• Journal of Microbiology
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• 제35권1호
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• pp.53-60
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• 1997

Pseudomonas sp. P20 and Pseudomonas sp. DJ-12 isolated from the polluted environment are capable of degrading biphenyl and 4-chlorobiphenyl (4CB) to produce benzoic acid and 4-chlorobenzoic acid (4CBA) respectively, by pcbABCD-encoded enzymes. 4CBA can be further degraded by Pseudomonas sp. DJ-12, but not by Pseudomonas sp P20. However, the meta-cleavage activities of 2, 3-dihydroxybiphenyl (2, 3-DHBP) and 4-chloro-2, 3-DHBP dioxygenases (2, 3-DHBD) encoded by pcbC in Pseudomonas sp. P20 were stronger than Pseudomonas sp. DJ-12. In this study, the pcbC gene encoding 2, 3-DHBD was cloned from the genomic DNA of Pseudomonas sp. P20 by using pKT230. A hybrid plasmid pKK1 was constructed and E. coli KK1 transformant was selected by transforming the pKK1 hybrid plasmid carrying pcbC into E. coli XL1-Blue. By transferring the pKK1 plasmide of E. coli KK1 into Pseudomonas sp. DJ-12 by conjugation, a recombinant strain Pseudomonas sp. P20, Pseudomonas sp. DJ-12, and the recombinant cell assay methods. Pseudomonas sp. DJ12-C readily degraded 4CB and 2, 3-DHBP to produce 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2, 4-dienoic acid (HOPDA), and the resulting 4CBA and benzoic acid were continuously catabolized. Pseudomonas sp. DJ12-C degraded 1 mM 4CB completely after incubation for 20 h, but Pseudomonas sp. P20 and Pseudomonas sp. DJ-12 showed only 90% and Pseudomonas sp. DJ-12 had, but its degradation activity to 2, 3-DHBP, 3-methylcatechol, and catechol was improved.

• 한국환경과학회지
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• 제5권5호
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• pp.611-617
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• 1996

유일한 탄소원으로서 Biphenyl을 포함하고 있는 액체배지에서 Pseudomonas sp. P2의 생육에 미치는 영양원의 효과에 관해 연구하였다. Pseudomonas sp. P2의 특성을 조사하기 위한, 배양시간은 균의 생육 유선에서 대수성장기 말인 100시간으로 하였다. PCBs를 분해하는 Pseudomonas sp. P2의 생육을 위한 최적 조성은 1000 mg/L $NH_4NO_3$, 1000 mg/L KH_2PO_4$, 100 mg/L MgSO_4$.$7H_2O$, 30 mg/L $CaCl_2$.$2H_2O$, 200 mg/L NaCl, 10mg/L $FeSO_4$.$7H_2O$였다. Pseudomonas sp. P2에 의한 100시간 배양후 절연유 내에 있는 PCBs의 분해률은 500mg/L에서 59.3%, 1000mg/L에서 57.6%, 1500mg/L에서 51.4%, 2000mg/L에서는 48.775 였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제24권6호
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• pp.657-663
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• 1996

Pseudomonas sp. P20 isolated from the polluted environment is capable of degrading biphenyl and 4-chlorobiphenyl. The pcbABCD genes responsible for degradation of biphenyl and 4-chlorobiphenyl were cloned using pBluescript SK(+) from the chromosomal DNA of Pseudomonas sp. P20 to construct pCK1 and pCK102, harbouring pcbABCD and pcbCD, respectively. The 2, 3-DHBP dioxygenase gene, pcbC, was cloned again from pCK102 by using pKT230 which is known as a shuttle vector and pKK1 hybrid plasmid was constructed. The E. coli KK1 transformant obtained by transforming the pKK1 into E. coli XL1-Blue showed 2, 3-DHBP dioxygenase activity. The specific 2, 3-DHBP dioxygenase activity of E. coli KK1 was similar to that of the E. coli CK102, but much higher than those of the natural isolates, Pseudomonas sp. DJ-12 and Pseudomonas sp. P20.

• 한국수산과학회지
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• 제31권6호
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• pp.852-858
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• 1998

1996년 7월 마산만의 해수를 0.8 $\mu$m filter에 여과한 여과액과 f/2배지에서 배양한 P. micans와의 혼합배양액에서 P. micans를 사멸시키는 해양세균을 분리하였다. 분리균의 형태학적 및 생화학적 검사와 균체지방산을 분석하여 동정한 결과 Pseudomonas 속으로 동정되어 Pseudomonas sp. LG-2로 명명하였으며, 그 살조특성을 조사한 결과는 아래와 같다. Pseudomonas sp. LG-2의 개체수와 배양여과액의 농도가 높을수록 P. micans의 사멸효과가 높게 나타났다. $1.3\times10^5,\;1.3\times10^6$ cells/ml의 농도로 접종한 시험관의 P. micans는 급격히 감소하여 배양 7일 후에는 $10^2$ cells/ml 이하로 사멸되었다. 또한, 배양석과액의 최종농도가 $30\%$일 경우에는 급격히 감소하여 배양 3일 후 거의 사멸하였다. Pseudomonas sp. LG-2의 성장시기에 따른 배양여과액의 사멸효과는 잠복기의 경우 P. micans의 성장에 큰 영향을 미치지 않았으나, 대수증식기 중기의 배양여과액은 접종 5일 후 P. micans의 개체수를 1/2로 감소시켰으며, 정상기의 배양여과액은 접종 후 급격히 감소시켜 배양 3일 후 대부분 사멸시켰다. Alexandrium tamarense, Prorocentrum micans, Scrippsiella trochoidea, Gymnodinium sanguineum, Cochlodinium polykrikoides의 5종의 적조원인 편모조류에 대한 Pseudomonas sp. LG-2의 살조특이성은 P. micans와 S. trochoidea에 살조효과를 나타내었다.

• 한국환경보건학회지
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• 제22권3호
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• pp.1-7
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• 1996

Polychlorinated Biphenyls(PCBs)의 생물학적 처리가 시도되고 있으며, PCBs를 분해할 수 있는 미생물을 이용할 수 있다. 따라서 본 연구에서는 폐기된 절연유의 생물학적 처리를 위하여 PCBs를 분해하는 균을 분해하였으며, 분해된 균을 이용하여 절연유 내의 Polychlorinated Biphenyls(PCBs) 분해를 회분식 실험에서 연구하였다. 대구의 신천으로부터 유일한 탄소원으로 Biphenyl을 포함하고 있는 고체배지에서 PCBs를 분해할 수 있는 Pseudomonas sp. P2 균주를 분해하였다. PCBs의 용해도를 높이기 위해 사용된 유화제 alkyl aryl ethoxylated phosphate가 200 mg/L에서는 Pseudomonas sp. P2 균주의 성장에 영향을 미치지 않았다. 1000 mg/L의 Biphenyl과 PCBs에 Pseudomonas sp. P2를 접종하여 160시간 배양후에 Biphenyl과 PCBs의 분해가 각각 97.5%, 58.0%였다. Biphenyl 1000 mg/L에서 최대성장율($\mu_{max}$)은 0.34 $day^{-1}$, 0.26 였다. 따라서 염소가 결합되지 않은 Biphenyl는 염소가 결합된 PCBs보다 분해가 빠르게 진행되었다. 또한 Pseudomonas sp. P2는 Biphenyl과 PCBs의 분해로 부터 유도된 황색의 분해대사산물을 확인하였다. 본 연구에서는 Pseudomonas sp. P2 균주가 절연유 내의 PCBs를 분해할 수 있다는 것을 확인하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제22권4호
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• pp.353-359
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• 1994

Pseudomonas sp. P20 was a bacterial isolate which has the ability to degrade 4-chlorobi- phenyl(4CB) to 4-chlorobenzoic acid via the process of meta-cleavage. The recombinant plasmid pCK1 was constructed by insetting the 14-kb EcoRI fragment of the chromosomal DNA containing the 4CB-degrading genes into the vector pBluescript SK(+). Subsequently, E. coli XL1-Blue was transformed with the hybrid plasmid producing the recombinant E. coli CK1. The recombinant cells degraded 4CB and 2,3-dihydroxybiphenyl(2,3-DHBP) by the pcbAB and pcbCD gene products, respectively. The pcbC gene was expressed most abundantly at the late exponential phase in E. coli CK1 as well as in Pseudomonas sp. P20, and the level of the pcbC gene product, 2,3-DHBP dioxygenase, expressed in E. coli CK1 was about two-times higher than in Pseudomonas sp. P20. The activities of 2,3-DHBP dioxygenase on catechol and 3-methylcatechol were about 26 to 31% of its activity on 2,3-DHBP, but the enzyme did not reveal any activities on 4-methylcatechol and 4-chlorocatechol.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제18권6호
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• pp.633-639
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• 1990

Cellulase 복합체와 xylanase를 동시에 분비하는 Pseudomonas sp. LBC 505와 CYC 10의 cellulase 유전자를 pUC19를 사용하여 E.coli에 클로닝시켰다. Congo red 염색시 노란색 환을 형성하는 대장균 형질전환에서 7.0Kb-와 4.6Kb-HindIII 단편을 함유한 재조합 플라스미드 pLC1과 pLC2를 가각 분리하였다. DNA hybridization 실험에서 pLC1 과 pLC2는 Pseudomonas sp. LBC 505와 CYC 10 유래임이 각각 밝혀졌고, Immunoassay 실험에서도 유사성이 인정되었다. pLC1을 함유하고 있는 대장균은 cellulas의 24를 세포외로 분비하였고, 효소활성은 모균주에 비해 1.4배 증가하였다. pLC1과 pLC2의 효소학적 성질도 모균주와 동일하였으며, 기질특이성과 HPLC로 유리당을 분석한 결과, 클로닝된 유전자는 endo type인 것으로 나타났다.

• KSBB Journal
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• 제18권3호
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• pp.174-179
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• 2003

폐광지역으로부터 quinoline (2,3-benzopyridine)을 유일한 탄소원, 질소원, 그리고 에너지원으로 이용하는 세균 NFQ-1을 농화 배양기법을 통하여 분리하였다. 분리된 세균은 그람음성의 간균으로서 BIOLOG 시험을 통하여 Pseudomonas nitroreducens로 동정되었으며, 본 연구에서는 Pseudomonas sp. NFQ-1으로 명명하였다. Quinoline의 분해는 호기적 조건하의 B-배지에서 Pseudomonas sp. NFQ-1를 이용하여 실시되었다. 균주 NFQ-1 세균은 2.5 mM quinoline을 9시간 이내 완전히 분해하였다. 배양기간 동안 quinoline 분해의 중간대사산물인 2-hydroxyquinoline이 일시적으로 생성되었다가 배양기간 후반부에 사라졌다. 배양의 초기 pH 8.0은 6.8로 감소하다가 배양이 진행됨에 따라 7.0이 되었다. 대상 기질로서 quinoline의 농도가 증가함에 따라 생장곡선에서 유도기가 길어졌으며, 고농도의 quinoline (＞15 mM)은 주어진 조건에서 균주의 생장과 quinoline의 분해를 억제하였다. 부가 질소원으로 7.6 mM $(\textrm{NH}_{4})_{2}\textrm{SO}_{4}$의 첨가조건하에서 Pseudomonas sp. NFQ-1은 2-hydroxyquinoline, p-coumaric acid, benzoic acid, p-cresol, p-hydroxybenzoate, protocatechuic acid, catechol 등의 다양한 화합물을 이용할 수 있었으나 일부 화합물들 (예, 6-hydroxyquinoline, 8-hydroxyquinoline, coumarin, indoline, pyridine, lepidine, quinaldine, 4-bydroxycournarin, benzene, salicylic acid, phenol, phthalate)은 탄소원으로 이용되지 못하였다. euinoline의 분해경로를 규명하기 위하여 catechol dioxygenases의 specific activity를 결정하였다. 그 값은 catechol 1,2-dioxygenase에서 약 184.7 U/mg, 그리고 catechol 1,2-dioxygenase에서 약 33.19 U/mg이었다. 그 결과 균주 NFQ-1은 quinoline를 분해하기 위하여 주로 ortho-분해경로를, 그리고 부분적으로 meta-분해경로를 이용하는 것을 보여주었다.

• 생명과학회지
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• 제21권1호
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• pp.134-140
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• 2011

대전일원의 유류오염 지역의 토양으로부터 원유를 단일 탄소원으로 이용하는 총 145균주를 순수분리 하였고, 이중 생물 계면활성제 생성능이 가장 우수한 한 균주를 최종 선별하여 형태 및 생리 생화학적 특성을 조사하고 16S rRNA 염기서열을 분석을 통하여 동정한 결과 Pseudomonas sp.로 확인되어 Pseudomonas sp. Z1이라 명명하였다. 최종 선별된 Pseudomonas sp. Z1은 클로람페니콜과 암피실린 등의 항생제와 리튬, 망간, 바륨 등의 중금속에 대해 강한 내성을 갖고 있었고, 최적 온도와 pH는 각각 $30^{\circ}C$와 pH 6.0-7.0으로 확인되었다. Pseudomonas sp. Z1이 생성하는 생물 계면활성제는 배양 10시간 이후부터 배양액의 표면장력이 급격히 감소해, 배양 21시간 후에 최대 28 dyne/cm까지 감소되었고, 2% 이상의 NaCl을 첨가한 경우 배양액의 생물계면활성제의 활성이 감소하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제16권11호
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• pp.1740-1746
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• 2006

Enrichment techniques led to the isolation of a Pseudomonas sp. strain P2 from municipal waste-contaminated soil sample, which could utilize different isomers of a commercial mixture of 4-nonylphenol when grown in the presence of phenol. The isolate was identified as Pseudomonas sp., based on the morphological, nutritional, and biochemical characteristics and 16S rDNA sequence analysis. The ${\beta}$-ketoadipate pathway was found to be involved in the degradation of phenol by Pseudomonas sp. strain P2. Gas chromatography-mass spectrometric analysis of the culture media indicated degradation of various major isomers of 4-nonylphenol in the range of 29-50%. However, the selected ion monitoring mode of analysis of biodegraded products of 4-nonylphenol indicated the absence of any aromatic compounds other than those of the isomers of 4-nonylphenol. Moreover, Pseudomonas sp. strain P2 was incapable of utilizing various alkanes individually as sole carbon source, whereas the degradation of 4-nonylphenol was observed only when the test organism was induced with phenol, suggesting that the degradation of 4-nonylphenol was possibly initiated from the phenolic moiety of the molecule, but not from the alkyl side-chain.