• 제목/요약/키워드: Population estimates

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한우 당대검정우와 후대검정우의 성장형질에 관한 유전모수 추정 (Estimation of Genetic Parameters for The Growth Traits of Performance and Progeny Test in Hanwoo(Bos taurus Coreanae))

  • 기근서;최태정;김시동;최호성;백동훈
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제49권6호
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    • pp.699-710
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    • 2007
  • 본 연구는 1989년 8월부터 2005년 9월까지 농협중앙회 가축개량사업소에서 당대 검정을 실시한 비거세우 3,904두의 검정 자료와 1996년 8월부터 2004년 6월까지 축산연구소 한우시험장(대관령지소), 유전자원시험장(남원지소), 농협중앙회 가축개량사업소에서 출생한 후대검정 거세우 2,424두의 검정 자료를 조사 분석하였다. 분석 형질은 당대검정 비거세우(후보우)의 6개월령, 12개월령 체중 및 12개월령 일당증체량과 후대검정 거세우의 6, 12, 24개월령 체중 및 12개월령 일당증체량으로 DFREML 패키지를 이용하여 분석하였다. 측정된 당대검정우의 6개월령, 12개월령 체중 그리고 일당증체량은 각각 181.72±30.22kg, 351.48±40.24kg 그리고 998.07±153.84g으로 나타났으며 후대검정우의 6개월령, 12개월령, 24개월령 체중 그리고 일당증체량은 각각 169.18±32.82kg, 229.37±44.57kg, 570.45±64.36kg 그리고 739.41±172.14g으로 나타났다. 당대검정 비거세우(후보우)의 6개월령 체중, 12개월령 체중 및 일당증체의 유전력은 각각 0.54±0.06, 0.60±0.06 및 0.23±0.04 추정되었다. 후대검정 거세우의 6개월령, 12개월령 및 24개월령 체중에 대한 유전력은 0.80±0.08, 0.50±0.07 및 0.46±0.07로 나타났으며 일당증체에 대한 유전력은 0.07±0.03으로 추정되었다. 한우의 당대 검정에 있어서도 기존의 초기성장형질에 대한 조사뿐만 아니라 12개월 이후의 체중에 대한 조사도 고려해봐야 할 것이며 차후 후대 검정우의 체중과 도체형질간의 유전모수 추정 연구 또한 필요하다고 생각된다. 이는 곧 당대와 후대간 체중의 간접적인 비교와 후대의 체중과 도체형질간의 간접적인 비교를 가져올 것이라 사료된다.

한우의 도체중, 배장근단면적 및 근내지방도의 유전모수 추정방법 (Methods for Genetic Parameter Estimations of Carcass Weight, Longissimus Muscle Area and Marbling Score in Korean Cattle)

  • 이득환
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권4호
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    • pp.509-516
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    • 2004
  • 한우 종모우 선발을 위한 유전능력 평가에서 고려되는 형질들 중 이산형 형태로 조사되는 근내지방도의 유전변이가 추정방법에 따라 어느 정도 차이가 있는지 알아보기 위한 모의실험을 실시하였다. 모의실험 자료는 연속변량으로 간주되는 도체중 및 배장근단면적과 근내지방도의 잠재변수를 다변량 정규분포함수에서 생성하였고 근내지방도의 잠재변수를 이용하여 특정 임계값을 중심으로 순서화된 근내지방도 점수로 변화 하였따. 근내지방도의 점수 부여방법으로써 비거세우에서 조사된 근내지방도의 점수 1${\sim}$5점 사이에 정규분포에서 크게 어긋나는 분포특성을 갖도록 자료(DSI)를 생성하였고 또한 한우 거세우에서 현재 조사되고 있는 점수 1${\sim}$7점 사이에 정규 분포에 좀더 접근한 분포특성을 갖는 모의 자료(DS2)를 생성하였다. 분석방법간에 유전변이 추정의 정확도를 알아보기 위하여 1) 생성된 이들 자료를 선형으로 간주하고 다형질 혼합 선형 개체모형에서 REML 분석방법으로 유전변이를 추정하였고 2) 특정 임계치를 중심으로 잠재변수가 존재한다는 가정하에 다형질 임계 개체 혼합모형을 설정하여 Gibbs sampling 방법으로 유전변이를 추정하였다. 여기서 추정된 유전변이(유전력, 유전상관 및 잔차상관)에 대하여 모수와의 차이를 검정함으로써 편의되는 정도를 알아보았다. 모의실험은 각 자료에 대하여 10회 실시하였다. 분석결과, 근내지방도의 유전력 추정치는 DS1에서는 다형질 임계개체혼합모형을 설정하여 Gibbs sampling 방법으로 모수에 대한 사후분포의 평균으로 계산한 결과 참값과 유의적인 차이가 없는 것으로 분석되었다. 반면에 근내지방도를 선형으로 간주하고 다형질 선형 개체혼합모형에 의한 유전력 추정치는 모수보다 매우 낮은 유전력을 보였다(0.500 vs 0.315). 유전상관 추정치는 선형모형에서의 REML 방법 또는 임계모형에서의Gibbs sampling 방법에서 모두 모수와 유의적인 차이가 없는 것으로 분석되었으나 근내지방도의 잔차상관에 있어서 REML 방법으로 분석하였을 경우에 모수보다 낮게 추정되었다. 반면에 범주형 모형에서는 모수와 추정치 간에 유의적인 차이가 없는 것으로 분석되었다. 또한 7개의 범주형으로 조사된 자료(DS2)에서 이들 추정치는 DS1에서와 동일한 경향을 보였는데 그 편의 정도는 다소 적어지는 경향을 보였다. 따라서 이산형으로 조사되는 근내지방도에 대한 유전변이를 추정하기 위해서는 범주형 임계모형이 선형모형 보다 사소 정확한 추정을 할 수 있을 것으로 판단 되었다.

Molecular Characterization of Rathi and Tharparkar Indigenous Cattle (Bos indicus) Breeds by RAPD-PCR

  • Sharma, Amit Kumar;Bhushan, Bharat;Kumar, Sanjeev;Kumar, Pushpendra;Sharma, Arjava;Kumar, Satish
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제17권9호
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    • pp.1204-1209
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    • 2004
  • Random amplification of polymorphic DNA-Polymerase Chain Reaction (RAPD-PCR) analysis was carried out using DNA samples of 30 animals of Rathi cattle and 42 animals of Tharparkar cattle. Genomic DNA was isolated as per standard protocol and evaluated for its quality, purity and concentration. Twenty three random primers were screened out of which 15 primers yielded satisfactory amplifications and were used for further analysis. Average numbers of polymorphic fragments per primer were 7.07${\pm}$0.86 in Rathi and 6.80${\pm}$0.61 in Tharparkar cattle. The percentage of polymorphic bands in these two cattle breeds were 86 and 87%, respectively. Within breed genetic similarities for pooled over primers in the animals of Rathi and Tharparkar breeds were .577${\pm}$0.30 and 0.531${\pm}$0.02, respectively on the basis of band frequency (BF) and 0.645${\pm}$0.04 and 0.534${\pm}$0.04, respectively on the basis of band sharing (BS). Averages of between breed genetic similarities for pooled over primers were 0.97 and 0.92 according to BF and BS, respectively, which reflect higher degree of genetic similarity between Rathi and Tharparkar cattle breeds. Index of genetic distance based on BF and BS for pooled over primers was 0.030${\pm}$0.011 and 0.088${\pm}$0.031, respectively. Percentage of polymorphic bands and within-breed genetic similarities on the basis of band frequency (BF) and band sharing (BS) for pooled over primers revealed higher genetic similarity in Rathi than Tharparkar cattle population. High estimates of between breed genetic similarities for pooled over primers indicated that either Rathi is having decent from Tharparkar or both the cattle breeds are having common descent. Low value of Index of genetic distances between these two cattle breeds may be due to the fact that Rathi and Tharparkar cattle breeds are the native of Thar Desert in Northwest India. The results of between breed genetic distances also confirm the existence of high degree of genetic similarity between these two breeds of cattle.

혼합 검벨분포모형을 이용한 확률강우량의 산정 (Estimating Quantiles of Extreme Rainfall Using a Mixed Gumbel Distribution Model)

  • 윤필용;김태웅;양정석;이승오
    • 한국수자원학회논문집
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    • 제45권3호
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    • pp.263-274
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    • 2012
  • 최근 다양한 기후변동성으로 인해 전 세계적으로 극한호우사상이 동시다발적으로 일어나고 있다. 우리나라의 극한호우사상은 주로 여름철 태풍으로 인한 호우와 국지성 집중호우에 의해서 발생한다. 극한호우사상에 대한 적절한 확률강우량을 추정하기 위해서, 본 연구에서는 연최대치일강우를 태풍으로 인한 강우와 집중호우로 인한 강우로 구분하여 확률적 거동을 고려하였다. 일반적인 강우빈도해석법은 연최대치강우가 단일 모집단을 이룬다고 가정하여 단일 분포함수를 적용하여 확률강우량을 추정하는 반면, 본 연구에서는 연최대치강우를 구성하는 두 가지 호우의 통계적 특성을 수문빈도해석에서 고려하기 위해, 혼합 분포함수를 적용하였다. 비교적 긴 관측강우자료를 보유한 15개 지점을 선정하여, 일강우량에 대한 확률강우량을 산정하고 비교분석을 실시하였다. 혼합 검벨분포모형에 의한 확률강우량은 단일 검벨분포함수를 적용한 확률강우량과 비교하여 지역에 따라 증감이 나타났으며, 이러한 결과는 홍수방어시스템의 계획 및 설계에서 유용한 정보를 제공할 것이다.

Genetic Analysis of Ultrasound and Carcass Measurement Traits in a Regional Hanwoo Steer Population

  • Hwang, Jeong Mi;Cheong, Jae Kyoung;Kim, Sam Su;Jung, Bong Hwan;Koh, Myung Jae;Kim, Hyeong Cheol;Choy, Yun Ho
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제27권4호
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    • pp.457-463
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    • 2014
  • Ultrasound measurements of backfat thickness (UBF), longissimus muscle area (ULMA) and marbling score (UMS) and carcass measurements of carcass weight (CW), backfat thickness (BF), longissimus muscle area (LMA), and marbling score (MS) on 7,044 Hanwoo steers were analyzed to estimate genetic parameters. Data from Hanwoo steers that were raised, finished in Hoengseong-gun, Gangwon-do (province) and shipped to slaughter houses during the period from October 2010 to April 2013 were evaluated. Ultrasound measurements were taken at approximately three months before slaughter by an experienced operator using a B-mode real-time ultrasound device (HS-2000, FHK Co. Ltd., Tokyo, Japan) with a 3.5 MHz linear probe. Ultrasound scanning was on the left side between 13th rib and the first lumbar vertebrae. All slaughtering processes and carcass evaluations were performed in accordance with the guidelines of beef grading system of Korea. To estimate genetic parameters, multiple trait animal models were applied. Fixed effects included in the models were: the effects of farm, contemporary group effects (year-season at the time of ultrasound scanning in the models for UBF, ULMA, and UMS, and year-season at slaughter in the models for CW, BF, LMA, and MS), the effects of ultrasound technicians as class variables and the effects of the age in days at ultrasound scanning or at slaughtering as linear covariates, respectively for ultrasound and carcass measures. Heritability estimates obtained from our analyses were 0.37 for UBF, 0.13 for ULMA, 0.27 for UMS, 0.44 for CW, 0.33 for BF, 0.36 for LMA and 0.54 MS, respectively. Genetic correlations were strongly positive between corresponding traits of ultrasound and carcass measures. Genetic correlation coefficient between UBF and BF estimate was 0.938, between ULMA and LMA was 0.767 and between UMS and MS was 0.925. These results suggest that ultrasound measurement traits are genetically similar to carcass measurement traits.

북한산 둘레길에서 참진드기의 계절적 발생과 중증열성혈소판감소증후군 바이러스 검출 (Seasonal Prevalence of Ticks at Bukhansan Dullegil and Detection of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus)

  • 서장훈;전보영;;이인용
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제52권2호
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    • pp.143-149
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    • 2020
  • 2019년 4월부터 10월까지 북한산 둘레길 12구간(지축동), 14구간(울대리), 18구간(호원동)에서 참진드기를 채집해서 계절적 분포 조사와 매개체의 SFTS 바이러스 감염 여부를 확인하였다. 천젓기와 천끌기 방법으로 개피참진드기, 일본참진드기와 중증열성혈소판감소증후군의 주된 매개체로 알려진 작은소피참진드기 3종이 채집되었다. 작은소피참진드기는 채집비율이 지축동 91%, 울대리 94%, 호원동 98%를 차지하여 우점종이었다. 작은소피참진드기의 성숙단계에 따른 계절별 채집비율을 보면 성충의 경우 세 지역 모두 9월에 최고치를 보였고 약충의 경우에는 4월에서 6월 사이에 주로 채집되었다. 유충의 경우에는 9월과 10월에 최고치를 보였다. 채집된 작은소피참진드기 1,158개체를 성숙단계별로 2× OneStep RT-PCR과 nested PCR로 SFTS 바이러스 검사를 한 결과 양성은 나타나지 않았다. 2010년 개장 이후 이용객이 늘어나는 북한산 둘레길에서 기후 온난화로 증가가 예상되는 참진드기 매개 질환에 대한 위험분석과 효율적인 예방에 본 조사 결과가 활용될 수 있다.

외상성 뇌 손상이후의 우울증 (Depression after Traumatic Brain Injury)

  • 정한용;한선호
    • 생물정신의학
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    • 제6권1호
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    • pp.21-29
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    • 1999
  • 외상성 뇌 손상은 다양한 신경행동학적 후유증을 나타낸다. 불안정한 기분, 무감동증, 공격성, 충동성, 과민성 등을 나타내고 기억력 상실, 집중력 장해, 정보처리 지연, 지남력 감소, 자기인식 결여, 및 문제 해결 능력의 결여 등 인지 기능의 손상을 나타낸다. 이러한 신경행동학적 증상은 직업과 가정을 포함하는 개인의 역할 수행에 다양한 충격을 주고 이는 또한 다양한 정도의 감정적 어려움을 더하게 되어, 이러한 생물학적, 심리적, 사회적 요인들이 우울증을 일으킨다. 외상성 뇌 손상이후의 우울증의 발병률은 주요 우울증이 25~50%, 기분저하 장애가 15~30%로 보고되고 있다. 외상성 뇌 손상이후의 우울증의 양상은 근본적으로는 일반적인 우울증의 양상과 별다른 차이가 없는 것으로 보고된 바 있다. 뇌 손상이후의 시간에 따라 우울증 양상에서의 차이를 보여 첫 6개월에 나타나는 경우에는 불안, 초기 불면증, 기분의 조석 변동, 및 식욕 장애 등이, 그리고 12개월의 경우에는 말기 불면증, 성욕 상실, 집중력 저하 등이 각각 두드러진 것으로 보고된 바 있다. 또한 외상성 뇌 손상이후의 급성 기에 발생하는 우울증은 보다 더 생물학적 원인이 관여하는 것으로, 지연성 우울증의 경우에는 심리적인 요인들이 더 많이 관여하는 것으로 보고되고 있다. 좌측전반부 병소와 주요 우울증의 연관성이 여러 연구에서 보고되고 있으며, 특히 불안을 호소하는 우울증은 우반구 병소와 그리고 불안의 호소가 적은 우울증은 좌측 전반부와 연관된다고 보고되었다. 외상성 뇌 손상이후에 우울증을 나타내는 경우의 병리생리학적 변화는 우울증의 원인론과 연관되어 많은 관심을 받고있으나 아직 어떠한 결론을 도출해내기에는 이르다. 치료에는 fluoxetine, desipramine 등 부작용이 적은 항우울제가 선택된다.

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국가표준식품성분 데이터베이스 대표시료 선정을 위한 표본설계 (A study on collecting representative food samples for the 10th Korean standard foods composition table)

  • 김진흠;황해원;조유정;박진우
    • 응용통계연구
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    • 제33권2호
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    • pp.215-228
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    • 2020
  • 농촌진흥청에서는 식품산업진흥법 제19조 제1항에 의거하여 국가표준식품성분표를 5년 주기로 발표하고 있다. 본 논문에서는 2021년 국가표준식품성분표 제10개정판 발간을 앞두고 우리나라 국민들이 많이 소비하고 있는 식품으로 선정된 182개 식품의 대표시료를 합리적이고 과학적으로 추출하기 위한 방안을 제안하였다. 농수산물을 포함한 식품을 판매하는 식료품점을 유통형태에 따라 대형마트와 전통시장으로 구분한 후 NFNAP에서 제안한 층화다단추출법을 각각 적용하여 8개 표본을 추출하였다. NFNAP는 미국인들이 소비하고 있는 식료품의 성분표에 대한 신뢰성 있는 추정을 담보하기 위해 미국 농무성과 국립보건원이 1977년에 협약을 맺고 공동 연구로 개발한 국가식품 영양분석 프로그램이다. 대형마트에 기초한 표본추출에서는 이마트 가양점, 홈플러스 시흥점, 롯데마트 동두천점, 이마트 수원점, 롯데마트 둔산점, 롯데마트 여수점, 이마트 울산점, 하나로클럽 울산점이 표본으로 추출되었고, 전통시장에 기초한 표본추출에서는 서울시 금천구 독산동우시장과 송파구 풍납시장, 고양시 일산서구 일산시장, 광주광역시 북구 운암시장, 대전광역시 대덕구 법동시장, 부산광역시 영도구 봉래시장과 해운대구 좌동재래시장, 창원시 진해구 중앙시장이 표본으로 추출되었다.

성 감별 유전자를 도입한 다산계계통 신품종 육종에 관한 연구 I. 반생유전계통 조성 (Breeding of New Synthetic Egg Production Line in Domestic Chicken by Intlroducing Sex Linked Gene. I. Production of the Autosexing Breed)

  • 오봉국;손시환;이정구
    • 한국가금학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.113-123
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    • 1992
  • 본 연구는 반성은색유전자(S:silver gene)를 도입하여 성 감별용 산란종계 계통으로 육성하여 이를 모계통으로 이용함으로서 깃털에 의한 자웅감별이 가능할 뿐만 아니라 잡종강세를 이용한 우수실용계를 작출하고자 수행되었다. 암수 감별용 계통 조성을 위하여서는 현재 시판되고 있는 백색 실용계 수컷(Z$^{s}$ Z$^{s}$ ) 및 갈색 실용계 암컷(Z$^{s}$ W)을 이용하여 이들 중 우수개체를 선발하여 교잡시킴으로서 생산된 개체중 유전적 조성이 은색유전자를 동형(homo)으로 가진 개체들을 모계통으로 육성하고, 부계통 조성을 위하여서는 갈색유전자를 동형으로 가진 개체를 선발 육성하므로서 감별의 원종계를 작출하였다. 이들 조성된 계통을 이용하여 생산능력이 우수한 계통으로 육종하기 위하여 폐쇄군 육종방법(clossed flock breeding)을 사용하였다. 합성종 계계의 산란능력 검정 결과 60주령까지의 산란기록에 근거한 주요 경제능력은 초산 일령 161일, 60주령시 산난수 219개, 산난율 84% 평균난중 61g으로 외국에서 수입되는 우수종계에 버금가는 성적을 나타내었다. 또한 깃털에 의한 자웅감별이 가능할 뿐만 아니라 산난능력도 우수한 실용성 있는 암수 감별용 합성종을 육성 할 것으로 판단된다. 합성종 계통의 유전분석 결과 이들의 유전모수가 정상집단의 유전모수와 유사한 추정치를 보임으로서 특정계통 조성을 위한 선발에 기인된 유전변이의 변화는 거의 없음을 시사한다.

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Effect of errors in pedigree on the accuracy of estimated breeding value for carcass traits in Korean Hanwoo cattle

  • Nwogwugwu, Chiemela Peter;Kim, Yeongkuk;Chung, Yun Ji;Jang, Sung Bong;Roh, Seung Hee;Kim, Sidong;Lee, Jun Heon;Choi, Tae Jeong;Lee, Seung-Hwan
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제33권7호
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    • pp.1057-1067
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    • 2020
  • Objective: This study evaluated the effect of pedigree errors (PEs) on the accuracy of estimated breeding value (EBV) and genetic gain for carcass traits in Korean Hanwoo cattle. Methods: The raw data set was based on the pedigree records of Korean Hanwoo cattle. The animals' information was obtained using Hanwoo registration records from Korean animal improvement association database. The record comprised of 46,704 animals, where the number of the sires used was 1,298 and the dams were 38,366 animals. The traits considered were carcass weight (CWT), eye muscle area (EMA), back fat thickness (BFT), and marbling score (MS). Errors were introduced in the pedigree dataset through randomly assigning sires to all progenies. The error rates substituted were 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, and 80%, respectively. A simulation was performed to produce a population of 1,650 animals from the pedigree data. A restricted maximum likelihood based animal model was applied to estimate the EBV, accuracy of the EBV, expected genetic gain, variance components, and heritability (h2) estimates for carcass traits. Correlation of the simulated data under PEs was also estimated using Pearson's method. Results: The results showed that the carcass traits per slaughter year were not consistent. The average CWT, EMA, BFT, and MS were 342.60 kg, 78.76 ㎠, 8.63 mm, and 3.31, respectively. When errors were introduced in the pedigree, the accuracy of EBV, genetic gain and h2 of carcass traits was reduced in this study. In addition, the correlation of the simulation was slightly affected under PEs. Conclusion: This study reveals the effect of PEs on the accuracy of EBV and genetic parameters for carcass traits, which provides valuable information for further study in Korean Hanwoo cattle.