• 제목/요약/키워드: RIL

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Proteomic analysis of rice mutants susceptible to Magnaporthe oryzae

  • Ryu, Hak-Seung;Song, Min-Young;Kim, Chi-Yeol;Han, Muho;Lee, Sang-Kyu;Ryoo, Nayeon;Cho, Jung-Il;Hahn, Tae-Ryong;Jeon, Jong-Seong
    • Plant Biotechnology Reports
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    • 제3권2호
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    • pp.167-174
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    • 2009
  • To identify genes involved in rice Pi5-mediated disease resistance to Magnaporthe oryzae, we compared the proteomes of the RIL260 rice strain carrying the Pi5 resistance gene with its susceptible mutants M5465 and M7023. Proteins were extracted from the leaf tissues of both RIL260 and the mutant lines at 0, 24, and 48 h after M. oryzae inoculation and separated by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2-DE). Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) analysis identified eight proteins that were differently expressed between the resistant and susceptible plants (three down- and five up-regulated proteins in the mutants). The down-regulated proteins included a triosephosphate isomerase (spot no. 2210), a 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase (no. 3611), and an unknown protein (no. 4505). In addition, the five up-regulated proteins in the mutants were predicted to be a fructokinase I (no. 313), a glutathione S-transferase (no. 2310), an atpB of chloroplast ATP synthase (no. 3616), an aminopeptidase N (no. 3724), and an unknown protein (no. 308). These results suggest that proteomic analysis of rice susceptible mutants is a useful method for identifying novel proteins involved in resistance to the M. oryzae pathogen.

Analysis of genome variants in dwarf soybean lines obtained in F6 derived from cross of normal parents (cultivated and wild soybean)

  • Roy, Neha Samir;Ban, Yong-Wook;Yoo, Hana;Ramekar, Rahul Vasudeo;Cheong, Eun Ju;Park, Nam-Il;Na, Jong Kuk;Park, Kyong-Cheul;Choi, Ik-Young
    • Genomics & Informatics
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    • 제19권2호
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    • pp.19.1-19.9
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    • 2021
  • Plant height is an important component of plant architecture and significantly affects crop breeding practices and yield. We studied DNA variations derived from F5 recombinant inbred lines (RILs) with 96.8% homozygous genotypes. Here, we report DNA variations between the normal and dwarf members of four lines harvested from a single seed parent in an F6 RIL population derived from a cross between Glycine max var. Peking and Glycine soja IT182936. Whole genome sequencing was carried out, and the DNA variations in the whole genome were compared between the normal and dwarf samples. We found a large number of DNA variations in both the dwarf and semi-dwarf lines, with one single nucleotide polymorphism (SNP) per at least 3.68 kb in the dwarf lines and 1 SNP per 11.13 kb of the whole genome. This value is 2.18 times higher than the expected DNA variation in the F6 population. A total of 186 SNPs and 241 SNPs were discovered in the coding regions of the dwarf lines 1282 and 1303, respectively, and we discovered 33 homogeneous nonsynonymous SNPs that occurred at the same loci in each set of dwarf and normal soybean. Of them, five SNPs were in the same positions between lines 1282 and 1303. Our results provide important information for improving our understanding of the genetics of soybean plant height and crop breeding. These polymorphisms could be useful genetic resources for plant breeders, geneticists, and biologists for future molecular biology and breeding projects.

잡초성벼인 강화앵미11 유래 잎도열병 저항성 유전자 탐색 (Identification of Leaf Blast Resistance Genes Derived from a Korean Weedy Rice, Ganghwaaengmi 11)

  • 서정필;조영찬;김정주;신영섭;양창인;노재환;김연규
    • 한국육종학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.390-396
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    • 2010
  • 본 연구는 국내 수집 잡초성벼에 존재하는 잎도열병 저항성 관련 유전자를 탐색하고, 이 저항성유전자와 연관된 분자 마커를 탐색하는 것이다. 도열병에 감수성인 자포니카 품종인 낙동벼와 도열병에 강한 잡초성벼인 강화앵미11을 교잡하여 120개 RILs를 육성하여, 도열병 균주반응과 잎도열병 밭못자리검정을 통한 저항성 유전자 탐색에 이용하였다. 1. 총 45개 도열병 균주를 이용하여 양친들을 검정한 결과, 잡초성벼 강화앵미11은 25개 균주에 대하여 저항성 반응을 보였고, 낙동벼는 1개의 균주에만 저항성 반응을 보였다. 2. 강화앵미11이 저항성반응을 보이는 25개 균주 중에서 90-008등 9개 균주를 선발하여 120개 RILs에 대한 도열병 균주에 대한 저항성반응을 조사한 결과, 대부분의 RILs이 저항성반응으로 치우친 경향을 보였으며, 수원, 철원 및 남양 잎도열병 밭못자리 검정포장에서 실시한 120 RILs의 저항성반응 분포도 도열병 균주반응에서 나타난 결과와 유사한 경향을 보였다. 3. 12번 염색체 OSR32-RM101 영역에서 90-008, 97-268, 93-456, 04-226, 03-177 및 87-138 도열병 균주와 수원, 철원, 남양 지역 잎도열병 밭못자리 검정에 대한 저항성 유전자를 탐색하였으며, 이 저항성 유전자는 강화앵미11에서 유래되었고, 표현형변이를 60%이상 설명하는 주동유전자인 것으로 추정된다. 4. 90-008균주와 남양 잎도열병 밭못자리 검정에 대한 저항성 유전자는 12번 염색체 외에 11번 염색체에서도 탐색되었으며, 93-456 균주와 철원, 수원지역 잎도열병 밭못자리 검정에 대한 저항성유전자는 7번과 11번 염색체에서도 탐색되었고, 이들 저항성유전자는 낙동벼 대립유전자에 의해 저항성이 증가되었다.

국내 잡초벼(완도앵미6) 유래 RILs 집단의 식미 관련 특성분석 및 우량계통 선발 (Development of Elite Lines with Improved Eating Quality Using RIL Population Derived from the Korean Weedy Rice, Wandoaengmi6)

  • 김석만;박슬기;박현수;백만기;정종민;조영찬;서정필;이건미;이창민;김춘송
    • 한국국제농업개발학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.428-436
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    • 2019
  • 본 연구는 국내 잡초벼인 완도앵미6의 식미관련 유용인자를 자포니카벼 품종에 도입하여 식미가 개선된 새로운 품종을 개발하기 위한 기초 육종연구로 수행되었다. 식미개선을 위하여 국내 자포니카 벼 품종인 화영과 윤기치가 우수한 국내 잡초벼인 완도앵미6를 교배하여 재조합 자식계통을 육성하였으며 이 조합으로부터 고품질 품종 개발에 활용 가능한 우량계통을 육종에 이용하고자 수행한 결과는 다음과 같다. 1. 화영과 완도앵미6 조합의 교배립을 생산하여 SSD법으로 8세대까지 계통전개 하였으며 초형 등을 고려하여 최종 224계통의 RIL을 육성하였다. 2. 육성된 RIL집단의 주요 농업특성 특성을 3년(2016-2018) 간 평가하여 연차간 변이를 확인하였으며, 육성된 집단으로부터 작물학적 특성과 식미관련 특성이 우수한 10계통을 선발하였다. 3. 선발된 계통에 대한 아밀로스 함량, 단백질 함량, 알칼리 붕괴도 등의 이화학적 특성을 분석하였는데, 특히 선발된 계통 모두가 수여친인 완도앵미6의 수준에서 윤기치가 개선된 것을 확인하였다. 4. 식미와 관련이 높은 것으로 알려진 밥의 질감과 관련하여 관능평가와 기계적 물성 측정값에 대한 비교에서 두 방법간에 상관이 확인되지 않아 이에 대한 보완 연구가 필요할 것으로 사료된다.

콩 우수 계통 '천알'에서 발견한 역병 저항성 유전자좌 (Identification of a Locus Associated with Resistance to Phytophthora sojae in the Soybean Elite Line 'CheonAl')

  • 유희진;강은지;강인정;김지민;강성택;이성우
    • 한국작물학회지
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    • 제68권3호
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    • pp.134-146
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    • 2023
  • 콩 역병(Phytophthora root rot, PRR)은 난균(oomycete)인 Phytophthora sojae에 의해 발생하는 콩의 주요 병 중 하나로, 배수가 잘 안 되는 밭이나 습한 토양에서 심하게 발생한다. 역병의 피해를 효과적으로 줄일 수 있는 방법은 주로 역병 저항성 품종을 재배하는 것으로, 이는 저항성 유전자 Rps (resistance to P. sojae)에 대한 연구를 중심으로 이루어진다. 본 연구는 대풍 과 천알(계통명 SS0404-T5-76)을 교배하여 구축한 RIL (recombinant inbred line) 집단을 이용하여 콩 역병 균주40468과 연관된 저항성 유전자좌를 탐색하기 위해 수행되었다. 역병 균주40468에 대한 저항성 평가는 하배축 접종(hypocotyl inoculation) 방법으로 이루어졌다. 저항성 검정 결과, 천알은 저항성,대풍은 감수성을 보였고 집단 내에서는 계통들의 표현형이 분리되는 양상을 보였다. 집단 내에서 표현형 분포는 1:1 (R:S) (χ2 = 0.57, p = 0.75) 분리비와 일치하였으며, 이는 저항성 반응이 단일 유전자에 의해 조절됨을 나타낸다. 대풍, 천알과 각 RIL 계통들은 고밀도 SNP 유전자형 분석을 통해 데이터를 얻었고, 이를 바탕으로 유전자 지도를 작성하였다. 일원분산 분석(Single-marker ANOVA) 및 linkage analysis 결과, 18번 염색체의 55.9~56.4 Mbp에서 높은 통계적 유의성을 보였으며, 이 지역의 표현형 분산은 ~98%로 나타났다. 탐색된 영역은 다수의 선행연구에서 Rps의 위치로 보고된 지역과 겹치며, 콩 표준 유전체 정보를 기반으로 0.5 Mbp 범위 내에서 leucine-rich repeat (LRR) 또는 serine/threonine kinase(STK)을 합성하는 유전자 9개를 포함하고 있다. 천알은 역병 균주40468에 대한 저항성 유전자좌가 밝혀진 첫 국내 콩 품종으로, 본 연구에서 밝힌 천알의 저항성 유전자좌는 향후 역병 저항성 육종 및 연구에서 유용한 재료가 될 것이다.

고려의 관학과 효경

  • 전준우
    • 한국도서관정보학회지
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    • 제3권
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    • pp.79-88
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    • 1976
  • In Ecorea Lrynasty, the authority all officers a compulsary obligatic.~ to learn the Nyo-I~.'z~\ulcorneruzngd er the custody of a super1 iscr o; Letters wino -1 a\ulcorner the ~ejponsible officer to train ci~ril senants. The Nyo-Kjli ilg was possible to interpret the pious love of ci I illans to the~re lders as a mutual ethics between the parental ber~ec;~lc nce and the filial piety of inferiors which n-as far superior to the traditional cthic; that was laid on an firm obligation of inieri~rs to tEei:- elders. The filial piety as a lovc for elders mean2 a mutual harrn~n:a~n d show\ulcorner a berieiolent conduct as an influence of a political morality. Thc heaer-o!erLt conduct was developed as a political morality of Confucius originated from the filial piety of Confucius based on a moral policj . Such a kenerolent conduct is to become a main spring to effect a mutual tie betn-een the king and his people as a national system of the Confucian theory. In i*

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