• 제목/요약/키워드: Rag-2

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RAG1 유전자의 염기서열에 기초한 왜매치 Abbottina springeri (잉어목, 잉어과)의 분자계통학적 위치 (Molecular Phylogenetic Position of Abbottina springeri (Cypriniformes: Cyprinidae) Based on Nucleotide Sequences of RAG1 Gene)

  • 김근용;방인철
    • 한국어류학회지
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    • 제22권4호
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    • pp.273-278
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    • 2010
  • 왜매치 Abbottina springeri Banarescu and Nalbant의 분자계통학적 위치를 밝히기 위해 한국에 서식하는 버들매치속 2종과 모래주사속 5종의 핵 유전자인 recombination activating gene 1 (RAG1)의 염기서열을 분석하였다. RAG1 유전자 염기서열 정보에 기초한 계통수에서 배들매치 A. rivularis는 단계통군을 형성하는 왜매치, Biwia zezera 및 모래주사속 종들과 분리되었다. 이 계통 내에서 B. zezera는 왜매치와 모래주사속 5종을 구성된 단계통 그룹과 자매계통 관계를 보였다. 분자계통수 상에서 버들매치속 2종은 다계통군으로 나타났고, 이러한 결과는 골격 특징들에 근거한 이들의 계통적 관계를 밝힌 선행연구와 잘 일치하였다. 따라서 입의 피질돌기 유무와 부레의 골낭 유무와 크기 등과 같은 형태적 특징들에 근거한 버들배치속과 모래주사속의 현분류체계는 진화 역사를 잘 반영하지 못하는 것으로 여겨진다.

당귀 및 아위가 평활근 이완과 iNOS 발현에 미치는 영향 (Effects of Radix Angelicae Gigantis and Resina Ferulae on the Relaxation of Smooth Muscle and Expression of iNOS)

  • 김성재;송봉근;이언정;김형균;김중길
    • 대한한의학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.60-67
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    • 2000
  • Objectives : Radix Angelicae Gigantis(RAG) and Resina Ferulae(RF) have been used in oriental medicine or folk medicine to increase stamina. The aim of this study was the characterization of the mechanism of action of RAG and RF on smooth muscle and macrophages in rats to find new substances for the treatment of erectile dysfunction, cardiovascular diseases and immune dysfunction. Methods : We investigated the effects of the water extracts of RAG and RF on phenylephrine or KCl-contracted rat endothelium-denuded aorta, the production of NO in vascular smooth muscle cell (VSMC) and the production of NO and induction of iNOS in the $IFN-{\gamma}-primed$ RAW 264.7 cells. Results : The water extracts of the RAG and RF showed significant concentration-dependent relaxation effects on phenylephrine or KCl-contracted rat endothelium-denuded aorta. It also reduced the tension of the rat endothelium denuded aorta which was contracted in $Ca^{2+}-free$ media. On the other hand, it increased production of NO in VSMC which was stimulated with $IL-{\beta}$ or $IL-{\beta}$ plus $IFN-{\gamma}$. The water extracts of RAG and RF increased production of NO and induction of iNOS in the $IFN-{\gamma}-primed$ RAW 264.7 cells. Conclusions : According to the above results, the water extracts of RAG and RF relaxed the smooth muscle effectively and increased the production of NO in VSMC and macrophages. So, these herbs can be applied to erectile dysfunction, hypertension, angina pectoris, artherosclerosis and a defense defect for virus or microbe.

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RAG 기반 계층 분류 (2) (RAG-based Hierarchical Classification)

  • 이상훈
    • 대한원격탐사학회지
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    • 제22권6호
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    • pp.613-619
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    • 2006
  • 본 연구는 원격 탐사의 영상 처리에서 영상 분할의 상위 수준으로 응집 계층 clustering의 dendrogram을 통한 무감독 영상 분류를 제안한다. 제안된 알고리즘은 분광 영역에서 정의된 RAG (Regional Agency Graph)와 min-heap 자료 구조를 이용하여 MCSNP (Mutual Closest Spectral Neighbor Pair)의 집합을 검색하면서 합병을 수행하는 계층 clustering 방법이다. 계산 시간과 저장 기억의 사용에 대한 효율을 증가시키기 위해 분광적 인접성을 정의하는 분광 공간(spectral space)내의 다중 창을 사용하였고 RNV (Region Neighbor Vector)을 이용하여 합병에 의하여 변하는 RAG 갱신하였고 적정한 단계 수가 주어진다면 제안된 알고리즘은 집단 합병의 계층적 관계를 쉽게 해석 할 수 있는 dendrogram을 생성한다. 본 연구는 simulation 자료를 사용하여 광범위하게 제안된 알고리즘에 대한 평가 실험을 수행 하였으며 실험 결과는 알고리즘의 효율성을 입증하였다. 또한 한반도에서 관측된 방대한 크기의 QuickBird 영상의 적용 결과는 제안된 알고리즘이 무감독 영상 분류를 위한 강력한 수단임을 보여준다.

RAG-1 and IgM Genes, Markers for Early Development of the Immune System in Olive Flounder, Paralichthys olivaceus

  • Lee, Jang-Wook;Yang, Hyun;Noh, Jae Koo;Kim, Hyun Chul;Park, Choul-Ji;Park, Jong-Won;Hwang, In Joon;Kim, Sung Yeon;Lee, Jeong-Ho
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제18권2호
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    • pp.99-106
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    • 2014
  • Fish larvae are immediately exposed to microbes from hatching to maturation of their lymphoid organs, therefore effective innate mechanisms is very important for survival. However, the knowledge of the development of immune system in fish is limited and in demand now. In vertebrates, recombination-activating gene 1 (RAG-1) and immunoglobulin M (IgM) have been considered as very useful markers of the physiological maturity of the immune system. In this study, the expression of the both genes was assessed throughout the early developmental stages of olive flounder larvae (5-55 dph) and used as markers to follow the development of immune system. RAG-1 and IgM mRNA expression was detectable at 5 dph and remained so until 55 dph. These patterns of expression may suggest that the olive flounder start to develop its function around 5 dph. Tissue distribution was found that both genes mRNAs are only expressed in the immune-related organ such as spleen, kidney and gill. The early detection of IgM mRNA led to the investigation of its presence in oocytes. Both RAG-1 and IgM mRNA transcripts were detected in unfertilized oocytes, suggesting that they are maternally transferred. The biological significance of such a phenomenon remains to be investigated.

낙동강 상류 황지천에 서식하는 쉬리속(genus Coreoleuciscus) 어류 집단의 종 동정 및 잡종 판별 (Species and Hybrid Identification of Genus Coreoleuciscus Species in Hwnag-ji Stream, Nakdong River Basin in Korea)

  • 송하윤;김재훈;서인영;방인철
    • 한국어류학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.1-12
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    • 2017
  • 낙동강 상류 지류인 황지천에서 쉬리(Coreoleuciscus splendidus)와 참쉬리(C. aeruginosa)의 종 간 자연잡종 개체를 채집하였다. 쉬리와 참쉬리의 종 간 잡종 개체는 외부형태 비교와 함께 핵 DNA의 RAG1 유전자(1,334 bp)와 미토콘드리아 DNA인 CO1 유전자(1,551 bp)를 이용한 염기서열 분석을 실시하였다. 외부형태 분석결과 잡종 개체는 등지느러미, 꼬리지느러미 및 뒷지느러미 3곳에서 지느러미 반문의 형태가 쉬리와 참쉬리의 중간 형태를 나타내었다. RAG1과 CO1 유전자를 이용한 분자계통 분석결과 황치천에 분포하는 쉬리속 어류는 쉬리, 참쉬리 두 종과 두 종 간의 잡종 개체군으로 구성되어 있음을 확인하였으며, CO1 유전자의 염기서열 분석결과 순종인 정교배체와 잡종인 상반교배체가 잘 구분되었다. 또한 RAG1 유전자 분석결과 13개의 염기서열 변이를 확인하였고, 잡종 개체는 9개의 염기서열에서 double peaks가 확인되었다. 유전학적 분석과 외부형태 변이 분석에 의해 쉬리와 참쉬리 사이에 잡종화가 발생한 것을 확인하였으나 잡종 F2세대와 잡종 F1 세대의 생식적 격리 여부는 확인하지 못하였다.

검색 증강 LLM을 이용한 치과 상담용 챗봇 개발 (Development of Dental Consultation Chatbot using Retrieval Augmented LLM)

  • 박종진
    • 한국인터넷방송통신학회논문지
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    • 제24권2호
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    • pp.87-92
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    • 2024
  • 본 논문에서는 치과 상담용 챗봇을 개발하기 위해 기존의 대규모 언어 모델(LLM)과 랭체인 라이브러리를 이용하여 검색 증강 생성(RAG) 시스템을 구현하였다. 이를 위해 국내 치과 대학병원의 웹페이지 게시판에 있는 내용을 수집하고 치과 전문의의 자문과 감수를 받아 상담 데이터를 구축하였다. 입력된 상담용 데이터를 적절한 크기로 분할하기 위해 청크 크기와 각 청크의 겹치는 텍스트의 크기는 각각 1001과 100으로 하였다. 시뮬레이션 결과 검색 증강 LLM은 사용자 입력과 가장 유사한 상담 내용을 검색하여 출력하였다. 구축된 챗봇을 통해 치과 상담의 접근성과 상담 내용의 정확성을 높일 수 있음이 확인되었다.

원지(遠志)와 석창포(石菖蒲)의 단독 및 혼합추출액이 CT105 로 유도된 신경세포암 세포주에 미치는 영향 (Comparative effects of Radix Polygalae and Rhizoma Acori Graminei on CT105-induced neuroblastoma cell lines)

  • 한원주;김형수;김상태;김태헌;류영수;강형원
    • 동의신경정신과학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.95-105
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    • 2003
  • Alzheimer's disease(AD) is a geriatric dementia that is widespread in old age. In the future AD will be the largest problem in public health service. From old times, Much medicines have been used for treatment of dementia, but there is no medicine having obvious effect. AD is one of brain retrogression disease. So We studied on herbal medicine that have a relation of brain retrogression. From old times, In Oriental Medicine, Radix Polygalae and Rhizoma Acori Graminei have been used for disease in relation to brain retrogression. We studied of anti-Alzheimer effect on CT105-induced neuroblastoma cell lines by Radix Polygalae(RP) and Rhizoma Acori Graminei(RAG) water extract. As the result of this study, In RP and RAG group, the apoptosis in the nervous system is inhibited, the repair against the degeneration of Neuroblastoma cells by CT105 expression is induced. These results indicate that In RP and RAG, RAG possess the strongest in inhibitory effect of apoptosis in the nervous system and repair effect against the degeneration of Neuroblastoma cells by CT105 expression.

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영역분할과 컬러 특징을 이용한 건물 인식기법 (Building Recognition using Image Segmentation and Color Features)

  • 허정훈;이민철
    • 로봇학회논문지
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    • 제8권2호
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    • pp.82-91
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    • 2013
  • This paper proposes a building recognition algorithm using watershed image segmentation algorithm and integrated region matching (IRM). To recognize a building, a preprocessing algorithm which is using Gaussian filter to remove noise and using canny edge extraction algorithm to extract edges is applied to input building image. First, images are segmented by watershed algorithm. Next, a region adjacency graph (RAG) based on the information of segmented regions is created. And then similar and small regions are merged. Second, a color distribution feature of each region is extracted. Finally, similar building images are obtained and ranked. The building recognition algorithm was evaluated by experiment. It is verified that the result from the proposed method is superior to color histogram matching based results.

한국산 꼼치과 어류의 분자계통 및 분류학적 재검토 (Molecular Phylogeny and Taxonomic Review of the Family Liparidae (Scorpaenoidei) from Korea)

  • 송영선;반태우;김진구
    • 한국어류학회지
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    • 제27권3호
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    • pp.165-182
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    • 2015
  • 쏨뱅이아목 (Scorpaenoidei) 어류에 속하는 꼼치과 (Liparidae) 어류는 형태적으로 유사하고 오동정 가능성이 크며 체색과 몸의 상대적인 크기 변이가 심하여 분류학적으로도 상당히 혼란스러운 분류군이다. 따라서, 본 연구는 꼼치과 어류의 자원변동을 이해하고 자원관리를 위해 국내 보고된 3속 10종을 대상으로 분자계통 및 분류학적 재검토를 수행하였다. 미토콘드리아DNA COI 영역과 핵DNA RAG2 영역의 염기서열을 이용한 분자계통 분석 결과, 물미거지가 분홍꼼치와 가깝게 유집되는 mtCOI 계통 결과를 제외하면 3속 (분홍꼼치속, 물미거지속, 꼼치속)이 대등한 단계통성을 나타내었다. Gilbert and Burke (1912)는 L. ochotensis와 구분되는 한국산 미거지를 L. ingens로 신종 보고하였으나, 본 연구에서 한국산 미거지는 일본산 및 러시아산 L. ochotensis와 형태 및 분자에서 잘 일치하였으므로 한국산 미거지의 학명을 L. ingens에서 L. ochotensis로 변경한다.