• 제목/요약/키워드: RNA synthesis

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Flock House Virus RNA1 with a Long Heterologous Sequence at the 3'-end Can Replicate in Mammalian Cells and Mediate Reporter Gene Expression

  • Kim, Doyeong;Cho, Tae-Ju
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제29권11호
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    • pp.1790-1798
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    • 2019
  • Flock House virus (FHV), an insect RNA virus, has a bipartite genome. FHV RNA1 can be packaged in turnip yellow mosaic virus (TYMV) as long as the FHV RNA has a TYMV sequence at the 3'-end. The encapsidated FHV RNA1 has four additional nucleotides at the 5'-end. We investigated whether the recombinant FHV RNA1 could replicate in mammalian cells. To address this issue, we prepared in vitro transcribed FHV RNAs that mimicked the recombinant FHV RNA1, and introduced them into baby hamster kidney (BHK) cells. The result showed that the recombinant FHV RNA1 was capable of replication. An eGFP gene inserted into the frame with B2 gene of the FHV RNA1 was also successfully expressed. We also observed that eGFP expression at the protein level was strong at 28℃ but weak at 30℃. Sequence analysis showed that the 3'-ends of the RNA1 and RNA3 replication products were identical to those of the authentic FHV RNAs. This indicates that FHV replicase correctly recognized an internally-located replication signal. In contrast, the 5'-ends of recombinant FHV RNA1 frequently had deletions, indicating random initiation of (+)-strand synthesis.

$Interferon-\gamma$가 치주인대 세포의 Collagen 및 Fibronectin의 합성과 Alkaline Phosphatase 활성에 미치는 영향 (EFFECTS OF $INTERFERON-\gamma$ ON COLLAGEN AND FIBRONECTIN SYNTHESIS IN PRIMARY CULTURED PERIODONTAL LIGAMENT CELLS)

  • 김광석;성재현;최제용;류현모
    • 대한치과교정학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.229-248
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    • 1993
  • 결합 조직의 대사를 억제하고, 골조직이나 골세포의 골기질 대사 역시 억제하는 것으로 알려져 있는 $Interferon-\gamma(IFN-\gamma)$의 교정치료에의 이용 가능성을 평가하기 위하여, 교정력에 의한 골 개조 과정에서 중심적 역할을 하는 것으로 알려진 치주인대 세포를 primary culture하여 배양된 세포에 $IFN-\gamma$를 투여함으로써 이것이 골조직 기질의 합성능에 미치는 영향에 대하여 관찰하였다. $IFN-\gamma$는 세포의 DNA합성능을 약하게 증가시켰으며, 세포내 DNA 총량에는 영향을 미치지 않았다. 따라서 이 실험에서 사용한 용량의 $IFN-\gamma$는 세포에 독성이 없다고 할 수 있으며, 다른 결합조직 세포에서 나타나는 항증식 효과와는 반대되는 결과였다. $IFN-\gamma$는 비교원성 단백질(NCP)의 합성을 증가시키는 양상을 나타내었으나, 교원질(CDP)의 합성은 감소시키는 경향을 보여, 총단백질에 대한 교원질의 합성비율은 $IFN-\gamma$에 의해 용량 의존적으로 감소하였다. 또한 교원질의 mRNA양은 단백질 합성과 유관하게 $IFN-\gamma$에 의해 억제되었다. 따라서 $IFN-\gamma$는 교원질 합성의 전사과정 혹은 그 이후의 과정에 영향을 미칠 것으로 예상할 수 있다. 한편 Indomethacin의 투여로 $IFN-\gamma$에 의해 억제된 교원질의 합성이 영향을 받지 않았기 때문에 $IFN-\gamma$에 의한 교원질 합성 과정에 prostaglandin이 관련되지 않았음을 알 수 있었다. 반면 fibronectin의 합성은 10 및 100 U/ml의 $IFN-\gamma$ 투여시에는 영향을 받지 않았으나, 1000U/ml의 $IFN-\gamma$투여시에는 유의한 증가를 나타내어, 교원질에서와는 다른 영향을 나타내었다. 또한 mRNA steady state level에서도 $IFN-\gamma$는 교원질의에서와는 달리 fibronectin mRNA 양에는 영향을 미치지 않았다. 즉 $IFN-\gamma$ fibronectin 유전자 발현에 영향을 미치는 부위는 전사나, 전사후 변형단계가 아닌 단백질 합성단계에서 영향을 미침을 보여주었다. 따라서 $IFN-\gamma$ 교원질과 fibronectin합성 조절 영향을 미치는 부위 서로 다름을 알 수 있겠다. Alkaline phospatase의 활성은 10-1000 U/ml의 $IFN-\gamma$를 투여시 약하게 증가시키는 경향을 보였으나 석회화가 일어날 정도로 높게 증가시키지는 못했다. 따라서 $IFN-\gamma$는 골기질의 주성분인 type I 교원질의 합성을 선택적으로 억제하는 기능과 alkaline phosphatase의 활성을 크게 증가시키지 못한 점 등으로 미루어 볼 때, 골개조를 억제하는 방향으로 작용한다고 볼 수 있으며, 교정치료 과정중 골개조를 억제하는 부위에서 사용을 시도해 볼 수 있겠다.

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생쥐의 纖維芽細胞와 SCK 腫瘍細胞에서 Stress와 pH에 의한 Stress Protein 遺傳子發見의 調節 (Modulation of Stress Protein Gene Expression by Environmental Stress and pH in the Mouse Fibroblasts and SCK Tumor Cells)

  • Kang, Man-Sik;Lee, Chung-Choo;Lee, Bonggeun;Suh, Mi-Young
    • 한국동물학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.108-119
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    • 1985
  • Stress protein (SP) 遺傳子發現의 調節機構를 밝히기 위한 한가지 방편으로 환경의 stress와 pH가 SP의 合成誘導에 어떤 作用을 하는지를 SDS-PAGE를 이용해서 分析하였다. 蛋白質合成의 전반적 양상은 MEF와 SCK 세포에서 달랐으나 SP의 양상은 동일하였다. 그중에서 $SP_70$의 誘導와 感衰의 kinetics는 특히 흥미로웠다. $SP_70$의 kinetics는 酸性 pH와 正常 pH에서 類似하였으나 最大量의 SP 合成에 필요한 溫度와 그 處理時間은 pH에 의해 달리 나타나서, 酸性 pH 에서는 자은 溫度와 짧은 處理時間에서 나타나고 더욱 오래 지속되는 경향을 보였다. SP의 合成誘導와 SP mRNA의 축적은 actinomycin D에 의해 阻止되는 사실로 미루어 SP의 合成이 誘導되기 위해서는 새로운 mRNA의 合成이 필요함을 알수 있었고, cycloheximide 처리의 결과는 SP의 合成誘導에 앞서서 어떤 特異한 蛋白質의 合成은 일어나지는 않음을 알수 있었다. 이상과 같은 몇가지 實驗結果는 MEF와 SCK 세포에서 SP의 合成誘導는 일차적으로 轉寫水潗에서 調節되며, $SP_70$의 合成은 自動調節됨과 아울러 SP의 水潗은 세포늬 stress 상태와 相關關係가 있는 것으로 推論할수 있음을 보여주었다.

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다양한 마늘 추출물이 HepG2 세포에서 콜레스테롤 합성에 미치는 효과 (Effects of Various Garlic (Allium sativum) Extracts on Cholesterol Synthesis in HepG2 Cells)

  • 정수한;이상훈;고광석
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제44권12호
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    • pp.1779-1784
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    • 2015
  • 본 연구에서는 마늘의 다양한 조리법에 따른 냉수추출 마늘 추출물이 HepG2 세포 내 콜레스테롤 합성에 미치는 효과에 대하여 알아보고자 세포 내 중성지방 및 콜레스테롤 함량을 확인하고 real-time PCR을 이용하여 작용 기전을 알아보았다. 마늘을 $25^{\circ}C$에서 60분간 숙성하였을 경우 1분간 숙성하였을 때와 비교하여 추출물 내 alliin 함량이 감소하는 것을 확인할 수 있었다. 마늘 추출물을 HepG2 세포에 처리하였을 때 세포 내 중성지방 및 콜레스테롤의 함량이 감소하는 모습을 보여주었으며, 특히 동결건조 마늘 추출물이 그 효과가 가장 우수하였다. 콜레스테롤 합성의 제한효소인 HMGCoA reductase의 발현량 역시 마늘 추출물을 처리함에 따라 감소하는 모습을 보였으며, 동결건조 마늘 추출물을 처리하였을 때 가장 많이 감소하는 모습을 보였다. 다만 산성처리를 한 마늘의 추출물을 세포에 처리하였을 때에는 그 효과가 감소하는 것으로 나타났다. 동결건조 마늘 추출물의 농도 비례 효과를 살펴본 결과 동결건조 마늘 추출물의 경우 생마늘을 상온에 60분 숙성시킨 마늘 추출물과 구운마늘 추출물에 비하여 세포 내 중성지방과 콜레스테롤 합성 감소에 효과가 뛰어난 것으로 나타났으며, 이러한 결과는 HMGCoA reducatase mRNA의 상대적 발현 수준 차이 이상의 지질 감소 효과를 나타내는 것을 확인할 수 있었다. 따라서 동결건조 마늘의 경우 생마늘을 섭취하였을 때와 유사한 또는 더 우수한 효능을 보이면서도 오히려 보관성이 우수하고 생마늘 섭취 시 나타날 수 있는 과민 반응 및 알레르기 반응의 위험이 적기 때문에 다양하게 응용될 수 있는 가능성이 있을 것으로 사료되며, 이를 뒷받침할 방안들의 연구가 진행되어져야 할 것으로 판단된다.

Anti-stress effects of Gastrodia elata on catecholamine pathway in rat

  • Ri, Qrian-Young
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2003년도 제10차 국제학술회의 및 추계정기 학술발표회
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    • pp.17-17
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    • 2003
  • Enzymes involved in catecholamine synthesis are present in the highest concentration in the adrenal medulla, however they were found also in other, mainly nervous tissues. Increased transcription of genes for catecholamine biosynthetic enzymes is an important mechanism to increase the capacity for epineprine/norepinephrine biosynthesis with stress. Gastrodia elata(Chinese name: Tienma), are very important Chinese herbal medicines used for the medical treatment of headaches, migraine, dizziness, epilepsy, rheumatism, neuralgia, paralysis and other neuralgic and nervous disorders. Immobilize stressed rat markedly increased tyrosine hydroxylase (TH) mRNA and dopamine-${\beta}$-hydroxylase (DBH) mRNA transcriptior level more than control group. But treated Gastrodia elata extracts in immobilized stressed rat slightly increased TH mRNA and DBH mRNA transcription level more than normal group. In addition, we are obtained identical results in PC12 cell line. Decrease of transcription level of TH mRNA and DBH mRNA is indicating that Gastrodia elata have a anti-stress effects which decrease the transcription level of TH and DBH mRNA on catecholamine biosynthesis pathway.

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Anti-stress effects of Gastrodia elata on catecholamine pathway in rat

  • Ri, Qrian-Young
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2003년도 심포지엄
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    • pp.37-37
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    • 2003
  • Enzymes involved in catecholamine synthesis are present in the highest concentration in the adrenal medulla, however they were found also in other, mainly nervous tissues. Increased transcription of genes for catecholamine biosynthetic enzymes is an important mechanism to increase the capacity for epineprine/norepinephrine biosynthesis with stress. Gastrodia elata(Chinese name: Tienma), are very important Chinese herbal medicines used for the medical treatment of headaches, migraine, dizziness, epilepsy, rheumatism, neuralgia, paralysis and other neuralgic and nervous disorders. Immobilize stressed rat markedly increased tyrosine hydroxylase (TH) mRNA and dopamine-$\beta$-hydroxylase (DBH) mRNA transcription level more than control group. But treated Gastrodia elata extracts in immobilized stressed rat slightly increased TH mRNA and DBH mRNA transcription level more than normal group. In addition, we are obtained identical results in PC12 cell line. Decrease of transcription level of TH mRNA and DBH mRNA is indicating that Gastrodia elata have a anti-stress effects which decrease the transcription level of TH and DBH mRNA on catecholamine biosynthesis pathway.

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Identifying the cellular location of brain cytoplasmic 200 RNA using an RNA-recognizing antibody

  • Shin, Heegwon;Lee, Jungmin;Kim, Youngmi;Jang, Seonghui;Ohn, Takbum;Lee, Younghoon
    • BMB Reports
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    • 제50권6호
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    • pp.318-322
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    • 2017
  • Brain cytoplasmic 200 RNA (BC200 RNA) is a neuron-specific non-coding RNA, implicated in the inhibition of local synaptodendritic protein synthesis, and is highly expressed in some cancer cells. Although BC200 RNA has been shown to inhibit translation in vitro, the cellular location of this inhibition is unknown. In this study, we used a BC200 RNA-recognizing antibody to identify the cellular locations of BC200 RNA in HeLa cervical carcinoma cells. We observed punctate signals in both the cytoplasm and nucleus, and further discovered that BC200 RNA co-localized with the p-body decapping enzyme, DCP1A, and the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein E2 (hnRNP E2). The latter is a known BC200 RNA-binding partner protein and a constituent of p-bodies. This suggests that BC200 RNA is localized to p-bodies via hnRNP E2.

Inhibition of the Replication of Hepatitis C Virus Replicon with Nuclease-Resistant RNA Aptamers

  • Shin, Kyung-Sook;Lim, Jong-Hoon;Kim, Jung-Hye;Myung, Hee-Joon;Lee, Seong-Wook
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제16권10호
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    • pp.1634-1639
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    • 2006
  • Hepatitis C virus (HCV)-encoded nonstructural protein 5B (NS5B) possesses RNA-dependent RNA polymerase activity, which is considered essential for viral proliferation. Thus, HCV NS5B is a good therapeutic target protein for the development of anti-HCV agents. In this study, we isolated two different kinds of nuclease-resistant RNA aptamers with 2'-fluoro pyrimidines against the HCV NS5B from a combinatorial RNA library with 40 nucleotide random sequences, using SELEX technology. The isolated RNA aptamers were observed to specifically and avidly bind the HCV NS5B with an apparent $K_d$ of 5 nM and 18 nM, respectively, in contrast with the original RNA library that hardly bound the target protein. Moreover, these aptamers could partially inhibit RNA synthesis of the HCV subgenomic replicon when transfected into Huh-7 hepatoma cell lines. These results suggest that the RNA aptamers selected in vitro could be useful not only as therapeutic agents of HCV infection but also as a powerful tool for the study of the HCV RNA-dependent RNA polymerase mechanism.

Lactococcal plasmid pGKV21의 SSB-coated 229-nt ssi signal 상에서 E. coli RNA polymerase에 의한 시발체 RNA 합성 (Primer RNA Synthesis by E. coli RNA Polymerase on the SSB-coated 229-nt ssi Signal of Lactococcal Plasmid pGKV21)

  • 정진용;김은실;김삼웅;강호영;박정동
    • 생명과학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.305-310
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    • 2009
  • 플라스미드 pGKV21에는 229-nt single-strand DNA initiation (ssi) signal이 존재한다. Asymmetric PCR 기법으로 합성된 229-nt ssDNA 단편을 이용하여 실제로 RNA polymerase에 의한 priming ability와 protein interaction을 확인하였다. in vitro primer RNA 합성 실험 결과, 229-nt ssDNA 단편은 filamentous M13 phage의 주형 DNA에서와 비슷한 효율로 시발체 RNA를 합성하였으며, 이 반응은 strand-specific하게 이루어졌다. DNase I footprinting과 gel retardation 실험 결과, RNA polymerase와 SSB 단백질은 229-nt ssDNA 단편에 stable interaction을 하며, 시발체 RNA를 합성하였다. 또한, in vivo 조건 하에서 RNA polymerase의 저해제인 rifampicin을 처리하여 세포내에 ssDNA 중간체가 집적되는 정도를 비교하여 본 결과, 플라스미드 pGKV21은 rifampicin-sensitive RNA polymerase가 상보가닥 합성에 관여 함을 보여 주었다.