• 제목/요약/키워드: R-Q model

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2차원 수치모형을 이용한 남한강과 섬강 합류부 구간의 흐름 및 하상변동 해석 (Numerical analysis of flow and bed change at a confluence of the Namhan River and the Seom River using a two-dimensional model)

  • 박문형;김형석;백창현
    • 한국수자원학회논문집
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    • 제51권12호
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    • pp.1273-1284
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    • 2018
  • 본 연구에서는 4대강 살리기 사업 후 퇴적현상이 지배적으로 발생하는 남한강과 섬강 합류부 구간을 대상으로 2차원 수치모형인 CCHE2D 모형을 이용하여 하천의 흐름 및 하상변동에 대한 해석을 수행하였다. 대상지점 합류부는 남한강 본류의 만곡부에 지류 섬강이 유입되는 특성을 갖는다. CCHE2D 모형은 비평형 유사이송을 해석하며 소류사와 부유사 조정거리가 중요한 입력변수로 대상지점에서는 소류사 조정거리가 하상변동에 가장 큰 영향을 주는 것으로 나타났다. 수치모의 결과 유량비($Q_r$) 변화가 남한강과 섬강 합류부 지점에서 흐름 및 하상변동에 영향을 미쳤으며, $Q_r{\leq}2.5$인 경우에는 합류전 본류의 유속이 증가하여 흐름박리구역을 감소시켰으며 이로 인해 합류부 내측의 퇴적이 감소하였다. $Q_r$>2.5이면 합류부 구간에 퇴적이 증가하여 사주가 형성될 가능성이 높은 것으로 나타났다. 수치모의를 통해 2013년에 발생한 유량비 변화에 의해 합류부에 고정사주가 형성된 것을 알 수 있었다.

고추역병균(Phytophthora capsici)에 대한 N-Phenylbenzenesulfonamide 유도체들의 살균활성에 관한 3D-QSAR 분석과 고활성 화합물의 예측 (3D-QSAR Analysis on the Fungicidal Activity with N-Phenylbenzenesulfonamide Analogues against Phytophthora blight (Phytophthora capsici) and Prediction of Higher Active Compounds)

  • 성민규;강규영;조윤기;성낙도
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제50권3호
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    • pp.192-197
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    • 2007
  • 고추역병균(Phytophthora capsici)에 대한 N-phenylbenzenesulfonamide 및 N-phenyl-2-thienylsulfonamide 유도체(1-37)들의 살균활성에 관한 3차원적인 정량적 구조와 활성과의 관계(3DQSARs)들을 비교 분자장 분석(CoMFA)과 비교분자 유사성 지수분석(CoMSIA) 방법으로 각각 검토하였다. CoMFA(2) 모델($r^2_{cv.}(q^2)$ = 0.692 및 $r^2_{ncv.}$= 0.965)이 CoMSIA(2) 모델($r^2_{cv.}(q^2)$ =0.796 및 $r^2_{ncv.}$= 0.958)보다 상관성과 예측성이 양호하였다. 최적의 CoMFA(2) 모델에 따른 살균활성은 분자의 입체장과 정전기장에 의존적이었다. 또한, CoMFA(2) 모델의 등고도 분석 결과로부터 살균활성의 63%가 입체적으로 큰 S-phenyl 고리의 meta-치환기($R_1$) 그리고 나머지 살균활성의 32.9%가 양하전을 띄는 N-phenyl 고리의 $R_4$-치환기와 S-phenyl 고리의 para-치환기($R_1$)에 기인하는것으로 예측되었으며 이 같은 사실에 기초하여 일련의 고활성 화합물, $R_1$ = 3-decyl 치환체 ($pred.pI_50$ = 5.88) 등이 예측되었다.

N-phenylbenzenesulfonamide 유도체들에 의한 모잘록병균 (Pythium ultimum)의 살균활성에 관한 CoMFA 및 CoMSIA분석 (CoMFA and CoMSIA Analysis on the Fungicidal Activity against Damping-off (Pythium ultimum) with N-phenylbenzenesulfonamide Analogues)

  • 장석찬;강규영;성낙도
    • 농약과학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.8-17
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    • 2007
  • N-phenylbenzenesulfonamide 및 N-phenyl-2-thienylsulfonamide 유도체(1-34)들의 phenyl 및 theinyl 고리상치환기(R1-R5) 변화에 따른 모잘록병균(Pythium ultimum)의 살균활성에 관한 3차원적인 정량적 구조와 활성과의 관계(3D-QSARs)들을 비교 분자장 분석(CoMFA)과 비교분자 유사성 지수분석(CoMSIA) 방법으로 각각 검토하였다. 전반적으로 CoMSIA 모델들의 통계값은 atom based fit 정렬보다는 field fit 정렬시에 높은 값을 나타내었으나 CoMFA모델의 경우에는 차이가 없었다. 그리고 CoMSIA (FF1) 모델($r_{cv.}^2\;(q^2)=0.674$$r_{ncv.}^2=0.964$)이 CoMFA (AF5) 모델($r_{cv.}^2\;(q^2)=0.616$$r_{ncv.}^2=0.930$)보다 상관성과 예측성이 양호하였다. CoMSIA (FF1) 모델의 정보에 따라 살균활성은 분자의 정전기장과 소수성장에 의존적이었다. 또한, CoMSIA (FF3) 모델의 등고도 분석 결과로부터 N-phenyl 고리상 R4-치환기의 친수성과 수소결합 받게로서의 성질인 모잘록병균의 살균활성에 기여할 것으로 예상되었다.

Isolation and Identification of a Photosynthetic Bacterium Containing a High Content of Coenzyme Q10

  • Jeong, Soo-Kyoung;Ahn, Soon-Cheol;Kong, In-Soo;Kim, Joong-Kyun
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제11권3호
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    • pp.172-176
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    • 2008
  • To develop a potent strain for the production of coenzyme $Q_{10}$, a photosynthetic bacterium was isolated from silt of the Nakdong River in Korea. Using l6S-rDNA sequence analysis, the isolated strain was identified as Rhodobacter sphaeroides. A stable improvement in its $CoQ_{10}$ content was achieved by chemical mutation, upon which the content of $CoQ_{10}$(2.94 mg/g dry cell) was increased by approximately 1.9-fold, comparable to that of R. sphaeroides reported in other studies. The isolate is a potentially valuable microorganism for mass production of $CoQ_{10}$, and may provide an appropriate model for further study of economical mass production.

옥수수의 색소 발현에 관련된 조직 특이성 조절유전자 R locus에 관하여 (Tissue Specific Gene Regulation of The Anthocyanin Synthesis Regulator Gene R in Maize)

  • 임용표
    • 한국식물학회:학술대회논문집
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    • 한국식물학회 1987년도 식물생명공학 심포지움 논문집 Proceedings of Symposia on Plant Biotechnology
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    • pp.323-347
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    • 1987
  • The R locus of maize in one of several genes that regulate the anthocyanin pigments throughout the body of the plant and seed. The R gene product may regulate pigment deposition by controlling the expression of the flavonoid biosynthetic gene pathway in a tissue-specific manner. To understand the basis for tissue specific regulation and allelic variation at R, the molecular study has been done by cloning a portion of the R complex by transposon tagging with Ac. R specific probe were cloned from the R-nj mutant induced by Ac insertion mutagenesis. From southern analysis of R-r complex using the R-nj probe, the structure of R-r was proposed that R-r containes the three elements, (P)(Q)(S). These elements may organize as the inversion triplication model which (S) sequence was inverted in relation to (P) and (Q). The R-sc derivated from R-mb or R-nj was cloned with R-nj probe, and molecular genetical data showed that R-sc containes tissue specific and tissue nonspecific area, and the sequencing of R-sc are progressed now.

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이노베이션 상관관계 테스트를 이용한 잡음인식 (Identification of Noise Covariance by using Innovation Correlation Test)

  • 박성욱
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 1992년도 하계학술대회 논문집 A
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    • pp.305-307
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    • 1992
  • This paper presents a technique, which identifies both process noise covariance and sensor noise covariance by using innovation correlation test. A correlation test, which checks whether the square root Kalman filter is workingly optimal or not, is given. The system is stochastic autoregressive moving-average model with auxiliary white noise Input. The linear quadratic Gaussian control is used for minimizing stochastic cost function. This paper indentifies Q, R, and estimates parametric matrics $A(q^{-1}),B(q^{-1}),C(q^{-1})$ by means of extended recursive least squares and model reference control. And The proposed technique has been validated in simulation results on the fourth order system.

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CoMFA vs. Topomer CoMFA, which One is better a Case Study with 5-Lipoxygenase Inhibitors

  • Gadhe, Changdev G.
    • 통합자연과학논문집
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    • 제4권2호
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    • pp.91-98
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    • 2011
  • Quantitative structure-activity relationships (QSAR) have been applied for two decades in the development of relationships between physicochemical properties of chemical substances and their biological activities to obtain a reliable statistical model for prediction of the activities of new chemical entities. The fundamental principle underlying the QSAR is that the structural difference is responsible for the variations in biological activities of the compounds. In this work, we developed 3D-QSAR model for a series of 5-Lipoxygenase inhibitors, utilizing comparative molecular field analysis (CoMFA) and Topomer CoMFA methodologies. Our developed models addressed superiority of Topomer CoMFA over CoMFA. The CoMFA model was obtained with $q^2$=0.593, $r^2$=0.939, $Q^2$=0.334 with 6 optimum number of components (ONC). Higher statistical results were obtained with the Topomer CoMFA model ($q^2$=0.819, $r^2$=0.947, ONC=5). Further robustness of developed models was checked with the ANOVA test and it shows F=113 for CoMFA and F=162.4 for Topomer CoMFA model. Contour map analysis indicated that the more requirement of electrostatic parameter for improved potency.

코스닥 제약기업의 연구개발비 무형자산화 비중이 기업가치에 미치는 영향 (The Influence on Enterprise Value of R&D Costs of KOSDAQ pharmaceutical companies)

  • 조영란;이상원
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제20권11호
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    • pp.487-493
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    • 2019
  • 본 연구는 제약기업대상 연구개발비 무형자산비중을 살펴보고, 무형자산화 비중이 기업 가치에 영향을 미치는지 코스닥제약기업 중심으로 살펴보았다. 연구대상은 2011년부터 2017년까지 코스닥에 상장된 연도별, 기업별 연구개발비 회계자료가 있는 제약기업 39개를 표본으로 종속변수로 토빈Q, 독립변수로 연구개발비 무형자산화 비중으로 설계하여 패널데이터모형으로 분석하였다. 결론은 코스닥제약기업은 연구개발비 무형자산화 비중이 토빈Q(기업가치)에 부정적인 영향을 미치는 것으로 나타났다. 연구개발비 무형자산비중이 클수록 코스닥 제약기업에서는 기업가치가 낮아질 수 있다는 시사점을 제공한다. 즉, 코스닥 제약기업에서는 부채비율이 높을수록 투자규모를 늘리는 현상을 반영하기에 무형자산 비중이 커진다고 해서 기업가치가 증가하지 않는다는 것으로 설명할 수 있다. 본 연구는 기존 연구들은 연구개발비 총액을 기업 가치와 관련성을 규명한 연구들이 대부분인 반면, 연구개발비를 좀 더 세분화해서 '무형자산화 비중'만을 놓고, 코스닥 제약기업의 기업 가치에 영향을 미치는지 여부를 연구했다는 데 그 의의가 있다.

SWAT-MODFLOW를 활용한 남한강 복하천유역의 지하수 모의 평가 (Groundwater evaluation in the Bokha watershed of the Namhan River using SWAT-MODFLOW)

  • 한대영;이지완;장원진;김성준
    • 한국수자원학회논문집
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    • 제53권11호
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    • pp.985-997
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    • 2020
  • SWAT (Soil Water Assessment Tool)-MODFLOW은 준분포형 연속강우유출모형과 분포형 지하수 모형을 결합한 모델이다. 본 연구는 남한강에 위치한 복하천 유역의 지하수에 대해 SWAT과 SWAT-MODFLOW의 모의결과를 비교평가 하였다. 두 모델간의 비교에 앞서 각 모델은 유역 내 흥천 수위 관측소의 일별 유출량 자료와 율현 지하수위 관측데이터의 9년(2009 ~ 2017년)의 자료로 보정 및 검증되었다. SWAT의 경우 기저유량과 감수위에 영향을 주는 GW_DELAY, GWQMN과 ALPHA_BF를 이용하여 보정하였고 그 결과 결정계수(R2)는 0.70, Nash-sutcliffe 모델효율(NSEQ, NSEinQ)은 각각 0.73, -0.1을 나타냈다. SWAT-MODFLOW의 경우는 토양속성별 대수층 수리전도도(K, m/day), 비저류량(Ss, 1/m), 비산출량(Sy) 및 유효토심(m) 자료가 추가로 적용되었다. 동일 기간의 모의 결과 R2, NSEQ, NSEinQ는 각각 0.69, 0.74, 0.51을 나타냈다. 특히, SWAT-MODFLOW 적용결과 대수층의 수리지질학적 자료 입력을 통해 저유량 모의가 상당히 개선되었다. SWAT과 SWAT-MODFLOW의 총 유출량은 각각 718.6 mm, 854.9 mm이며 기저유량은 각각 342.9 mm, 423.5 mm로 산정되었다.

Structure and Photoreaction of Photoactive Yellow Protein

  • Imamoto, Yasushi;Harigai, Miki;Shimizu, Nobutaka;Kamikubo, Hironari;Yamazaki, Yoichi;Kataoka, Mikio
    • Journal of Photoscience
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    • 제9권2호
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    • pp.126-129
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    • 2002
  • The chromophore/protein interactions in the photocycle intermediates of photoactive yel- low protein (PYP) were probed by site-directed mutagenesis. The absorption spectra of L- intermediates produced from E46Q, T50V, and R52Q mutants were calculated using the absorption spectra of dark states and difference absorption spectra between L-intermediates and dark states, and compared with that of PYP$\_$L/. The absorption spectrum of R52Q$\_$L/ agreed with that of PYP$\_$L/, but those of E46Q$\_$L/ and T50V$\_$L/ were red-shifted. The effect of these mutations on the absorption spectrum for L-intermediate was comparable to that for the dark state, suggesting that the interaction around the phe-nolic oxygen of the chromophore is conserved in PYP$\_$L/ unlike the crystal structure. On the other hand, we have reported that the absorption spectra of Y 42F$\_$M/, T50V $\_$M/, and R52Q$\_$M/ agreed with that of PYP$\_$M/, but that of E46Q$\_$M/ was red-shifted, suggesting that the hydrogen bond of the chromophore with Glu46 is conserved but that with Tyr42 is broken in PYP$\_$M/. These results suggest that the chromophore inter-acts with Glu46 throughout the photocycle, but never directly interacts with Arg52. This model con- flicts with some of the structural model of PYP intermediates proposed based on the high-resolution X -ray crystallography.

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