• 제목/요약/키워드: Protein purification

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Aflatoxin $B_1$의 검출을 위한 효소면역측정법의 개발 (Development of an Enzyme-Linked Immunosorbent Assay for the Iletection of Aflatoxin $B_1$)

  • 손동화;박애란;서병철;김진철;이인원;남영중;허우덕
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제20권2호
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    • pp.225-232
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    • 1992
  • 효소면역측정법에 의한 aflatoxin $B_1(AFB_1)$의 정량법을 개발하기 위하여, 항체를 생산.정제하여 분석법을 확립하고 직접법과 간접법(direct/indirect competitive ELISA)의 특성 및 문제점을 비교. 검토하였다. Bovine serum albumin(BSA)을 carrier protein으로 한 $AFB_1$-1-(O-carboxymethyl)oxime -BSA를 토끼에 면역하여 항$AFB_1$항혈청을 생산하였다. 정량 침강반응에 의하여 항혈청으로부터 항BSA항체를 제거하고 황산암모늄 침전법 및 EDAE-Sephadex A-50 이온교환 크로마토그래피를 통하여 순도 높은 IgG항체를 정제하여 항$AFB_1$항체를 사용하였다.

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Quercetin Derivatives from Siegesbeckia glabrescens Inhibit the Expression of COX-2 Through the Suppression of NF-κB Activation in Microglia

  • Lim, Hyo-Jin;Li, Hua;Kim, Jae-Yeon;Ryu, Jae-Ha
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제19권1호
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    • pp.27-32
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    • 2011
  • The activation of microglia induces the overproduction of inflammatory mediators that are responsible for the neurodegenerative disorders including Alzheimer's disease and Parkinson's disease. The large amounts of prostaglandin $E_2$ ($PGE_2$) produced by inducible cyclooxygenase (COX-2) is one of the main inflammatory mediators that can contribute to neurodegeneration. The inhibition of COX-2 thus may provide therapeutic strategy for the treatment of neurodegenerative diseases. From the activity-guided purification of EtOAc soluble fraction of Siegesbeckia glabrescens, four compounds were isolated as inhibitors of $PGE_2$ production in LPS-activated microglia. Their structures were determined as 3, 4'-dimethylquercetin (1), 3, 7-dimethylquercetin (2), 3-methylquercetin (3) and 3, 7, 4'-trimethylquercetin (4) by the mass and NMR spectral data analysis. The compounds 1-4 showed dose-dependent inhibition of $PGE_2$ production in LPS-activated microglia with their $IC_{50}$ values of 7.1, 4.9, 4.4, $12.4\;{\mu}M$ respectively. They reduced the expression of protein and mRNA of COX-2 through the inhibition of I-${\kappa}B{\alpha}$ degradation and NF-$\kappa}B$ activity that were correlated with the inactivation of p38 and ERK. Therefore the active compounds from Siegesbeckia glabrescens may have therapeutic effects on neuro-inflammatory diseases through the inhibition of overproduction of $PGE_2$ and suppression of COX-2 overexpression.

Characterization of Phosphatidylcholine-Hydrolyzing Phospholipase D in the Scuticociliate Parasite, Uronema marinum

  • Seo, Jung-Soo;Kim, Moo-Sang;Kim, Na-Young;Ahn, Sang-Jung;Jee, Bo-Young;Jung, Sung-Hee;Kim, Jin-Woo;Kim, Ki-Hong;Lee, Hyung-Ho;Chung, Joon-Ki
    • 한국어병학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.1-11
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    • 2008
  • We report the existence of new type of phosphatidylcholine-hydrolyzing phospholipase D (PLD), which has been characterized and partially purified in the scuticociliate, Uronema marinum. The enzyme from partial purification showed that it was existed in membrane fraction and was a neutral PLD, which catalyzed both transphosphatidylation and hydrolysis reaction. The activity of partially purified membrane-bound PLD was also found to be optimal at pH 7.0-7.5 for 2 hours at 37℃ and depended strictly on the presence of Ca2+ (2.5 mM) and Mg2+ (1.6 mM). Immunoblot analysis indicated that the enzyme was distinct from hPLD1 (human PLD1) and hPLD2 (human PLD2) because it was not recognized by a polyclonal antibody raised to the 12 terminal amino acid of these enzymes. We also found that the membrane-bound PLD is a PIP2-dependent PLD and that GTP-binding proteins are not implicated in the regulation of this enzyme: This enzyme activity is markedly stimulated by phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PIP2) but not by the small G-protein Arf and GTPrS. In addition, this enzyme was capable of hydrolyzing phosphatidylcholine (PC) but not phosphatidylethanolamine (PE), implying that PC was a preferred substrate.

한국재래간장 발효균 Bacillus subtilis K7 유래의 혈전용해 Protease의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of Fibrinolytic Enzyme Produced by Bacillus subtilis K7 Isolated from Korean Traditional Soy Sauce)

  • 김두영;이은탁;김상달
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제46권3호
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    • pp.176-182
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    • 2003
  • 한국재래간장으로부터 혈전용해효소를 강하게 생산하는 균주를 선발하고 이를 Bacillus subtilis K7로 동정하였다. B. subtilis K7이 생산하는 혈전용해성 protease를 정제하여 분자량을 확인한 결과 21,500 Da이었다. 정제된 효소의 최적반응조건은 $40^{\circ}C$와 pH 9.0이었으며 pH 5.0라서 12.0까지 안정하고 $50^{\circ}C$에서 20분간 열처리한 후에도 50%이상의 효소활성을 가지며 EDTA, CDTA 및 iodoacetat에 실활하는 효소이었다. 이 효소의 fibrin에 대한 Km 값은 $1.8{\times}10^{-2}$ M이었다.

무화과 펙틴에스테라제의 부분 정제 및 in situ 상태에서의 활성 특성 (Partial Purification of Fig Pectinesterase and Characterization of its in situ Activity)

  • 허원녕;김명화;고은경
    • 한국식품과학회지
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    • 제30권5호
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    • pp.1169-1178
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    • 1998
  • 무화과 PE를 추출하여 ammonium sulfate로 분획 투석한 후 Q-Sepharose column 및 CM-cation exchanger column을 이용한 chromatography와 HPLC에 의해 1개의 음이온성 PE와 2개의 양이온성 PE로 분리되었으며, 이들은 모두 전기영동상에 분자량 27,000정도의 밀접한 두 개의 band로 나타난 부분 정제된 단백질이었다. 이 효소 단백질들은 보관 중에 활성을 급격히 상실되므로 현실적인 이용성을 고려하여 분말화한 시료 현탁액을 이용한 in situ PE의 특성을 조사하였다. 그 결과 분말 시료는 냉동 저장뿐 만 아니라 $5^{\circ}C$에서도 장기간 저장할 수 있었으며, 최적 pH는 8.5, 최적온도는 $50^{\circ}C$이였고, 활성화 에너지는 7,671 cal $mol^{-1}\;K^{-1}$ 이었으며 $55^{\circ}C$까지는 열 안정성을 유지하였다. 또한 $0.2{\sim}0.4$ M NaCl에서 활성이 촉진되었으며 PE의 용출은 0.8 M 이상의 NaCl 에서 효과적이였고 $0{\sim}1.0$ M NaCl까지의 범위에서는 특별히 안정성에 영향을 미치지 않았다.

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Expression, Purification and Functional and structural relationship of pyruvate dehydrogenase phosphatase

  • Kim, Young-Mi;Jung, Ki-Hwa
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 2002년도 창립10주년기념 및 국립독성연구원 의약품동등성평가부서 신설기념 국재학술대회:생물학적 동등성과 의약품 개발 전략을 위한 국제심포지움
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    • pp.236-236
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    • 2002
  • Pyruvate dehydrogenase phosphatase (PDP) is a mitochondrial protein serine/threonine phosphatase that catalyzes the dephosphorylation and concomitant reactivation of the pyruvate dehydrogenase componant of the pyruvate dehydrogenase complex (PDC). PDP consists of a Mg$\^$+2/ -dependent and Ca$\^$+2)-stimulated catalytic subunit (PDPc) of Mr 52,600 and a FAD-containing regulatory subunit (PDPr) of Mr 95.600. Catalytic subunit of pyruvate dehydrogenase phosphatase (PDPc) has been suggested to have three major functional domains such as dihydrolipoamide acetyltransferase(E$_2$)-binding domain, regulatory subunit of PDP(PDPr)-binding domain, and calcium-binding domain. In order to identify functional domains, recombinant catalytic subunit of pyruvate dehydrogenase phosphatase (rPDPc) was expressed in E. coli JM101 and purified to near homogeneity using the unique property of PDPc: PDPm binds to the inner lipoyl domain (L$_2$) of E$_2$ of pyruvate dehydrogenase complex (PDC) in the presence of Ca$\^$+2/, not under EGTA. PDPc was limited-proteolysed by trypsin, chymotrypsin, Arg-C, and elastase at pH7.0 and 30$^{\circ}C$ and N-terminal analysis of the fragment was done. Chymotrypsin, trypsin, and elastase made two major framents: N-terminal large fragment, approx. 50kD and C-terminal small fragment, approx. 0 kDa. Arg-C made three major fragments: N-terminal fragment, approx. 35 kD, and central fragment, approx. 15 kD, and C-terminal fragment, approx. 10 kD. This study strongly suggest that PDPc consists of three major functional domains. However, further study should be necessary to identify the functional role.

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볏짚분해과정 중에 생산하는 Fomitopsis palustris 균체 외 Xylanase의 분리정제 및 효소특성 (Purification and Characterization of Xylanase from Fomitopsis palustris in Rice Straw Culture)

  • 윤정준;이영민;최두열;김영균;김영숙
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제35권6호
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    • pp.159-165
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    • 2007
  • 본 논문에서는 갈색부후균 Fomitopsis palustris가 볏짚을 분해하는 과정 중에 생산하는 xylanase를 확인하여 분리 정제하고, 아미노산 서열분석을 통해 동정하였다. 그리고 동정된 단백질의 효소특성을 조사하였다. 분리 정제된 단백질은 SDS-PAGE분석에서 43kDa의 분자량을 나타내었고, 아미노산 서열분석에서는 Glycoside Hydrolase family 10에 속하는 xylanase와 높은 상동성을 나타내었다. 정제효소의 기질에 대한 $K_m$치는 $31 mg/m{\ell}$, $V_{max}$는 252.3 U/mg, $K_{cat}$$2.3{\times}10^4/min$이고, 최적 pH 범위는 pH 4.0~5.0 최대 활성 온도는 $70^{\circ}C$로 밝혀졌다.

느타리 버섯균의 정치배양으로부터 생산되는 중요한 망간퍼옥시데이즈(MnP3)의 N-말단 아미노산 배열 분석 (N-terminal amino acid sequence analysis of major manganese peroxidase (MnP3) produced by static culture of Pleurotus ostreatus)

  • 하효철
    • 한국버섯학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.185-190
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    • 2019
  • 리그닌 분해 담자균류로 알려져 있는 느타리버섯균 No.42는 망간퍼옥시데이즈(MnP) 및 락게이즈(Lac)를 생산하였으나 글루코오스-펩톤-이스트-밀기울(GPYW)배지를 이용한 정치배양조건하에서 리그닌퍼옥시데이즈(LiP)활성은 검출되지 않았다. 한편, 동일배지에서 망간퍼옥시데이즈 활성은 11일째 80(3.6) U/flask(ml)의 최대 생산되었다. 망간퍼옥시데이즈 분리정제는 Sepha-ros CL-6B 및 Mono-Q 컬럼순으로 수행하였으며 주요 망간퍼옥시데이즈 isozyme은 단일밴드로 분자량은 36.4KDa이였다. N-말단으로부터 19개의 아미노산 배열은 단백질 자동 분석 장치로 분석한 결과 ATCADGRTTANAACCVLFP를 나타내었다. 느타리버섯균 No.42의 정치배양조건 하에서 세포외로 생산되는 중요한 망간퍼옥시데이즈 isozyme의 N-말단 아미노산 배열은 이전에 보고된 MnP3의 아미노산 배열과 동일하였다.

대장균으로부터 생산된 Bacillus licheniformis WL-12의 Cellulase 특성 (Properties of a Bacillus licheniformis Cellulase Produced by Recombinant Escherichia coli)

  • 박종덕;김연아;윤기홍
    • 미생물학회지
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    • 제45권3호
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    • pp.257-262
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    • 2009
  • Bacillus licheniformis WL-12의 carboxymethyl cellulase (cellulase) 유전자를 함유한 대장균 균체 파쇄상등액으로부터 DEAE-Sepharose와 Q-Sepharose 컬럼 크로마토그래피를 통해 cellulase를 정제하였다. 정제된 효소의 비활성은 163 U/mg이었으며, SDS-PAGE에 의해 측정된 분자량은 약 49.5 kDa으로 나타났다. pH 5.5와 $55^{\circ}C$에서 최대 반응활성을 보였으며, SDS (5mM)에 의해서는 cellulase의 활성이 완전히 저해되었고 $Cu^{2+}$5mM)에 의해서는 약간 증진되었다. 정제된 cellulase는 CMC, konjac, barley $\beta$-glucan과 lichenan을 가수분해하였으나 xylan, locust bean gum 및 p-nitrophenyl-$\beta$-glucopyranoside를 분해하지 못하였다. Cellooligosaccharides를 정제된 WL-12 cellulase로 분해하였을 때 cellobiose와 cellotriose가 주된 최종 반응산물로 관찰되었으며 cellobiose보다는 중합도가 큰 cellotriose, cellotetrasoe와 cellopentaose는 분해하였으나 cellobiose는 분해하지 못하는 것으로 확인되었다.

Purification and Characterization of Chitinase from Paenibacillus illinoisensis KJA-424

  • JUNG WOO JIN;KUK JU HEE;KIM KIL YONG;KIM TAE HWAN;PARK RO DONG
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권2호
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    • pp.274-280
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    • 2005
  • A chitinase was purified from the culture supernatant of Paenibacillus illinoisensis KJA-424 by protein precipitation, DEAE-Sephadex anion-exchange chromatography, and Sephadex G-150 gel filtration. The molecular weight of the purified chitinase was 54 kDa on SDS-PAGE and activity staining. Optimal pH and temperature were pH 5.0 and 60$^{circ}$C, the presence of 10 ruM Ag$^{+}$ and Hg$^{2+}$ inhibited the activity by $92.1/%$ and $97.7/%$, and the K$_{m}$ and V$_{max}$ values were 1.12 mg chitin mrl and 1.48$\mu$mol GlcNAc min$^{-1}$, respectively. The enzyme hydrolyzed tetramer to dimer, pentamer to dimer and trimer, and hexamer to dimer, trimer and tetramer, indicating an endo-splitting mechanism. The chitinase had no hydrolytic activity toward dimer and trimer. The chitinase inhibited the mycelial growth of Rhizoctonia solani, suggesting an antifungal property.