• 제목/요약/키워드: RARa

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흰쥐 대뇌세포의 저산소증 모델에서 석창포(石菖浦 Acori graminei rhizoma. AGR)에 의한 유전자 표현 변화의 microarray 분석 (Microarray Analysis of Alteration in Gene Expression by Acori graminei rhizoma (AGR) Water-Extract in a Hypoxic Model of Cultured Rat Cortical Cells)

  • 박동준;정승현;문일수;이원철;신길조
    • 생명과학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.150-161
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    • 2007
  • Acori graminei Rhizomn (AGR) is a perennial herb which has been used clinically as a traditional oriental medicine against stroke, Alzheimer's disease, and vascular dementia. We investigated the effect of AGR on the modulation of gene expression profile in a hypoxic model of cultured rat cortical cells. Rat cerebrocortical cells were grown in Neurobasal medium. On DIV12, cells were treated with AGR $(10ug/m\ell)$, given a hypoxic shock (2% $O_2$, 3 hr) on DIV14, and total RNAs were prepared one day after shock. Microarray analyses indicated that the expression levels of most genes were altered within the global M values +0.5 and -0.5, i.e., 40% increase or decrease. There were 750 genes which were upregulated by < global M +0,2, while 700 genes were downregulated by > global M -0.2. The overall profile of gene expression suggests that AGR suppresses apoptosis (upregulation of anti-apopotic genes such as TEGT, TIEG, Dad, p53, and downregulation of pro-apopotic genes such as DAPK, caspase 2, pdcd8), ROS (upregulation of RARa, AhR), and that AGR has neurotrophic effects (upregulation of Aktl, Akt2). These results provide a platform for investigation of the molecular mechanism of the effect of AGR in neuroprotection.

New genotype classification and molecular characterization of canine and feline parvoviruses

  • Chung, Hee-Chun;Kim, Sung-Jae;Nguyen, Van Giap;Shin, Sook;Kim, Jae Young;Lim, Suk-Kyung;Park, Yong Ho;Park, BongKyun
    • Journal of Veterinary Science
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    • 제21권3호
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    • pp.43.1-43.13
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    • 2020
  • Background: Canine parvovirus (CPV) and feline panleukopenia (FPV) cause severe intestinal disease and leukopenia. Objectives: In Korea, there have been a few studies on Korean FPV and CPV-2 strains. We attempted to investigate several genetic properties of FPV and CPV-2. Methods: Several FPV and CPV sequences from around world were analyzed by Bayesian phylo-geographical analysis. Results: The parvoviruses strains were newly classified into FPV, CPV 2-I, CPV 2-II, and CPV 2-III genotypes. In the strains isolated in this study, Gigucheon, Rara and Jun belong to the FPV, while Rachi strain belong to CPV 2-III. With respect to CPV type 2, the new genotypes are inconsistent with the previous genotype classifications (CPV-2a, -2b, and -2c). The root of CPV-I strains were inferred to be originated from a USA strain, while the CPV-II and III were derived from Italy strains that originated in the USA. Based on VP2 protein analysis, CPV 2-I included CPV-2a-like isolates only, as differentiated by the change in residue S297A/N. Almost CPV-2a isolates were classified into CPV 2-III, and a large portion of CPV-2c isolates was classified into CPV 2-II. Two residue substitutions F267Y and Y324I of the VP2 protein were characterized in the isolates of CPV 2-III only. Conclusions: We provided an updated insight on FPV and CPV-2 genotypes by molecular-based and our findings demonstrate the genetic characterization according to the new genotypes.

Alport 증후군에서 사구체 기저막의 형태학적 변화와 사구체 상피세포의 구조 및 임상지표와의 관계 (Relationship of Glomerular Basement Membrane Alterations to Epithelial Cell Structure and Clinical Parameters in Alport Syndrome)

  • 엄혜진;홍성진;이재승;정현주;김영기;김기혁
    • Childhood Kidney Diseases
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    • 제14권1호
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    • pp.22-31
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    • 2010
  • 목 적 : Alport증후군 환자의 사구체 기저막의 형태학적 변화 및 사구체 상피세포의 구조 변화에 따른 임상지표간의 상관 관계를 알아보고자 하였다. 방 법 : Alport 증후군으로 확진된 15명의 환자를 대상으로 하였다. 사구체 기저막을 형태학적 변화에 따라 1) 정상(C1), 2) minor alteration: widening of lamina rara interna or externa without lamina densa changes (C2), 3)nonspecific splitting of lamina densa (C3), 4) basket-weave pattern of lamina densa splitting (C4)의 4가지 범주로 나누고 각 범주에 해당하는 사구체 기저막의 비율을(%) 측정하였다. 또한 각 범주의 사구체 기저막에서 사구체 기저막 $10\;{\mu}m$에 대한 상피세포의 세과여극(slit pore)의 밀도를 구하였고, 나이에 따른 사구체 기저막의 형태학적 변화를 살펴보았다. 결 과 : 요 중 단백질 배설량과 정상 기저막 소견(C1) 사이는 역비례 관계를 보였고(P<0.05), 요 중 단백질 배설량과 비정상 사구체 기저막 소견(C2+C3+C4) 사이는 정비례 관계를 보였다(P<0.05). 비정상적 기저막 소견을 보이는 각 범주와 단백뇨나 크레아티닌 청소율과는 의미 있는 상관관계가 없었다. 크레아티닌 청소율과 정상 사구체 기저막(C1)의 비율과의 관계는 통계적인 의미가 없었고(P=0.085), 비정상 사구체 기저막(C2+C3+C4)의 비율과도 통계적으로 의미가 없었다(P=0.080). 신생검 당시의 나이와 사구체 기저막의 형태학적 변화도 상관관계가 없었다. 결 론 : Alport 증후군 환자에서 사구체 기저막의 변화는 단백뇨와 관련성이 있지만 사구체 상피세포 구조와 사구체여과율과는 관련성이 없었다.

반하후박탕(半夏厚朴湯)이 생쥐의 심리적 스트레스에 미치는 영향과 유전자 분석 (Effect of Banhahoobak-tang (Banxiahoupo-tang) Extract (BHTe) on Psychological Stress)

  • 최금애;조수인;김경수;최창원;위통순;양승정;박수연;김경옥
    • 동의신경정신과학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.117-130
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    • 2015
  • Objectives: Banhahoobak-tang has been used to treat plum-pit qi, chest and hypochondriac distension, moist or greasy tongue coat, and wiry slow or wiry slippery pulse. It might be used to control coughing and vomiting. We observed that Banhahoobak-tang extract (BHTe) had anti-psychological stress effect. The objective of this study was to determine the effect of BHTe on restoring the transcriptional regulation of genes related to psychological stress. Methods: After giving psychological stress to mice, BHTe was orally administered at 100 mg/kg/day for five days. After extracting whole brain tissue from the mice, the gene expression changes were determined by microarray. Transcription factor binding site (TFBS) analysis showed up- and down-regulated genes related to psychological stress were protected by BHTe and segregated according to the structure of TFBS. We performed text based Pubmed search to select significant target genes involved in psychological stress affected by BHTe. Results: 1. Serum corticosterone level was decreased in the BHTe administered group, although the psychological stress was increased. 2. The BHTe administered group had no significant change in noradrenaline content in brain tissue, but the psychological stress group had decreased level. 3. The BHTe administered group had increased time of staying at open-arm than the psychological stress group. 4. Microarray revealed that TANK and RARA genes were up-regulated genes while AES, CDC42, FOS, NCL, and PVR were down-regulated genes by psychological stress but restored by BHTe.

섬진강 하류계에서 유종섬모충류의 군집구조와 계절적 동태 (Seasonal Dynamics and Community Structure of Tintinnina in lower Seomjin River System)

  • 유형빈;박수산
    • 환경생물
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    • 제19권1호
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    • pp.25-36
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    • 2001
  • 본 연구는 유종섬모충류의 생태학적 특성을 알아보기 위하여 1998년 3월부터 1999년 1월까지 격월로 섬진강 하류계에서 12개 정점을 선정하여 실시하였다. 조사기간 중 유종섬모충류는 총 8속 56종이 동정 분류되었다. 출현종의 월별분포는 1998년 3월에 7속 40종으로 가장 많이 출현하였고, 1998년 11월에 2속 3종으로 가장 적은 종이 출현하였다. 출현종의 정점별 분포는, 정점 12에서 8속 38종으로 가장 많았고, 정점 3에서 2속 5종으로 가장 적게 출현하였다. 유종섬모충류의 월별 총출현량은 20,099 (5월) - 699,502 indiv./㎥ (3월)의 범위로 변동하고 있었다. 정점별로는 정점 11에서 가장 많은 출현량(431,706 indiv./㎥)을 보였고, 정점 4에서 가장 적은 출현량(8,777 indiv./㎥)을 보였다. 우점종은 22종으로 그중 Tintinnopsis속이 18종으로 전체 우점종의 81.8%를 차지하였다. 유종섬모충류의 군집동태와 환경요인과의 상관관계에서는 여러 환경요인 중 수온과 염분도가 군집동태에 가장 큰 영향을 미친 것으로 조사되었는데 수온은 10-15$^{\circ}C$에서, 염분도는 10.1-25.0$\textperthousand$ 구간에서 다양한 종 조성과 높은 출현량을 나타내었다.

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