Objective: The first stage in both breeding and programs for the conservation of genetic resources are the identification of genetic diversity in the relevant population. The aim of the present study is to identify genetic diversity of six brown layer pure chicken lines (Rhode Island Red [RIRI, RIRII], Barred Rock [BARI, BARII], Columbian Rock [COL], and line 54 [L-54]) with microsatellite markers. Furthermore, the study aims to employ its findings to discuss the possibilities for the conservation and sustainable use of these lines that have been bred as closed populations for a long time. Methods: In the present study, a total number of 180 samples belonging to RIRI (n = 30), RIRII (n = 30), BARI (n = 30), BARII (n = 30), L-54 (n = 30), and COL (n = 30) lines were genotyped using 22 microsatellite loci. Microsatellite markers are extremely useful tools in the identification of genetic diversity since they are distributed throughout the eukaryotic genome in multitudes, demonstrate co-dominant inheritance and they feature a high rate of polymorphism and repeatability. Results: In this study, we found all loci to be polymorphic and identified the average number of alleles per locus to be in the range between 4.41 (BARI) and 5.45 (RIRI); the observed heterozygosity to be in the range between 0.31 (RIRII) and 0.50 (BARII); and $F_{IS}$ (inbreeding coefficient) values in the range between 0.16 (L-54) and 0.46 (RIRII). The $F_{IS}$ values obtained in this context points out to a deviation from Hardy-Weinberg equilibrium due to heterozygote deficiency in six different populations. The Neighbour-Joining tree, Factorial Correspondence Analysis and STRUCTURE clustering analyzes showed that six brown layer lines were separated according to their genetic origins. Conclusion: The results obtained from the study indicate a medium level of genetic diversity, high level inbreeding in chicken lines and high level genetic differentiation between chicken lines.
Saleem, Asima;Sahar, Amna;Pasha, Imran;Shahid, Muhammad
Food Science of Animal Resources
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v.42
no.4
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pp.672-688
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2022
The objective of this study was to explore the potential of front face fluorescence spectroscopy (FFFS) as rapid, non-destructive and inclusive technique along with multi-variate analysis for predicting meat adulteration. For this purpose (FFFS) was used to discriminate pure minced beef meat and adulterated minced beef meat containing (1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, and 100%) of chicken meat as an adulterant in uncooked beef meat samples. Fixed excitation (290 nm, 322 nm, and 340 nm) and fixed emission (410 nm) wavelengths were used for performing analysis. Fluorescence spectra were acquired from pure and adulterated meat samples to differentiate pure and binary mixtures of meat samples. Principle component analysis, partial least square regression and hierarchical cluster analysis were used as chemometric tools to find out the information from spectral data. These chemometric tools predict adulteration in minced beef meat up to 10% chicken meat but are not good in distinguishing adulteration level from 1% to 5%. The results of this research provide baseline for future work for generating spectral libraries using larger datasets for on-line detection of meat authenticity by using fluorescence spectroscopy.
There are considerable reports that the expression of insulin-like growth factor-Ⅰ (IGF-Ⅰ) is related to ovarian regulation and oviductal development in poultry. Korean Native Ogol Chicken (KNOC) have been inbred to keep a pure line so that there has been limitation in the improvement of egg productivity by genetic studies. Therefore, this study was conducted to investigate the early egg productivity of KNOC pre-selected by IGF-Ⅰ expression. (omitted)
Native chickens hold a significant share of the market in China. In response to the huge demand from the market, the productivity of Chinese native chickens needs to be improved. Cross breeding is an effective method to increase productivity, although it might affect meat quality. In this study, two pure lines (SD02 and SD03) of Erlang mountainous chickens were hybridized with a yellow feather and faster growing line (SD01). The effect of hybridization on carcass and meat quality (physiochemical and textural traits) was measured in the $F_1$ population at d 91 of age. The hybrids exhibited higher body weight and dressed weight, and amount of semi-eviscerated, eviscerated, breast muscle and abdominal fat (p<0.05). Abdominal fat yield also increased (p<0.05) compared to the offspring of the two pure-lines. Meanwhile, there was no significant difference in meat quality traits except for the myofiber diameter and density and the shear force of the breast muscle. Overall, the offspring of cross-lines were similar to pure lines in meat color, pH value, inosinic acid, crude protein, crude fat, dry matter, moisture content and amino acid composition in the breast muscle. These results suggest that productivity can be improved via cross-breeding while maintaining meat quality of the Erlang mountainous chicken.
Yoo, Jaehong;Koo, Bonjin;Kim, Eunjoo;Heo, Jung Min
Korean Journal of Agricultural Science
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v.42
no.1
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pp.23-27
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2015
The study was conducted to determine the effect of corssbred Korean native chickens (CKNC) on growth performance indices for hatch to 28 days. A total of 192 1-day-old birds were divided into one of 4 CKNC groups by 5 Korean native pure strains. Diets used in the study consisted of 2 phases with corn and soybean meal basis as earlier (1~2 weeks; crude protein 18.5%, metabolizable energy 3,000 kcal/kg), and grower (2~4 weeks; crude protein 15.0%, Metabolizable Energy 2,850 kcal/kg). Body weight and feed intake were measured bi-weekly. Crossbred 1G (group of family line) had higher body weight and average daily gain whereas crossbred 5Y had greater average daily feed intake and feed conversion ratio than other crossbred Korean native chicken for hatch to 28 days. The results in the current study indicated that crossbred 1G had higher growth performance indices compared with other crossbred Korean native chicken for hatch to 28 days.
Objective: This study was conducted to investigate the basic information on genetic structure and characteristics of Korean Native chickens (NC) and foreign breeds through the analysis of the pure chicken populations and commercial chicken lines of the Hanhyup Company which are popular in the NC market, using the 20 microsatellite markers. Methods: In this study, the genetic diversity and phylogenetic relationships of 445 NC from five different breeds (NC, Leghorn [LH], Cornish [CS], Rhode Island Red [RIR], and Hanhyup [HH] commercial line) were investigated by performing genotyping using 20 microsatellite markers. Results: The highest genetic distance was observed between RIR and LH (18.9%), whereas the lowest genetic distance was observed between HH and NC (2.7%). In the principal coordinates analysis (PCoA) illustrated by the first component, LH was clearly separated from the other groups. The correspondence analysis showed close relationship among individuals belonging to the NC, CS, and HH lines. From the STRUCTURE program, the presence of 5 clusters was detected and it was found that the proportion of membership in the different clusters was almost comparable among the breeds with the exception of one breed (HH), although it was highest in LH (0.987) and lowest in CS (0.578). For the cluster 1 it was high in HH (0.582) and in CS (0.368), while for the cluster 4 it was relatively higher in HH (0.392) than other breeds. Conclusion: Our study showed useful genetic diversity and phylogenetic relationship data that can be utilized for NC breeding and development by the commercial chicken industry to meet consumer demands.
Choi, Eun Sik;Bang, Min Hee;Kim, Ki Gon;Kwon, Jae Hyun;Chung, Ok Young;Sohn, Sea Hwan
Korean Journal of Poultry Science
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v.44
no.2
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pp.123-134
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2017
This study was conducted to establish new synthetic lines of Korean Native Chicken. We performed $5{\times}5$ diallel crossings with GPS lines of Korean Native Chicken for the selection of parent stock. The production traits including viability, body weight, age at first egg laying, egg weight, hen-day egg production, and hen-housed egg production were measured and analyzed for 25 crosses with 1,157 hens. The heterosis effects of these traits were also estimated. The results showed that the average survival rate during laying periods was 67.7% in the pure lines and 77.1% in the crosses. The 25 cross combinations were shown to be distinctly divided into three groups according to body weight; nine crosses in the high-weight group, 12 crosses in the medium-weight group and four crosses in the light-weight group. The average body weight at 12 weeks of age was $1,873.8{\pm}43.0g$ in the high group, $1,595.4{\pm}56.6g$ in the medium group and $1,152.7{\pm}24.7g$ in the light group, and $1,560.2{\pm}339.3g$ in the pure lines and $1,640.9{\pm}213.7g$ in the crosses. In terms of egg production performance, the age at first egg laying was $139.7{\pm}4.9$ days in the pure lines and $135.8{\pm}5.1$ days in the crosses. The average egg weight was $52.3{\pm}1.6g$ in the pure line and $53.0{\pm}1.6g$ in the crosses. The average hen-housed egg production from 20 to 40 weeks was $58.3{\pm}12.9$ eggs in the pure line and $69.2{\pm}10.4$ eggs in the crosses. The average heterosis effect was 16.9% for survival rate, 5.4% for body weight at 12 weeks, -2.7% for age at first egg laying, 1.3% for egg weight, and 14.3% for hen-day egg production. Generally, the heterosis effect for viability and egg production traits was higher than that for growth trait. On the basis of these results, it is expected that the selection of the HF combination, which had excellent growth performance, is the most desirable as the paternal strain, and the selection of GW and FW combinations, which had excellent laying performance, are preferable as the maternal strain.
Kim, Kigon;Park, Byoungho;Jeon, Iksoo;Choo, Hyojun;Ham, Jinjoo;Park, Keon;Cha, Jaebeom
Korean Journal of Poultry Science
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v.48
no.4
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pp.193-206
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2021
This study aimed to identify the growth performance of Korean indigenous chicken pure-line by sex and twelve strains conserved in Poultry Research Institute, National Institute of Animal Science, Rural Development Administration. The effect of sex and strain on body weight was significantly different in every period, with males being heavier in all periods than females. In the case of biweekly weight gain, the tendency to increase rapidly from birth to six weeks old, and to decrease in the period from twelve to fourteen weeks old was common across all sex and strains. Depending on sex and strain, there were significant differences in age and the number of peaks. Regardless of sex and strain, the determination coefficient and adjusted determination coefficient showed high goodness of fit (99.1~99.9%) to growth functions. However, for each model, the goodness-of-fit had variations by sex and strains. von Betalanffy function had the best fit to growth curves in all the female strains except strain D. On the other hand, Gompertz function had the best fit for all the male strains except strain C. Logistic function showed the lowest goodness-of-fit in all sex and strains. Mature weights were in the order of von bertalanffy, Gompertz, and Logistic models, while growth ratio and maturing rate followed the order of logistic, gompertz, and von bertalanffy functions. This information could be useful for Korean indigenous chicken management and designing crossbreeding tests and breeding programs.
This study carried out to investigate selection response of pure line population of layer chicken. Data for two layer pure line of Single Comb White Leghorn were collected from 1986 to 1991. Primary selection criteria were egg number to 270 days of age (EN270), egg weight(BW270), body weight (BW270) at 270 days of age and the days of the 1st egg(SM). The results obtained in this study are summarized as follows ; 1. Mean phenotypic values of two strains were decreased by 1.94 day(K), 1.320ay(F) for SM and increased by 0.09g(K), -0.05g(F) for EW 270 and 0.56(K), -0.78(F) for EN270. 2. The ratio of a realized selection differential to expected selection differentials for SM (sexual maturity), EW 270, and BW 270 were not significantly decreased during 5 generations. 3. Heritability were estimated from sib analysis. The means of estimates were 0.28(F), 0.39(K) for BW270, and 0.25(F), 0.29(K) for EN270 and 0.51(F), 0.48(K) for EW270. 4. The genetic gains were estimated by method of selection index in retrospect on the basis of selection differentials. EN270 and EW270 were found to increase by 2.01(F), 2.25(K) and 0.54 (F), 0.65(K) per generation.
Sohn, Sea Hwan;Choi, Eun Sik;Kim, Ki Gon;Park, Byeongho;Choo, Hyo Jun;Heo, Jung Min;Oh, Ki Suk
Korean Journal of Poultry Science
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v.48
no.2
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pp.69-80
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2021
We conducted a 4 × 4 diallel cross-mating test using 934 chickens from four grandparent stock lines to develop a new synthetic breed of Korean native chicken. The mean values, combining ability, and reciprocal effects on survival rate, body weight, and hen-day egg production were analyzed. In phenotypes, most chickens have yellowish-brown, reddish-brown and mixed color feathers. The average survival rate was 86.8±12.3%, with the highest in YH combination. Specific combining ability (SCA) had a greater effect on survival rate than general combining ability (GCA), and the SCA of HY combination was the highest. The 16 cross-combinations were distinctly divided into three weight groups according to their genetic characteristics. At 12 weeks of age, GCA showed a greater effect on weight than SCA, and the SCA of FH combination was the highest. The age at first egg laying was 157 days, and the crosses reached sexual maturity faster than the pure lines. The egg production rate was highest in SY at 79.5±2.1%. The GCA and SCA for hen-day egg production were similar, and the SCA was highest in the HS and FY combinations. The reciprocal effect showed that the offspring's egg production rate was high when S and Y were maternal parents in almost all combinations. In conclusion, FH and HF combinations, which have excellent growth performance, are the most desirable paternal parent stock strains, and FY, FS, HY, and SY combinations, which have excellent laying performance with moderate weight, are the preferred maternal strains.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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