• 생명과학회지
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• 제20권8호
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• pp.1181-1185
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• 2010

본 연구는 WSSV의 주요 구조단백질인 VP19와 VP28을 모두 포함하는 VP19+28 fusion protein을 제조하여, Litopenaeus vannamei에서 WSSV에 대한 백신으로서의 효능을 평가하고자 수행하였다. VP19와 VP28 유전자를 fusion하여 제작한 VP19+28 유전자를 pET-28a(+) vector에 삽입하고 단일단백질로서 제작된 VP19+28 유전자를 E. coli BL21 (DE3)에서 발현시켰다. 백신실험을 위해 새우에게 2주 동안 실험용 사료를 급이하였으며, 그 후 바이러스액($1{\times}10^2$배로 희석한 WSSV)을 이용하여 새우에게 주사 감염에 의해 in vivo 공격실험(challenge test)을 수행하였다. 실험결과, vaccination을 하지 않은 새우들은 감염 후 11일째에 100%의 누적폐사율을 보였으며, host control로써 E. coli BL21을 사용하여 vaccination한 새우들은 감염 후 17일째에 100%의 누적폐사율을 보였다. rVP19, rVP28, rVP19+28을 이용하여 vaccination한 새우들의 경우 감염 후 21일째에 각각 66.7%, 41.7%, 41.7%의 누적폐사율을 보였다. 이상의 결과를 통해 rVP28과 rVP19+28이 WSSV에 대해 높은 백신효능을 가짐을 확인하였다. 또한 감염 후 21일째에 fusion protein rVP19+28과 rVP28의 누적폐사율은 동일하였지만 공격실험기간 동안 폐사율이 rVP19+28을 투여 한 실험군이 낮게 나타나는 것을 보아 WSSV에 대한 새우의 방어효능은 rVP19+28이 더 높음을 나타내는 것이다.

• 한국잡초학회지
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• 제16권4호
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• pp.354-361
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• 1996

Thiobencarb 처리에 의한 수도품종의 내성 정도를 조사하고 내성 메카니즘을 연구하기 위하여 내성 및 감수성 품종간의 단백질 함량, SDS-PAGE에 의한 단백질 유형의 변화를 조사하였다. 본 시험에 공시한 5개 품종 중 IR 10198-66-2와 IR 9660-50-3-1은 온실 및 실내실험에서 공히 thiobencarb에 대하여 내성을 보였으며 IR 22, IR 31802-48-2-2, IR 20656-R-R-R-6-1은 제초제 농도가 증가함에 따라 생장이 크게 억제되어 감수성을 나타내었다. Thiobencarb 처리에 의한 단백질의 함량은 내성 및 감수성 품종간에 뚜렷한 차이를 보였는데 감수성 품종의 단백질 함량은 제초제 농도가 증가함에 따라 크게 감소하는 경향을 나타내었으나 내성품종의 경우 감소가 거의 없었다. SDS-PAGE에 의한 단백질 밴드는 내성 품종의 경우 5ppm 처리에서도 변화가 없었으나 감수성 품종은 5ppm 처리에서 94-30 kD 사이와 14.4kD 부근의 단백질 밴드가 사라지는 경향을 보였다. Thiobencarb 3ppm을 처리한 감수성 품종인 IR 22의 2차원 전기영동에 의한 단백질 패턴에서는 14.4kD와 55kD 부근의 spot가 사라지거나 density가 감소하는 경향을 보였다. 이상의 단백질 함량과 유형의 변화로 미루어 보아 thiobencarb 처리는 감수성 품종의 특정 단백질 합성을 억제하는 것으로 나타났으며, 벼의 thiobencarb에 대한 내성은 이 부위의 단백질과 밀접한 관계가 있는 것으로 사료된다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제13권1호
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• pp.59-64
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• 1970

Bence Jones 단백질(蛋白質)(As,Ik,In)를 DEAE-Sephadex A-50 Column으로 0.02M phosphate Buffer(pH8.)와 0.5M NaCl를 gradient로 사용(使用)해 정재(精製)하였다. 시료(試料) As(K-형(型))의 정재결과(精製結果) 주성분(主成分)인 F-1는 조단백질(粗蛋白質) 500mg로부터 350mg 얻었으며 다른 시료(試料) Im와 Ik($lambda$-형(型))에서도 각각 주성분(主成分)을 242mg(Im)와 146mg(Ik) 얻을 수 있었다. 정재(精製)한 시료(試料)는 그의 순도(純度)를 알기 위해 Poly acryl amide의 Disc electrophoresis로 확인한 후 K-형(型) Bence jones단백질(蛋白質)의 일종(一種)인 As와 $lambda$-형(型)의 일종(一種)인 IM를 6N-HCI로 $105^{\circ}C$에서 20시간(時間) 가수분해(加水分努)후 Amino 산(酸) 조정(組成)을 살펴보았다. DNP법(法)으로 시료(試料) K-형(型)(As, Ko, Ta)의 단백질(蛋白質)의 N-말단(末端)을 검출(檢出)해 Ta는 glutamic acid, Ko, As는 Aspartic acid임을 확인하였으며 Paper 상(上)에 나타난 DNP-Amino 산(酸)은 5% $NaHCO_3$ (pH8) 4ml에 추출(抽出)해 그 수량(收量)을 ${\varepsilon}=18.1{\times}10^3DNP$ $Asp\;{\varepsilon}=17.41{\times}10^(3){\;}DNP{\;}Glu$에 의(依)해 산출(算出)하였더니 Ko는 54.3%, As는 65%이였으며 Ta는 85%의 수량(收量)이였다. ${\lambda}$-형(型)의 Im,Ik의 시료(試料)도 DNP법(法)으로 N-말단(末端)을 검출(檢出)해 보았더니 검출(檢出)되지 아니하였다.

• KSBB Journal
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• 제19권5호
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• pp.406-409
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• 2004

Matrix Assisted Laser Desorption ionization Time of Flight (MALDI-TOF) was used for enzymes identification related to B -1,3-glucan synthesis. Agrobacterium sp. ATCC31750 was cultivated with two stage Continuous Stirrer Tank Reactor (CSTR) and the cells were harvested and their protein profiles were analysed by two dimensional electrophoresis. The specific enzyme spot was treated with trypsin and ana lysed by MALDI-TOF to get peptide molecular weight. The peptide molecular weights were matched with Agrobacterium tumefacience's Data Base from the matrix science site, then could identify the avaliable key enzymes. In this study, we identified key metabolite of synthesis of beta-1,3-glucan, such as glucose-6-phosphate isomerase, phosphoglucomutase, B-1,3-glucan synthase and glucokinase, and we also identified uracil phosphoribocyl transferase and Ribosome recycling factor also.

• 한국정보처리학회:학술대회논문집
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• 한국정보처리학회 2005년도 추계학술발표대회 및 정기총회
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• pp.513-516
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• 2005

단백질 2DE 이미지 분석의 주요작업은 스팟 매칭에 의한 동일한 종류의 단백질 그룹인 패어링 클래스를 구성하는 것으로서 단백질간의 상호 작용, 질병에 관련한 단백질의 변화 등을 관찰할 수 있다. 하지만 2DE 실험의 여러 가지 문제점으로 인하여 패어링 클래스는 먼지, 공기방울 등 에러를 포함하게 되며 이런 에러들은 왜곡된 분석결과를 초래한다. 따라서 본 논문에서는 동일한 조직에서 같은 종류의 단백질은 발현량이 비슷하다는 특성을 이용하여 패어링 클래스의 개개의 스팟을 참조 스팟 속성으로 나눈 값을 유사도로 정의하고, 스팟의 유사도가 사용자에 의하여 선택되는 필터링 배수에 의한 범위를 벗어날 때 에러 스팟으로 간주하여 제거되는 에러 필터링 기법을 제안한다. 실험에서는 정확도(Precision), 재현율(Recall) 및 조화평균(Harmonic-mean) 값을 사용하여 제안된 필터링 기법의 타당성을 보여준다.

• 고려인삼학회:학술대회논문집
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• 고려인삼학회 1978년도 학술대회지
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• pp.75-77
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• 1978

It was found that water extract of Panax ginseng strongly inhibited adrenaline-induced lipolysis in isolated fat cells of rat epididymal adipose tissue. An antilipolytic action of the water extract was easily inactivated by treatment with pronase, suggesting that the active principle might be a protein or a peptide. Experiments were designed to purify the antilipolytic substance, or insulin-like substance, of the water extract. The water extract was dialyzed against disti'led water. The outer dialysate was subjected to DEAE-cellulose column chromatography, gelfuaration on sephadex G-50 column, avicel cellulose column chromatography and phospho-cellulose column chromatography, successively. The finally purified substance gave one spot on thin layer chromatography. The molecular weight was found to be around 1000. Experiments are now in progress to elucidate the structure of this insulin-like peptide.

• Applied Biological Chemistry
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• 제30권2호
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• pp.163-168
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• 1987

전보에서 보고한 Bradyrhizobium japonicum 9 균주와 Rhizobium fredii 7 균주의 균체 중의 단백질 Pattern의 차이를 일차원 및 이차원 전기영동법에 의하여 조사하였다. 일차원 전기영동법 (SDS-PAGE)에 의해서는 두 group의 균체에서 모두 52개의 band가 관찰되었고 그 중 6개의 main band 로써 group 간의 차이가 확인되었으며, 이차원 전기영동법(2D-PAGE)에 의한 두 group간에 단백질 구성은 Rhizobium fredii 에서는 단백질이 산성 쪽에, Bradyrhizobium japonicum 는 alkali성 쪽에 비교적 많이 분포되어 있었다. 또한 두 group 간의 균체 아미노산 조성을 조사한 결과 조선상의 뚜렷한 차이가 없었다. 분리된 근류균을 확인하는데 전기영동법이 유용하였으며, 일차원 전기영동법은 많은 균주를 신속하게 확인할 수 있었고 이차원 전기영동법은 해상력 및 분리된 단백질 spot를 분석하는데 용이하였다.

• Food Science and Biotechnology
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• 제17권5호
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• pp.912-918
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• 2008

This study was conducted to identify the differences in proteomic characteristics of 'Agakong', recombinant inbred line, and its parental genotypes 'Eunhakong' (Glycine max) and 'KLG10084' (G. soja). The isoflavone content of 'Agakong' was 3 times higher than that of its parental lines. A combined high-throughput proteomic approach was employed to determine the expression profile and identity of proteins using 2-dimensional gel electrophoresis and matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry. The overall distribution patterns of proteins are quite similar, but lots of protein spot intensities varied among the genotypes. A total of 41 proteins, representing significant difference in the quantities of protein among the lines, were successfully identified. Among them, more than 50% of the proteins identified were subunits of glycinin and $\beta$-conglycinin, 2 major storage proteins. This study showed that the proteomic analysis could help to define specific changes in protein level and composition, which can occur in the generation of new soybean varieties.

• 한국수정란이식학회지
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• 제23권1호
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• pp.25-30
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• 2008

This study was performed to identify and analyze the specifically expressed plasma proteins during early pregnancy in both pregnant and non-pregnant Hanwoo. Blood samples were collected at 0 (the day of AI), 2, 3, 4, 7, and 11 weeks after AI from pregnant (n=3) and non-pregnant (n=4) Hanwoo, respectively. The hematological parameters were measured. After 2-dimensional electrophoresis using serum, normalized protein spots were selected for the significant expression variation deviated over two fold in its expression level between two groups. Among 17 spots selected, 15 were identified as albumin, IgG1 heavy chain constant region, haptoglobin, ferrochelatase, fibrinogen, hemopexin. 5 spots were expressed only in non-pregnant specific. The spot identification of 1105 and 6106 was decreased after 3 weeks from AI. However, 2/17 spots were still unidentified. Further studies are needed to analyze the function of the proteins associated with early pregnancy.

• 정보처리학회논문지D
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• 제15D권5호
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• pp.681-690
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• 2008

단백질체학에서 특정 조건 하에서 단백질의 기능 이상 및 구조 변형 유무를 규명하고 질병 과정을 추적하는 것은 중요한 연구이다. 일반적으로 단백질의 발현량 변화 분석에는 통계적 방법이 많이 사용되고 있으며 단백질 상용 이미지 분석 소프트웨어에서 제공하는 그래픽을 이용한 방법들도 있으나, 이 방법들은 많은 조직 내에 존재하는 수많은 단백질을 수동으로 비교해야 하는 어려움이 있다. 본 논문에서는 데이터베이스와 데이터마이닝 기법을 이용하여 OLAP 데이터 큐브와 Discovery-driven 탐색의 응용 방법을 제안한다. 데이터 큐브의 특성을 이용함에 의해서, 질병에 의해 발현량이 변하는 단백질 뿐 아니라 임상적 특성과 단백질의 영향 관계를 분석하는 것이 가능하다. 데이터 큐브에서 단백질의 발현량 변화 분석에 적합한 데이터 큐브의 척도와Discovery-driven 탐색을 위한 예외 지표를 제안하고, 특히 In-exception을 계산하는데 있어서의 계산량 감소 방안을 제시한다. 실험을 통해 폐암 2-DE 데이터에서 데이터 큐브와 Discovery-driven 방법이 유용함을 보인다.