Lim, Hyeon Woo;Kim, Tae Hyun;Choi, Il Ju;Kim, Chan Gyoo;Lee, Jong Yeul;Cho, Soo Jeong;Eom, Hyeon Seok;Moon, Sung Ho;Kim, Dae Yong
Radiation Oncology Journal
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v.34
no.3
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pp.193-201
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2016
Purpose: To assess the clinical outcomes of radiotherapy (RT) using two-dimensional (2D) and three-dimensional conformal RT (3D-CRT) for patients with gastric mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma to evaluate the effectiveness of involved field RT with moderate-dose and to evaluate the benefit of 3D-CRT comparing with 2D-RT. Materials and Methods: Between July 2003 and March 2015, 33 patients with stage IE and IIE gastric MALT lymphoma received RT were analyzed. Of 33 patients, 17 patients (51.5%) were Helicobacter pylori (HP) negative and 16 patients (48.5%) were HP positive but refractory to HP eradication (HPE). The 2D-RT (n = 14) and 3D-CRT (n = 19) were performed and total dose was 30.6 Gy/17 fractions. Of 11 patients who RT planning data were available, dose-volumetric parameters between 2D-RT and 3D-CRT plans was compared. Results: All patients reached complete remission (CR) eventually and median time to CR was 3 months (range, 1 to 15 months). No local relapse occurred and one patient died with second primary malignancy. Tumor response, survival, and toxicity were not significantly different between 2D-RT and 3D-CRT (p > 0.05, each). In analysis for dose-volumetric parameters, $D_{max}$ and CI for PTV were significantly lower in 3D-CRT plans than 2D-RT plans (p < 0.05, each) and $D_{mean}$ and V15 for right kidney and $D_{mean}$ for left kidney were significantly lower in 3D-CRT than 2D-RT (p < 0.05, each). Conclusion: Our data suggested that involved field RT with moderate-dose for gastric MALT lymphoma could be promising and 3D-CRT could be considered to improve the target coverage and reduce radiation dose to the both kidneys.
A desktop grid, which is a computing grid composed of idle computing resources in a large network of desktop computers, is a promising platform for compute-intensive distributed computing applications. However, due to reliability and unpredictability of computing resources, effective scheduling of parallel computing applications on such a platform is a difficult problem. This paper proposes a new scheduling method aimed at reducing the total execution time of a parallel application on a desktop grid. The proposed method is based on utilizing the histories of execution behavior of individual computing nodes in the scheduling algorithm. In order to test out the feasibility of this idea, execution trace data were collected from a set of 40 desktop workstations over a period of seven weeks. Then, based on this data, the execution of several representative parallel applications were simulated using trace-driven simulation. The simulation results showed that the proposed method improves the execution time of the target applications significantly when compared to previous desktop grid scheduling methods. In addition, there were fewer instances of application suspension and failure.
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
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v.24
no.4
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pp.661-667
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2010
Astragali Radix (AR) has been used in traditional medicinal herb, which is known to tonify the qi and blood. It has been asserted to be a tonic that can improve the function of the lungs, adrenal glands and the gastrointestinal tract, increase metabolism, promote healing and reduce fatigue. Also, Plantago asiatica (PA) has the anti-inflammatory, antiseptic, antitussive, cardiac, diuretic, expectorant, haemostatic effects, though it is considered to be less powerful than the seed. Recent research is showing that it is promising in lowering cholesterol and controlling diabetes. Obesity is characterized at the cellular level by an increase in the number and size of adipocytes differentiated from fibroblastic preadipocytes in adipose tissue. In the present study, we investigated the effects of 3 to 7 extracts of mixed medicinal herbs (water and ethanol extract of Astragali Radix; ARW and ARE, water and ethanol extract of Plantago asitica; PAW and PAE, and those mixed extracts; ARW+PAE, ARW+PAW and ARE+PAE) on adipogenesis and apoptosis in 3T3-L1 adipocytes by MTT assay, Oil-Red-O staining and TUNEL assay. And then, we determined total contents of phenolic compounds and flavonoid compounds in mixed herbal extracts. These result showed that herbal extracts (ARW, PAE and ARW+PAE) affected on adipogenesis and apoptosis in 3T3-L1 adipocytes among 3 to 7 extracts tested. Especially herbal mixed extracts (ARW+PAE) had the highest inhibition on differentiation of preadipocytes and lipoid accumulation of maturing adipocytes. And it did not affect cell viability of mature adipocytes, but herbal mixed extracts (ARW+PAE) increased apoptosis in mature adipocytes, as proved by highest concentration $200\;{\mu}g/m{\ell}$ using TUNEL assay. In addition, contents of total phenoilc compounds and flavonoids showed the highest level in ARE+PAE and PAE than ARW. These results suggest that this main target for adipocyte functions could be effective in improving the metabolic syndrome including obesity.
Jo, Gyunghee;Jeong, Mun Sik;Wi, Jimin;Kim, Doo Hyun;Kim, Sangkyu;Kim, Dain;Yoon, Jun-Yeol;Chae, Heesu;Kim, Kyun-Hwan;Hong, Hyo Jeong
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.28
no.8
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pp.1376-1383
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2018
The hepatitis B virus (HBV) envelope contains small (S), middle (M), and large (L) proteins. PreS1 of the L protein contains a receptor-binding motif crucial for HBV infection. This motif is highly conserved among 10 HBV genotypes (A-J), making it a potential target for the prevention of HBV infection. In this study, we successfully generated a neutralizing human monoclonal antibody (mAb), 1A8 (IgG1), that recognizes the receptor-binding motif of preS1 using a phage-displayed human synthetic Fab library. Analysis of the antigen-binding activity of 1A8 for different genotypes indicated that it can specifically bind to the preS1 of major HBV genotypes (A-D). Based on Bio-Layer interferometry, the affinity ($K_D$) of 1A8 for the preS1 of genotype C was 3.55 nM. 1A8 immunoprecipitated the hepatitis B virions of genotypes C and D. In an in vitro neutralization assay using HepG2 cells overexpressing the cellular receptor sodium taurocholate cotransporting polypeptide, 1A8 effectively neutralized HBV infection with genotype D. Taken together, the results suggest that 1A8 may neutralize the four HBV genotypes. Considering that genotypes A-D are most prevalent, 1A8 may be a neutralizing human mAb with promising potential in the prevention and treatment of HBV infection.
Overuse of synthetic pesticides caused negative side-effects such as environmental contamination, development of insect pests' resistance, and effects on non-target organisms. Plant origin substances without/or with low mammalian toxicity have been considered as promising alternatives to the synthetic pesticides. Fumigant toxicity of the essential oil of Iranian Yarrow, Achillea millefolium L., was investigated against a cosmopolitan stored-product insect pest: saw-toothed grain beetle (Oryzaephilus surinamensis L.). Chemical profile of this essential oil was studied by Gas Chromatography-Mass Spectrometry. Tested concentrations were significantly effective to the mortality of insect pest. A positive correlation between essential oil concentrations and pest mortality were realized. LC50 value (lethal concentration needed to 50% mortality) was achieved as $17.977(16.195{\pm}20.433){\mu}l/l$ air. The main components were 1,8-Cineole (13.17%), nerolidol (12.87%), ${\alpha}$-cubebene (12.35%), artemisia ketone (6.69%), ${\alpha}$-terpineol (5.27%), alloaromadendrene oxide (4.71%) and borneol (3.99%). Terpenic compounds including monoterpene hydrocarbons (8.19%), monoterpenoids (44.23%), sesquiterpene hydrocarbons (21.69%) and sesquiterpenoids (22.24%) were 96.35% of the total identified compounds. Results indicated that the terpene-rich A. millefolium essential oil may be considered as a safe bio-agent in the O. surinamensis management.
Background: Notoginsenoside Ft1 is a promising potential candidate for cardiovascular and cancer disease therapy owing to its positive pharmacological activities. However, the yield of Ft1 is ultralow utilizing reported methods. Herein, an acid hydrolyzing strategy was implemented in the acquirement of rare notoginsenoside Ft1. Methods: Chemical profiles were identified by ultraperformance liquid chromatography coupled with quadruple-time-of-flight and electrospray ionization mass spectrometry (UPLC-Q/TOF-ESI-MS). The acid hydrolyzing dynamic changes of chemical compositions and the possible transformation pathways of saponins were monitored by ultrahigh-performance LC coupled with tandem MS (UHPLC-MS/ MS). Results and conclusion: Notoginsenoside Ft1 was epimerized from notoginsenoside ST4, which was generated through cleaving the carbohydrate side chains at C-20 of notoginsenosides Fa and Fc, and vinaginsenoside R7, and further converted to other compounds via hydroxylation at C-25 or hydrolysis of the carbohydrate side chains at C-3 under the acid conditions. High temperature contributed to the hydroxylation reaction at C-25 and 25% acetic acid concentration was conducive to the preparation of notoginsenoside Ft1. C-20 epimers of notoginsenoside Ft1 and ST4 were successfully separated utilizing solvent method of acetic acid solution. The theoretical preparation yield rate of notoginsenoside Ft1 was about 1.8%, which would be beneficial to further study on its bioactivities and clinical application.
Cancer/testis (CT) antigens are immunogenic in cancer patients, exhibit highly tissue-restricted expression, and are considered promising target molecules for cancer vaccines. We investigated the expression of 13 CT genes in 29 Korean patients with primary breast carcinoma. The most frequently expressed CT genes were MAGE-3 (66%) and MAGE-1 (57%), followed by LAGE-1 (55%), NY-SAR-35 (49%), MAGE-4 (41%), NY-ESO-1 (38%), CT-7 (24%) and SSX-4 (24%), whereas SSX-1, SSX-2, MAGE-10 and NY-TLU-57 were found to be expressed significantly less often (3-7%) and SCP-l not all. Expression of at least one antigen was observed in 28 breast cancer samples. Immunohistochemistry was performed for NY-ESO-l and MAGE-3 protein expression in breast tumor samples. NY-ESO-l and MAGE-3 proteins were expressed in 11 of 29 (38%) and 12 of 29 (41 %) breast tumors. Our results suggest that CT antigens may be potential candidates for polyvalent immunotherapy in Korean breast cancer patients.
Ryu, Jinhyun;Yoon, Nal Ae;Lee, Yeon Kyung;Jeong, Joo Yeon;Kang, Seokmin;Seong, Hyemin;Choi, Jungil;Park, Nammi;Kim, Nayoung;Cho, Wha Ja;Paek, Sun Ha;Cho, Gyeong Jae;Choi, Wan Sung;Park, Jae-Yong;Park, Jeong Woo;Kang, Sang Soo
Molecules and Cells
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v.38
no.2
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pp.156-162
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2015
Urokinase plasminogen activator (uPA) and urokinase plasminogen activator receptor (uPAR) play a major role in the infiltrative growth of glioblastoma. Downregulatoion of the uPA and uPAR has been reported to inhibit the growth glioblastoma. Here, we demonstrate that tristetraprolin (TTP) inhibits the growth of U87MG human glioma cells through downregulation of uPA and uPAR. Our results show that expression level of TTP is inversely correlated with those of uPA and uPAR in human glioma cells and tissues. TTP binds to the AU-rich elements within the 3' untranslated regions of uPA and uPAR and overexpression of TTP decreased the expression of uPA and uPAR through enhancing the degradation of their mRNAs. In addition, overexpression of TTP inhibited the growth and invasion of U87MG cells. Our findings implicate that TTP can be used as a promising therapeutic target to treat human glioma.
Purpose: To introduce our early experience with intensity-modulated radiotherapy (IMRT) in the treatment of nasopharyngeal carcinoma. Methods and Materials: Eight patients who underwent IMRT for no disseminated nasopharyngeal carcinoma at the Asan Medical Center between September 2001 and November 2002 were evaluate by prospective analysis. According to the 1997 American Joint Committee on Cancer staging classification, 5 had Stage III, and 3 had Stage IVB disease. The IMRT plans were designed to be delivered as a 'Simultaneous Modulated Accelerated Radiation Therapy' (SMART) using the 'step and shoot' technique with a MLC (multileaf collimator). Daily fractions of 2.2-2.5Gy and 1.9-2Gy were prescribed and delivered to the GTV and CTV and clinically negative neck node, respectively. The prescribed dose was 70A-79.0Gy to the gross tumor volume (GTV), 60Gy to the clinical target volume (CTV) and metastatic nodal station, and 46Gy to the clinically negative neck. All patients also received weekly cisplatin during radiotherapy. Acute and late normal tissue effects were graded according to the Radiation Therapy Oncology Group (RTOG) radiation morbidity scoring criteria. Results: Follow-up period was ranging from 5 to 18 months. All patients showed complete response and loco-regional control rate was 100% but one patient died of malnutrition due to treatment related toxicity. There were no Grade 3 or 4 xerostomia and all patients had experienced improvement of salivary gland function. Conclusion: 'Simultaneous Modulated Accelerated Radiation Therapy' (SMART) boost intensity-modulated radiotherapy technique allows parotid sparing as evidenced both clinically and by dosimetry. Initial tumor response and loco-regional control was promising. It is clinically feasible. A larger population of patients and a long-term follow-up are needed to evaluate ultimate tumor control and late toxicity.
Kim, Hyun-Tae;Zhang, Gui-Ping;Kim, Hyoung-Jin;Joo, Young-Hoon;Ra, In-Ho
Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
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v.16
no.6
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pp.683-690
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2006
Reducing power consumption to extend network lifetime is one of the most important challenges in designing wireless sensor networks. One promising approach to conserving system energy is to keep only a minimal number of sensors active and put others into low-powered sleep mode, while the active sensors can maintain a connected covet set for the target area. The problem of computing such minimum working sensor set is NP-hard. In this paper, a centralized Voronoi tessellation (CVT) based approximate algorithm is proposed to construct the near optimal cover set. When sensor's communication radius is at least twice of its sensing radius, the covet set is connected at the same time; In case of sensor's communication radius is smaller than twice of its sensing radius, a connection scheme is proposed to calculate the assistant nodes needed for constructing the connectivity of the cover set. Finally, the performance of the proposed algorithm is evaluated through theoretical analysis and extensive numerical experiments. Experimental results show that the proposed algorithm outperforms the greedy algorithm in terms of the runtime and the size of the constructed connected cover set.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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