• 제목/요약/키워드: Program Bank

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구름버섯균 KN9522에서 degenerate primer를 이용한 Mn-Peroxidase 동위효소 유전자들의 PCR 클로닝 (PCR Cloning of Genes Encoding the Mn-Peroxidase Isozyme Family from Trametes versicolor KN9522 Using Degenerate Primers)

  • 전상철;김규중
    • 미생물학회지
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    • 제42권1호
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    • pp.77-81
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    • 2006
  • 구름버섯균 KN9522로부터 분리한 Mn-peroxidase 동위효소 CVMP1, CVMP2, CVMP3 및 CVMP5를 코딩하는 게놈유전자를 분리하기 위해 4개의 동위효소 N-말단아미노산서열을 기준으로 제작한degenerate primer들이 사용되었다. 하나를 제외한 3개의 동위효소들은 그에 대응되는 염기서열 900정도 되는 PCR산물 (cmp1, cmp2 및 cmp5)을 얻었다. NCBI의 BLAST 프로그램을 사용하여 PCR산물들의 염기서열을 분석한 결과, cmp1, cmp2 및 cmp5는 구름버섯균 PRL572로부터 분리한 유전자 MPG-I (등록번호 Z30668) 및 PGV-II(등록번호 Z54279)와 유사하였다. cmp1과 cmp2는 MPG-I유전자의 염기서열과 각각 77%및 95%의 상동성을 보였고 cmp5는 PGV-II 염기서열과 88%의 상동성을 보였다. 본 실험을 통하여 저자들은 Mn-peroxidase 동위효소계의 아미노산 서열을 기준으로 제작된 degenerate primer들을 사용하여 게놈 DNA조각을 분리할 수 있었다.

바이러스 핵산중합효소의 아미노산 서열에 의한 바이러스 분류 (Classification of Viruses Based on the Amino Acid Sequences of Viral Polymerases)

  • 남지현;이동훈;이건명;이찬희
    • 미생물학회지
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    • 제43권4호
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    • pp.285-291
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    • 2007
  • 볼티모어의 분류체계에 의하면 바이러스는 복제 및 단백질합성 전략에 따라 6개의 집단으로나눌 수 있다. 몇 종류의 작은 DNA 바이러스를 제외한 대부분의 바이러스는 게놈 복제를 위한 자신의 핵산중합효소를 유전자로 암호화하고 있다. 바이러스 핵산중합효소에는 DNA-의존DNA 중합효수, RNA-의존RNA 중합효소, RNA-의존 DNA 중합효소 세 종류가 있으며, 이들은 모두 4개의 공통된 모티프(motif)를 가진다. 우리는 볼티모어의 분류체계와 바이러스의 핵산중합효소와의 관계를 아미노산 서열을 통해 분자 계통분류학적 분석을 통해 알아보고자 하였다. NCBI GenBank에서 얻은 바이러스 중합효소의 아미노산 서열을 CLUSTAL X 프로그램으로 다중서열하고, Neighbor-joining, Maximum-likelihood, Bayesian의 세 가지 방법으로 계통도를 그려보았다. 미세한 차이는 있었으나, 세 가지 방법 모두에서 볼티모어의 분류법과 일치하는 결과를 보였고, 특이하게도 두 가닥 RNA 바이러스는 숙주의 종류에 따라, (-)RNA 바이러스는 게놈의 절편화에 따라 각각2개의 소집단으로 나뉘어지는 것을 볼 수 있었다.

일부 28S rRNA 염기서열을 이용한 백합 상과 패류의 계통분류 (Molecular Phylogeny of Veneroidea (Bivalvia: Heteroconchia) on the Basis of Partial Sequences of 28S rRNA Gene)

  • 김세창;김재진;홍현철
    • 한국패류학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.147-161
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    • 2005
  • 백합 상과의 계통분류학적 유연관계를 알아보기 위하여 14 종의 이치 아강 이매패류와 3 종의 익형 아강 패류를 대상으로 28S rRNA의 일부 염기서열을 분석한 뒤 GenBank에 등록된 관련 종들의 염기서열을 취득하여 PAUP 프로그램을 이용하여 최대 절약분석을 실시한 결과 다음과 같은 결과를 얻었다. 분석된 1,480 개의 형질 (gap 포함) 중 560 개의 형질이 parsimony 결과 informative하였다. 하나의 가장 절약적인 분지도를 구했을 경우 전체 분지의 길이는 2765였고 consistency index (Cl) = 0.4843, homoplasy index (Hl) = 0.5157, Retention index (Rl) = 0.6291 로 나타났다. 동일 종 표본, Corbicula fluminea와 Sinonovacula constricts의 경우 각각 3.1%, 1.2%의 차이를 보였다. Pitarinae-Cyclininae-Meretrinae가 하나의 분지를 이루고 있었고, Samaranginae-Chioninae-Dorsininae가 다른 하나의 분지를 이루고 있었다.

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16S rRNA 유전자 분석에 의한 전남 순천만 갯벌의 세균 다양성 (Bacterial Diversity in the Mud Flat of Sunchon Bay, Chunnam Provice, by 16S rRNA Gene Analysis)

  • 이명숙;홍순규;이동훈;배경숙
    • 미생물학회지
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    • 제37권2호
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    • pp.137-144
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    • 2001
  • 순천만 갯벌의 세균 군집의 다양성을 조사하기 위해 16S rDNA의 다양성을 조사하였다. 갯벌로부터 전체 핵산을 분리한 후, 세균에 상보적인 universal primer로 증폭된 16S rDNA로부터 클론 라이브러리를 만들었다. 총 111개의 클론으로부터 HaeIII를 이용하여 amplified rDNA restriction analysis (ARDRA)를 수행하고, Gelcompar II 프로그램을 이용하여 pattern을 clustering하였다. 111개의 클론 중 100가지의 서로 다른 RFLP type이 조사되었고, 이들 중 전체 클론 라이브러리를 대표할 수 있는 20개의 클론을 선별하여 부분적인 염기서열을 분석하여 세균 다양성을 분석하였다. 20개의 클론중에는 RDP와 GenBank에서 제공하는 small subunit RNA database와 동일한 클론은 존재하지 않았으며, 이미 알려진 배양 가능한 세균의 16S rRNA 염기서열과 비교 하였을때 77∼96.8%의 유사도를 보였다. 또한 이들 20개의 클론은 alpha-, delta-, gamma-Proteobacteria, low G+C Gram positive bacteria, high G+C Gram positive bacteria, Sphingobacteria (Cytophaga); Cyanobacteria (Chloroplast)등 주요한 7개 lineage에 속했으며, 클론들 중 Proteobacteria가 우점종을 차지하고 있었다.

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은행 정보시스템 감사에 관한 사례 연구 (A Case Study on the Information Systems Audit of a Bank)

  • 황경태;김송주
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제9D권3호
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    • pp.467-476
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    • 2002
  • 은행업에 있어서 정보시스템의 중요성은 다른 산업에 비해서 매우 높다. 본 논문에서는 한 은행의 사례를 토대로 은행에서 실시하고 있는 정보시스템 감사 제도의 전반적인 현황을 분석하여 문제점 및 발전 방향을 제시한다. 주요한 문제점은 다음과 같다. 전반적으로 정보시스템 프로세스의 수행 정도가 미흡하고, 감사 실시 정도는 전반적으로 중요한 프로세스에는 적절히 대응하고 있으나 금융 및 전산사고 예방에만 초점을 맞추어 전략적인 측면의 대응이 미흡한 것으로 나타났다. 또한 감사 활동이 프로세스 수행에 긍정적인 영향을 미치지 못하고 있어서 감사 사후 관리를 개선할 필요성이 제기되었다. 감사 인력/조직적인 측면에서는 인력의 충원이 필요하고, 전략 기획 분야와 연구·개발 활동이 미흡하고, 감사인의 적격성 및 독립성 분야에서 기준 대비 미흡한 면이 있는 것으로 분석되었다. 여기에 대한 발전 방향으로는 내부 감사 부서들간의 적절한 감사 분담, 외부 감사의 활용, 감사 자동화 도구 도입, 자가통제평가 제도 도입, 감사인력에 대한 경력개발 제도 실시, 위험 기반 감사 제도 도입 등이 있다. 본 연구의 결과는 은행업, 더 나아가서 다른 산업의 기업들이 참고할 수 있는 사시점을 제공하고, 본 연구에서 활용한 분석 프레임워크는 향후 정보시스템 감사 분야의 학술적인 연구에서 활용될 수 있을 것이다.

삭제된 파일 조각에서 기계어 코드 유사도를 이용한 악의적인 파일 탐지에 대한 연구 (A Study of Detecting Malicious Files using Similarity between Machine Code in Deleted File Slices)

  • 류동주;이석봉;김민수
    • 정보보호학회논문지
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    • 제16권6호
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    • pp.81-93
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    • 2006
  • 컴퓨터 포렌식스에서 파일 시스템은 사이버범죄의 증거를 수집할 수 있는 대상이다. 이에 따라 파일 시스템을 복구하고 중요한 정보를 찾는 방법은 많이 제시되고 있다. 그러나 조각난 파일이나 파일 지스러기 공간에서 악성 파일을 찾는 방법은 제시되고 있지 않다. 본 논문에서는 파일 조각이 악의적인 파일인지를 조사하는 방법을 제시한다. 조각 파일 내의 기계어 코드 비율을 검사하여 실행파일인지를 판단하고, 명령어 시퀀스 유사도를 비교하여 악성파일인지를 판단한다. 명령어 시퀀스 유사도를 검사하기 위해, HMM을 이용하여 악성 파일을 프로파일링하고 연속된 평가값을 비교하는 방법을 제시한다. 이러한 방법을 적용하여 적절한 임계 수준에서 버퍼오버플로우 공격 특성을 갖는 악의적인 실행 파일을 정확히 가려낼 수 있었다.

Application of Finite Element Analysis for Structural Stability Evaluation of Modern and Contemporary Sculptures: 'Eve 58-1' by Man Lin Choi

  • Kwon, Hee Hong;Shin, Jeong Ah;Cho, Nam Chul
    • 보존과학회지
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    • 제38권4호
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    • pp.277-288
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    • 2022
  • 'Eve 58-1', the subject of this study is a statue made of plaster and its structural stability was evaluated by utilizing the CAE program in order to prevent the risk of damage arising from impact and vibration that are generated during the packaging and transportation process given its material characteristics. CAE is an abbreviation for Computer Applied Engineering for realization by predicting changes at the time of application of virtual physical energy. It is applied by reflecting the physical property conditions and each boundary condition of plaster, and the digital images of the internal and external structure of the work were acquired through 3D scanning and CT analysis for interpretation by executing finite element modeling. When acceleration is applied to the work in the direction of its own weight, the left-right side and the front-rear side, it was possible to confirm a maximum displacement value of 15.24 mm in the head section of the front-rear side direction that has been tilted by approximately 27° from the Y-axis and the largest stress value of 12.46 MPa was at the left ankle section. The corresponding results confirmed that the left ankle section is the most vulnerable area and the section for which precautions need to be exercised and supplemented at the time of transporting the work by means of objective values.

기업가적 행동과 환경이 국가 경제성장에 미치는 영향 - 무역과 혁신의 조절효과를 중심으로 - (Impact of Entrepreneurial Behavior and Environment on Economic Growth based on Country Data - Focusing on Moderating Effect of Trade and Innovation -)

  • 이예림;김학민
    • 무역학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.41-59
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    • 2016
  • 한 국가의 기업가정신이 경제성장에 기여하는 영향요인으로 주목받고 있는 상황이다. 본 연구는 기업가정신을 기업가적 행동과 환경으로 세분화하여 이들이 국가의 경제성장에 미치는 영향에 대하여 분석하고자 하였다. 기존 연구에서는 기업가정신이라는 변수를 중심으로 경제성장과의 관계성을 분석하였다면, 본 연구에서는 기업가적 활동과 기업가적 환경이라는 변수를 이용하여 극가들의 경제성장에 미치는 영향을 설명하고자 하였다. 더 나아가, 무역과 혁신이 제시된 독렵변수들과 경제성과와의 관계에서 조절적 역할을 수행하는 지를 검증하고자 하였다. GEM의 Adult Population Survey(APS)와 National Expert Survey(NES), World bank에서 데이터를 수집하여 패널분석을 실시한 결과, 기업가적 행동과 기업가 환경요인은 모두 혹은 부분적으로 국가별 경제성장에 유의한 정의 영향을 미치는 것으로 분석되었다. 특히, 기회추구형 창업활동이 경제성장에 정의 영향을 주는 것으로 나타나 창업활동의 질적인 측면이 경제성장의 성과로 이어지는데 중요한 변수임을 도출하였다. 또한, 정부 창업 지원프로그램과 경제성장의 관계에 대하여 무역과 혁신이 유의하게 조절효과를 갖는 것을 확인하였으며, 본 연구 결과에 따른 시사점에 대하여 논의하였다.

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SLA Class III 영역의 돼지 Complement Factor B(CFB) 유전자의 Cloning, cSNP 동정 및 유전자형 분석 (Cloning, cSNP Identification, and Genotyping of Pig Complement Factor B(CFB) Gene Located on the SLA Class III Region)

  • 김재환;임현태;서보영;종타오;유채경;정은지;전진태
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제50권6호
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    • pp.753-762
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    • 2008
  • GenBank database로부터 돼지 genomic 서열과 사람의 CFB 유전자의 CDS를 정렬하여 돼지 CFB 유전자의 CDS를 추정하였다. 이를 바탕으로 제작된 primer를 이용하여 RT-PCR을 실시하여 CDS 내부서열을 결정하였으며, 결정된 서열을 바탕으로 primer 제작 및 RACE-PCR을 실시하였다. 돼지 CFB 유전자의 전체 CDS 길이는 2298 bp였으며, 사람 및 마우스와의 비교결과 염기삽입/결실이 확인되었다. CDS 및 아미노산 서열을 사람 및 마우스와 비교한 결과 CDS는 84% 및 80%, 아미노산 서열은 79%, 77%의 상동성을 보였다. 포유류의 CFB에서 일반적으로 나타나는 보체조절단백질(complement control protein, CCP) 영역, Von willebrand factor A(VWFA) 영역, 그리고 serine protease 영역이 확인되었으며, 단백질 기능에 중요하게 작용하는 아미노산 잔기들은 돼지를 포함한 사람, 마우스, 소, 말에서 동일하게 나타났다. 사람, 마우스, 소, 말, 돼지 CFB 유전자의 아미노산 서열에 의한 유전적 거리지수 및 neighbor-joining tree 작성 결과 돼지는 같은 우제목에 속하는 소와 가장 가까운 계통유전학적 유연관계를 나타내었다. 결정된 CDS를 바탕으로 exon 영역을 증폭하기 위한 primer를 제작하였고, cSNP 분석을 위해서 돼지 6품종을 대상으로 direct sequencing을 실시하였다. 그 결과 아미노산 치환을 일으키는 3개(C13T, A1696G, A2015C)의 cSNP가 동정되었다. 동일한 DNA를 사용하여 동정된 3개의 cSNP를 대상으로 Multiplex- ARMS 방법으로 유전자형 분석 결과 direct sequencing 결과와 일치하였다. Multiplex-ARMS 방법의 재현성 확인을 위해 무작위로 2개의 DNA 시료를 선발한 후 direct sequencing과 Multiplex-ARMS 분석을 각각 실시하였으며, 3개의 cSNP에 대한 유전자형이 일치함을 재확인하였다. 따라서 본 연구에서 확인된 3개의 cSNP는 SLA class III 영역의 haplotype 분석을 위한 기초 자료로 사용될 수 있으며, Multiplex- ARMS 기법은 이종장기 개발에 필수적인 SLA 전체 영역 내 유전자들의 유전자형 분석을 위한 효율적인 분석방법이라고 사료된다.

DDMB 구조에서의 런타임 메모리 최적화 알고리즘 (Run-time Memory Optimization Algorithm for the DDMB Architecture)

  • 조정훈;백윤흥;권수현
    • 정보처리학회논문지A
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    • 제13A권5호
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    • pp.413-420
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    • 2006
  • 대부분의 디지털 신호 처리기 (Digital Signal Processor)는 두 개 이상의 메모리 뱅크를 가지는 하버드 아키텍처 (Harvard architecture)를 지원한다. 다중 메모리 뱅크 중에서 하나는 프로그램용으로 나머지는 데이터용으로 사용하여 프로세서가 한 명령어 사이클에 메모리의 여러 데이터에 동시 접근을 가능하게 한다. 이전 연구에서 우리는 다중 메모리 뱅크에 효율적으로 데이터를 할당하는 방법에 대하여 논하였다. 본 논문에서는 이전 연구의 확장으로 런타임 메모리의 최적화에 대한 우리의 최근 연구에 대하여 소개한다. 듀얼 데이터 메모리 뱅3(Dual Data Memory Bank)를 효율적으로 이용하기 위해 각 메모리 뱅크에 할당된 변수를 관리하기 위한 독립적인 두 개의 런타임 스택이 필요하다. 프로시저에 대한 두 메모리 뱅크의 활성화 레코드(Activation Record)의 크기는 각 메모리 뱅크에 할당된 변수의 개수가 일정하지 않기 때문에 다를 수 있다. 따라서 여러 개의 프로시저가 연속으로 호출될 때 두 개의 런타임 스택의 크기가 크게 달라질 수 있다. 이러한 두 메모리 뱅크 사이의 불균형은 하나의 메모리에 여유 공간이 있음에도 불구하고 다른 하나의 메모리 뱅크의 사용량이 온칩 메모리(on-chip memory)범위를 초과하는 원인이 될 수 있다. 본 논문에서는 온칩 메모리를 효율적으로 사용하기 위해 두 런타임 스택의 균형 맞추기를 시도했다. 본 논문에서 제안하는 알고리즘은 상대적으로 단순하지만 효율적으로 런타임 메모리를 사용할 수 있다는 것을 실험결과를 통해 보여주고 있다.