role in tactics approach. Each agent leads interactive cooperation by sharing state information with another using Databoard, As each agent has planning capacity, an agent takes appropriate actions for playing allocated roles in dynamic environments. This cooperation and interactive operation between agents causes a collision problem, so it approaches at tactics side for controlling this problem. Our experimental result shows that "Level Unified Approach Method" has better performance than existing rental approach method or de-centralized approach method.
Lee, Yong-Ho;Tokraks, Stephen;Nair, Saraswathy;Bogardus, Clifton;Permana, Paska A.
Biomedical Science Letters
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v.15
no.4
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pp.301-307
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2009
Whole-body insulin resistance results largely from impaired insulin-stimulated glucose disposal in skeletal muscle. Our previous studies using differential display and quantitative real-time RT-PCR have shown that a novel cDNA band (DD23) had a higher level of expression in insulin resistant skeletal muscle and it was correlated with whole-body insulin action, independent of age, sex, and percent body fat. In this study, we cloned and characterized DD23. The DD23 sequence is part of the 3'UTR region of the RNA binding motif, single stranded interacting protein (RBMS3). We have cloned the full length cDNA for RBMS3 and identified two splice variants. These variants named DD23-L and DD23-S have 15 and 14 exons respectively and differ from RBMS3 in the 3'UTR significantly. Northern blot analyses showed that an ~8.8 kb mRNA transcript of DD23 was predominantly expressed in skeletal muscle and to a lesser extent in placenta, but not in heart, brain, lung, liver, or kidney, unlike RBMS3. Elevated expression levels of these novel alternatively spliced variants of RBMS3 in skeletal muscle may play a role in whole body insulin resistance.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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